Coagulation factor VIII
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 20–2351 | 未记录 | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CALCIUM ION × 1 COPPER (II) ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取环境条件 | 分辨率 3.56 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 12JV | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 12JP Structural determination of lipid-bound Factor VIII 提交 2026-04-08 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–2351(2332 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.46 Å |
| 1CFG MEMBRANE-BINDING PEPTIDE FROM THE C2 DOMAIN OF FACTOR VIII FORMS AN AMPHIPATHIC STRUCTURE AS DETERMINED BY NMR SPECTROSCOPY 提交 1994-11-10 | 构建体不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2322–2343(22 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1D7P Crystal structure of the c2 domain of human factor viii at 1.5 a resolution at 1.5 A 提交 1999-10-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 M
2190–2348(159 aa)
片段:C2-DOMAIN
|
突变:S2296C | SO4 SULFATE ION × 2 CYS CYSTEINE × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;AMMONIUM SULFATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.215 |
| 1FAC COAGULATION FACTOR VIII, NMR, 1 STRUCTURE 提交 1996-06-30 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2322–2342(21 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4;308.3 K
|
分辨率未提供 |
| 1IQD Human Factor VIII C2 Domain complexed to human monoclonal BO2C11 Fab. 提交 2001-07-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
2193–2348(156 aa)
片段:C-TERMINAL DOMAIN
|
突变:S2296C | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;PEG8000, sodium chloride, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 2R7E Crystal Structure Analysis of Coagulation Factor VIII 提交 2007-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
19–760(742 aa)
片段:residues 19-760
链 B
1582–2351(770 aa)
片段:residues 1582-2351
|
突变:F1838S | CA CALCIUM ION × 3 CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;8-10% PEG 8000, 0.1M Imidazole, 100-300 mM NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.347 |
| 3CDZ Crystal structure of human factor VIII 提交 2008-02-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–759(740 aa)
片段:B-domain deleted (UNP residues 20-764)
链 B
1668–2351(684 aa)
片段:B-domain deleted (UNP residues 1668-2351)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;298 K;100 mM Tris-HCl, 10% EtOH, 7% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.98 Å R-free 0.327 |
| 3HNB Factor VIII Trp2313-His2315 segment is involved in membrane binding as shown by crystal structure of complex between factor VIII C2 domain and an inhibitor 提交 2009-05-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 M
2189–2347(159 aa)
片段:C2 domain of Factor VIIIa light chain, UNP residues 2189-2347
|
未记录 | 768 (2R)-1-(2,4-dichlorophenoxy)-3-[(2E)-2-imino-3-(2-piperidin-1-ylethyl)-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl]propan-2-ol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;2.8M sodium chloride, 0.1M Tris-HCl, 3% glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.15 Å R-free 0.220 |
| 3HNY Factor VIII Trp2313-His2315 segment is involved in membrane binding as shown by crystal structure of complex between factor VIII C2 domain and an inhibitor 提交 2009-06-01 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 M
2189–2347(159 aa)
片段:factor VIII c2 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;2.8M sodium chloride, 0.1M Tris-HCl, 3% glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.201 |
| 3HOB Factor VIII Trp2313-His2315 segment is involved in membrane binding as shown by crystal structure of complex between factor VIII C2 domain and an inhibitor 提交 2009-06-01 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 M
2189–2347(159 aa)
片段:factor VIII c2 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;30.0% PEG 2000, MME 0.15M KBr, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.263 |
| 3HOB Factor VIII Trp2313-His2315 segment is involved in membrane binding as shown by crystal structure of complex between factor VIII C2 domain and an inhibitor 提交 2009-06-01 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2189–2347(159 aa)
片段:factor VIII c2 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;30.0% PEG 2000, MME 0.15M KBr, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.07 Å R-free 0.263 |
| 3J2Q Model of membrane-bound factor VIII organized in 2D crystals 提交 2012-12-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–764(745 aa)
片段:UNP residues 20-764
链 B
1668–2351(684 aa)
片段:UNP residues 1668-2351
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 15.00 Å |
| 3J2S Membrane-bound factor VIII light chain 提交 2012-12-21 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1710–2351(642 aa)
片段:UNP residues 1710-2356
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 5mM CaCl2;pH 7.4;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 5mM CaCl2
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 3.5 seconds before plunging;95 K;冷冻剂 ETHANE;Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (Vitrobot Mark III)
|
分辨率 15.00 Å |
| 4BDV CRYSTAL STRUCTURE OF A TRUNCATED B-DOMAIN HUMAN FACTOR VIII 提交 2012-10-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–769(750 aa)
片段:COAGULATION FACTOR VIII, RESIDUES 20-769,1657-1666
链 A
1657–1666(10 aa)
片段:COAGULATION FACTOR VIII, RESIDUES 20-769,1657-1666
链 B
1667–2351(685 aa)
片段:RESIDUES 1667-2351
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CU1 COPPER (I) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;3% PEG550, 0.100 M NACL, 0.100 M TRIS-HCL PH 7.5, 10% ETHANOL
|
分辨率 3.98 Å R-free 0.246 |
| 4KI5 Cystal structure of human factor VIII C2 domain in a ternary complex with murine inhbitory antibodies 3E6 and G99 提交 2013-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 M
2190–2351(162 aa)
片段:C2 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;28% PEG-1000, 0.15 M sodium acetate, 0.025 M Tris-HCl, 0.05 M NaCl, 0.15 M ammonium nitrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.47 Å R-free 0.238 |
| 4PT6 The discobody: an engineered discoidin domain from factor VIII that binds v 3 integrin with antibody-like affinities 提交 2014-03-10 | 构建体不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2190–2351(162 aa)
片段:unp residues 2190-2351
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.252 |
| 4PT6 The discobody: an engineered discoidin domain from factor VIII that binds v 3 integrin with antibody-like affinities 提交 2014-03-10 | 构建体不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2190–2351(162 aa)
片段:unp residues 2190-2351
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å R-free 0.252 |
| 4XZU Crystal Structure of the Human Factor VIII C2 Domain in Complex with Murine 3E6 Inhibitory Antibody 提交 2015-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 M
2193–2346(154 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;12-18% PEG 8000, MES, 0-200 mM magnesium chloride
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.267 |
| 4XZU Crystal Structure of the Human Factor VIII C2 Domain in Complex with Murine 3E6 Inhibitory Antibody 提交 2015-02-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 G
2193–2346(154 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;12-18% PEG 8000, MES, 0-200 mM magnesium chloride
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.267 |
| 5K8D Crystal structure of rFVIIIFc 提交 2016-05-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–759(740 aa)
链 B
1713–2350(638 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.3;297 K;5% Ethanol, 100mM TRIS pH 7.3
|
分辨率 4.19 Å R-free 0.362 |
| 6MF0 Crystal Structure Determination of Human/Porcine Chimera Coagulation Factor VIII 提交 2018-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–761(375 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 A
2039–2351(313 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 B
387–761(375 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 B
2039–2351(313 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CU1 COPPER (I) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;16% PEG3350, 0.025 M magnesium chloride, 0.025 M HEPES
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 6MF0 Crystal Structure Determination of Human/Porcine Chimera Coagulation Factor VIII 提交 2018-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
387–761(375 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
链 A
2039–2351(313 aa)
片段:UNP residues 1-386 (pig), 387-761 (human), 762-771,1438-1820 (pig), 2039-2351 (human)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CU1 COPPER (I) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;16% PEG3350, 0.025 M magnesium chloride, 0.025 M HEPES
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.287 |
| 6MF2 Improved Model of Human Coagulation Factor VIII 提交 2018-09-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
19–760(742 aa)
片段:UNP residues 19-760,1582-2351
链 A
1582–2351(770 aa)
片段:UNP residues 19-760,1582-2351
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CU1 COPPER (I) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;8-10% PEG8000, 0.1 M imidazole, 100-300 mM sodium chloride
|
分辨率 3.61 Å R-free 0.284 |
| 7K66 Structure of Blood Coagulation Factor VIII in Complex with an Anti-C1 Domain Pathogenic Antibody Inhibitor 提交 2020-09-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
406–761(356 aa)
链 A
2039–2351(313 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.7;293 K;17.5 %(w/v) PEG 1500, 50 mM HEPES (pH 7.7)
|
分辨率 3.92 Å R-free 0.322 |
| 7KBT Factor VIII in complex with the anti-C2 domain antibody, G99 提交 2020-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
387–761(375 aa)
链 A
2039–2351(313 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CU COPPER (II) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;8 - 18% PEG 1500, PEG 6K, or PEG 10K and 50mM malic acid, pH 7.
|
分辨率 4.15 Å R-free 0.338 |
| 8G6I Coagulation factor VIII bound to a patient-derived anti-C1 domain antibody inhibitor 提交 2023-02-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
406–761(356 aa)
链 A
2039–2351(313 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;150 mM NaCl, 20 mM HEPES pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 8TY1 Cryo-EM structure of coagulation factor VIII bound to NB2E9 提交 2023-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
392–771(380 aa)
链 A
2039–2351(313 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;20 mM HEPES (pH 7.4) and 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.46 Å |
| 9D5D Crystal Structure of Blood Coagulation Factor VIII C2 Domain Mutant L2251A/L2252A 提交 2024-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 M
2191–2351(161 aa)
片段:C2 domain (UNP residues 2191-2351)
|
突变:L2251A,L2252A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;4 M potassium formate, 0.1 M Bis-Tris propane, pH 9, 2% w/v PEG2000 MME
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.223 |
| 9JBV Structure of Engineered Coagulation Factor VIII with Enhanced Secretion and Coagulation Potential 提交 2024-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–764(764 aa)
链 A
1659–2351(693 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
共 25 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | FA8_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–2332; UniProt 20–2351 |