1bwc

STRUCTURE OF HUMAN GLUTATHIONE REDUCTASE COMPLEXED with AJOENE INHIBITOR AND SUBVERSIVE SUBSTRATE

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 76.5 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (GLUTATHIONE REDUCTASE)

Homo sapiens

UniProt P00390

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–478 未记录 CL CHLORIDE ION × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 AJ3 3-(PROP-2-ENE-1-SULFINYL)-PROPENE-1-THIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.9;pH 6.9 分辨率 2.10 Å R-free 0.230

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 26 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GSHR_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–478; UniProt 1–478

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1bwc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1bwc
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1bwc
沉积日期 deposition_date1998-09-23
结构标题 titleSTRUCTURE OF HUMAN GLUTATHIONE REDUCTASE COMPLEXED with AJOENE INHIBITOR AND SUBVERSIVE SUBSTRATE
关键词 keywordsOXIDOREDUCTASE, FLAVOENZYME, REDOX-ACTIVE CENTER; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.96
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.03
零角强度 I(0) i043870600.00
分子量 molecular_weight50897.0 kDa
排除体积 excluded_volume63663 ų
包络体积 envelope_volume78528 ų
水化壳体积 shell_volume27093 ų
包络直径 envelope_diameter78.2
壳层 Rg shell_rg31.34
包络 Rg envelope_rg24.08
形状 Rg shape_rg24.04
总 Rg total_rg24.85
总原子数 total_atoms3562
残基数 n_residues461
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax76.5
Rg (实空间) rg_real24.81
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.47
I(0) (实空间) i0_real4.3870e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.6970e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.85
I(0) (倒空间) i0_reciprocal43870000.0000
解质量估计 total_estimate0.9138
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary32.8
偏度 Skewness skewness0.116
峰度 Kurtosis kurtosis-0.598
角度范围 angular_range— – 0.3200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha8120000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.959; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.999

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1bwca1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyc.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family familyc.3.1.5 — FAD/NAD-linked reductases, N-terminal and central domains
结构域编号 domain_idd1bwca2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyc.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family familyc.3.1.5 — FAD/NAD-linked reductases, N-terminal and central domains
结构域编号 domain_idd1bwca3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.87 — CO dehydrogenase flavoprotein C-domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.87.1 — FAD/NAD-linked reductases, dimerisation (C-terminal) domain
家族 Family familyd.87.1.1 — FAD/NAD-linked reductases, dimerisation (C-terminal) domain

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1bwcA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — FAD/NAD(P)-binding domain
结构域编号 domain_id1bwcA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — FAD/NAD(P)-binding domain
结构域编号 domain_id1bwcA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology390 — Enolase-like; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — FAD/NAD-linked reductase, C-terminal dimerisation domain

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)