当前蛋白身份:Q9Y5X1
重新检索
差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2RAI The PX-BAR membrane remodeling unit of Sorting Nexin 9 提交 2007-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
204–595(392 aa)
片段:C-terminal fragment, residues 214-594
链 B
204–595(392 aa)
片段:C-terminal fragment, residues 214-594
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.3M Ammonium tartrate dibasic, 0.1M BIS-TRIS propane, pH 7.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.301 |
| 2RAJ SO4 bound PX-BAR membrane remodeling unit of Sorting Nexin 9 提交 2007-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
204–595(392 aa)
片段:C-terminal fragment, residues 214-594
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.3M Ammonium tartrate dibasic, 0.1M BIS-TRIS propane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.276 |
| 2RAK PI(3)P bound PX-BAR membrane remodeling unit of Sorting Nexin 9 提交 2007-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
204–595(392 aa)
片段:C-terminal fragment, residues 214-594
|
未记录 | PIB 2-(BUTANOYLOXY)-1-{[(HYDROXY{[2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL)OXY]METHYL}ETHYL BUTANOATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.3M Ammonium tartrate dibasic, 0.1M BIS-TRIS propane, pH 7.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.293 |
| 3DYT Crystal structure of Snx9PX-BAR (230-595), C2221 提交 2008-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
230–595(366 aa)
片段:UNP residues 230-595
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293.15 K;1.8M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 5% PEG 400, 0.05M MgSO4, 15% Xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.245 |
| 3DYU Crystal structure of Snx9PX-BAR (230-595), H32 提交 2008-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
230–595(366 aa)
片段:UNP residues 230-595
链 B
230–595(366 aa)
片段:UNP residues 230-595
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293.15 K;1.8M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 5% PEG 400, 0.05M MgSO4, 15% Xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.403 |
| 3DYU Crystal structure of Snx9PX-BAR (230-595), H32 提交 2008-07-28 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
230–595(366 aa)
片段:UNP residues 230-595
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293.15 K;1.8M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 5% PEG 400, 0.05M MgSO4, 15% Xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.403 |
| 3LGE Crystal structure of rabbit muscle aldolase-SNX9 LC4 complex 提交 2010-01-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致 |
链 E
152–182(31 aa)
片段:UNP residues 152-182
链 F
152–182(31 aa)
片段:UNP residues 152-182
链 G
152–182(31 aa)
片段:UNP residues 152-182
链 H
152–182(31 aa)
片段:UNP residues 152-182
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;PEG-MME 550, MgCl2, pH 7, Vapor Diffusion, Hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.189 |
| 7OJ9 NMR solution structure of SNX9 SH3 - EEEV nsP3 peptide complex 提交 2021-05-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–64(64 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] SNX9 SH3, 1 mM EEEV nsP3 peptide, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9R4W Solution NMR structure of SNX9 SH3 in complex with EspF 提交 2025-05-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
1–64(64 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 ambient
NMR样品组成
1.3 mM [U-13C; U-15N] SNX9 SH3, 1.5 mM EspF, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成
1.9 mM SNX9 SH3, 1.5 mM [U-13C; U-15N] EspF, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |