SAXSdb — 6n4v

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1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

Coat protein

Pseudomonas phage PP7

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein homooligomer	Homooligomer	Protein 120	No other associated polymer	Consistent with protein count

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	Q38062_BPPP7
Isoform	—
PDB entities	1
Chains and sequence ranges	Author chain A； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain A； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain AA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain AA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain AB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain AB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain AC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain AC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain AD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain AD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain Af； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain Af； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain B； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain B； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain BA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain BA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain BB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain BB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain BC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain BC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain BD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain BD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain C； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain C； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain CA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain CA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain CB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain CB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain CC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain CC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain CD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain CD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain D； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain D； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain DA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain DA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain DB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain DB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain DC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain DC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain DD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain DD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain E； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain E； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain EA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain EA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain EB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain EB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain EC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain EC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain ED； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain ED； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain F； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain F； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain FA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain FA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain FB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain FB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain FC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain FC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain FD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain FD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain G； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain G； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain GA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain GA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain GB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain GB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain GC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain GC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain GD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain GD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain H； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain H； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain HA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain HA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain HB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain HB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain HC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain HC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain HD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain HD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain I； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain I； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain IA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain IA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain IB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain IB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain IC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain IC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain ID； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain ID； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain J； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain J； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain JA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain JA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain JB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain JB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain JC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain JC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain JD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain JD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain K； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain K； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain KA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain KA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain KB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain KB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain KC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain KC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain KD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain KD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain L； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain L； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain LA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain LA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain LB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain LB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain LC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain LC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain LD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain LD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain M； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain M； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain MA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain MA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain MB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain MB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain MC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain MC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain MD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain MD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain N； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain N； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain NA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain NA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain NB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain NB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain NC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain NC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain ND； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain ND； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain O； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain O； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain OA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain OA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain OB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain OB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain OC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain OC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain OD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain OD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain P； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain P； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain PA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain PA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain PB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain PB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain PC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain PC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain PD； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain PD； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain Q； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain Q； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain QA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain QA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain QB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain QB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain QC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain QC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain R； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain R； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain RA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain RA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain RB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain RB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain RC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain RC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain S； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain S； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain SA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain SA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain SB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain SB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain SC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain SC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain T； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain T； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain TA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain TA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain TB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain TB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain TC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain TC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain UA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain UA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain UB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain UB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain UC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain UC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain V； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain V； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain VA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain VA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain VB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain VB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain VC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain VC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain W； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain W； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain WA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain WA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain WB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain WB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain WC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain WC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain X； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain X； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain XA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain XA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain XB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain XB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain XC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain XC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain Y； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain Y； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain YA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain YA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain YB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain YB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain YC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain YC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain Z； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain Z； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain ZA； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain ZA； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain ZB； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain ZB； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128 Author chain ZC； PDBConstruct 1–127； UniProt 2–128 Author chain ZC； PDBConstruct 132–258； UniProt 2–128

The page prioritizes protein identity, the current assembly, associated components, oligomeric state and cross-PDB links. Chain mapping and sequence ranges are retained as data evidence. Internal IDs, import timestamps and assembly operation expressions are maintenance fields and are not shown here.

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2. Structure Basics 2. Structure Basics

Entry ID entry_id	6n4v
Deposition date deposition_date	2018-11-20
Structure title title	CryoEM structure of Leviviridae PP7 WT coat protein dimer capsid (PP7PP7-WT)
Keywords keywords	T4, icosahedral, PP7, biotechnology, vaccine, drug delivery, VIRUS LIKE PARTICLE; VIRUS LIKE PARTICLE
Experimental Method method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

This page reads only the latest assembly calculations. Every curve maps to an explicit PDB entry, official biological assembly and coordinate model.

6n4v__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

Download this curve (.dat)

6n4v__assembly_1__model_1 | I(q)

100 plotted points; both axes use logarithmic scales.

6n4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) will be calculated and displayed separately for the same assembly/model.

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg (electron density)	149.10 Å
Total Rg	149.10 Å
Atom count	236760
Residues	30960
Excluded volume	4226900 Å³
Maximum q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	Structure unit	Oligomeric description	Status	CRYSOL	Actions
1	1	`6n4v__assembly_1__model_1`	120-meric （120）	Success	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	View Download

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4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

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5. Entities and Polymers Entities & Polymers (1)

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Unit-cell length a length_a	1.000 Å
Unit-cell length b length_b	1.000 Å
Unit-cell length c length_c	1.000 Å
Unit-cell angle α angle_alpha	90.00 °
Unit-cell angle β angle_beta	90.00 °
Unit-cell angle γ angle_gamma	90.00 °
Molecules per unit cell Z z_pdb	—

Space group space_group	P 1
Space-group number int_tables_number	1
Crystal system crystal_system	—

Resolution resolution	3.00 Å
Resolution测定Method resolution_method	—
颗粒数 num_particles	33224

Description description	Coat protein
Molecular weight formula_weight	28144.0 kDa
Source method src_method	man
Copy count entity_count	120

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	;Af,A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD ;
Atom count atom_count	236760

CryoEM structure of Leviviridae PP7 WT coat protein dimer capsid (PP7PP7-WT)

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

Coat protein

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

2. Structure Basics 2. Structure Basics

3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

6n4v__assembly_1__model_1

6n4v__assembly_1__model_1 | I(q)

6n4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

Unit cell Unit Cell

Symmetry Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. Entities and Polymers Entities & Polymers (1)

Entity 1 Entity 1 polymer

Polymer Polymer

Source Source

7. Citations (1)

Source organism organism	Pseudomonas phage PP7
NCBI taxonomy ID ncbi_taxonomy_id	12023
Host organism host_organism	Escherichia coli

CryoEM structure of Leviviridae PP7 WT coat protein dimer capsid (PP7PP7-WT)

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

Coat protein

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

2. Structure Basics 2. Structure Basics

3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

6n4v__assembly_1__model_1

6n4v__assembly_1__model_1 | I(q)

6n4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

Unit cell Unit Cell

Symmetry Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. Entities and Polymers Entities & Polymers (1)

Entity 1 Entity 1 polymer

Polymer Polymer

Source Source

7. Citations (1)