TROPONIN C
Gallus gallus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–90 | 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1 - 90 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;72 % AMMONIUM SULFATE 100 MM TRIS 2 % MPD, 5 MM CALCIUM CHLORIDE PH 7.5 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.250 |
| 2 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 B; UniProt 1–90 | 片段:N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 1 - 90 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;72 % AMMONIUM SULFATE 100 MM TRIS 2 % MPD, 5 MM CALCIUM CHLORIDE PH 7.5 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.250 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1AVS | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BLQ STRUCTURE AND INTERACTION SITE OF THE REGULATORY DOMAIN OF TROPONIN-C WHEN COMPLEXED WITH THE 96-148 REGION OF TROPONIN-I, NMR, 29 STRUCTURES 提交 1998-07-19 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–90(90 aa)
片段:REGULATORY
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.85;303 K;离子强度(mmCIF原始值)100 mM KCL;压力 1
NMR样品组成
H2O
|
分辨率未提供 |
| 1CTA DETERMINATION OF THE SOLUTION STRUCTURE OF A SYNTHETIC TWO-SITE CALCIUM-BINDING HOMODIMERIC PROTEIN DOMAIN BY NMR SPECTROSCOPY 提交 1992-11-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
93–126(34 aa)
链 B
93–126(34 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1CTD DETERMINATION OF THE SOLUTION STRUCTURE OF A SYNTHETIC TWO-SITE CALCIUM-BINDING HOMODIMERIC PROTEIN DOMAIN BY NMR SPECTROSCOPY 提交 1992-11-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
93–126(34 aa)
链 B
93–126(34 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1JC2 COMPLEX OF THE C-DOMAIN OF TROPONIN C WITH RESIDUES 1-40 OF TROPONIN I 提交 2001-06-07 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
89–163(75 aa)
片段:residues 89-163 of GB entry 212778
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 ambiant
NMR样品组成
~1.3 mM C-domain of Sqeletal Troponin C, 1.9 mM of TnI peptide (residues 1-40), 100 mM KCl, 10 mM Imidazole, 1 mM DSS | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1NCX TROPONIN C 提交 1996-06-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–162(162 aa)
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1NCY TROPONIN-C, COMPLEX WITH MANGANESE 提交 1996-06-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–162(162 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.10 Å |
| 1NCZ TROPONIN C 提交 1996-06-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–162(162 aa)
|
未记录 | TB TERBIUM(III) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 1NPQ structure of a rhodamine-labeled N-domain Troponin C mutant (Ca2+ saturated) in complex with skeletal Troponin I 115-131 提交 2003-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–90(90 aa)
片段:TnC, residues 1-90
|
突变:E56C, E63C | CA CALCIUM ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)320 mM KCl;压力 ambiant
NMR样品组成
320 mM KCl, 10 mM imidazole, 1.3% NaN3, pH 6.5, ~1mM sNTnC.2Ca2+.TnI115-131.BR56-63 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1PON SITE III-SITE IV TROPONIN C HETERODIMER, NMR 提交 1996-04-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
93–126(34 aa)
片段:SITE III AND IV
链 B
129–162(34 aa)
片段:SITE III AND IV
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1SKT SOLUTION STRUCTURE OF APO N-DOMAIN OF TROPONIN C, NMR, 40 STRUCTURES 提交 1998-04-06 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–90(90 aa)
片段:N-DOMAIN, RESIDUES 1-90
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.7;277 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM KCL;压力 1
NMR样品组成
WATER
|
分辨率未提供 |
| 1SMG CALCIUM-BOUND E41A MUTANT OF THE N-DOMAIN OF CHICKEN TROPONIN C, NMR, 40 STRUCTURES 提交 1997-02-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–90(90 aa)
片段:N-DOMAIN
|
突变:E41A | CA CALCIUM ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.7;303.15 K
|
分辨率未提供 |
| 1TNP STRUCTURES OF THE APO AND CALCIUM TROPONIN-C REGULATORY DOMAINS: THE MUSCLE CONTRACTION SWITCH 提交 1995-07-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–90(90 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1TNQ STRUCTURES OF THE APO AND CALCIUM TROPONIN-C REGULATORY DOMAINS: THE MUSCLE CONTRACTION SWITCH 提交 1995-07-07 | 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–90(90 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1TNW NMR SOLUTION STRUCTURE OF CALCIUM SATURATED SKELETAL MUSCLE TROPONIN C 提交 1995-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–163(162 aa)
|
突变:T130I | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1TNX NMR SOLUTION STRUCTURE OF CALCIUM SATURATED SKELETAL MUSCLE TROPONIN C 提交 1995-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–163(162 aa)
|
突变:T130I | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1TOP STRUCTURE OF CHICKEN SKELETAL MUSCLE TROPONIN-C AT 1.78 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-08-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–162(162 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.78 Å |
| 1YTZ Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-activated state 提交 2005-02-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
1–162(162 aa)
|
未记录 | DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 3 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.338 |
| 1YTZ Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-activated state 提交 2005-02-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–162(162 aa)
|
未记录 | DR6 ALPHA-[4-(1,1,3,3 - TETRAMETHYLBUTYL)PHENYL]-OMEGA-HYDROXY-POLY(OXY-1,2-ETHANEDIYL) × 6 CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;0.4 M NaH2PO4/1.6 M K2HPO4, 200 mM NaCl, 0.1 M immidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.338 |
| 1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 7.00 Å R-free 0.359 |
| 1YV0 Crystal structure of skeletal muscle troponin in the Ca2+-free state 提交 2005-02-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–162(162 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;1.6 M tri-Sodium Citrate dihydrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 7.00 Å R-free 0.359 |
| 1ZAC N-DOMAIN OF TROPONIN C FROM CHICKEN SKELETAL MUSCLE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-04-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–90(90 aa)
片段:N-DOMAIN, RESIDUES 1-90
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.7;277 K;离子强度(mmCIF原始值)50mM KCL;压力 1
NMR样品组成
WATER
|
分辨率未提供 |
| 2W49 ISOMETRICALLY CONTRACTING INSECT ASYNCHRONOUS FLIGHT MUSCLE 提交 2008-11-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric |
链 0
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
链 3
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
链 6
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
链 9
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS;20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 HELIUM;SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR
|
分辨率 35.00 Å |
| 2W4U Isometrically contracting insect asynchronous flight muscle quick frozen after a length step 提交 2008-12-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric |
链 0
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
链 3
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
链 6
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
链 9
5–163(159 aa)
片段:RESIDUES 5-163
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS;20 MM MOPS BUFFER, 5 MM NAN3, AND MGCL2, ATP, CACL2, AND EGTA IN VARYING MILLIMOLAR CONCENTRATIONS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 HELIUM;SMASH AGAINST A LIQUID HELIUM COOLED GOLD COATED COPPER MIRROR
|
分辨率 35.00 Å |
| 4TNC REFINED STRUCTURE OF CHICKEN SKELETAL MUSCLE TROPONIN C IN THE TWO-CALCIUM STATE AT 2-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1987-09-28 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–162(161 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
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| UniProt名称 | TNNC2_CHICK |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–90; UniProt 1–90 作者链 B; PDB构建体 1–90; UniProt 1–90 |