当前蛋白身份：Q9Y2G2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4IKM X-ray structure of CARD8 CARD domain 提交 2012-12-26 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
345–431（87 aa）
片段：MBP tagged human CARD8 CARD domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | IOD IODIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；16% PEG8000, 0.1 M NaI, 0.1 M NaAc, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.46 Å R-free 0.253 |
| 6K9F Structure of unknow protein 4 提交 2019-06-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
345–431（87 aa）
链 B
345–431（87 aa）
链 C
345–431（87 aa）
链 D
345–431（87 aa）
链 E
345–431（87 aa）
链 F
345–431（87 aa）
链 G
345–431（87 aa）
链 H
345–431（87 aa）
链 I
345–431（87 aa）
链 J
345–431（87 aa）
链 K
345–431（87 aa）
链 L
345–431（87 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.302 |
| 6XKJ Cryo-EM structure of CARD8-CARD filament 提交 2020-06-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 B
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 C
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 D
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 E
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 F
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 G
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 H
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 I
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 J
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 K
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 L
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 M
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 N
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 O
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
链 P
451–537（87 aa）
片段：CARD domain (UNP residues 451-537)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.54 Å |
| 7JKQ Human DPP9-CARD8 complex 提交 2020-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–537（537 aa）
链 C
1–537（537 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25mM HEPES, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7JN7 Human DPP9-CARD8 complex 提交 2020-08-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–537（537 aa）
链 C
1–537（537 aa）
|
未记录 | GK2 [(2~{R})-1-[(2~{R})-2-azanyl-3-methyl-butanoyl]pyrrolidin-2-yl]boronic acid × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；25 mM HEPES, pH 7.5, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |