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THROMBIN INHIBITOR FROM TRIATOMA PALLIDIPENNIS

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 84.0 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

THROMBIN

物种未注明

UniProt P00735

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 H； UniProt 367–625 链 L； UniProt 326–366 未记录 TRIABIN × 1 （Q27049） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；50 MM NA ACETATE, PH 4.6, 100 MM (NH4)2SO4, 16 % PEG 4,000 分辨率 2.60 Å R-free 0.275

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1AVG Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A0H THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF PPACK-MEIZOTHROMBIN DESF1: KRINGLE/THROMBIN AND CARBOHYDRATE/KRINGLE/THROMBIN INTERACTIONS AND LOCATION OF THE LINKER CHAIN 提交 1997-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 208–366（159 aa） 片段：F2/THROMBIN DOMAIN
链 B 367–625（259 aa） 片段：F2/THROMBIN DOMAIN
链 D 208–366（159 aa） 片段：F2/THROMBIN DOMAIN
链 E 367–625（259 aa） 片段：F2/THROMBIN DOMAIN
未记录 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；17 MG/ML PROTEIN, 2% PEG4000, .25 M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 8.0, 33% SATURATED AMMONIUM SULFATE
分辨率 3.20 Å R-free 0.242
1BBR THE STRUCTURE OF RESIDUES 7-16 OF THE A ALPHA CHAIN OF HUMAN FIBRINOGEN BOUND TO BOVINE THROMBIN AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 517–625（109 aa）
链 H 367–516（150 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1BBR THE STRUCTURE OF RESIDUES 7-16 OF THE A ALPHA CHAIN OF HUMAN FIBRINOGEN BOUND TO BOVINE THROMBIN AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-04-27 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 318–366（49 aa）
链 K 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1BBR THE STRUCTURE OF RESIDUES 7-16 OF THE A ALPHA CHAIN OF HUMAN FIBRINOGEN BOUND TO BOVINE THROMBIN AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-04-27 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 318–366（49 aa）
链 N 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1BBR THE STRUCTURE OF RESIDUES 7-16 OF THE A ALPHA CHAIN OF HUMAN FIBRINOGEN BOUND TO BOVINE THROMBIN AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 318–366（49 aa）
链 K 367–625（259 aa）
链 M 318–366（49 aa）
链 N 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1ETR REFINED 2.3 ANGSTROMS X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE THROMBIN COMPLEXES FORMED WITH THE BENZAMIDINE AND ARGININE-BASED THROMBIN INHIBITORS NAPAP, 4-TAPAP AND MQPA: A STARTING POINT FOR IMPROVING ANTITHROMBOTICS 提交 1992-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 MIT amino{[(4S)-5-[(2R,4R)-2-carboxy-4-methylpiperidin-1-yl]-4-({[(3R)-3-methyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolin-8-yl]sulfonyl}amino)-5-oxopentyl]amino}methaniminium × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1ETS REFINED 2.3 ANGSTROMS X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE THROMBIN COMPLEXES FORMED WITH THE BENZAMIDINE AND ARGININE-BASED THROMBIN INHIBITORS NAPAP, 4-TAPAP AND MQPA: A STARTING POINT FOR IMPROVING ANTITHROMBOTICS 提交 1992-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 MID 1-[N-(naphthalen-2-ylsulfonyl)glycyl-4-carbamimidoyl-D-phenylalanyl]piperidine × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1ETT REFINED 2.3 ANGSTROMS X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE THROMBIN COMPLEXES FORMED WITH THE BENZAMIDINE AND ARGININE-BASED THROMBIN INHIBITORS NAPAP, 4-TAPAP AND MQPA: A STARTING POINT FOR IMPROVING ANTITHROMBOTICS 提交 1992-07-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 4QQ 4-[(2S)-2-{[(4-methylphenyl)sulfonyl]amino}-3-oxo-3-(piperidin-1-yl)propyl]benzene-1-carboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HRT THE STRUCTURE OF A COMPLEX OF BOVINE ALPHA-THROMBIN AND RECOMBINANT HIRUDIN AT 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-02-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1ID5 CRYSTAL STRUCTURE OF BOVINE THROMBIN COMPLEX WITH PROTEASE INHIBITOR ECOTIN 提交 2001-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 367–622（256 aa） 片段：THROMBIN HEAVY CHAIN
链 L 318–366（49 aa） 片段：THROMBIN LIGHT CHAIN
未记录 CA CALCIUM ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG6K, Citric Acid, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
1MKW THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；24% POLYETHYLENE GLYCOL 2000, 0.1M SODIUM ACETATE, PH 4.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE
分辨率 2.30 Å R-free 0.282
1MKW THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 318–625（308 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；24% POLYETHYLENE GLYCOL 2000, 0.1M SODIUM ACETATE, PH 4.6, 0.2M AMMONIUM SULFATE
分辨率 2.30 Å R-free 0.282
1MKX THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.8；38% AMMONIUM SULFATE, 0.25M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 5.8, 1% POLYETHYLENE GLYCOL 4000 (DROP ONLY).
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1MKX THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 K 318–625（308 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.8；38% AMMONIUM SULFATE, 0.25M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 5.8, 1% POLYETHYLENE GLYCOL 4000 (DROP ONLY).
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1MKX THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 367–625（259 aa）
链 K 318–625（308 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.8；38% AMMONIUM SULFATE, 0.25M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 5.8, 1% POLYETHYLENE GLYCOL 4000 (DROP ONLY).
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1MKX THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 318–625（308 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.8；38% AMMONIUM SULFATE, 0.25M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 5.8, 1% POLYETHYLENE GLYCOL 4000 (DROP ONLY).
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1MKX THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 367–625（259 aa）
链 K 318–625（308 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.8；38% AMMONIUM SULFATE, 0.25M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 5.8, 1% POLYETHYLENE GLYCOL 4000 (DROP ONLY).
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1MKX THE CO-CRYSTAL STRUCTURE OF UNLIGANDED BOVINE ALPHA-THROMBIN AND PRETHROMBIN-2: MOVEMENT OF THE YPPW SEGMENT AND ACTIVE SITE RESIDUES UPON LIGAND BINDING 提交 1997-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.8；38% AMMONIUM SULFATE, 0.25M AMMONIUM PHOSPHATE, PH 5.8, 1% POLYETHYLENE GLYCOL 4000 (DROP ONLY).
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
1NL1 BOVINE PROTHROMBIN FRAGMENT 1 IN COMPLEX WITH CALCIUM ION 提交 2003-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–190（147 aa） 片段：fragment 1 (residues 1-156)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6；pH 7.6
分辨率 1.90 Å R-free 0.253
1NL2 BOVINE PROTHROMBIN FRAGMENT 1 IN COMPLEX WITH CALCIUM AND LYSOPHOSPHOTIDYLSERINE 提交 2003-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–189（146 aa） 片段：FRAGMENT 1 (residues 1-156)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 7 CL CHLORIDE ION × 3 LPS O-{HYDROXY[((2R)-2-HYDROXY-3-{[(1S)-1-HYDROXYPENTADECYL]OXY}PROPYL)OXY]PHOSPHORYL}-L-SERINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6；pH 7.6
分辨率 2.30 Å R-free 0.274
1TBQ CRYSTAL STRUCTURE OF INSECT DERIVED DOUBLE DOMAIN KAZAL INHIBITOR RHODNIIN IN COMPLEX WITH THROMBIN 提交 1995-03-02 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å
1TBQ CRYSTAL STRUCTURE OF INSECT DERIVED DOUBLE DOMAIN KAZAL INHIBITOR RHODNIIN IN COMPLEX WITH THROMBIN 提交 1995-03-02 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 318–366（49 aa）
链 K 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å
1TBR CRYSTAL STRUCTURE OF INSECT DERIVED DOUBLE DOMAIN KAZAL INHIBITOR RHODNIIN IN COMPLEX WITH THROMBIN 提交 1995-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 367–625（259 aa）
链 J 318–366（49 aa）
链 K 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å R-free 0.263
1TBR CRYSTAL STRUCTURE OF INSECT DERIVED DOUBLE DOMAIN KAZAL INHIBITOR RHODNIIN IN COMPLEX WITH THROMBIN 提交 1995-03-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å R-free 0.263
1TBR CRYSTAL STRUCTURE OF INSECT DERIVED DOUBLE DOMAIN KAZAL INHIBITOR RHODNIIN IN COMPLEX WITH THROMBIN 提交 1995-03-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 318–366（49 aa）
链 K 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.60 Å R-free 0.263
1TOC STRUCTURE OF SERINE PROTEINASE 提交 1996-07-20 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 318–366（49 aa）
链 B 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å
1TOC STRUCTURE OF SERINE PROTEINASE 提交 1996-07-20 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 318–366（49 aa）
链 D 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å
1TOC STRUCTURE OF SERINE PROTEINASE 提交 1996-07-20 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 318–366（49 aa）
链 H 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å
1TOC STRUCTURE OF SERINE PROTEINASE 提交 1996-07-20 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 318–366（49 aa）
链 F 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å
1UCY THROMBIN COMPLEXED WITH FIBRINOPEPTIDE A ALPHA (RESIDUES 7-19). THREE COMPLEXES, ONE WITH EPSILON-THROMBIN AND TWO WITH ALPHA-THROMBIN 提交 1996-08-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 517–625（109 aa）
链 H 367–516（150 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1UCY THROMBIN COMPLEXED WITH FIBRINOPEPTIDE A ALPHA (RESIDUES 7-19). THREE COMPLEXES, ONE WITH EPSILON-THROMBIN AND TWO WITH ALPHA-THROMBIN 提交 1996-08-30 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 J 318–366（49 aa）
链 K 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1UCY THROMBIN COMPLEXED WITH FIBRINOPEPTIDE A ALPHA (RESIDUES 7-19). THREE COMPLEXES, ONE WITH EPSILON-THROMBIN AND TWO WITH ALPHA-THROMBIN 提交 1996-08-30 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 M 318–366（49 aa）
链 N 367–625（259 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1UVT BOVINE THROMBIN--BM14.1248 COMPLEX 提交 1996-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 I48 N-{3-METHYL-5-[2-(PYRIDIN-4-YLAMINO)-ETHOXY]-PHENYL}-BENZENESULFONAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1UVU BOVINE THROMBIN--BM12.1700 COMPLEX 提交 1996-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 DCH 3-(7-DIAMINOMETHYL-NAPHTHALEN-2-YL)-PROPIONIC ACID ETHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1VIT THROMBIN:HIRUDIN 51-65 COMPLEX 提交 1996-01-31 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；HANGING DROP, RESERVOIRS CONTAINING 39% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.25 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 AND 1% PEG4000. DROPS CONSISTED OF EQUAL VOLUMES OF RESERVOIR AND PROTEIN SOLUTION CONTAINING 23.5 MG/ML PROTEIN., vapor diffusion - hanging drop
分辨率 3.20 Å
1VIT THROMBIN:HIRUDIN 51-65 COMPLEX 提交 1996-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 367–516（150 aa）
链 G 517–625（109 aa）
链 M 318–366（49 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；HANGING DROP, RESERVOIRS CONTAINING 39% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 0.25 M AMMONIUM PHOSPHATE PH 8.0 AND 1% PEG4000. DROPS CONSISTED OF EQUAL VOLUMES OF RESERVOIR AND PROTEIN SOLUTION CONTAINING 23.5 MG/ML PROTEIN., vapor diffusion - hanging drop
分辨率 3.20 Å
1YCP THE CRYSTAL STRUCTURE OF FIBRINOGEN-AA PEPTIDE 1-23 (F8Y) BOUND TO BOVINE THROMBIN EXPLAINS WHY THE MUTATION OF PHE-8 TO TYROSINE STRONGLY INHIBITS NORMAL CLEAVAGE AT ARGININE-16 提交 1997-05-01 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 367–625（259 aa）
链 L 318–366（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；2.0M AMMONIUM SULFATE 0.1M HEPES, PH 7.5 2.0% POLYETHYLENE GLYCOL 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
1YCP THE CRYSTAL STRUCTURE OF FIBRINOGEN-AA PEPTIDE 1-23 (F8Y) BOUND TO BOVINE THROMBIN EXPLAINS WHY THE MUTATION OF PHE-8 TO TYROSINE STRONGLY INHIBITS NORMAL CLEAVAGE AT ARGININE-16 提交 1997-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 J 318–366（49 aa）
链 K 367–516（150 aa）
链 M 517–625（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；2.0M AMMONIUM SULFATE 0.1M HEPES, PH 7.5 2.0% POLYETHYLENE GLYCOL 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.245
2A1D Staphylocoagulase bound to bovine thrombin 提交 2005-06-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 326–366（41 aa） 片段：Thrombin light chain
链 B 367–625（259 aa） 片段：Thrombin heavy chain
未记录 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M IMIDAZOLE, 0.2M AMMONIUM FORMATE, 12% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
2A1D Staphylocoagulase bound to bovine thrombin 提交 2005-06-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 326–366（41 aa） 片段：Thrombin light chain
链 F 367–625（259 aa） 片段：Thrombin heavy chain
未记录 0G6 D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1M IMIDAZOLE, 0.2M AMMONIUM FORMATE, 12% POLYETHYLENE GLYCOL 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.306
2HPP Structures of the noncovalent complexes of human and bovine prothrombin fragment 2 with human ppack-thrombin 提交 1993-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 214–292（79 aa） 片段：UNP residues 214-292
未记录 0G7 D-phenylalanyl-N-[(3S)-6-carbamimidamido-1-chloro-2-oxohexan-3-yl]-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.30 Å
2ODY Thrombin-bound boophilin displays a functional and accessible reactive-site loop 提交 2006-12-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 318–366（49 aa） 片段：Thrombin light chain, residues 318-366
链 B 367–625（259 aa） 片段：Thrombin heavy chain, residues 367-625
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；279 K；18% PEG 8000, 0.05M Potassium phosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 279K
分辨率 2.35 Å R-free 0.230
2ODY Thrombin-bound boophilin displays a functional and accessible reactive-site loop 提交 2006-12-27 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 318–366（49 aa） 片段：Thrombin light chain, residues 318-366
链 D 367–625（259 aa） 片段：Thrombin heavy chain, residues 367-625
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；279 K；18% PEG 8000, 0.05M Potassium phosphate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 279K
分辨率 2.35 Å R-free 0.230
2PF1 STRUCTURE OF BOVINE PROTHROMBIN FRAGMENT 1 REFINED AT 2.25 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–199（156 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
2PF2 THE CA+2 ION AND MEMBRANE BINDING STRUCTURE OF THE GLA DOMAIN OF CA-PROTHROMBIN FRAGMENT 1 提交 1991-12-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–199（156 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CA CALCIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
2SPT DIFFERENCES IN THE METAL ION STRUCTURE BETWEEN SR-AND CA-PROTHROMBIN FRAGMENT 1 提交 1994-02-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 44–188（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SR STRONTIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
3PMA 2.2 Angstrom crystal structure of the complex between Bovine Thrombin and Sucrose Octasulfate 提交 2010-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 B 367–625（259 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；3 microliters Bovine thrombin, 7 mg/ml in 0.01M Tris-HCl, ph 8.0, 0.05M NaCl, 0.1M sodium citrate, 20% w/v, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
3PMA 2.2 Angstrom crystal structure of the complex between Bovine Thrombin and Sucrose Octasulfate 提交 2010-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 D 367–625（259 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；3 microliters Bovine thrombin, 7 mg/ml in 0.01M Tris-HCl, ph 8.0, 0.05M NaCl, 0.1M sodium citrate, 20% w/v, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
3PMA 2.2 Angstrom crystal structure of the complex between Bovine Thrombin and Sucrose Octasulfate 提交 2010-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 B 367–625（259 aa）
链 C 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 D 367–625（259 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 4 CIT CITRIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；3 microliters Bovine thrombin, 7 mg/ml in 0.01M Tris-HCl, ph 8.0, 0.05M NaCl, 0.1M sodium citrate, 20% w/v, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
3PMA 2.2 Angstrom crystal structure of the complex between Bovine Thrombin and Sucrose Octasulfate 提交 2010-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 B 367–625（259 aa）
链 C 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 D 367–625（259 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 2 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；3 microliters Bovine thrombin, 7 mg/ml in 0.01M Tris-HCl, ph 8.0, 0.05M NaCl, 0.1M sodium citrate, 20% w/v, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.245
3PMB 2.9 Angstrom crystal structure of bovine thrombin in tetragonal spacegroup 提交 2010-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 B 367–625（259 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；3 microliters Bovine thrombin, 7 mg/ml in 0.01M Tris-HCl, ph 8.0, 0.05M NaCl, 0.1M sodium citrate, 20% w/v PEG3350, 15% v/v 2-propanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
3PMB 2.9 Angstrom crystal structure of bovine thrombin in tetragonal spacegroup 提交 2010-11-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 336–364（29 aa） 片段：Bovine Thrombin Light Chain residues 336-364
链 D 367–625（259 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；295 K；3 microliters Bovine thrombin, 7 mg/ml in 0.01M Tris-HCl, ph 8.0, 0.05M NaCl, 0.1M sodium citrate, 20% w/v PEG3350, 15% v/v 2-propanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.301
7A0D The Crystal Structure of Bovine Thrombin in complex with Hirudin (C16U/C28U) at 1.6 Angstroms Resolution 提交 2020-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 HHH 367–625（259 aa）
链 LLL 318–366（49 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；297 K；38% PEG 4000, 0.1 M sodium phosphate (pH= 4.7), 0.2 M NaCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.215
7A0E The Crystal Structure of Bovine Thrombin in complex with Hirudin (C6U/C14U) at 1.9 Angstroms Resolution 提交 2020-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 HHH 367–625（259 aa）
链 LLL 318–366（49 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；297 K；38% PEG 4000, 0.1 M sodium phosphate (pH= 4.7), and 0.2 M NaCl
分辨率 1.90 Å R-free 0.263
7A0F The Crystal Structure of Bovine Thrombin in complex with Hirudin (C22U/C39U) at 2.7 Angstroms Resolution 提交 2020-08-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 HHH 367–625（259 aa）
链 LLL 318–366（49 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.7；297 K；38% PEG 4000, 0.1 M sodium phosphate (pH= 4.7), 0.3 M NaCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.253

共 30 个其他 PDB 条目、55 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THRB_BOVIN
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 14–41； UniProt 326–366 作者链 H； PDB构建体 1–259； UniProt 367–625

TRIABIN

Triatoma pallidipennis

UniProt Q27049

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 19–160 未记录 THROMBIN × 1 （P00735） THROMBIN × 1 （P00735） X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 4.6；50 MM NA ACETATE, PH 4.6, 100 MM (NH4)2SO4, 16 % PEG 4,000 分辨率 2.60 Å R-free 0.275

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TRIA_TRIPA
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–142； UniProt 19–160

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1avg

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1avg
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1avg
沉积日期 deposition_date1997-09-16
结构标题 titleTHROMBIN INHIBITOR FROM TRIATOMA PALLIDIPENNIS
关键词 keywordsBOVINE THROMBIN, THROMBIN INHIBITOR, COMPLEX (BLOOD COAGULATION-INHIBITOR), COMPLEX (BLOOD COAGULATION-INHIBITOR) complex; COMPLEX (BLOOD COAGULATION/INHIBITOR)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron23.97 Å
零角强度 I(0) i043170600.00
分子量 molecular_weight50536.0 kDa
排除体积 excluded_volume63082 ų
包络体积 envelope_volume75615 ų
水化壳体积 shell_volume26682 ų
包络直径 envelope_diameter89.6 Å
壳层 Rg shell_rg30.88 Å
包络 Rg envelope_rg24.25 Å
形状 Rg shape_rg23.96 Å
总 Rg total_rg24.80 Å
总原子数 total_atoms3559
残基数 n_residues442
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax84.0 Å
Rg (实空间) rg_real25.03 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.67 Å
I(0) (实空间) i0_real4.3170e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.2740e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal43170000.0000
解质量估计 total_estimate0.6054
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary26.7 Å
偏度 Skewness skewness0.413
峰度 Kurtosis kurtosis-0.316
角度范围 angular_range— – 0.3200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha11500000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.797; Stabil: 0.994; Sysdev: 0.184; Positv: 1.000; Valcen: 0.942; Smooth: 0.000
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1avg.1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.2 — Eukaryotic proteases
结构域编号 domain_idd1avgi_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.60 — Lipocalins
超家族 Superfamily superfamilyb.60.1 — Lipocalins
家族 Family familyb.60.1.3 — Thrombin inhibitor

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1avgH01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id1avgH02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id1avgI00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology128 — Lipocalin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Calycin beta-barrel core domain
结构域编号 domain_id1avgL00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology140 — Epsilon-Thrombin; Chain L
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thrombin light chain domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)