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1bkc

CATALYTIC DOMAIN OF TNF-ALPHA CONVERTING ENZYME (TACE)

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 135.0 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TUMOR NECROSIS FACTOR-ALPHA-CONVERTING ENZYME

Homo sapiens

UniProt P78536

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 219–474 突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.4；pH 5.4 分辨率 2.00 Å R-free 0.270
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 219–474 突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.4；pH 5.4 分辨率 2.00 Å R-free 0.270
3 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 219–474 突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.4；pH 5.4 分辨率 2.00 Å R-free 0.270
4 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 I； UniProt 219–474 突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 5.4；pH 5.4 分辨率 2.00 Å R-free 0.270

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1BKC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1ZXC Crystal structure of catalytic domain of TNF-alpha converting enzyme (TACE) with inhibitor 提交 2005-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–477（263 aa）
突变：yes ZN ZINC ION × 1 IH6 (3S)-4-{[4-(BUT-2-YNYLOXY)PHENYL]SULFONYL}-N-HYDROXY-2,2-DIMETHYLTHIOMORPHOLINE-3-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG 4000, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.28 Å R-free 0.285
1ZXC Crystal structure of catalytic domain of TNF-alpha converting enzyme (TACE) with inhibitor 提交 2005-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–477（263 aa）
突变：yes ZN ZINC ION × 1 IH6 (3S)-4-{[4-(BUT-2-YNYLOXY)PHENYL]SULFONYL}-N-HYDROXY-2,2-DIMETHYLTHIOMORPHOLINE-3-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG 4000, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.28 Å R-free 0.285
2A8H Crystal structure of catalytic domain of TACE with Thiomorpholine Sulfonamide Hydroxamate inhibitor 提交 2005-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–477（263 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 4NH 4-({4-[(4-AMINOBUT-2-YNYL)OXY]PHENYL}SULFONYL)-N-HYDROXY-2,2-DIMETHYLTHIOMORPHOLINE-3-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG 4000, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.30 Å R-free 0.281
2A8H Crystal structure of catalytic domain of TACE with Thiomorpholine Sulfonamide Hydroxamate inhibitor 提交 2005-07-08 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–477（263 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 4NH 4-({4-[(4-AMINOBUT-2-YNYL)OXY]PHENYL}SULFONYL)-N-HYDROXY-2,2-DIMETHYLTHIOMORPHOLINE-3-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG 4000, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.30 Å R-free 0.281
2DDF Crystal structure of TACE in complex with TAPI-2 提交 2006-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 218–474（257 aa）
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM CITRATE BUFFER , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.230
2DDF Crystal structure of TACE in complex with TAPI-2 提交 2006-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 218–474（257 aa）
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 3 IMD IMIDAZOLE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM CITRATE BUFFER , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.70 Å R-free 0.230
2FV5 Crystal structure of TACE in complex with IK682 提交 2006-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 216–475（260 aa）
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 541 (2R)-N-HYDROXY-2-[(3S)-3-METHYL-3-{4-[(2-METHYLQUINOLIN-4-YL)METHOXY]PHENYL}-2-OXOPYRROLIDIN-1-YL]PROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.10 Å R-free 0.256
2FV5 Crystal structure of TACE in complex with IK682 提交 2006-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 216–475（260 aa）
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 541 (2R)-N-HYDROXY-2-[(3S)-3-METHYL-3-{4-[(2-METHYLQUINOLIN-4-YL)METHOXY]PHENYL}-2-OXOPYRROLIDIN-1-YL]PROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.10 Å R-free 0.256
2FV9 Crystal structure of TACE in complex with JMV 390-1 提交 2006-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 218–475（258 aa）
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6k, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 2.02 Å R-free 0.264
2FV9 Crystal structure of TACE in complex with JMV 390-1 提交 2006-01-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 218–475（258 aa）
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 002 N-[(2R)-2-BENZYL-4-(HYDROXYAMINO)-4-OXOBUTANOYL]-L-ISOLEUCYL-L-LEUCINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6k, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 2.02 Å R-free 0.264
2I47 Crystal structure of catalytic domain of TACE with inhibitor 提交 2006-08-21 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；20% PEG4000, 20% isopropanol, 0.1M sodium Citrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.227
2I47 Crystal structure of catalytic domain of TACE with inhibitor 提交 2006-08-21 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；20% PEG4000, 20% isopropanol, 0.1M sodium Citrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.227
2I47 Crystal structure of catalytic domain of TACE with inhibitor 提交 2006-08-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 KGY 4-({[4-(BUT-2-YN-1-YLOXY)PHENYL]SULFONYL}METHYL)-1-[(3,5-DIMETHYLISOXAZOL-4-YL)SULFONYL]-N-HYDROXYPIPERIDINE-4-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；20% PEG4000, 20% isopropanol, 0.1M sodium Citrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.227
2I47 Crystal structure of catalytic domain of TACE with inhibitor 提交 2006-08-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 KGY 4-({[4-(BUT-2-YN-1-YLOXY)PHENYL]SULFONYL}METHYL)-1-[(3,5-DIMETHYLISOXAZOL-4-YL)SULFONYL]-N-HYDROXYPIPERIDINE-4-CARBOXAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；20% PEG4000, 20% isopropanol, 0.1M sodium Citrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 1.90 Å R-free 0.227
2M2F The membran-proximal domain of ADAM17 提交 2012-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 581–642（62 aa） 片段：UNP residues 581-642
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2OI0 Crystal structure analysis 0f the TNF-a Coverting Enzyme (TACE) in complexed with Aryl-sulfonamide 提交 2007-01-10 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 216–477（262 aa） 片段：TACE Proteinase domain (Residues 216-477)
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 283 (3S)-1-{[4-(BUT-2-YN-1-YLOXY)PHENYL]SULFONYL}PYRROLIDINE-3-THIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；30% PGME 550, 0.1M BIS-TRIS, 50 mM CaCl2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.268
3B92 Novel thio-based TACE inhibitors Part 2: Rational design, synthesis and SAR of thiol-contaning aryl sufones 提交 2007-11-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 216–474（259 aa） 片段：TACE proteinase domain, UNP residues 216-474
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 2 440 3-{[4-(but-2-yn-1-yloxy)phenyl]sulfonyl}propane-1-thiol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；30% PEGMME 550, 0.1M BIS-TRIS, 50mM CaCl2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.280
3CKI Crystal structure of the TACE-N-TIMP-3 complex 提交 2008-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 219–474（256 aa） 片段：TACE catalytic domain (UNP RESIDUES 219-474)
突变：S266A, N452Q ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.5；309 K；100 mM sodium acetate/acetic acid, 25% polyethylene glycol 3,350, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 309K
分辨率 2.30 Å R-free 0.284
3E8R Crystal structure of catalytic domain of TACE with hydroxamate inhibitor 提交 2008-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–477（263 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 215-477
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 615 (1R,2S)-N~2~-hydroxy-1-{4-[(2-phenylquinolin-4-yl)methoxy]benzyl}cyclopropane-1,2-dicarboxamide × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100mM sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3E8R Crystal structure of catalytic domain of TACE with hydroxamate inhibitor 提交 2008-08-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–477（263 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 215-477
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 615 (1R,2S)-N~2~-hydroxy-1-{4-[(2-phenylquinolin-4-yl)methoxy]benzyl}cyclopropane-1,2-dicarboxamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100mM sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3EDZ Crystal structure of catalytic domain of TACE with hydroxamate inhibitor 提交 2008-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–477（263 aa） 片段：UNP residues 215-477
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.204
3EDZ Crystal structure of catalytic domain of TACE with hydroxamate inhibitor 提交 2008-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–477（263 aa） 片段：UNP residues 215-477
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 CIT CITRIC ACID × 1 550 methyl (1R,2S)-2-(hydroxycarbamoyl)-1-{4-[(2-methylquinolin-4-yl)methoxy]benzyl}cyclopropanecarboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.204
3EWJ Crystal structure of catalytic domain of TACE with carboxylate inhibitor 提交 2008-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–477（263 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 215-477
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.210
3EWJ Crystal structure of catalytic domain of TACE with carboxylate inhibitor 提交 2008-10-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–477（263 aa） 片段：catalytic domain, UNP residues 215-477
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 642 (1S,3R,6S)-4-oxo-6-{4-[(2-phenylquinolin-4-yl)methoxy]phenyl}-5-azaspiro[2.4]heptane-1-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.210
3G42 Crystal Structure of TACE with Tryptophan Sulfonamide Derivative Inhibitor 提交 2009-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q 792 N-{[4-(but-2-yn-1-yloxy)phenyl]sulfonyl}-5-methyl-D-tryptophan × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG4k, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
3G42 Crystal Structure of TACE with Tryptophan Sulfonamide Derivative Inhibitor 提交 2009-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q 792 N-{[4-(but-2-yn-1-yloxy)phenyl]sulfonyl}-5-methyl-D-tryptophan × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG4k, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
3G42 Crystal Structure of TACE with Tryptophan Sulfonamide Derivative Inhibitor 提交 2009-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q 792 N-{[4-(but-2-yn-1-yloxy)phenyl]sulfonyl}-5-methyl-D-tryptophan × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG4k, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
3G42 Crystal Structure of TACE with Tryptophan Sulfonamide Derivative Inhibitor 提交 2009-02-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 212–492（281 aa） 片段：catalytic domain
突变：S266A, N452Q 792 N-{[4-(but-2-yn-1-yloxy)phenyl]sulfonyl}-5-methyl-D-tryptophan × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；292 K；PEG4k, isopropanol, NaCitrate, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
3KMC Crystal structure of catalytic domain of TACE with tartrate-based inhibitor 提交 2009-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.80 Å R-free 0.259
3KMC Crystal structure of catalytic domain of TACE with tartrate-based inhibitor 提交 2009-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 403 (2R,3R)-4-[4-(2-chlorophenyl)piperazin-1-yl]-2,3-dihydroxy-4-oxo-N-(2-thiophen-2-ylethyl)butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.80 Å R-free 0.259
3KME Crystal structure of catalytic domain of TACE with phenyl-pyrrolidinyl-tartrate inhibitor 提交 2009-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
3KME Crystal structure of catalytic domain of TACE with phenyl-pyrrolidinyl-tartrate inhibitor 提交 2009-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, Q452N ZN ZINC ION × 1 Z59 (2R,3R)-2,3-dihydroxy-4-oxo-4-[(2R)-2-phenylpyrrolidin-1-yl]-N-(thiophen-2-ylmethyl)butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6000, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
3L0T Crystal structure of catalytic domain of TACE with hydantoin inhibitor 提交 2009-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6k, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.92 Å R-free 0.239
3L0T Crystal structure of catalytic domain of TACE with hydantoin inhibitor 提交 2009-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 Z94 N-{4-[(4S)-2,5-dioxoimidazolidin-4-yl]phenyl}acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6k, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.92 Å R-free 0.239
3L0V Crystal structure of catalytic domain of TACE with the first hydantoin inhibitor occupying the S1' pocket 提交 2009-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 724 (5R)-5-[(5-methoxy-3-oxo-1,3-dihydro-2H-indazol-2-yl)methyl]-5-methylimidazolidine-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6k, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.75 Å R-free 0.208
3L0V Crystal structure of catalytic domain of TACE with the first hydantoin inhibitor occupying the S1' pocket 提交 2009-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 724 (5R)-5-[(5-methoxy-3-oxo-1,3-dihydro-2H-indazol-2-yl)methyl]-5-methylimidazolidine-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6k, 10% 2-Propanol, 100 mM sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.75 Å R-free 0.208
3LE9 Crystal structure of the catalytic domain of TACE with Indazolinone-phenyl-hydantoin inhibitor 提交 2010-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 727 (5R)-5-[(5-methoxy-3-oxo-1,3-dihydro-2H-indazol-2-yl)methyl]-5-phenylimidazolidine-2,4-dione × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.85 Å R-free 0.230
3LE9 Crystal structure of the catalytic domain of TACE with Indazolinone-phenyl-hydantoin inhibitor 提交 2010-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 727 (5R)-5-[(5-methoxy-3-oxo-1,3-dihydro-2H-indazol-2-yl)methyl]-5-phenylimidazolidine-2,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM CITRATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.85 Å R-free 0.230
3LEA Crystal structure of the catalytic domain of TACE with Isoindolinone-biphenyl-hydantoin inhibitor 提交 2010-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q Z93 2-{[(4R)-2,5-dioxo-4-(4-pyridin-3-ylphenyl)imidazolidin-4-yl]methyl}-6-methoxy-1-oxo-1H-isoindolium × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM ACETATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
3LEA Crystal structure of the catalytic domain of TACE with Isoindolinone-biphenyl-hydantoin inhibitor 提交 2010-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa） 片段：residues 215-476
突变：S266A, V353G, N452Q Z93 2-{[(4R)-2,5-dioxo-4-(4-pyridin-3-ylphenyl)imidazolidin-4-yl]methyl}-6-methoxy-1-oxo-1H-isoindolium × 1 ZN ZINC ION × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM ACETATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.00 Å R-free 0.219
3LGP Crystal structure of catalytic domain of tace with benzimidazolyl-thienyl-tartrate based inhibitor 提交 2010-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa）
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 50X (2R,3R)-4-[(2R)-2-(3-chlorophenyl)pyrrolidin-1-yl]-2,3-dihydroxy-4-oxo-N-[(5-{[2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-1-yl]methyl}thiophen-2-yl)methyl]butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM ACETATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.244
3LGP Crystal structure of catalytic domain of tace with benzimidazolyl-thienyl-tartrate based inhibitor 提交 2010-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa）
突变：S266A, V353G, N452Q ZN ZINC ION × 1 50X (2R,3R)-4-[(2R)-2-(3-chlorophenyl)pyrrolidin-1-yl]-2,3-dihydroxy-4-oxo-N-[(5-{[2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-1-yl]methyl}thiophen-2-yl)methyl]butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-PROPANOL, 100 MM SODIUM ACETATE, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.90 Å R-free 0.244
3O64 Crystal structure of catalytic domain of TACE with 2-(2-Aminothiazol-4-yl)pyrrolidine-Based Tartrate Diamides 提交 2010-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 215–476（262 aa） 片段：TACE
突变：S266A, V353G, N452Q IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 INN N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-3-methyl-L-valyl-N-(2-aminoethyl)-L-alaninamide × 1 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-Propanol, 100mM Sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.88 Å R-free 0.218
3O64 Crystal structure of catalytic domain of TACE with 2-(2-Aminothiazol-4-yl)pyrrolidine-Based Tartrate Diamides 提交 2010-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 215–476（262 aa） 片段：TACE
突变：S266A, V353G, N452Q IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 ZN ZINC ION × 1 786 (2R,3R)-2,3-dihydroxy-4-{(2R)-2-[2-(methylamino)-5-(methylsulfonyl)-1,3-thiazol-4-yl]pyrrolidin-1-yl}-4-oxo-N-{(1R)-1-[4-(1H-pyrazol-1-yl)phenyl]ethyl}butanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；295 K；15% PEG 6K, 10% 2-Propanol, 100mM Sodium citrate buffer, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.88 Å R-free 0.218
8CQY Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the PBM TACE C-terminal peptide 提交 2023-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 813–824（12 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；20% w/v PEG 3350, 0.2 M NaSCN at pH 7
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
8SNL Structure of human ADAM17/iRhom2 sheddase complex 提交 2023-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–824（824 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
8SNM Structure of mature human ADAM17/iRhom2 sheddase complex in complex with ADAM17 prodomain 提交 2023-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–214（214 aa）
链 B 215–824（610 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
8SNN Structure of mature human ADAM17/iRhom2 sheddase complex, conformation 1 提交 2023-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 215–824（610 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.32 Å
8SNO Structure of mature human ADAM17/iRhom2 sheddase complex, conformation 2 提交 2023-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 215–824（610 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9E6K Fully human monoclonal antibody targeting the cysteine-rich substrate-interacting region of ADAM17 on cancer cells. 提交 2024-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 530–644（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.15 Å
9O54 ADAM17 Prodomain-Metalloproteinase Domains bound to MEDI3622 Fab 提交 2025-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–477（477 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9O58 Zymogen ADAM17-iRhom2 complex bound by the MEDI3622 Fab 提交 2025-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 28–824（797 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
9Q7Y Zymogen ADAM17- iRhom1 Cytoplasmic Deletion (365) Complex Bound by the MEDI3622 Fab 提交 2025-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 28–698（671 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9XY4 Zymogen ADAM17- iRhom1 Cytoplasmic Deletion (370) Complex Bound by the MEDI3622 Fab 提交 2025-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 28–698（671 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.12 Å

共 32 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ADA17_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1, 2, 3
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–256； UniProt 219–474 作者链 C； PDB构建体 1–256； UniProt 219–474 作者链 E； PDB构建体 1–256； UniProt 219–474 作者链 I； PDB构建体 1–256； UniProt 219–474

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bkc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bkc
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bkc
沉积日期 deposition_date1998-04-23
结构标题 titleCATALYTIC DOMAIN OF TNF-ALPHA CONVERTING ENZYME (TACE)
关键词 keywordsZN-ENDOPEPTIDASE, HYDROLASE, TNF-ALPHA; ZN-ENDOPEPTIDASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier38.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron38.85 Å
零角强度 I(0) i0219352000.00
分子量 molecular_weight116900.0 kDa
排除体积 excluded_volume144900 ų
包络体积 envelope_volume200090 ų
水化壳体积 shell_volume44691 ų
包络直径 envelope_diameter139.1 Å
壳层 Rg shell_rg42.70 Å
包络 Rg envelope_rg37.96 Å
形状 Rg shape_rg38.84 Å
总 Rg total_rg39.10 Å
总原子数 total_atoms8202
残基数 n_residues1019
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax135.0 Å
Rg (实空间) rg_real39.15 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.24 Å
I(0) (实空间) i0_real2.1940e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.8020e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal39.06 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal219300000.0000
解质量估计 total_estimate0.8511
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary52.7 Å
偏度 Skewness skewness0.398
峰度 Kurtosis kurtosis-0.195
角度范围 angular_range— – 0.2050 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha22130000.0000
实空间数据点数 n_real_points42
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.777; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.945; Smooth: 0.783
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1bkca_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.10 — TNF-alpha converting enzyme, TACE, catalytic domain
结构域编号 domain_idd1bkcc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.10 — TNF-alpha converting enzyme, TACE, catalytic domain
结构域编号 domain_idd1bkce_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.10 — TNF-alpha converting enzyme, TACE, catalytic domain
结构域编号 domain_idd1bkci_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family familyd.92.1.10 — TNF-alpha converting enzyme, TACE, catalytic domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1bkcA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Collagenase (Catalytic Domain)
结构域编号 domain_id1bkcC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Collagenase (Catalytic Domain)
结构域编号 domain_id1bkcE00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Collagenase (Catalytic Domain)
结构域编号 domain_id1bkcI00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Collagenase (Catalytic Domain)
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)