SAXSdb — 1e42

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AP-2 COMPLEX SUBUNIT BETA

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 701–937	片段：APPENDAGE DOMAIN, RESIDUES 701-937	DTD DITHIANE DIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8.8；WELL SOLUTION: 1.6 - 2.0M MGCL2, 0.1M BICINE PH 8.7 - 9.0, 15% GLYCEROL, 1MM DTT. PROTEIN: 40MG/ML, 5MM HEPES, 50MM NACL, 4MM DTT, 1:1 MIXTURE	分辨率 1.70 Å R-free 0.246
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 701–937	片段：APPENDAGE DOMAIN, RESIDUES 701-937	DTD DITHIANE DIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NI NICKEL (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 8.8；WELL SOLUTION: 1.6 - 2.0M MGCL2, 0.1M BICINE PH 8.7 - 9.0, 15% GLYCEROL, 1MM DTT. PROTEIN: 40MG/ML, 5MM HEPES, 50MM NACL, 4MM DTT, 1:1 MIXTURE	分辨率 1.70 Å R-free 0.246

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1E42	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2G30 beta appendage of AP2 complexed with ARH peptide 提交 2006-02-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 701–937（237 aa）片段：residues 701-937	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；289 K；18% PEG 8000, 100mM HEPES pH 7.5, 4mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 289K	分辨率 1.60 Å R-free 0.243
2IV8 beta appendage in complex with b-arrestin peptide 提交 2006-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 700–937（238 aa）片段：RESIDUES 700-937	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；0.2M MG FORMATE 30% PEG 3350 OTHER REMARKS: THIS WAS THE ONLY CRYSTAL OBTAINED DESPITE HEROIC ATTEMPTS. THE CRYSTAL WAS HIGHLY MOSAIC, AND EPITAXIALLY SPLIT, LIMITING THE AMOUNT OF DATA WHICH COULD BE COLLECTED., pH 7.40	分辨率 2.80 Å R-free 0.369
2IV9 B2-appendage from AP2 in complex with Eps15 peptide 提交 2006-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 700–937（238 aa）片段：APPENDAGE DOMAIN, RESIDUES 700-937 链 B 700–937（238 aa）片段：APPENDAGE DOMAIN, RESIDUES 700-937	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；2M AMMONIUM SULPHATE, 0.1M AMMONIUM ACETATE PH 4.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.267
2JKR AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with Dileucine peptide RM(phosphoS)QIKRLLSE 提交 2008-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–591（591 aa）片段：BETA2 CHAIN, RESIDUES 1-591	未记录	SO4 SULFATE ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE	分辨率 2.98 Å R-free 0.260
2JKR AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with Dileucine peptide RM(phosphoS)QIKRLLSE 提交 2008-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–591（591 aa）片段：BETA2 CHAIN, RESIDUES 1-591	未记录	SO4 SULFATE ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE	分辨率 2.98 Å R-free 0.260
2JKT AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with CD4 Dileucine peptide RM(phosphoS) EIKRLLSE Q to E mutant 提交 2008-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–591（591 aa）片段：BETA2 CHAIN, RESIDUES 1-591	未记录	SO4 SULFATE ION × 15	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE	分辨率 3.40 Å R-free 0.256
2JKT AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with CD4 Dileucine peptide RM(phosphoS) EIKRLLSE Q to E mutant 提交 2008-08-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–591（591 aa）片段：BETA2 CHAIN, RESIDUES 1-591	未记录	SO4 SULFATE ION × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE	分辨率 3.40 Å R-free 0.256
2VGL AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE 提交 2007-11-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–591（591 aa）片段：1-591	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.2；18% PEG, 10MM NA/K PHOSPHATE PH 6.2, 200MM NACL, 4MM DTT, IP6	分辨率 2.60 Å R-free 0.339
2XA7 AP2 clathrin adaptor core in active complex with cargo peptides 提交 2010-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–592（592 aa）片段：BETA CHAIN, RESIDUES 1-592	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.6-0.8M LISO4, 0.6-0.7M NH4SO4, 100MM NA CITRATE PH 6.5; CRYOPROTECTANT 20% GLYCEROL	分辨率 3.10 Å R-free 0.285
2XA7 AP2 clathrin adaptor core in active complex with cargo peptides 提交 2010-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–592（592 aa）片段：BETA CHAIN, RESIDUES 1-592	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；0.6-0.8M LISO4, 0.6-0.7M NH4SO4, 100MM NA CITRATE PH 6.5; CRYOPROTECTANT 20% GLYCEROL	分辨率 3.10 Å R-free 0.285
4UQI AP2 controls clathrin polymerization with a membrane-activated switch 提交 2014-06-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–651（651 aa）片段：BETA 2 SUBUNIT EXTENDED TRUNK DOMAIN, RESIDUES 1-651	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.2；18% PEG1000, 10MM NA/K PHOSPHATE PH 6.2, 200MM NACL, 4MM DTT, IP6	分辨率 2.79 Å R-free 0.259
5M5R Clathrin heavy chain N-terminal domain bound to beta2 adaptin clathrin box motif 提交 2016-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 629–637（9 aa）片段：UNP Residues 629-637 链 D 629–637（9 aa）片段：UNP Residues 629-637	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；1 uL protein plus peptide mix (14 mg/mL NTD and 3.4 mM peptide) plus 2 uL reservoir equilibrated against a 200 uL reservoir of 0.94 M sodium malonate pH 6.7	分辨率 1.76 Å R-free 0.205
6QH5 AP2 clathrin adaptor mu2T156-phosphorylated core in closed conformation 提交 2019-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–592（592 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；289 K；20% PEG 1000; 100 mM Na+/K+ phosphate buffer (pH 7.2), 200 mM NaCl, and 10 mM DTT	分辨率 2.56 Å R-free 0.257
6QH6 AP2 clathrin adaptor core with two cargo peptides in open+ conformation 提交 2019-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–592（592 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；289 K；7.5% PVA, 9% 1-propanol, 90 mM Hepes pH 7.4, 100 mM guanidine hydrochloride	分辨率 5.00 Å R-free 0.285
6QH7 AP2 clathrin adaptor mu2T156-phosphorylated core with two cargo peptides in open+ conformation 提交 2019-01-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–592（592 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；289 K；7.5% PVA, 9% 1-propanol, 90 mM Hepes pH 7.4, 100 mM guanidine hydrochloride	分辨率 3.40 Å R-free 0.248
6URI HIV-1 Nef in complex with the CD4 cytoplasmic domain and the AP2 clathrin adaptor complex 提交 2019-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–591（591 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.9；298 K；15% Peg 4000, 0.2M potassium chloride, ~10% 1,6-hexanediol, 0.1M HEPES	分辨率 3.00 Å R-free 0.277
6YAE AP2 core in physiological buffer 提交 2020-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–591（591 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6YAF AP2 on a membrane containing tyrosine-based cargo peptide 提交 2020-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–937（937 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was supplemented with 10 nm nanogold fiducials, and 3 ul of the mixture was backside blotted for 3 seconds.	分辨率 9.10 Å
6YAH AP2 in clathrin coats assembled on a membrane containing dileucine- and tyrosine-based cargo peptides 提交 2020-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–937（937 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was supplemented with 10 nm nanogold fiducials, and 3 ul of the mixture was backside blotted for 3 seconds.	分辨率 10.20 Å
6YAI Clathrin with bound beta2 appendage of AP2 提交 2020-03-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 F 719–951（233 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The sample was supplemented with 10 nm nanogold fiducials, and 3 ul of the mixture was backside blotted for 3 seconds.	分辨率 9.20 Å
7OG1 AP2 clathrin adaptor core in complex with cargo peptide and FCHO2 提交 2021-05-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 BBB 1–591（591 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；Crystals of AP-2 in complex with FCHO2 linker and TGN38 peptide, supplemented with 10mM K Na Tartrate, grew in sitting drops with reservoir 0.1M Mg formate dehydrate, 10% to 15% PEG 3350. The crystals were cryo-protected with 0.1M Mg formate dehydrate, 13% PEG 3350, 18-24% Glycerol and 1mg/ml of peptide.	分辨率 3.25 Å R-free 0.306
7OHO Crystal structure of AP2 FCHO2 chimera 提交 2021-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 BBB 1–542（542 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；18% PEG 12000 0.1M Na/K phosphate pH 6.2 0.2M NaCl 4mM DTT in the presence of 3-fold molar excess of IP6.	分辨率 2.88 Å R-free 0.273
7OM8 Beta2 appendage domain of AP2 bound to terminal domains beneath the hub of the 28 triskelia mini clathrin coat complex, class 15 提交 2021-05-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 719–951（233 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3 uL of sample applied to a grid and blotted for 4.5 s before plunging	分辨率 10.50 Å
7Z5C Chimera of AP2 with FCHO2 linker domain as a fusion on Cmu2 subunit 提交 2022-03-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–591（591 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6；50% HKT buffer (10mM Hepes, 10mM Tris 120mM potassium acetate pH 7.2) and 50% Core buffer (10mM Tris, 250mM NaCl, pH 8) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å

共 21 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AP2B1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 22–258； UniProt 701–937 作者链 B； PDB构建体 22–258； UniProt 701–937

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1e42
沉积日期 deposition_date	2000-06-27
结构标题 title	Beta2-adaptin appendage domain, from clathrin adaptor AP2
关键词 keywords	ENDOCYTOSIS, ADAPTOR; ENDOCYTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	29.50 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.88 Å
零角强度 I(0) i0	43898600.00
分子量 molecular_weight	53301.0 kDa
排除体积 excluded_volume	67323 Å³
包络体积 envelope_volume	82555 Å³
水化壳体积 shell_volume	25628 Å³
包络直径 envelope_diameter	110.6 Å
壳层 Rg shell_rg	33.44 Å
包络 Rg envelope_rg	28.82 Å
形状 Rg shape_rg	28.87 Å
总 Rg total_rg	29.37 Å
总原子数 total_atoms	3733
残基数 n_residues	466
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	102.5 Å
Rg (实空间) rg_real	29.73 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.80 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.3900e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.0610e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	29.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	43900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6401
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.543
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.163
角度范围 angular_range	— – 0.2700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	8501000.0000
实空间数据点数 n_real_points	55
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.776; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.092; Positv: 1.000; Valcen: 0.817; Smooth: 0.896

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	AP-2 COMPLEX SUBUNIT BETA
分子量 formula_weight	29088.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	4555

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMGMAPGGYVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	DITHIANE DIOL
分子量 formula_weight	152.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	NICKEL (II) ION
分子量 formula_weight	58.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	822

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1e42a1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.10 — Clathrin adaptor appendage domain
家族 Family family	b.1.10.1 — Alpha-adaptin ear subdomain-like

结构域编号 domain_id	d1e42a2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.105 — Subdomain of clathrin and coatomer appendage domain
超家族 Superfamily superfamily	d.105.1 — Subdomain of clathrin and coatomer appendage domain
家族 Family family	d.105.1.1 — Clathrin adaptor appendage, alpha and beta chain-specific domain

结构域编号 domain_id	d1e42b1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.10 — Clathrin adaptor appendage domain
家族 Family family	b.1.10.1 — Alpha-adaptin ear subdomain-like

结构域编号 domain_id	d1e42b2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.105 — Subdomain of clathrin and coatomer appendage domain
超家族 Superfamily superfamily	d.105.1 — Subdomain of clathrin and coatomer appendage domain
家族 Family family	d.105.1.1 — Clathrin adaptor appendage, alpha and beta chain-specific domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1e42A01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1150 —

结构域编号 domain_id	1e42A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TATA-Binding Protein

结构域编号 domain_id	1e42B01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1150 —

结构域编号 domain_id	1e42B02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TATA-Binding Protein

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	97.040 Å
晶胞边长 b length_b	124.590 Å
晶胞边长 c length_c	67.640 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	124.18 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.700 Å
最低分辨率 resolution_low	67.420 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1960
R_free r_free	0.2460

fit	/app/data/saxs_computation/e4/1e42/1e42.fit
pddf	/app/data/pr_computation/e4/1e42/1e42.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/e4/1e42/1e42.dat

Beta2-adaptin appendage domain, from clathrin adaptor AP2