当前蛋白身份:Q9Y5X1 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2RAI The PX-BAR membrane remodeling unit of Sorting Nexin 9 提交 2007-09-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 204–595(392 aa) 片段:C-terminal fragment, residues 214-594
链 B 204–595(392 aa) 片段:C-terminal fragment, residues 214-594
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.3M Ammonium tartrate dibasic, 0.1M BIS-TRIS propane, pH 7.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.20 Å R-free 0.301
2RAJ SO4 bound PX-BAR membrane remodeling unit of Sorting Nexin 9 提交 2007-09-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 204–595(392 aa) 片段:C-terminal fragment, residues 214-594
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.3M Ammonium tartrate dibasic, 0.1M BIS-TRIS propane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.276
2RAK PI(3)P bound PX-BAR membrane remodeling unit of Sorting Nexin 9 提交 2007-09-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 204–595(392 aa) 片段:C-terminal fragment, residues 214-594
未记录 PIB 2-(BUTANOYLOXY)-1-{[(HYDROXY{[2,3,4,6-TETRAHYDROXY-5-(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL)OXY]METHYL}ETHYL BUTANOATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.3M Ammonium tartrate dibasic, 0.1M BIS-TRIS propane, pH 7.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.00 Å R-free 0.293
3DYT Crystal structure of Snx9PX-BAR (230-595), C2221 提交 2008-07-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 230–595(366 aa) 片段:UNP residues 230-595
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293.15 K;1.8M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 5% PEG 400, 0.05M MgSO4, 15% Xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 2.08 Å R-free 0.245
3DYU Crystal structure of Snx9PX-BAR (230-595), H32 提交 2008-07-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 230–595(366 aa) 片段:UNP residues 230-595
链 B 230–595(366 aa) 片段:UNP residues 230-595
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293.15 K;1.8M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 5% PEG 400, 0.05M MgSO4, 15% Xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 4.10 Å R-free 0.403
3DYU Crystal structure of Snx9PX-BAR (230-595), H32 提交 2008-07-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 230–595(366 aa) 片段:UNP residues 230-595
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293.15 K;1.8M Ammonium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 5% PEG 400, 0.05M MgSO4, 15% Xylitol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.15K
分辨率 4.10 Å R-free 0.403
3LGE Crystal structure of rabbit muscle aldolase-SNX9 LC4 complex 提交 2010-01-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 E 152–182(31 aa) 片段:UNP residues 152-182
链 F 152–182(31 aa) 片段:UNP residues 152-182
链 G 152–182(31 aa) 片段:UNP residues 152-182
链 H 152–182(31 aa) 片段:UNP residues 152-182
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;PEG-MME 550, MgCl2, pH 7, Vapor Diffusion, Hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.189
7OJ9 NMR solution structure of SNX9 SH3 - EEEV nsP3 peptide complex 提交 2021-05-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–64(64 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.15;压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] SNX9 SH3, 1 mM EEEV nsP3 peptide, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
9R4W Solution NMR structure of SNX9 SH3 in complex with EspF 提交 2025-05-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–64(64 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)150;压力 ambient
NMR样品组成 1.3 mM [U-13C; U-15N] SNX9 SH3, 1.5 mM EspF, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 1.9 mM SNX9 SH3, 1.5 mM [U-13C; U-15N] EspF, 20 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供