1f02

CRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL 282-RESIDUE FRAGMENT OF INTIMIN IN COMPLEX WITH TRANSLOCATED INTIMIN RECEPTOR (TIR) INTIMIN-BINDING DOMAIN

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

INTIMIN

Escherichia coli

UniProt P19809

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 TRANSLOCATED INTIMIN RECEPTOR × 2 (Q9KWH9) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EAE_ECO27
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–282; UniProt 658–939

TRANSLOCATED INTIMIN RECEPTOR

Escherichia coli

UniProt Q9KWH9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 INTIMIN × 1 (P19809) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KWH9_ECOLI
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 2–66; UniProt 272–336

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1f02
沉积日期 deposition_date2000-05-14
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF C-TERMINAL 282-RESIDUE FRAGMENT OF INTIMIN IN COMPLEX WITH TRANSLOCATED INTIMIN RECEPTOR (TIR) INTIMIN-BINDING DOMAIN
关键词 keywordsImmunoglobulin-like fold, C-type lectin-like fold, four-helix bundle, CELL ADHESION; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1f02__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1f02__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1f02__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)41.59 Å
Rg(电子密度)43.19 Å
总 Rg42.66 Å
原子数3102
残基数414
排除体积54611 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1f02__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (5 domains)

结构域编号 domain_idd1f02i1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.14 — Invasin/intimin cell-adhesion fragments
家族 Family familyb.1.14.1 — Invasin/intimin cell-adhesion fragments
结构域编号 domain_idd1f02i2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.14 — Invasin/intimin cell-adhesion fragments
家族 Family familyb.1.14.1 — Invasin/intimin cell-adhesion fragments
结构域编号 domain_idd1f02i3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.169 — C-type lectin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.169.1 — C-type lectin-like
家族 Family familyd.169.1.3 — Invasin/intimin cell-adhesion fragment, C-terminal domain
结构域编号 domain_idd1f02t1
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.67 — Translocated intimin receptor (tir) intimin-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyj.67.1 — Translocated intimin receptor (tir) intimin-binding domain
家族 Family familyj.67.1.1 — Translocated intimin receptor (tir) intimin-binding domain
结构域编号 domain_idd1f02t2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1f02I01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id1f02I02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1080
结构域编号 domain_id1f02I03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology100 — Mannose-Binding Protein A; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Mannose-Binding Protein A, subunit A
结构域编号 domain_id1f02T00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology820 — Translocated Intimin Receptor; Chain T
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Translocated intimin receptor, central domain

7. 引用文献 (1)