SERINE/THREONINE PHOSPHATASE 2B
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–521 | 未记录 | SERINE/THREONINE PHOSPHATASE 2B × 1 (P63098) ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 8% PEG 6000, 0.1M CACL2, 0.1M TES PH 7.5, 1 MM DTT. | 分辨率 2.10 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1AUI | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1M63 Crystal structure of calcineurin-cyclophilin-cyclosporin shows common but distinct recognition of immunophilin-drug complexes 提交 2002-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–372(372 aa)
片段:RESIDUES 1-372
链 E
1–372(372 aa)
片段:RESIDUES 1-372
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;0.1 M NA CACODYLATE, 0.2 M MGCL2, 13% PEG8000, 2.5% ETHANOL, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.322 |
| 1MF8 Crystal Structure of human calcineurin complexed with cyclosporin A and human cyclophilin 提交 2002-08-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
20–392(373 aa)
片段:TRUNCATED FORM (RESIDUES 20-392)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.6;12% PEG 4000, 5MM POTASSIUM PHOSPHATE, 75MM SODIUM CITRATE, 15% GLYCEROL, 5MM TRIS, PH 4.6, MICROBATCH, TEMPERATURE 292K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.300 |
| 2JOG Structure of the calcineurin-NFAT complex 提交 2007-03-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
21–347(327 aa)
片段:residues 21-347
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambient
NMR样品组成
500uM [U-13C; U-15N; U-2H] calcineurin, 0.4-0.6 mM NFAT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300uM calcineurin, 0.3 mM [U-13C; U-15N; U-2H] NFAT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
400uM [2H, FIMY-1H] calcineurin, 0.4 mM [ul-2H15N, Id1LdVg -1H13C] NFAT, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2JZI Structure of Calmodulin complexed with the Calmodulin Binding Domain of Calcineurin 提交 2008-01-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
391–414(24 aa)
片段:UNP residues 391-414, Calmodulin_binding_domain_of_Calcineurin
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;310 K
NMR样品组成
1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin, 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin binding domain of Calcineurin, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2P6B Crystal Structure of Human Calcineurin in Complex with PVIVIT Peptide 提交 2007-03-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
1–380(380 aa)
片段:Residues 1-381
链 C
1–380(380 aa)
片段:Residues 1-381
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;12% PEG 4000, 0.1M calcium chloride, 0.1M TES, 0.001M DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.254 |
| 2R28 The complex Structure of Calmodulin Bound to a Calcineurin Peptide 提交 2007-08-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
389–413(25 aa)
链 D
389–413(25 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.5;298 K;20% PEG 3350, 0.2M ammonium phosphate, 0.1M citrite acid , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.280 |
| 2W73 High-resolution structure of the complex between calmodulin and a peptide from calcineurin A 提交 2008-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 K
395–411(17 aa)
片段:CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
链 L
395–411(17 aa)
片段:CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.45 Å R-free 0.217 |
| 2W73 High-resolution structure of the complex between calmodulin and a peptide from calcineurin A 提交 2008-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 M
395–411(17 aa)
片段:CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
链 O
395–411(17 aa)
片段:CALMODULIN BINDING DOMAIN, RESIDUES 385-411
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.45 Å R-free 0.217 |
| 3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
14–370(357 aa)
片段:UNP residues 14-370
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG 20,000
MgSO4
CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
14–370(357 aa)
片段:UNP residues 14-370
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG 20,000
MgSO4
CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 3LL8 Crystal Structure of Calcineurin in Complex with AKAP79 Peptide 提交 2010-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 A
14–370(357 aa)
片段:UNP residues 14-370
链 C
14–370(357 aa)
片段:UNP residues 14-370
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;PEG 20,000
MgSO4
CaCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 4F0Z Crystal Structure of Calcineurin in Complex with the Calcineurin-Inhibiting Domain of the African Swine Fever Virus Protein A238L 提交 2012-05-05 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
片段:Calcineurin A Subunit
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 8 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;295 K;0.16 M ammonium citrate dibasic, 20% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.178 |
| 4Q5U Structure of calmodulin bound to its recognition site from calcineurin 提交 2014-04-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
391–414(24 aa)
片段:calmodulin-binding domain (UNP residues 391-414)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;3:1 10 mg/ml protein to mother liquor (24% PEG1000, 20% glycerol), final volume 200 nL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.248 |
| 5C1V CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF CATALYTIC SUBUNIT OF HUMAN CALCINEURIN 提交 2015-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–346(345 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2-347
|
突变:YES | FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;0.1 M HEPES, 25% PEG 3350, PH 7.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.249 |
| 5C1V CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF CATALYTIC SUBUNIT OF HUMAN CALCINEURIN 提交 2015-06-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–346(345 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 2-347
|
突变:YES | FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;290 K;0.1 M HEPES, 25% PEG 3350, PH 7.5,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
|
分辨率 3.35 Å R-free 0.249 |
| 5SVE Structure of Calcineurin in complex with NFATc1 LxVP peptide 提交 2016-08-05 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1 M HEPES pH 7.0
15% Peg 4000
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.239 |
| 6NUC Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.194 |
| 6NUF Structure of Calcineurin in complex with NHE1 peptide 提交 2019-01-31 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
|
未记录 | FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.209 |
| 6NUU Structure of Calcineurin mutant in complex with NHE1 peptide 提交 2019-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
|
突变:H155A, Y159A | FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9.5;298 K;40% (v/v) PEG 600, 100 mM CHES/ Sodium hydroxide pH 9.5, 0.2 M MgCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.243 |
| 6UUQ Structure of Calcineurin bound to RCAN1 提交 2019-10-31 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
26–339(314 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;0.1 M Sodium cacodylate, 12% Peg 8000, 0.1 M Calcium acetate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.205 |
| 9B9G Structure of the PI4KA complex bound to Calcineurin 提交 2024-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 I
2–391(390 aa)
链 I
162–391(230 aa)
链 K
2–391(390 aa)
链 K
162–391(230 aa)
|
突变:L236P,D238N 突变:L236P,D238N 突变:L236P,D238N 突变:L236P,D238N | CA CALCIUM ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7;Freshly prepared gel filtration buffer, filtered through 0.22um filter and degassed
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot force -5, blot time 1 s
|
分辨率 3.50 Å |
| 9NXE Crystal Structure of Calcineurin Clinical Variant E282K 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
|
突变:E282K | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 FE FE (III) ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 9;290 K;0.1 M CAPS pH 9, 0.2 M MgCl2 and 24% PEG 600
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.243 |
| 9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
|
突变:D90A | FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.4;298 K;200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding
|
分辨率 3.13 Å R-free 0.295 |
| 9NXF Crystal structure of CN:Tak1 complex 提交 2025-03-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–370(370 aa)
|
突变:D90A | FE FE (III) ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.4;298 K;200 mM Sodium citrate tribasic pH 8.4, 22% PEG 3350, 3% ethanol. Microseeding
|
分辨率 3.13 Å R-free 0.295 |
| 9NXN Crystal structure of CN:RII alpha 提交 2025-03-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–370(370 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;289 K;0.1 M sodium citrate pH 5.0, 0.1 M Magnesium chloride hexahydrate, 15% PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.250 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | P2BA_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–521; UniProt 1–521 |