SAXSdb — 6n4v

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coat protein

Pseudomonas phage PP7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 120	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q38062_BPPP7
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 A； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 AA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 AA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 AB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 AB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 AC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 AC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 AD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 AD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 Af； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Af； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 B； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 B； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 BA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 BA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 BB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 BB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 BC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 BC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 BD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 BD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 C； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 C； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 CA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 CA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 CB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 CB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 CC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 CC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 CD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 CD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 D； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 D； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 DA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 DA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 DB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 DB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 DC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 DC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 DD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 DD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 E； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 E； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 EA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 EA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 EB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 EB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 EC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 EC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 ED； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ED； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 F； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 FA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 FA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 FB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 FB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 FC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 FC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 FD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 FD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 G； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 G； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 GA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 GA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 GB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 GB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 GC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 GC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 GD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 GD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 H； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 H； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 HA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 HA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 HB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 HB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 HC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 HC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 HD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 HD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 I； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 I； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 IA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 IA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 IB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 IB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 IC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 IC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 ID； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ID； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 J； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 J； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 JA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 JA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 JB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 JB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 JC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 JC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 JD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 JD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 K； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 K； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 KA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 KA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 KB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 KB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 KC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 KC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 KD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 KD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 L； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 L； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 LA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 LA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 LB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 LB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 LC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 LC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 LD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 LD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 M； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 M； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 MA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 MA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 MB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 MB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 MC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 MC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 MD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 MD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 N； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 N； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 NA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 NA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 NB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 NB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 NC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 NC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 ND； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ND； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 O； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 O； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 OA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 OA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 OB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 OB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 OC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 OC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 OD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 OD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 P； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 P； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 PA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 PA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 PB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 PB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 PC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 PC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 PD； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 PD； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 Q； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Q； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 QA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 QA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 QB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 QB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 QC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 QC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 R； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 R； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 RA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 RA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 RB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 RB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 RC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 RC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 S； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 S； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 SA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 SA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 SB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 SB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 SC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 SC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 T； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 T； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 TA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 TA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 TB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 TB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 TC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 TC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 UA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 UA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 UB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 UB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 UC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 UC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 V； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 V； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 VA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 VA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 VB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 VB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 VC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 VC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 W； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 W； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 WA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 WA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 WB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 WB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 WC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 WC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 X； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 X； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 XA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 XA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 XB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 XB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 XC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 XC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 Y； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Y； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 YA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 YA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 YB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 YB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 YC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 YC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 Z； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 Z； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 ZA； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ZA； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 ZB； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ZB； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128 作者链 ZC； PDB构建体 1–127； UniProt 2–128 作者链 ZC； PDB构建体 132–258； UniProt 2–128

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6n4v
沉积日期 deposition_date	2018-11-20
结构标题 title	CryoEM structure of Leviviridae PP7 WT coat protein dimer capsid (PP7PP7-WT)
关键词 keywords	T4, icosahedral, PP7, biotechnology, vaccine, drug delivery, VIRUS LIKE PARTICLE; VIRUS LIKE PARTICLE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6n4v__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6n4v__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6n4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	149.10 Å
总 Rg	149.10 Å
原子数	236760
残基数	30960
排除体积	4226900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6n4v__assembly_1__model_1`	120-meric （120）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	33224

描述 description	Coat protein
分子量 formula_weight	28144.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	120

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	;Af,A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC,DC,EC,FC,GC,HC,IC,JC,KC,LC,MC,NC,OC,PC,QC,RC,SC,TC,UC,VC,WC,XC,YC,ZC,AD,BD,CD,DD,ED,FD,GD,HD,ID,JD,KD,LD,MD,ND,OD,PD ;
原子数 atom_count	236760

CryoEM structure of Leviviridae PP7 WT coat protein dimer capsid (PP7PP7-WT)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coat protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6n4v__assembly_1__model_1

6n4v__assembly_1__model_1 | I(q)

6n4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Pseudomonas phage PP7
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12023
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

CryoEM structure of Leviviridae PP7 WT coat protein dimer capsid (PP7PP7-WT)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coat protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6n4v__assembly_1__model_1

6n4v__assembly_1__model_1 | I(q)

6n4v__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)