1dqr

CRYSTAL STRUCTURE OF RABBIT PHOSPHOGLUCOSE ISOMERASE, A GLYCOLYTIC ENZYME THAT MOONLIGHTS AS NEUROLEUKIN, AUTOCRINE MOTILITY FACTOR, AND DIFFERENTIATION MEDIATOR

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOSPHOGLUCOSE ISOMERASE

物种未注明

UniProt Q9N1E2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 6-PHOSPHOGLUCONIC ACID × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G6PI_RABIT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–557; UniProt 2–558 作者链 B; PDB构建体 1–557; UniProt 2–558

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1dqr
沉积日期 deposition_date2000-01-05
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF RABBIT PHOSPHOGLUCOSE ISOMERASE, A GLYCOLYTIC ENZYME THAT MOONLIGHTS AS NEUROLEUKIN, AUTOCRINE MOTILITY FACTOR, AND DIFFERENTIATION MEDIATOR
关键词 keywordsalpha-beta sandwich domains, anti-parallel beta sheet, parallel beta sheet, ISOMERASE; ISOMERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1dqr__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1dqr__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1dqr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)29.90 Å
Rg(电子密度)28.58 Å
总 Rg29.50 Å
原子数8824
残基数1110
排除体积156990 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1dqr__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd1dqra_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.80 — SIS domain
超家族 Superfamily superfamilyc.80.1 — SIS domain
家族 Family familyc.80.1.2 — Phosphoglucose isomerase, PGI
结构域编号 domain_idd1dqrb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.80 — SIS domain
超家族 Superfamily superfamilyc.80.1 — SIS domain
家族 Family familyc.80.1.2 — Phosphoglucose isomerase, PGI

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id1dqrA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10490 — Glucose-6-phosphate isomerase like protein; domain 1
结构域编号 domain_id1dqrA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10490 — Glucose-6-phosphate isomerase like protein; domain 1
结构域编号 domain_id1dqrA03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1390 — Phosphoglucose isomerase, C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id1dqrB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10490 — Glucose-6-phosphate isomerase like protein; domain 1
结构域编号 domain_id1dqrB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10490 — Glucose-6-phosphate isomerase like protein; domain 1
结构域编号 domain_id1dqrB03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1390 — Phosphoglucose isomerase, C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10

7. 引用文献 (1)