1cn3

INTERACTION OF POLYOMAVIRUS INTERNAL PROTEIN VP2 WITH MAJOR CAPSID PROTEIN VP1 AND IMPLICATIONS FOR PARTICIPATION OF VP2 IN VIRAL ENTRY

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COAT PROTEIN VP1

Polyomavirus

UniProt P49302

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 FRAGMENT OF COAT PROTEIN VP2 × 1 (P12908) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 FRAGMENT OF COAT PROTEIN VP2 × 2 (P12908) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COA1_POVMP
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–283; UniProt 34–316 作者链 B; PDB构建体 1–283; UniProt 34–316 作者链 C; PDB构建体 1–283; UniProt 34–316 作者链 D; PDB构建体 1–283; UniProt 34–316 作者链 E; PDB构建体 1–283; UniProt 34–316

FRAGMENT OF COAT PROTEIN VP2

物种未注明

UniProt P12908

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 COAT PROTEIN VP1 × 5 (P49302) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 12 COAT PROTEIN VP1 × 10 (P49302) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 COA2_POVMC
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 11–29; UniProt 278–296

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1cn3
沉积日期 deposition_date1999-05-24
结构标题 titleINTERACTION OF POLYOMAVIRUS INTERNAL PROTEIN VP2 WITH MAJOR CAPSID PROTEIN VP1 AND IMPLICATIONS FOR PARTICIPATION OF VP2 IN VIRAL ENTRY
关键词 keywordsVIRAL COAT PROTEIN VP1, VIRAL COAT PROTEIN VP2, VIRAL ENTRY, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1cn3__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1cn3__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1cn3__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)48.90 Å
Rg(电子密度)48.14 Å
总 Rg48.28 Å
原子数22522
残基数2888
排除体积400600 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1cn3__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1cn3__assembly_2__model_1 dodecameric (12) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd1cn3a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.6 — Group I dsDNA viruses
家族 Family familyb.121.6.1 — Papovaviridae-like VP
结构域编号 domain_idd1cn3b_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.6 — Group I dsDNA viruses
家族 Family familyb.121.6.1 — Papovaviridae-like VP
结构域编号 domain_idd1cn3c_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.6 — Group I dsDNA viruses
家族 Family familyb.121.6.1 — Papovaviridae-like VP
结构域编号 domain_idd1cn3d_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.6 — Group I dsDNA viruses
家族 Family familyb.121.6.1 — Papovaviridae-like VP
结构域编号 domain_idd1cn3e_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.6 — Group I dsDNA viruses
家族 Family familyb.121.6.1 — Papovaviridae-like VP

CATH v4.4 (5 domains)

结构域编号 domain_id1cn3A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology175 — Polyomavirus Vp1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Capsid protein VP1,Polyomavirus
结构域编号 domain_id1cn3B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology175 — Polyomavirus Vp1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Capsid protein VP1,Polyomavirus
结构域编号 domain_id1cn3C00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology175 — Polyomavirus Vp1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Capsid protein VP1,Polyomavirus
结构域编号 domain_id1cn3D00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology175 — Polyomavirus Vp1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Capsid protein VP1,Polyomavirus
结构域编号 domain_id1cn3E00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology175 — Polyomavirus Vp1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Capsid protein VP1,Polyomavirus
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7. 引用文献 (1)