SAXSdb — 1egs

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GROES

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 19–27	片段：MOBILE LOOP 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	无其他共同聚合物	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6.5；303 K	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1EGS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AON CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASYMMETRIC CHAPERONIN COMPLEX GROEL/GROES/(ADP)7 提交 1997-07-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG3000, 0.25M SODIUM GLUTAMATE, 100MM CACODYLIC ACID, PH 5.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.291
1PCQ Crystal structure of groEL-groES 提交 2003-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.81 Å R-free 0.278
1SVT Crystal structure of GroEL14-GroES7-(ADP-AlFx)7 提交 2004-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG3000, cacodylic acid, potassium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.81 Å R-free 0.274
1SX4 GroEL-GroES-ADP7 提交 2004-03-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；PEG 3000, cacodylic acid, sodium glutamate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.287
2C7C FITTED COORDINATES FOR GROEL-ATP7-GROES CRYO-EM COMPLEX (EMD-1180) 提交 2005-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2；pH 7.5；12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 7.70 Å
2C7D Fitted coordinates for GroEL-ADP7-GroES Cryo-EM complex (EMD-1181) 提交 2005-11-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2；pH 7.5；12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE	分辨率 8.70 Å
3WVL Crystal structure of the football-shaped GroEL-GroES complex (GroEL: GroES2:ATP14) from Escherichia coli 提交 2014-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；35% PEG 550 MME, 0.1M HEPES, 1mM ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.79 Å R-free 0.250
3WVL Crystal structure of the football-shaped GroEL-GroES complex (GroEL: GroES2:ATP14) from Escherichia coli 提交 2014-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 V 1–97（97 aa）链 W 1–97（97 aa）链 X 1–97（97 aa）链 Y 1–97（97 aa）链 Z 1–97（97 aa）链 a 1–97（97 aa）链 b 1–97（97 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；35% PEG 550 MME, 0.1M HEPES, 1mM ATP, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.79 Å R-free 0.250
3ZPZ Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM HEPES, 5 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT；pH 7.6；50 MM HEPES, 5 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGING,	分辨率 8.90 Å
3ZQ0 Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT；pH 7.6；50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGIN	分辨率 9.20 Å
3ZQ1 Visualizing GroEL-ES in the Act of Encapsulating a Non-Native Substrate Protein 提交 2013-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT；pH 7.6；50 MM HEPES, 50 MM KOAC, 10 MM MG(OAC)2, 2 MM DTT cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 95, TEMPERATURE- 98, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK III, METHOD- BLOT FOR 1 SECOND BEFORE PLUNGING,	分辨率 15.90 Å
5OPX Crystal structure of the GroEL mutant A109C in complex with GroES and ADP BeF2 提交 2017-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 1 1–97（97 aa）链 2 1–97（97 aa）链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）链 V 1–97（97 aa）链 W 1–97（97 aa）链 X 1–97（97 aa）链 Y 1–97（97 aa）链 Z 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 14 K POTASSIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；10 mM ATP, 3 mM BeF2, 0.1 M Tris, pH 8.0, 0.2 M NaCl and 20 % PEG 4000	分辨率 3.64 Å R-free 0.256
7PBJ Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("wide" conformation). 提交 2021-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 Af 1–97（97 aa）链 Am 1–97（97 aa）链 At 1–97（97 aa）链 Ba 1–97（97 aa）链 Bh 1–97（97 aa）链 Bo 1–97（97 aa）链 Bv 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7PBX Cryo-EM structure of the GroEL-GroES complex with ADP bound to both rings ("tight" conformation). 提交 2021-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 Af 1–97（97 aa）链 Al 1–97（97 aa）链 Ar 1–97（97 aa）链 Ax 1–97（97 aa）链 Bd 1–97（97 aa）链 Bj 1–97（97 aa）链 Bp 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.43 Å
7VWX CryoEM structure of football-shaped GroEL:ES2 with RuBisCO 提交 2021-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：29-meric	链 1 1–97（97 aa）链 2 1–97（97 aa）链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）链 V 1–97（97 aa）链 W 1–97（97 aa）链 X 1–97（97 aa）链 Y 1–97（97 aa）链 Z 1–97（97 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.60 Å
8BA9 CryoEM structure of GroEL-GroES-ADP.AlF3-Rubisco. 提交 2022-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).	分辨率 3.70 Å
8BAA CryoEM structure of GroEL-GroES-ADP.AlF3-Rubisco, class II. 提交 2022-10-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The grid was prepared using a chameleon (SPT Labtech).	分辨率 4.20 Å
8BKZ GroEL:GroES-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 AA 2–97（96 aa）链 B 2–97（96 aa）链 CA 2–97（96 aa）链 D 2–97（96 aa）链 F 2–97（96 aa）链 H 2–97（96 aa）链 J 2–97（96 aa）链 L 2–97（96 aa）链 N 2–97（96 aa）链 P 2–97（96 aa）链 R 2–97（96 aa）链 T 2–97（96 aa）链 W 2–97（96 aa）链 Y 2–97（96 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.30 Å
8BM0 Structure of GroEL:GroES-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 B 2–97（96 aa）链 E 2–97（96 aa）链 J 2–97（96 aa）链 M 2–97（96 aa）链 P 2–97（96 aa）链 S 2–97（96 aa）链 W 2–97（96 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8BM1 Structure of GroEL:GroES-ATP complex under continuous turnover conditions 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 B 2–97（96 aa）链 E 2–97（96 aa）链 J 2–97（96 aa）链 M 2–97（96 aa）链 P 2–97（96 aa）链 S 2–97（96 aa）链 W 2–97（96 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8BMO Structure of GroEL:GroES complex exhibiting ADP-conformation in trans ring obtained under the continuous turnover conditions 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 D 2–97（96 aa）链 G 2–97（96 aa）链 K 2–97（96 aa）链 N 2–97（96 aa）链 Q 2–97（96 aa）链 T 2–97（96 aa）链 W 2–97（96 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8BMT Structure of GroEL:GroES-ATP complex plunge frozen 200 ms after reaction initiation 提交 2022-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric	链 AA 2–97（96 aa）链 B 2–97（96 aa）链 CA 2–97（96 aa）链 D 2–97（96 aa）链 F 2–97（96 aa）链 H 2–97（96 aa）链 K 2–97（96 aa）链 M 2–97（96 aa）链 O 2–97（96 aa）链 Q 2–97（96 aa）链 S 2–97（96 aa）链 V 2–97（96 aa）链 W 2–97（96 aa）链 Y 2–97（96 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8P4M CryoEM structure of a C7-symmetrical GroEL7-GroES7 cage in presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 2.50 Å
8P4N CryoEM structure of a GroEL7-GroES7 cage with encapsulated disordered substrate MetK in the presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 2.90 Å
8P4O CryoEM structure of a GroEL7-GroES7 cage with encapsulated ordered substrate MetK in the presence of ADP-BeFx 提交 2023-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 3.04 Å
8QXS CryoEM structure of a GroEL14-GroES7 complex in presence of ADP-BeFx with wide GroEL7 trans ring conformation 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 3.12 Å
8QXT CryoEM structure of a GroEL14-GroES7 complex in presence of ADP-BeFx with narrow GroEL7 trans ring conformation 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 MG MAGNESIUM ION × 14 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 7 K POTASSIUM ION × 14	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；5.9 mM n-octyl-beta-D-glucopyranoside were added before vitrification	分辨率 2.90 Å
8QXU In situ structure average of GroEL14-GroES7 complexes with wide GroEL7 trans ring conformation in Escherichia coli cytosol obtained by cryo electron tomography 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 12.00 Å
8QXV In situ structure average of GroEL14-GroES7 complexes with narrow GroEL7 trans ring conformation in Escherichia coli cytosol obtained by cryo electron tomography 提交 2023-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric	链 O 1–97（97 aa）链 P 1–97（97 aa）链 Q 1–97（97 aa）链 R 1–97（97 aa）链 S 1–97（97 aa）链 T 1–97（97 aa）链 U 1–97（97 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 14 K POTASSIUM ION × 14 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 13.60 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	CH10_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–10； UniProt 19–27

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1egs
沉积日期 deposition_date	1997-06-30
结构标题 title	NMR STRUCTURE OF GROES MOBILE LOOP RESIDUES 19-27 IN THE SYNTHETIC PEPTIDE (RESIDUES 13-32) BOUND TO GROEL, 20 STRUCTURES
关键词 keywords	CHAPERONIN, PROTEIN FOLDING, HEAT SHOCK; CHAPERONIN
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	4.46 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	5.28 Å
零角强度 I(0) i0	3930640.00
分子量 molecular_weight	17762.0 kDa
排除体积 excluded_volume	23104 Å³
包络体积 envelope_volume	1808 Å³
水化壳体积 shell_volume	3065 Å³
包络直径 envelope_diameter	17.9 Å
壳层 Rg shell_rg	10.14 Å
包络 Rg envelope_rg	6.11 Å
形状 Rg shape_rg	5.22 Å
总 Rg total_rg	5.82 Å
总原子数 total_atoms	2680
残基数 n_residues	180
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	14.6 Å
Rg (实空间) rg_real	4.46 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.30 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.9310e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.4890e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	4.46 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	3931000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7883
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	5.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.043
峰度 Kurtosis kurtosis	-1.230
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	137.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.854; Stabil: 0.964; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.789; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1egsa_
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.50 — GroES fragments
超家族 Superfamily superfamily	j.50.1 — GroES fragments
家族 Family family	j.50.1.1 — GroES fragments

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

描述 description	GROES
分子量 formula_weight	870.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2680

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562

NMR STRUCTURE OF GROES MOBILE LOOP RESIDUES 19-27 IN THE SYNTHETIC PEPTIDE (RESIDUES 13-32) BOUND TO GROEL, 20 STRUCTURES

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GROES

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

fit	/app/data/saxs_computation/eg/1egs/1egs.fit
pddf	/app/data/pr_computation/eg/1egs/1egs.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/eg/1egs/1egs.dat