当前蛋白身份：Q9UK05
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ZKZ Crystal Structure of BMP9 提交 2005-05-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
片段：Growth/differentiation factor 2, residues 320-429
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；1-1.2 M Sodium Chloride, 7-10 mM Hexadecyltrimethylammonium Bromide 10 mM Magnesium Chloride, pH 7.5, temperature 296K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.272 |
| 4FAO Specificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex 提交 2012-05-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
链 B
320–429（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium malonate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.261 |
| 4FAO Specificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex 提交 2012-05-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
320–429（110 aa）
链 H
320–429（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium malonate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.261 |
| 4FAO Specificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex 提交 2012-05-22 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 M
320–429（110 aa）
链 N
320–429（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium malonate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.261 |
| 4FAO Specificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex 提交 2012-05-22 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 S
320–429（110 aa）
链 T
320–429（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium malonate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.261 |
| 4FAO Specificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex 提交 2012-05-22 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 a
320–429（110 aa）
链 b
320–429（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium malonate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.261 |
| 4FAO Specificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex 提交 2012-05-22 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 g
320–429（110 aa）
链 h
320–429（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium malonate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.36 Å R-free 0.261 |
| 4MPL Crystal structure of BMP9 at 1.90 Angstrom 提交 2013-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
321–429（109 aa）
片段：UNP residues 321-429
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；0.12M magnesium nitrate, 12% PEG3350, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 4YCG Pro-bone morphogenetic protein 9 提交 2015-02-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
320–429（110 aa）
链 D
320–429（110 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；0.15 M zinc acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 5.8, 4% isopropanol, 0.15 M nondetergent sulfobetaine (NDSB-211)
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.230 |
| 4YCI non-latent pro-bone morphogenetic protein 9 提交 2015-02-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
320–429（110 aa）
链 D
320–429（110 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；0.15 M zinc acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 5.8, 4% isopropanol, 0.15 M nondetergent sulfobetaine (NDSB-211)
|
分辨率 3.25 Å R-free 0.260 |
| 5HZW Crystal structure of the orphan region of human endoglin/CD105 in complex with BMP9 提交 2016-02-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
320–429（110 aa）
片段：UNP residues 320-429
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.1 M AMMONIUM TARTRATE
|
分辨率 4.45 Å R-free 0.318 |
| 5I05 Crystal structure of human BMP9 at 1.87 A resolution 提交 2016-02-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
片段：UNP residues 320-429
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；293 K；1.0 M LiCl, 4% (v/v) PEG6000, 0.1 M NA-CITRATE
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.233 |
| 6SF2 Ternary complex of human bone morphogenetic protein 9 (BMP9) growth factor domain, its prodomain and extracellular domain of activin receptor-like kinase 1 (ALK1). 提交 2019-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
320–429（110 aa）
链 C
23–319（297 aa）
链 E
320–429（110 aa）
链 F
23–319（297 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.14 M potassium sodium tartrate, 14% PEG 3350
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.274 |
| 9DPM BMP-9 Monomer Growth Factor with Cysteinylation 提交 2024-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S | CYS CYSTEINE × 1 NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；289.15 K；0.9 M sodium chloride, 133 mM HEPES, 166 mM MES
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.242 |
| 9DPN BMP-9 Wild-Type Dimer Without Radiation Damage in Neutral pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 10 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；1M NaCl, 17% Glycerol, 0.1 M HEPEs pH 7.5
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.206 |
| 9DPO BMP-9 Wild-Type Dimer With Radiation Damage in Neutral pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S | CL CHLORIDE ION × 10 NA SODIUM ION × 8 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；1M NaCl, 17% Glycerol, 0.1 M HEPEs pH 7.5
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.245 |
| 9DPP BMP-9 Wild-Type Dimer in Acidic pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 18 NA SODIUM ION × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；289.15 K；1M NaCl, 3.5% PEG8K, 0.3M Citrate pH 3.5
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.258 |
| 9DPQ BMP-9 Wild-Type Dimer without Radiation Damage in Acidic pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 20 NA SODIUM ION × 12 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；289.15 K；1M NaCl, 3.5% PEG8K, 0.3M Sodium Citrate pH 3.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.249 |
| 9DPR BMP-9 Wild-Type Dimer with Radiation Damage in Acidic pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 20 NA SODIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.5；289.15 K；1M NaCl, 3.5% PEG8K, 0.3M Sodium Citrate pH 3.5
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.266 |
| 9DPS BMP-9 G389S Dimer Without Radiation Damage in Neutral pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S, G389S | CL CHLORIDE ION × 12 NA SODIUM ION × 8 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；1M NaCl, 22-26% glycerol, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.249 |
| 9DPT BMP-9 G389S Dimer With Radiation Damage in Neutral pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S, G389S | CL CHLORIDE ION × 10 NA SODIUM ION × 8 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；1M NaCl, 22-26% glycerol, 0.1 M HEPEs pH 7.5
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.279 |
| 9DPU BMP-9 G389S Dimer in Acidic pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S, G389S | CL CHLORIDE ION × 10 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；1M NaCl, 0.1M Acetic Acid pH 4, 27% Glycerol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.224 |
| 9DPV BMP-9 K357R G389S Dimer Without Radiation Damage in Neutral pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S, K357R, G389S | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 10 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；1M NaCl, 22-26% glycerol, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.265 |
| 9DPW BMP-9 K357R G389S Dimer With Radiation Damage in Neutral pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S, K357R, G389S | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 18 NA SODIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289.15 K；1M NaCl, 22-26% glycerol, 0.1 M HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.299 |
| 9DPX BMP-9 G389S K357R Dimer in Acidic pH 提交 2024-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
320–429（110 aa）
|
突变：A321S, K357R, G389S | GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 12 NA SODIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；293 K；1M NaCl , 0.1M Acetic Acid pH 4, 32% Glycerol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.268 |