SAXSdb — 1dk0

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEME-BINDING PROTEIN A

Serratia marcescens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–188	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M NaHepes, pH8.0, 1.4M NaKTartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.77 Å R-free 0.213
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–188	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M NaHepes, pH8.0, 1.4M NaKTartrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.77 Å R-free 0.213

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1DK0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B2V HEME-BINDING PROTEIN A 提交 1998-12-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–188（188 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；0.2M CACL, 0.1M NA ACETATE PH 4.6, 20% ISOPRPANOL	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
1DKH CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA, PH 6.5 提交 1999-12-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–188（188 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 SM SAMARIUM (III) ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Cacodylate buffer pH6.5, Zinc Acetate 140mM, Glycerol 2%, PEG8000 10%, Samarium Chloride 10mM., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.288
1YBJ Structural and Dynamics studies of both apo and holo forms of the hemophore HasA 提交 2004-12-21	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–179（178 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM sodium phosphate buffer；压力 ambient NMR样品组成 1.8mM HasA 15N \| 20mM sodium phosphate buffer, pH5.6; 90% H2O/10% D20 NMR样品组成 1.9mM HasA 15N,13C \| 20mM sodium phosphate buffer, pH5.6; 90% H2O/10% D20	分辨率未提供
2CN4 The crystal structure of the secreted dimeric form of the hemophore HasA reveals a domain swapping with an exchanged heme ligand 提交 2006-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–174（173 aa）链 B 2–174（173 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 MICROLITERS PROTEIN (AT A CONCENTRATION OF ABOUT 4 MG/ML) WERE MIXED WITH 1 MICROLITER RESERVOIR CONSISTING OF 100 MM TRIS BUFFER AT PH 8.5, 2 M K2HPO4 AND 2 M NAH2PO4.	分辨率 2.30 Å R-free 0.224
2UYD Crystal structure of the SmHasA mutant H83A 提交 2007-04-04	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 1–188（188 aa）	突变：YES	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ZN ZINC ION × 8 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；DROPS WERE PREPARED BY MIXING 2MICROL OF THE PROTEIN SOLUTION WITH 1 MICROL OF THE RESERVOIR SOLUTION THAT CONTAINED 100 MM SODIUM CACODYLATE AT PH 6.5, 200 MM ZN(OAC)2 AND 10 % (V/V) 2-PROPANOL. THE BROWNISH CRYSTALS GREW OVER A PERIOD OF 2 MONTHS AT 20 DEGREES C.	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–188（187 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3CSL Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–188（187 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.274
3CSN Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA 提交 2008-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–188（187 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.244
3CSN Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA 提交 2008-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–188（187 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 3.00 Å R-free 0.244
3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 2–188（187 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
3DDR Structure of the Serratia marcescens hemophore receptor HasR-Ile671Gly mutant in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2008-06-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–188（187 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；291 K；2 M NaCl, 100 mM Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.262
5C58 A double mutant of serratia marcescens hemophore receptor HasR in complex with its hemophore HasA and heme 提交 2015-06-19	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–188（187 aa）片段：UNP residues 2-188	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100mM Tris pH 7 to 8, 1.8 to 2.2mM NaCl, 100mM K2HPO4	分辨率 2.79 Å R-free 0.296
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOH Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (14-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–176（176 aa）	突变：A2S, G13A, H17A, G21T, S42T, Q63N, N79S, D102T, V110N, D112E, A125S, V131E, G145S, D156K	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 GOL GLYCEROL × 2 NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.51 Å R-free 0.234
9XOK Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (51-mutation) with Iron Tetraphenylporphyrin 提交 2025-11-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–173（171 aa）	突变：;F11L, G12D, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17Q, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, S25A, T26S, S58T, A61K, N62D, Q63G, Q88T, S93A, D96N, D102S, T103S, S104T, Q109T, V110E, D112Q, V113F, S114R, F115L, N119G, L120W, S121T, L123E, Q124I, A125S, Q126E, T144S, G145T, A146P, E148L, T149Q, G153N, I154Q, D156Q, D157Q, V162T, D167M, Q168E, V169I, A170R ;	MQP [5,10,15,20-tetraphenylporphyrinato(2-)-kappa~4~N~21~,N~22~,N~23~,N~24~]iron × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M sodium cacodylate-HCl, 2M ammonium sulfate, 0.2M NaCl	分辨率 1.80 Å R-free 0.330
9XPD Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (51-mutation) with Heme 提交 2025-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–176（176 aa）	突变：;F11L, G12D, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17Q, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, S25A, T26S, S58T, A61K, N62D, Q63G, Q88T, S93A, D96N, D102S, T103S, S104T, Q109T, V110E, D112Q, V113F, S114R, F115L, N119G, L120W, S121T, L123E, Q124I, A125S, Q126E, T144S, G145T, A146P, E148L, T149Q, G153N, I154Q, D156Q, D157Q, V162T, D167M, Q168E, V169I, A170R ;	IMD IMIDAZOLE × 1 CIT CITRIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M imidazole-HCl, 1M sodium citrate tribasic	分辨率 1.22 Å R-free 0.177
9XPI Crystal Structure of Redesigned HasAsm Variant (48-mutation) with Heme 提交 2025-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–176（176 aa）	突变：;F11L, G12A, G13N, Y14L, S15T, I16L, H17A, D18E, Y19F, L20F, G21N, Q22E, T26Y, N41S, S58T, A61K, N62D, Q63G, N79S, E80P, Q88T, S91A, S93T, D96N, T103S, S104T, Q109V, V110N, D112E, S114T, G116S, L120W, S121T, L123E, A125E, Q126E, Q134K, V136I, G145T, E148L, T149Q, G153S, I154L, D156K, D157Q, V162I, Q168E, V169I ;	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ACT ACETATE ION × 3 ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M imidazole-HCl, 2.5M NaCl, 0.2M Zinc acetate	分辨率 2.16 Å R-free 0.255

共 13 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HASA_SERMA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188 作者链 B； PDB构建体 1–188； UniProt 1–188

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1dk0
沉积日期 deposition_date	1999-12-06
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA FROM SERRATIA MARCESCENS CRYSTAL FORM P2(1), PH8
关键词 keywords	PROTEIN-HEME COMPLEX; TWO HEME INSERTIONS, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.16 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.94 Å
零角强度 I(0) i0	24584900.00
分子量 molecular_weight	36695.0 kDa
排除体积 excluded_volume	45115 Å³
包络体积 envelope_volume	51892 Å³
水化壳体积 shell_volume	21634 Å³
包络直径 envelope_diameter	64.2 Å
壳层 Rg shell_rg	26.33 Å
包络 Rg envelope_rg	19.98 Å
形状 Rg shape_rg	19.94 Å
总 Rg total_rg	20.73 Å
总原子数 total_atoms	2598
残基数 n_residues	346
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	63.5 Å
Rg (实空间) rg_real	21.03 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.28 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.4580e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.7250e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.06 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	24590000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9122
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	25.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.144
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.517
角度范围 angular_range	— – 0.3750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2796000.0000
实空间数据点数 n_real_points	69
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.959; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.987

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HEME-BINDING PROTEIN A
分子量 formula_weight	19288.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2820

MAFSVNYDSSFGGYSIHDYLGQWASTFGDVNHTNGNVTDANSGGFYGGSLSGSQYAISSTANQVTAFVAGGNLTYTLFNEPAHTLYGQLDSLSFGDGLSGGDTSPYSIQVPDVSFGGLNLSSLQAQGHDGVVHQVVYGLMSGDTGALETALNGILDDYGLSVNSTFDQVAAATAVGVQHADSPELLAA

来源 Source

来源生物 organism	Serratia marcescens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	615
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	222

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1dk0a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.35 — Heme-binding protein A (HasA)
超家族 Superfamily superfamily	d.35.1 — Heme-binding protein A (HasA)
家族 Family family	d.35.1.1 — Heme-binding protein A (HasA)

结构域编号 domain_id	d1dk0b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.35 — Heme-binding protein A (HasA)
超家族 Superfamily superfamily	d.35.1 — Heme-binding protein A (HasA)
家族 Family family	d.35.1.1 — Heme-binding protein A (HasA)

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1dk0A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1500 — Heme-binding Protein A; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Haem-binding HasA

结构域编号 domain_id	1dk0B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1500 — Heme-binding Protein A; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Haem-binding HasA

▶

8. 引用文献 (2)

▶

晶胞边长 a length_a	45.540 Å
晶胞边长 b length_b	66.210 Å
晶胞边长 c length_c	58.930 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	104.91 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.770 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.1750
R_work r_work	0.1690
R_free r_free	0.2130

fit	/app/data/saxs_computation/dk/1dk0/1dk0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dk/1dk0/1dk0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dk/1dk0/1dk0.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEMOPHORE HASA FROM SERRATIA MARCESCENS CRYSTAL FORM P2(1), PH8

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEME-BINDING PROTEIN A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction