1dwn

Structure of bacteriophage PP7 from Pseudomonas aeruginosa at 3.7 A resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHAGE COAT PROTEIN

物种未注明

UniProt Q38062

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 180 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 15 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 18 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
6 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 360 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q38062
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–127; UniProt 2–128 作者链 B; PDB构建体 1–127; UniProt 2–128 作者链 C; PDB构建体 1–127; UniProt 2–128

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1dwn
沉积日期 deposition_date1999-12-09
结构标题 titleStructure of bacteriophage PP7 from Pseudomonas aeruginosa at 3.7 A resolution
关键词 keywordsVIRUS, PHAGE, BACTERIOPHAGE, COAT PROTEIN, ICOSAHEDRAL VIRUS; VIRUS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1dwn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1dwn__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1dwn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)128.90 Å
总 Rg129.00 Å
原子数174240
残基数22860
排除体积3114100 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1dwn__assembly_1__model_1 180-MERIC (180) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1dwn__assembly_2__model_1 trimeric (3) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1dwn__assembly_3__model_1 pentadecameric (15) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1dwn__assembly_4__model_1 octadecameric (18) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1dwn__assembly_5__model_1 trimeric (3) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
6 1 1dwn__assembly_6__model_1 360-meric (360) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1dwna_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.85 — RNA bacteriophage capsid protein
超家族 Superfamily superfamilyd.85.1 — RNA bacteriophage capsid protein
家族 Family familyd.85.1.1 — RNA bacteriophage capsid protein
结构域编号 domain_idd1dwnb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.85 — RNA bacteriophage capsid protein
超家族 Superfamily superfamilyd.85.1 — RNA bacteriophage capsid protein
家族 Family familyd.85.1.1 — RNA bacteriophage capsid protein
结构域编号 domain_idd1dwnc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.85 — RNA bacteriophage capsid protein
超家族 Superfamily superfamilyd.85.1 — RNA bacteriophage capsid protein
家族 Family familyd.85.1.1 — RNA bacteriophage capsid protein

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1dwnA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology380 — MS2 Viral Coat Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MS2 Viral Coat Protein
结构域编号 domain_id1dwnB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology380 — MS2 Viral Coat Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MS2 Viral Coat Protein
结构域编号 domain_id1dwnC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology380 — MS2 Viral Coat Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MS2 Viral Coat Protein

7. 引用文献 (1)