PROTEIN (CHALCONE SYNTHASE)
Medicago sativa
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–389 | 未记录 | STL RESVERATROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.5;pH 6.50 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1CGZ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BI5 CHALCONE SYNTHASE FROM ALFALFA 提交 1998-06-22 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.193 |
| 1BQ6 CHALCONE SYNTHASE FROM ALFALFA WITH COENZYME A 提交 1998-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–389(388 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 COA COENZYME A × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.212 |
| 1CGK CHALCONE SYNTHASE FROM ALFALFA COMPLEXED WITH NARINGENIN 提交 1999-03-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
|
未记录 | NAR NARINGENIN × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;THE DROPLE CONSISTED ON 25 MGR/ML (FINAL CONCENTRATION) PROTEIN MIXED WITH THE
RESERVOIR WHICH CONTAINED 2.4 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM PIPES BUFFER (PH 6.5)
,
IN THE PRESENCE (UP TO 5 MM) OR ABSENCE OF DTT REDUCING AGENT. CRYSTALS WERE
STABILIZED IN 40% (V/V) PEG400, 100 MM PIPES 16 MM NARINGENIN PRIOR TO
FREEZING AT 105 K, pH 6.50
|
分辨率 1.84 Å R-free 0.225 |
| 1CHW CHALCONE SYNTHASE FROM ALFALFA COMPLEXED WITH HEXANOYL-COA 提交 1999-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
链 B
1–389(389 aa)
|
突变:C164S 突变:C164S | HXC HEXANOYL-COENZYME A × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;THE CRYSTALS WERE OBTAINED OVERNIGHT AT 4 C HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD. THE DROPLET CONSISTED ON 25 MGR/ML (FINAL CONCENTRATION) PROTEIN MIXED WITH THE RESERVOIR WHICH CONTAINED 2.4 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM PIPES BUFFER (PH 6.5), IN THE PRESENCE (UP TO 5 MM) OR ABSENCE OF DTT REDUCING AGENT. CRYSTALS WERE STABILIZED IN 40% (V/V) PEG400, 100 MM PIPES AND 20 MM HEXANOYL-COA PRIOR TO FREEZING AT 105 K.
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.290 |
| 1CML CHALCONE SYNTHASE FROM ALFALFA COMPLEXED WITH MALONYL-COA 提交 1999-03-30 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
|
突变:C164A | SO4 SULFATE ION × 2 MLC MALONYL-COENZYME A × 2 PIN PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.50
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.200 |
| 1D6F CHALCONE SYNTHASE C164A MUTANT 提交 1999-10-13 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
|
突变:C164A | SO4 SULFATE ION × 2 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, 2 MM DITHIOTHREITOL (DTT), pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.201 |
| 1D6H CHALONE SYNTHASE (N336A MUTANT COMPLEXED WITH COA) 提交 1999-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–389(387 aa)
|
突变:N336A 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 COA COENZYME A × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, 2 MM DITHIOTHREITOL (DTT), pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.257 |
| 1D6I CHALCONE SYNTHASE (H303Q MUTANT) 提交 1999-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–389(388 aa)
片段:CHS
链 B
2–389(388 aa)
片段:CHS
|
突变:H303Q 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:H303Q 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, 2 MM DITHIOTHREITOL (DTT), pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.269 |
| 1D6I CHALCONE SYNTHASE (H303Q MUTANT) 提交 1999-10-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–389(388 aa)
片段:CHS
链 B
2–389(388 aa)
片段:CHS
|
突变:H303Q 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:H303Q 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS PROPANE, 2 MM DITHIOTHREITOL (DTT), pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.269 |
| 1I86 CHALCONE SYNTHASE, G256A MUTANT 提交 2001-03-12 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
|
突变:CHALCONE SYNTHASE (G256A) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M ammonium sulfate, 100 mM PIPES, 5 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.221 |
| 1I88 CHALCONE SYNTHASE (G256V) 提交 2001-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
链 B
1–389(389 aa)
|
突变:G256V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:G256V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M PIPES, 5 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.221 |
| 1I89 Chalcone synthase (G256L) 提交 2001-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
链 B
1–389(389 aa)
|
突变:G256L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:G256L 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M PIPES, 5 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.259 |
| 1I8B Chalcone synthase (G256F) 提交 2001-03-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
链 B
1–389(389 aa)
|
突变:G256F 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:G256F 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;2.2-2.4 M ammonium sulfate, 0.1 M PIPES, 5 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.251 |
| 1JWX Chalcone Synthase--F215S mutant 提交 2001-09-05 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
|
突变:F215S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;ammonium sulfate, PIPES, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.225 |
| 1U0V An Aldol Switch Discovered in Stilbene Synthases Mediates Cyclization of Specificity of Type III Polyketide Synthases: 18xCHS structure 提交 2004-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
链 B
1–389(389 aa)
|
突变:D96A, V98L, V99A, V100M, T131S, S133T, G134T, V135P, M137L, Y157V, M158G, M159V, Y160F, Q161H, L268K, K269G, D270A, G273D 突变:D96A, V98L, V99A, V100M, T131S, S133T, G134T, V135P, M137L, Y157V, M158G, M159V, Y160F, Q161H, L268K, K269G, D270A, G273D | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;PEG 8000, ammonium acetate, HEPES-Na+ buffer, ethylene glycol, DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.227 |
| 1U0W An Aldol Switch Discovered in Stilbene Synthases Mediates Cyclization Specificity of Type III Polyketide Synthases: 18xCHS+resveratrol Structure 提交 2004-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–389(389 aa)
链 B
1–389(389 aa)
|
突变:D96A, V98L, V99A, V100M, T131S, S133T, G134T, V135P, M137L, Y157V, M158G, M159V, Y160F, Q161H, L268K, K269G, D270A, G273D 突变:D96A, V98L, V99A, V100M, T131S, S133T, G134T, V135P, M137L, Y157V, M158G, M159V, Y160F, Q161H, L268K, K269G, D270A, G273D | STL RESVERATROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;PEG 8000, ammonium acetate, HEPES-Na+ buffer, ethylene glycol, resveratrol, DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.264 |
| 1U0W An Aldol Switch Discovered in Stilbene Synthases Mediates Cyclization Specificity of Type III Polyketide Synthases: 18xCHS+resveratrol Structure 提交 2004-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–389(389 aa)
链 D
1–389(389 aa)
|
突变:D96A, V98L, V99A, V100M, T131S, S133T, G134T, V135P, M137L, Y157V, M158G, M159V, Y160F, Q161H, L268K, K269G, D270A, G273D 突变:D96A, V98L, V99A, V100M, T131S, S133T, G134T, V135P, M137L, Y157V, M158G, M159V, Y160F, Q161H, L268K, K269G, D270A, G273D | STL RESVERATROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;PEG 8000, ammonium acetate, HEPES-Na+ buffer, ethylene glycol, resveratrol, DTT, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.264 |
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| UniProt名称 | CHS2_MEDSA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–389; UniProt 1–389 |