当前蛋白身份：Q9UNS2
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4D10 Crystal structure of the COP9 signalosome 提交 2014-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 K
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.4；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4, 10 MM UREA.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.228 |
| 4D10 Crystal structure of the COP9 signalosome 提交 2014-04-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.4；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4, 10 MM UREA.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.228 |
| 4D18 Crystal structure of the COP9 signalosome 提交 2014-05-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.4；CRYSTAL GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4. CRYSTAL DEHYDRATED OVERNIGHT WITH 20% PEG 6000 IN WELL
|
分辨率 4.08 Å R-free 0.253 |
| 4D18 Crystal structure of the COP9 signalosome 提交 2014-05-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 K
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.4；CRYSTAL GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4. CRYSTAL DEHYDRATED OVERNIGHT WITH 20% PEG 6000 IN WELL
|
分辨率 4.08 Å R-free 0.253 |
| 4WSN Crystal structure of the COP9 signalosome, a P1 crystal form 提交 2014-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4.
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.282 |
| 4WSN Crystal structure of the COP9 signalosome, a P1 crystal form 提交 2014-10-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 K
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4.
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.282 |
| 4WSN Crystal structure of the COP9 signalosome, a P1 crystal form 提交 2014-10-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 S
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4.
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.282 |
| 4WSN Crystal structure of the COP9 signalosome, a P1 crystal form 提交 2014-10-28 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 a
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4.
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.282 |
| 4WSN Crystal structure of the COP9 signalosome, a P1 crystal form 提交 2014-10-28 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 i
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4.
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.282 |
| 4WSN Crystal structure of the COP9 signalosome, a P1 crystal form 提交 2014-10-28 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 q
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；273 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 9.3 MG/ML PROTEIN IN 50 MM HEPES PH 7.4, 200 MM NACL, 2 MM EQUALLY WITH 12% PEG 6000, 100 MM TRISODIUM CITRATE PH 5.4, 0.1 M LI2SO4.
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.282 |
| 6R6H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 C
1–383（383 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5
100 mM NaCl
0.5 mM DTT
1% glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 8.40 Å |
| 6R7F Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 C
1–403（403 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5
100 mM NaCL
0.5 mM DTT
1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 6R7H Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
1–403（403 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5
100 mM NaCl
0.5 mM DTT
1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.80 Å |
| 6R7I Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 C
3–403（401 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 6R7N Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome 提交 2019-03-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 C
3–403（401 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM HEPES pH 7.5
100 mM NaCl
0.5 mM DTT
1% Glycerol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 8H38 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3~N8-CSN(mutate) complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
|
分辨率 4.25 Å |
| 8H3A Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3~N8(removed)-CSN complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.51 Å |
| 8H3F Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CRL3-CSN complex 提交 2022-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.73 Å |
| 9E5Z Cryo-EM structure of COP9 signalosome 提交 2024-10-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9E77 Cryo-EM structure of CSN-N8 in complex with CSN5i-3 提交 2024-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | 6LT 3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9E81 Cryo-EM structure of COP9 signalosome in complex with CSN5i-3 提交 2024-11-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | 6LT 3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9EFM Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-1 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.16 Å |
| 9EFQ Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-2 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 9EFV Cryo-EM structure of CSN-N8CUL1 in complex with CSN5i-3 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | 6LT 3-(difluoromethyl)-N-{6-[(5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 9EG1 COP9 signalosome deneddylation complex with cullin-5 提交 2024-11-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.52 Å |
| 9EG8 Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-4A 提交 2024-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9EGL Cryo-EM structure of COP9 signalosome precatalytic state with neddylated cullin-3 提交 2024-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.93 Å |
| 9PH4 Cryo-EM structure of COP9 signalosome in complex with CSN5i-1a 提交 2025-07-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 A1CH3 6-[(4R,5S,6S)-6-hydroxy-6,7,8,9-tetrahydro-5H-imidazo[1,5-a]azepin-5-yl][1,1'-biphenyl]-3-carbonitrile × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9QO0 Pre-activated 9-subunit COP9 signalosome and neddylated SCF (Skp1-Skp2-Cks1) complex structure 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric（15） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9QO1 Activated 9-subunit COP9 signalosome and neddylated SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex structure 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.23 Å |
| 9QO2 Dissociation-state-1 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9QO3 Dissociation-state-2 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 9QO4 Dissociation-state-3 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.95 Å |
| 9QO5 Dissociation-state-4 of 9-subunit CSN and SCF (SKP1-SKP2-CKS1) complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9QO6 9-subunit COP9 signalosome complex 提交 2025-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
1–423（423 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；15 mM Hepes pH 7.5, 120 mM NaCl, 0.5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |