1fvx

CLOSTRIDIUM BEIJERINCKII FLAVODOXIN MUTANT: G57N OXIDIZED

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 46.1 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1fvx

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1fvx
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id1fvx
沉积日期 deposition_date1996-12-12
结构标题 titleCLOSTRIDIUM BEIJERINCKII FLAVODOXIN MUTANT: G57N OXIDIZED
关键词 keywordsELECTRON TRANSPORT, FLAVOPROTEIN, FMN; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier15.36
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.85
零角强度 I(0) i05013090.00
分子量 molecular_weight15830.0 kDa
排除体积 excluded_volume19664 ų
包络体积 envelope_volume21430 ų
水化壳体积 shell_volume12942 ų
包络直径 envelope_diameter43.1
壳层 Rg shell_rg19.87
包络 Rg envelope_rg14.07
形状 Rg shape_rg13.86
总 Rg total_rg14.98
总原子数 total_atoms1108
残基数 n_residues138
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax46.1
Rg (实空间) rg_real15.24
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.23
I(0) (实空间) i0_real5.0130e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.5630e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal15.25
I(0) (倒空间) i0_reciprocal5013000.0000
解质量估计 total_estimate0.9027
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary21.6
偏度 Skewness skewness0.009
峰度 Kurtosis kurtosis-0.499
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1014000.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.921; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.991

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1fvxa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyc.23.5 — Flavoproteins
家族 Family familyc.23.5.1 — Flavodoxin-related

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1fvxA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily360 — Flavodoxin domain

7. 引用文献 (10)

8. 文件与曲线 (10)