当前蛋白身份:Q9WZP2 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3DKT Crystal structure of Thermotoga maritima encapsulin 提交 2008-06-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 120 PDB 声明:120-meric(120) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
链 B 1–265(265 aa)
链 C 1–265(265 aa)
链 D 1–265(265 aa)
链 E 1–265(265 aa)
链 F 1–265(265 aa)
链 G 1–265(265 aa)
链 H 1–265(265 aa)
链 I 1–265(265 aa)
链 J 1–265(265 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.1;292 K;0.1M citrate, 21.5% MPD (v/v), 0.25M ammonium acetate, pH5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.239
6WKV Cryo-EM structure of engineered variant of the Encapsulin from Thermotoga maritima (TmE) 提交 2020-04-17 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 0 1–265(265 aa)
链 1 1–265(265 aa)
链 2 1–265(265 aa)
链 3 1–265(265 aa)
链 4 1–265(265 aa)
链 5 1–265(265 aa)
链 6 1–265(265 aa)
链 7 1–265(265 aa)
链 8 1–265(265 aa)
链 9 1–265(265 aa)
链 A 1–265(265 aa)
链 B 1–265(265 aa)
链 C 1–265(265 aa)
链 D 1–265(265 aa)
链 E 1–265(265 aa)
链 F 1–265(265 aa)
链 G 1–265(265 aa)
链 H 1–265(265 aa)
链 I 1–265(265 aa)
链 J 1–265(265 aa)
链 K 1–265(265 aa)
链 L 1–265(265 aa)
链 M 1–265(265 aa)
链 N 1–265(265 aa)
链 O 1–265(265 aa)
链 P 1–265(265 aa)
链 Q 1–265(265 aa)
链 R 1–265(265 aa)
链 S 1–265(265 aa)
链 T 1–265(265 aa)
链 U 1–265(265 aa)
链 V 1–265(265 aa)
链 W 1–265(265 aa)
链 X 1–265(265 aa)
链 Y 1–265(265 aa)
链 Z 1–265(265 aa)
链 a 1–265(265 aa)
链 b 1–265(265 aa)
链 c 1–265(265 aa)
链 d 1–265(265 aa)
链 e 1–265(265 aa)
链 f 1–265(265 aa)
链 g 1–265(265 aa)
链 h 1–265(265 aa)
链 i 1–265(265 aa)
链 j 1–265(265 aa)
链 k 1–265(265 aa)
链 l 1–265(265 aa)
链 m 1–265(265 aa)
链 n 1–265(265 aa)
链 o 1–265(265 aa)
链 p 1–265(265 aa)
链 q 1–265(265 aa)
链 r 1–265(265 aa)
链 s 1–265(265 aa)
链 t 1–265(265 aa)
链 u 1–265(265 aa)
链 v 1–265(265 aa)
链 w 1–265(265 aa)
链 x 1–265(265 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
7K5W Cryo-EM structure of heterologous protein complex loaded Thermotoga maritima encapsulin capsid 提交 2020-09-17 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
7K5W Cryo-EM structure of heterologous protein complex loaded Thermotoga maritima encapsulin capsid 提交 2020-09-17 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
7K5W Cryo-EM structure of heterologous protein complex loaded Thermotoga maritima encapsulin capsid 提交 2020-09-17 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
7K5W Cryo-EM structure of heterologous protein complex loaded Thermotoga maritima encapsulin capsid 提交 2020-09-17 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
7K5W Cryo-EM structure of heterologous protein complex loaded Thermotoga maritima encapsulin capsid 提交 2020-09-17 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
7KQ5 Cryo-EM structure of a thermostable encapsulin from T. maritima 提交 2020-11-13 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE;3 ul sample applied to the carbon side of the grid and blotted for 4s before plunging.
分辨率 2.00 Å
7KQ5 Cryo-EM structure of a thermostable encapsulin from T. maritima 提交 2020-11-13 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE;3 ul sample applied to the carbon side of the grid and blotted for 4s before plunging.
分辨率 2.00 Å
7KQ5 Cryo-EM structure of a thermostable encapsulin from T. maritima 提交 2020-11-13 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE;3 ul sample applied to the carbon side of the grid and blotted for 4s before plunging.
分辨率 2.00 Å
7KQ5 Cryo-EM structure of a thermostable encapsulin from T. maritima 提交 2020-11-13 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE;3 ul sample applied to the carbon side of the grid and blotted for 4s before plunging.
分辨率 2.00 Å
7KQ5 Cryo-EM structure of a thermostable encapsulin from T. maritima 提交 2020-11-13 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 PROPANE;3 ul sample applied to the carbon side of the grid and blotted for 4s before plunging.
分辨率 2.00 Å
7LII Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7D 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182D, E183D, Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 3.55 Å
7LII Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7D 提交 2021-01-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182D, E183D, Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 3.55 Å
7LII Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7D 提交 2021-01-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182D, E183D, Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 3.55 Å
7LII Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7D 提交 2021-01-27 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182D, E183D, Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 3.55 Å
7LII Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7D 提交 2021-01-27 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182D, E183D, Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 3.55 Å
7LIJ Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1K 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187K RBF RIBOFLAVIN × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIJ Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1K 提交 2021-01-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187K RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIJ Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1K 提交 2021-01-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187K RBF RIBOFLAVIN × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIJ Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1K 提交 2021-01-27 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187K RBF RIBOFLAVIN × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIJ Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1K 提交 2021-01-27 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187K RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIK Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1R 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187R RBF RIBOFLAVIN × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.91 Å
7LIK Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1R 提交 2021-01-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187R RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.91 Å
7LIK Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1R 提交 2021-01-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187R RBF RIBOFLAVIN × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.91 Å
7LIK Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1R 提交 2021-01-27 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187R RBF RIBOFLAVIN × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.91 Å
7LIK Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S1R 提交 2021-01-27 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:H187R RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.91 Å
7LIL Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant SE3 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:G186E,H187E,Y188E RBF RIBOFLAVIN × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIL Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant SE3 提交 2021-01-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:G186E,H187E,Y188E RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIL Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant SE3 提交 2021-01-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:G186E,H187E,Y188E RBF RIBOFLAVIN × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIL Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant SE3 提交 2021-01-27 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:G186E,H187E,Y188E RBF RIBOFLAVIN × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIL Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant SE3 提交 2021-01-27 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:G186E,H187E,Y188E RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.84 Å
7LIM Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S6E 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.75 Å
7LIM Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S6E 提交 2021-01-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.75 Å
7LIM Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S6E 提交 2021-01-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.75 Å
7LIM Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S6E 提交 2021-01-27 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.75 Å
7LIM Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S6E 提交 2021-01-27 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:Del(184-190) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot 4 seconds, force 20 immediately prior to plunging into ethane
分辨率 2.75 Å
7LIS Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S5D 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:E184D,P189D, Del(185-188) RBF RIBOFLAVIN × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.96 Å
7LIS Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S5D 提交 2021-01-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:E184D,P189D, Del(185-188) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.96 Å
7LIS Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S5D 提交 2021-01-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:E184D,P189D, Del(185-188) RBF RIBOFLAVIN × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.96 Å
7LIS Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S5D 提交 2021-01-27 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:E184D,P189D, Del(185-188) RBF RIBOFLAVIN × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.96 Å
7LIS Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S5D 提交 2021-01-27 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:E184D,P189D, Del(185-188) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.96 Å
7LIT Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7G 提交 2021-01-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182G, L190G, Del(182-189) RBF RIBOFLAVIN × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.53 Å
7LIT Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7G 提交 2021-01-27 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182G, L190G, Del(182-189) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.53 Å
7LIT Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7G 提交 2021-01-27 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182G, L190G, Del(182-189) RBF RIBOFLAVIN × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.53 Å
7LIT Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7G 提交 2021-01-27 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182G, L190G, Del(182-189) RBF RIBOFLAVIN × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.53 Å
7LIT Thermotoga maritima Encapsulin Nanocompartment Pore Mutant S7G 提交 2021-01-27 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
突变:K182G, L190G, Del(182-189) RBF RIBOFLAVIN × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot force 0, wait time 30 seconds
分辨率 2.53 Å
7MU1 Thermotoga maritima encapsulin shell 提交 2021-05-14 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–264(264 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;20 mM Tris-HCl, pH 7.4, 150 mM NaCl and 5 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;blot force
分辨率 3.30 Å
7MU1 Thermotoga maritima encapsulin shell 提交 2021-05-14 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–264(264 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;20 mM Tris-HCl, pH 7.4, 150 mM NaCl and 5 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;blot force
分辨率 3.30 Å
7MU1 Thermotoga maritima encapsulin shell 提交 2021-05-14 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 A 1–264(264 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;20 mM Tris-HCl, pH 7.4, 150 mM NaCl and 5 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;blot force
分辨率 3.30 Å
7MU1 Thermotoga maritima encapsulin shell 提交 2021-05-14 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–264(264 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;20 mM Tris-HCl, pH 7.4, 150 mM NaCl and 5 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;blot force
分辨率 3.30 Å
7MU1 Thermotoga maritima encapsulin shell 提交 2021-05-14 Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–264(264 aa)
未记录 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;20 mM Tris-HCl, pH 7.4, 150 mM NaCl and 5 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE;blot force
分辨率 3.30 Å
9Y8P Cryo-EM structure of Thermotoga maritima encapsulin shell 提交 2025-09-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric(60) 与蛋白数一致
链 A 1–265(265 aa)
链 AA 1–265(265 aa)
链 AB 1–265(265 aa)
链 B 1–265(265 aa)
链 BA 1–265(265 aa)
链 BB 1–265(265 aa)
链 C 1–265(265 aa)
链 CA 1–265(265 aa)
链 CB 1–265(265 aa)
链 D 1–265(265 aa)
链 DA 1–265(265 aa)
链 DB 1–265(265 aa)
链 E 1–265(265 aa)
链 EA 1–265(265 aa)
链 EB 1–265(265 aa)
链 F 1–265(265 aa)
链 FA 1–265(265 aa)
链 FB 1–265(265 aa)
链 G 1–265(265 aa)
链 GA 1–265(265 aa)
链 GB 1–265(265 aa)
链 H 1–265(265 aa)
链 HA 1–265(265 aa)
链 HB 1–265(265 aa)
链 I 1–265(265 aa)
链 IA 1–265(265 aa)
链 J 1–265(265 aa)
链 JA 1–265(265 aa)
链 K 1–265(265 aa)
链 KA 1–265(265 aa)
链 L 1–265(265 aa)
链 LA 1–265(265 aa)
链 M 1–265(265 aa)
链 MA 1–265(265 aa)
链 N 1–265(265 aa)
链 NA 1–265(265 aa)
链 O 1–265(265 aa)
链 OA 1–265(265 aa)
链 P 1–265(265 aa)
链 PA 1–265(265 aa)
链 Q 1–265(265 aa)
链 QA 1–265(265 aa)
链 R 1–265(265 aa)
链 RA 1–265(265 aa)
链 S 1–265(265 aa)
链 SA 1–265(265 aa)
链 T 1–265(265 aa)
链 TA 1–265(265 aa)
链 U 1–265(265 aa)
链 UA 1–265(265 aa)
链 V 1–265(265 aa)
链 VA 1–265(265 aa)
链 W 1–265(265 aa)
链 WA 1–265(265 aa)
链 X 1–265(265 aa)
链 XA 1–265(265 aa)
链 Y 1–265(265 aa)
链 YA 1–265(265 aa)
链 Z 1–265(265 aa)
链 ZA 1–265(265 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å