1cnl

ALPHA-CONOTOXIN IMI

Method: SOLUTION NMR Dmax: 18.2 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (ALPHA-CONOTOXIN IMI)

物种未注明

UniProt P50983

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–12 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件:pH 3.1;280 K NMR样品组成:10% D2O/90% H2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CXA1_CONIM
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–12; UniProt 1–12

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1cnl

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1cnl
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1cnl
沉积日期 deposition_date1999-05-20
结构标题 titleALPHA-CONOTOXIN IMI
关键词 keywordsCONOTOXIN, NICOTINIC ACETYLCHOLINE RECEPTOR BLOCKER, TOXIN; TOXIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier5.69
回转半径 Rg (电子) rg_electron5.86
零角强度 I(0) i04558630.00
分子量 molecular_weight13566.0 kDa
排除体积 excluded_volume15476 ų
包络体积 envelope_volume2336 ų
水化壳体积 shell_volume3339 ų
包络直径 envelope_diameter23.9
壳层 Rg shell_rg11.13
包络 Rg envelope_rg7.58
形状 Rg shape_rg5.87
总 Rg total_rg6.24
总原子数 total_atoms1710
残基数 n_residues120
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax18.2
Rg (实空间) rg_real5.62
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.04
I(0) (实空间) i0_real4.5200e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.6140e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal5.79
I(0) (倒空间) i0_reciprocal4559000.0000
解质量估计 total_estimate0.7168
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary6.7
偏度 Skewness skewness0.265
峰度 Kurtosis kurtosis-0.475
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha2.6000
最高正则化参数 α highest_alpha426.1000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.970; Stabil: 0.905; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.893; Smooth: 0.810

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1cnla_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.30 — Conotoxins
超家族 Superfamily superfamilyj.30.1 — Conotoxins
家族 Family familyj.30.1.2 — alpha-conotoxin

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)