当前蛋白身份：Q9XSM3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6B5V Structure of TRPV5 in complex with econazole 提交 2017-09-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ECL 1-[(2R)-2-[(4-chlorobenzyl)oxy]-2-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-1H-imidazole × 4 CA CALCIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6DMR Lipid-bound full-length rbTRPV5 提交 2018-06-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6DMU PI(4,5)P2 bound full-length rbTRPV5 提交 2018-06-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6DMW Calmodulin-bound full-length rbTRPV5 提交 2018-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6O1N Cryo-EM structure of TRPV5 (1-660) in nanodisc 提交 2019-02-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 6O1P Cryo-EM structure of full length TRPV5 in nanodisc 提交 2019-02-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6O1U Cryo-EM structure of TRPV5 W583A in nanodisc 提交 2019-02-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6O20 Cryo-EM structure of TRPV5 with calmodulin bound 提交 2019-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
链 E
1–730（730 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6PBE ZINC17988990-bound TRPV5 in nanodiscs 提交 2019-06-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | O6S (4-oxo-5-phenyl-3,4-dihydrothieno[2,3-d]pyrimidin-2-yl)methyl 3-(3-oxo-2,3-dihydro-4H-1,4-benzoxazin-4-yl)propanoate × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 6PBF ZINC9155420-bound TRPV5 in nanodiscs 提交 2019-06-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | O6V (1S)-1-(4-oxo-5-phenyl-3,4-dihydrothieno[2,3-d]pyrimidin-2-yl)ethyl [(2S)-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzothiazin-2-yl]acetate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7T6J Cryo-EM structure of TRPV5 at pH8 in nanodiscs 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7T6K Cryo-EM structure of TRPV5 at pH6 in nanodiscs 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7T6L Cryo-EM structure of TRPV5 at pH5 in nanodiscs 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7T6M Cryo-EM structure of TRPV5 in nanodiscs with PI(4,5)P2 at pH6 state 1 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7T6N Cryo-EM structure of TRPV5 in nanodiscs at pH6 state 2 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7T6O Cryo-EM structure of TRPV5 in nanodiscs at pH6 state 3 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7T6P Cryo-EM structure of TRPV5 T709D in nanodiscs 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
突变：T709D 突变：T709D 突变：T709D 突变：T709D | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7T6Q Cryo-EM structure of TRPV5 T709D with PI(4,5)P2 in nanodiscs 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
突变：T709D 突变：T709D 突变：T709D 突变：T709D | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7T6R Cryo-EM structure of TRPV5 T709D in nanodiscs in the presence of Calmodulin 提交 2021-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
突变：T709D 突变：T709D 突变：T709D 突变：T709D | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8FFN RR-bound wildtype rabbit TRPV5 in nanodiscs 提交 2022-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | R2R ruthenium(6+) azanide pentaamino(oxido)ruthenium (1/4/2) × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ERG ERGOSTEROL × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.96 Å |
| 8FFO Cryo-EM structure of wildtype rabbit TRPV5 with PI(4,5)P2 in nanodiscs 提交 2022-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ERG ERGOSTEROL × 8 CPL 1-PALMITOYL-2-LINOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 16 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8FFQ Wildtype rabbit TRPV5 into nanodiscs in the presence of PI(4,5)P2 and ruthenium red 提交 2022-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ERG ERGOSTEROL × 8 R2R ruthenium(6+) azanide pentaamino(oxido)ruthenium (1/4/2) × 1 CPL 1-PALMITOYL-2-LINOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 8FHH Wildtype rabbit TRPV5 in nanodiscs in the presence of oleoyl coenzyme A, Closed stated 提交 2022-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 ERG ERGOSTEROL × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 8FHI Wildtype rabbit TRPV5 in nanodiscs in complex with oleoyl coenzyme A, Open stated 提交 2022-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ERG ERGOSTEROL × 8 3VV S-{(3R,5R,9R)-1-[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]-3,5,9-trihydroxy-8,8-dimethyl-3,5-dioxido-10,14-dioxo-2,4,6-trioxa-11,15-diaza-3lambda~5~,5lambda~5~-diphosphaheptadecan-17-yl} (9Z)-octadec-9-enethioate (non-preferred name) × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8TF2 Wildtype rabbit TRPV5 into nanodiscs in Apo state 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ERG ERGOSTEROL × 8 CPL 1-PALMITOYL-2-LINOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.57 Å |
| 8TF3 Wildtype rabbit TRPV5 into nanodiscs in complex with econazole 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ERG ERGOSTEROL × 8 CPL 1-PALMITOYL-2-LINOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 8 ECN 1-[(2S)-2-[(4-CHLOROBENZYL)OXY]-2-(2,4-DICHLOROPHENYL)ETHYL]-1H-IMIDAZOLE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.94 Å |
| 8TF4 Wildtype rabbit TRPV5 into nanodiscs in the presence of PI(4,5)P2 and econazole 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ERG ERGOSTEROL × 8 CPL 1-PALMITOYL-2-LINOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 8 ECN 1-[(2S)-2-[(4-CHLOROBENZYL)OXY]-2-(2,4-DICHLOROPHENYL)ETHYL]-1H-IMIDAZOLE × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 9O6G Wildtype rabbit TRPV5 in nanodics in the presence of Menthol and PI(4,5)P2 提交 2025-04-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–730（730 aa）
链 B
1–730（730 aa）
链 C
1–730（730 aa）
链 D
1–730（730 aa）
|
未记录 | ERG ERGOSTEROL × 8 CPL 1-PALMITOYL-2-LINOLEOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 16 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 4 IT9 (-)-Isopiperitenone × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å |