SAXSdb — 1bon

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-2

Bombyx mori

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 70–89	未记录	BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-6 × 1 （P26729）	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1BON	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BOM THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF BOMBYXIN-II, AN INSULIN-RELATED BRAIN-SECRETORY PEPTIDE OF THE SILKMOTH BOMBYX MORI: COMPARISON WITH INSULIN AND RELAXIN 提交 1994-07-21	当前字段一致	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 70–89（20 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BXA2_BOMMO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–20； UniProt 70–89

BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-6

Bombyx mori

UniProt P26729

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 20–47	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-2 × 1 （P15411）	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1BON	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BOM THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF BOMBYXIN-II, AN INSULIN-RELATED BRAIN-SECRETORY PEPTIDE OF THE SILKMOTH BOMBYX MORI: COMPARISON WITH INSULIN AND RELAXIN 提交 1994-07-21	当前字段一致	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 20–47（28 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BXA6_BOMMO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–28； UniProt 20–47

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1bon
沉积日期 deposition_date	1994-07-21
结构标题 title	THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF BOMBYXIN-II, AN INSULIN-RELATED BRAIN-SECRETORY PEPTIDE OF THE SILKMOTH BOMBYX MORI: COMPARISON WITH INSULIN AND RELAXIN
关键词 keywords	HORMONE, Structural Proteomics in Europe, SPINE, Structural Genomics; HORMONE
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	11.57 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	11.15 Å
零角强度 I(0) i0	47770100.00
分子量 molecular_weight	53071.0 kDa
排除体积 excluded_volume	64829 Å³
包络体积 envelope_volume	15487 Å³
水化壳体积 shell_volume	10130 Å³
包络直径 envelope_diameter	51.7 Å
壳层 Rg shell_rg	18.65 Å
包络 Rg envelope_rg	14.18 Å
形状 Rg shape_rg	11.18 Å
总 Rg total_rg	11.47 Å
总原子数 total_atoms	7140
残基数 n_residues	470
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	45.8 Å
Rg (实空间) rg_real	11.61 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.56 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.7770e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.4370e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	11.61 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	47770000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7004
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	13.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.433
峰度 Kurtosis kurtosis	0.154
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	45610.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.475; Stabil: 0.991; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.702; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-2
分子量 formula_weight	2188.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7140

GIVDECCLRPCSVDVLLSYC

来源 Source

来源生物 organism	Bombyx mori
通用名 common_name	domestic silkworm
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7091

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-6
分子量 formula_weight	3126.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QQPQAVHTYCGRHLARTLADLCWEAGVD

来源 Source

来源生物 organism	Bombyx mori
通用名 common_name	domestic silkworm
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7091

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1bon.1
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.1 — Insulin-like
超家族 Superfamily superfamily	g.1.1 — Insulin-like
家族 Family family	g.1.1.1 — Insulin-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

fit	/app/data/saxs_computation/bo/1bon/1bon.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bo/1bon/1bon.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bo/1bon/1bon.dat

THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF BOMBYXIN-II, AN INSULIN-RELATED BRAIN-SECRETORY PEPTIDE OF THE SILKMOTH BOMBYX MORI: COMPARISON WITH INSULIN AND RELAXIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

BOMBYXIN-II,BOMBYXIN A-6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)