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1g5m

HUMAN BCL-2, ISOFORM 1

Method: SOLUTION NMR Dmax: 55.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (APOPTOSIS REGULATOR BCL-2 WITH PUTATIVE FLEXIBLE LOOP REPLACED WITH A PORTION OF APOPTOSIS REGULATOR BCL-X PROTEIN)

Homo sapiens

UniProt P10415

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–34 链 A； UniProt 92–207 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM；压力 ambient NMR样品组成：15N-Bcl-2(1); 15N,13C-BCL-2(1) | H2O NMR样品组成：15N,13C-Bcl-2(1) | D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1G5M Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1GJH HUMAN BCL-2, ISOFORM 2 提交 2001-05-31 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM；压力 AMBIENT
NMR样品组成 15N-Bcl-2(2); 15N,13C-BCL-2(2) | H2O
NMR样品组成 15N, 13C-Bcl-2(2) | D2O
分辨率未提供
1YSW Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-2 complexed with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2005-02-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–34（32 aa）
链 A 91–205（115 aa）
未记录 43B 3-NITRO-N-{4-[2-(2-PHENYLETHYL)-1,3-BENZOTHIAZOL-5-YL]BENZOYL}-4-{[2-(PHENYLSULFANYL)ETHYL]AMINO}BENZENESULFONAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM Bcl-2 U-15N,13C, 25 mM Deuterated TRIS, 1 mM deuterated dithiothreitol, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2O21 Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-2 in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–34（32 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 43B 3-NITRO-N-{4-[2-(2-PHENYLETHYL)-1,3-BENZOTHIAZOL-5-YL]BENZOYL}-4-{[2-(PHENYLSULFANYL)ETHYL]AMINO}BENZENESULFONAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM TRIS; 150 mM sodium chloride；压力 1
NMR样品组成 25mM TRIS buffer; 150 mM sodium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2O22 Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-2 in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-29 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3–34（32 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 LIU N-[(4-{[1,1-dimethyl-2-(phenylthio)ethyl]amino}-3-nitrophenyl)sulfonyl]-4-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)benzamide × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM TRIS; 150 mM sodium chloride；压力 1
NMR样品组成 25 mM TRIS buffer; 150 mM sodium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2O2F Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-2 in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 8–31（24 aa）
链 A 92–204（113 aa）
未记录 LI0 4-(4-BENZYL-4-METHOXYPIPERIDIN-1-YL)-N-[(4-{[1,1-DIMETHYL-2-(PHENYLTHIO)ETHYL]AMINO}-3-NITROPHENYL)SULFONYL]BENZAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM TRIS; 150 mM sodium chloride；压力 1
NMR样品组成 25mM TRIS buffer; 150 mM sodium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2W3L Crystal Structure of Chimaeric Bcl2-xL and Phenyl Tetrahydroisoquinoline Amide Complex 提交 2008-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 9–33（25 aa） 片段：RESIDUES 9-33,92-206
链 A 92–206（115 aa） 片段：RESIDUES 9-33,92-206
未记录 DRO 1-(2-{[(3S)-3-(aminomethyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]carbonyl}phenyl)-4-chloro-5-methyl-N,N-diphenyl-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.258
2W3L Crystal Structure of Chimaeric Bcl2-xL and Phenyl Tetrahydroisoquinoline Amide Complex 提交 2008-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 9–33（25 aa） 片段：RESIDUES 9-33,92-206
链 B 92–206（115 aa） 片段：RESIDUES 9-33,92-206
未记录 DRO 1-(2-{[(3S)-3-(aminomethyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]carbonyl}phenyl)-4-chloro-5-methyl-N,N-diphenyl-1H-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.258
2XA0 Crystal structure of BCL-2 in complex with a BAX BH3 peptide 提交 2010-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–207（207 aa） 片段：RESIDUES 1-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SODIUM ACETATE (PH 4.2), 3.0 M SODIUM FORMATE
分辨率 2.70 Å R-free 0.242
2XA0 Crystal structure of BCL-2 in complex with a BAX BH3 peptide 提交 2010-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–207（207 aa） 片段：RESIDUES 1-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.1 M SODIUM ACETATE (PH 4.2), 3.0 M SODIUM FORMATE
分辨率 2.70 Å R-free 0.242
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–33（33 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
链 A 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–33（33 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
链 B 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–33（33 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
链 C 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–33（33 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
链 D 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–33（33 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
链 E 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 1–33（33 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
链 F 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4IEH Crystal Structure of human Bcl-2 in complex with a small molecule inhibitor targeting Bcl-2 BH3 domain interactions 提交 2012-12-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 A 92–207（116 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 1E9 N-(6-{4-[(4'-chlorobiphenyl-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-1,1-dioxido-1,2-benzothiazol-3-yl)-4-{[(2R)-4-(dimethylamino)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-nitrobenzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.6；277 K；0.05 M succinic acid, 0.25 M sodium malonate, 12% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.218
4LVT Bcl_2-Navitoclax (ABT-263) Complex 提交 2013-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
链 A 92–207（116 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
突变：A2P 突变：A2P 1XJ 4-(4-{[2-(4-chlorophenyl)-5,5-dimethylcyclohex-1-en-1-yl]methyl}piperazin-1-yl)-N-[(4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-[(trifluoromethyl)sulfonyl]phenyl)sulfonyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.2；296 K；0.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na Acetate, 0.2 M NaCl, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.05 Å R-free 0.222
4LVT Bcl_2-Navitoclax (ABT-263) Complex 提交 2013-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–34（34 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
链 B 92–207（116 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
突变：A2P 突变：A2P 1XJ 4-(4-{[2-(4-chlorophenyl)-5,5-dimethylcyclohex-1-en-1-yl]methyl}piperazin-1-yl)-N-[(4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-[(trifluoromethyl)sulfonyl]phenyl)sulfonyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.2；296 K；0.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na Acetate, 0.2 M NaCl, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.05 Å R-free 0.222
4LXD Bcl_2-Navitoclax Analog (without Thiophenyl) Complex 提交 2013-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
链 A 92–207（116 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
突变：A2P 突变：A2P 1XV 4-(4-{[4-(4-chlorophenyl)-5,6-dihydro-2H-pyran-3-yl]methyl}piperazin-1-yl)-N-{[3-nitro-4-(tetrahydro-2H-pyran-4-ylamino)phenyl]sulfonyl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；296 K；1.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES, 8%(V/V) PEG400, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 1.90 Å R-free 0.212
4MAN Bcl_2-Navitoclax Analog (with Indole) Complex 提交 2013-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
链 A 92–207（116 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
未记录 1Y1 4-[4-({4'-chloro-3-[2-(dimethylamino)ethoxy]biphenyl-2-yl}methyl)piperazin-1-yl]-2-(1H-indol-5-yloxy)-N-({3-nitro-4-[(tetrahydro-2H-pyran-4-ylmethyl)amino]phenyl}sulfonyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；296 K；1.5 M Li2SO4, 0.1 M Tris HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.07 Å R-free 0.234
4MAN Bcl_2-Navitoclax Analog (with Indole) Complex 提交 2013-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–34（34 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
链 B 92–207（116 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-34, 92-207
未记录 1Y1 4-[4-({4'-chloro-3-[2-(dimethylamino)ethoxy]biphenyl-2-yl}methyl)piperazin-1-yl]-2-(1H-indol-5-yloxy)-N-({3-nitro-4-[(tetrahydro-2H-pyran-4-ylmethyl)amino]phenyl}sulfonyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；296 K；1.5 M Li2SO4, 0.1 M Tris HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.07 Å R-free 0.234
5AGW Bcl-2 alpha beta-1 complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–34（34 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
链 B 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；0.02M CACL2, 0.1M MOPS PH7.0, 10% 2-PROPANOL
分辨率 2.69 Å R-free 0.272
5AGW Bcl-2 alpha beta-1 complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
链 A 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；0.02M CACL2, 0.1M MOPS PH7.0, 10% 2-PROPANOL
分辨率 2.69 Å R-free 0.272
5AGX Bcl-2 alpha beta-1 LINEAR complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
链 A 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；PH 7.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.245
5AGX Bcl-2 alpha beta-1 LINEAR complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–34（34 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
链 B 92–207（116 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；PH 7.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.245
5JSN Bcl2-inhibitor complex 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–207（207 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；30% Jeffamine ED-2001, pH7.0/100 mM HEPES pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.205
5JSN Bcl2-inhibitor complex 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–207（207 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；30% Jeffamine ED-2001, pH7.0/100 mM HEPES pH 7.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.205
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–34（34 aa）
链 B 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–34（34 aa）
链 C 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAU Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–34（34 aa）
链 D 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-tris chloride, pH 5.5, ).2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.75 Å R-free 0.215
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–34（34 aa）
链 B 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–34（34 aa）
链 C 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAX Bcl-2 complex with Beclin 1 BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–34（34 aa）
链 D 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；bis-tris chloride, pH 4.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–34（34 aa）
链 B 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–34（34 aa）
链 C 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–34（34 aa）
链 D 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
6GL8 Crystal structure of Bcl-2 in complex with the novel orally active inhibitor S55746 提交 2018-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 9–33（25 aa）
链 A 92–206（115 aa）
突变：;L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E ; 突变：;L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E,L95K, Q99E ; F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；284 K；0.1 M sodium acetate buffer pH 5.25, 20% Jeffamine600, 10% PEG3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.194
6IWB Crystal structure of a computationally designed protein (LD3) in complex with BCL-2 提交 2018-12-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–34（34 aa） 片段：UNP residues 1-34,UNP residues 92-207
链 B 92–207（116 aa） 片段：UNP residues 1-34,UNP residues 92-207
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；17% PEG2000, 0.1M Sodium Succinate (pH 5.5), 0.32M Ammonium Sulfate
分辨率 2.50 Å R-free 0.275
6IWB Crystal structure of a computationally designed protein (LD3) in complex with BCL-2 提交 2018-12-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–34（34 aa） 片段：UNP residues 1-34,UNP residues 92-207
链 D 92–207（116 aa） 片段：UNP residues 1-34,UNP residues 92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295.15 K；17% PEG2000, 0.1M Sodium Succinate (pH 5.5), 0.32M Ammonium Sulfate
分辨率 2.50 Å R-free 0.275
6O0K crystal structure of BCL-2 with venetoclax 提交 2019-02-16 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；5% PEG4K, 40%PEG400, 0.1M MES pH 6.0
分辨率 1.62 Å R-free 0.202
6O0L crystal structure of BCL-2 G101V mutation with venetoclax 提交 2019-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：G101V,G101V,G101V 突变：G101V,G101V,G101V LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG4K, 35% PEG400, 0.08M MES pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6O0L crystal structure of BCL-2 G101V mutation with venetoclax 提交 2019-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–34（34 aa）
链 C 92–207（116 aa）
突变：G101V,G101V,G101V 突变：G101V,G101V,G101V LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG4K, 35% PEG400, 0.08M MES pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6O0M crystal structure of BCL-2 F104L mutation with venetoclax 提交 2019-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：F104L,F104L,F104L 突变：F104L,F104L,F104L LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；5% PEG4K, 40% PEG400, 0.1M MES pH 6.0
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
6O0O crystal structure of BCL-2 G101V mutation with S55746 提交 2019-02-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：G101V,G101V,G101V 突变：G101V,G101V,G101V F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；291 K；0.1M NaCl 0.1M Succinic acid-NaOH pH5.0 10% PEG200
分辨率 2.00 Å R-free 0.267
6O0O crystal structure of BCL-2 G101V mutation with S55746 提交 2019-02-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–34（34 aa）
链 C 92–207（116 aa）
突变：G101V,G101V,G101V 突变：G101V,G101V,G101V F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；291 K；0.1M NaCl 0.1M Succinic acid-NaOH pH5.0 10% PEG200
分辨率 2.00 Å R-free 0.267
6O0P crystal structure of BCL-2 G101A mutation with venetoclax 提交 2019-02-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：G101A,G101A,G101A 突变：G101A,G101A,G101A LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；5% PEG4K, 40% PEG400, 0.1M MES pH 6.0
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
6QG8 Structure of human Bcl-2 in complex with PUMA BH3 peptide 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 10–33（24 aa）
链 A 92–203（112 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；284 K；from 0.2M MgCl2, 25% PegMME 2k, 0.1M Na Acetate buffer pH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.216
6QGG Structure of human Bcl-2 in complex with analogue of ABT-737 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–33（24 aa）
链 A 92–203（112 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D J1H [(3~{R})-3-[[4-[[4-[4-[[2-(4-chlorophenyl)phenyl]methyl]piperazin-1-yl]phenyl]carbonylsulfamoyl]-2-nitro-phenyl]amino]-4-phenylsulfanyl-butyl]-(2-hydroxy-2-oxoethyl)-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；284 K；1.4M Na/K phosphate pH 5.6
分辨率 1.50 Å R-free 0.173
6QGH Structure of human Bcl-2 in complex with ABT-263 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–33（24 aa）
链 A 92–203（112 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 1XJ 4-(4-{[2-(4-chlorophenyl)-5,5-dimethylcyclohex-1-en-1-yl]methyl}piperazin-1-yl)-N-[(4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-[(trifluoromethyl)sulfonyl]phenyl)sulfonyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；284 K；0.2 M NaCl, 25% PEG3350 and 0.1 M Bis-Tris buffer pH 5.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.206
6QGJ Structure of human Bcl-2 in complex with fragment/ABT-263 hybrid 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–33（24 aa）
链 A 92–203（112 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D J1T 4-[4-[(1~{R})-1-(6-methoxy-1,3-benzodioxol-5-yl)-2-pyrrolidin-1-yl-ethyl]phenyl]-~{N}-[4-[[(2~{R})-4-morpholin-4-yl-1-phenylsulfanyl-butan-2-yl]amino]-3-(trifluoromethylsulfonyl)phenyl]sulfonyl-benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；284 K；0.15M KSCN, 20% PEG1500 and 0.1M Na acetate buffer pH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
6QGK Structure of human Bcl-2 in complex with THIQ-phenyl pyrazole compound 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–33（24 aa）
链 A 92–203（112 aa）
突变：H20S, E42A, E44A, L95Q, R106L, E114Q, F124G, R127Y, G128A, R129S, E135A, E165A, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, E42A, E44A, L95Q, R106L, E114Q, F124G, R127Y, G128A, R129S, E135A, E165A, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D J1Q 1-[2-[[(3~{S})-3-(aminomethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]phenyl]-~{N},~{N}-dibutyl-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；0.2M Ca Acetate, 15% PEG4k, 0.1M Tris buffer pH 7.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.202
7LHB Crystal structure of Bcl-2 in complex with prodrug ABBV-167 提交 2021-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa） 片段：UNP residues 35-91 replaced with DVEENRTEAPEGTESE
链 A 92–207（116 aa） 片段：UNP residues 35-91 replaced with DVEENRTEAPEGTESE
突变：A4P, R26K 突变：A4P, R26K XZD Phosphoric acid mono-[5-(5-{4-[2-(4-chloro-phenyl)-4,4-dimethyl-cyclohex-1-enylmethyl]-piperazin-1-yl}-2-{3-nitro-4-[(tetrahydro-pyran-4-ylmethyl)-amino]-benzenesulfonylaminocarbonyl}-phenoxy)-pyrrolo[2,3-b]pyridin-7-ylmethyl] ester × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20% w/v PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M calcium chloride
分辨率 2.07 Å R-free 0.238
7LHB Crystal structure of Bcl-2 in complex with prodrug ABBV-167 提交 2021-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–34（34 aa） 片段：UNP residues 35-91 replaced with DVEENRTEAPEGTESE
链 B 92–207（116 aa） 片段：UNP residues 35-91 replaced with DVEENRTEAPEGTESE
突变：A4P, R26K 突变：A4P, R26K XZD Phosphoric acid mono-[5-(5-{4-[2-(4-chloro-phenyl)-4,4-dimethyl-cyclohex-1-enylmethyl]-piperazin-1-yl}-2-{3-nitro-4-[(tetrahydro-pyran-4-ylmethyl)-amino]-benzenesulfonylaminocarbonyl}-phenoxy)-pyrrolo[2,3-b]pyridin-7-ylmethyl] ester × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20% w/v PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M calcium chloride
分辨率 2.07 Å R-free 0.238
7LHB Crystal structure of Bcl-2 in complex with prodrug ABBV-167 提交 2021-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–34（34 aa） 片段：UNP residues 35-91 replaced with DVEENRTEAPEGTESE
链 C 92–207（116 aa） 片段：UNP residues 35-91 replaced with DVEENRTEAPEGTESE
突变：A4P, R26K 突变：A4P, R26K XZD Phosphoric acid mono-[5-(5-{4-[2-(4-chloro-phenyl)-4,4-dimethyl-cyclohex-1-enylmethyl]-piperazin-1-yl}-2-{3-nitro-4-[(tetrahydro-pyran-4-ylmethyl)-amino]-benzenesulfonylaminocarbonyl}-phenoxy)-pyrrolo[2,3-b]pyridin-7-ylmethyl] ester × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；20% w/v PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M calcium chloride
分辨率 2.07 Å R-free 0.238
7Y90 Crystal Structure Analysis of cp1 bound BCL2 提交 2022-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 JFF (2R)-3-[2-(aminomethyl)-3-azanyl-1-[4-[2-(2-chloranylethanoylamino)ethylcarbamoyl]phenyl]prop-1-enyl]sulfanyl-2-(carboxyamino)propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M Bis-Tris pH6.5, 2.0M Ammonium Sulfate
分辨率 2.09 Å R-free 0.276
7YA5 Crystal structure analysis of cp1 bound BCL2/G101V 提交 2022-06-27 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V JFF (2R)-3-[2-(aminomethyl)-3-azanyl-1-[4-[2-(2-chloranylethanoylamino)ethylcarbamoyl]phenyl]prop-1-enyl]sulfanyl-2-(carboxyamino)propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；Calcium acetate, PEG 3350
分辨率 1.85 Å R-free 0.243
7YB7 anti-apoptotic protein BCL-2-M12 提交 2022-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 10–35（26 aa）
链 A 92–203（112 aa）
未记录 IQ8 N-(2-acetamidoethyl)-4-(4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.5 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1.0 M Lithium sulfate monohydrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.194
7YB7 anti-apoptotic protein BCL-2-M12 提交 2022-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 10–35（26 aa）
链 B 92–203（112 aa）
未记录 IQ8 N-(2-acetamidoethyl)-4-(4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.5 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1.0 M Lithium sulfate monohydrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.194
8FY1 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-2) 提交 2023-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–207（207 aa）
未记录 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.56 Å R-free 0.250
8FY2 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/WH244/BCL-2) 提交 2023-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–207（207 aa）
未记录 YFH N-({4-[2-(4-{[(4R)-4'-chloro-4-methyl-6-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-[(1R,4R)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptan-5-yl]-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}-2,3,4,5-tetrahydro[1,1'-biphenyl]-4-yl]methyl}piperazin-1-yl)-2-oxoethyl]piperazin-1-yl}acetyl)-3-methyl-L-valyl-(4S)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Tris-Cl pH 8.7, 18% PEG 8000, 0.2 M MgCl2 and 3% 1,6-Hexanediol
分辨率 2.98 Å R-free 0.279
8HLL Crystal structure of p53/BCL2 fusion complex (complex 1) 提交 2022-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 10–35（26 aa）
链 B 92–203（112 aa）
突变：H20S,L95Q,R106L,F124G,R127Y,G128A,R129S,P168V,L175A,T178A,E179T,R183D 突变：H20S,L95Q,R106L,F124G,R127Y,G128A,R129S,P168V,L175A,T178A,E179T,R183D ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；PEG 8K 8%-13%, 0.1M HEPES, 0.8% ethylene glycol
分辨率 2.62 Å R-free 0.280
8HLM Crystal structure of p53/BCL2 fusion complex (complex 2) 提交 2022-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 10–35（26 aa）
链 B 92–203（112 aa）
突变：H20S,L95Q,R106L,F124G,R127Y,G128A,R129S,P168V,L175A,T178A,E179T,R183D 突变：H20S,L95Q,R106L,F124G,R127Y,G128A,R129S,P168V,L175A,T178A,E179T,R183D ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.1 M Imidazole, PEG8K 15-21%
分辨率 2.52 Å R-free 0.290
8HLN Crystal structure of p53/BCL2 fusion complex(complex3) 提交 2022-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 10–35（26 aa）
链 B 92–203（112 aa）
突变：H20S,L95Q,R106L,F124G,R127Y,G128A,R129S,P168V,L175A,T178A,E179T,R183D 突变：H20S,L95Q,R106L,F124G,R127Y,G128A,R129S,P168V,L175A,T178A,E179T,R183D ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；291 K；0.1 M HEPES, PEG8000 8%-13%, 0.8% ethylene glycol
分辨率 2.35 Å R-free 0.253
8U27 Bcl-2-xL complexed with compound 35 提交 2023-09-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–218（127 aa）
未记录 ULL propan-2-yl {4-[(5S)-1-(4-bromobenzoyl)-5-phenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazol-3-yl]phenyl}carbamate × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.3；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0375；压力 1
NMR测量条件 pH 7.3；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0375；压力 1
NMR测量条件 pH 7.3；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0375；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bcl-2-xL, 300 uM Compound 35, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 300 uM [U-99% 15N] Bcl-2-xL, 300 uM Compound 35, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 300 uM [U-10% 13C] Bcl-2-xL, 300 uM Compound 35, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
8VWX Human Bcl-2 (G101V Mutant)/Bcl-xL Chimera Fused to Maltose-Binding Protein 提交 2024-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–34（25 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris (pH 8.5), 25% PEG 3350, and 200 mM sodium chloride
分辨率 1.77 Å R-free 0.225
8VWZ Human Bcl-2 (G101V Mutant)/Bcl-xL Chimera Fused to MBP in Complex with Inhibitor S55746 提交 2024-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–34（25 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；100 mM bis-tris (pH 5.5), 2 M ammonium sulfate
分辨率 2.33 Å R-free 0.256
8VXM Human Bcl-2/Bcl-xL Chimera Fused to MBP in Complex with Inhibitor S55746 提交 2024-02-05 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–34（25 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris (pH 8.5), 25% PEG 3350, 200 mM lithium sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.243
8VXN Human Bcl-2/Bcl-xL Chimera Fused to Maltose-Binding Protein 提交 2024-02-05 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 10–34（25 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris (pH 8.0), 29% PEG 3350, 200 mM sodium chloride
分辨率 2.09 Å R-free 0.264
9O14 Crystal Structure of BCL-2 in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 2 NTA NITRILOTRIACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；15.0% PEG-3350 and 150 mM CsCl
分辨率 1.73 Å R-free 0.222
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–34（34 aa）
链 C 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–34（34 aa）
链 E 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–34（34 aa）
链 G 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 1–34（34 aa）
链 I 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 1–34（34 aa）
链 K 92–207（116 aa）
突变：G101V 突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O16 Crystal Structure of human BCL-2 (R129L) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–34（34 aa）
链 A 92–207（116 aa）
突变：R129L 突变：R129L IMD IMIDAZOLE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG-3350, 200 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris, pH 8.5
分辨率 1.73 Å R-free 0.210

共 47 个其他 PDB 条目、79 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BCL2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34 作者链 A； PDB构建体 51–166； UniProt 92–207

PROTEIN (APOPTOSIS REGULATOR BCL-2 WITH PUTATIVE FLEXIBLE LOOP REPLACED WITH A PORTION OF APOPTOSIS REGULATOR BCL-X PROTEIN)

Homo sapiens

UniProt Q07817

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 29–44 未记录 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM；压力 ambient NMR样品组成：15N-Bcl-2(1); 15N,13C-BCL-2(1) | H2O NMR样品组成：15N,13C-Bcl-2(1) | D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1G5M Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1BXL STRUCTURE OF BCL-XL/BAK PEPTIDE COMPLEX, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-10-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 303 K
分辨率未提供
1G5J COMPLEX OF BCL-XL WITH PEPTIDE FROM BAD 提交 2000-11-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–44（44 aa） 片段：RESIDUES 1-209
链 A 85–209（125 aa） 片段：RESIDUES 1-209
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）40 mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成 15N-Bcl-xL/unlabeled Bad peptide; 15N,13C-Bcl-xL/unlabelled Bad peptide | H2O; D2O
分辨率未提供
1GJH HUMAN BCL-2, ISOFORM 2 提交 2001-05-31 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM；压力 AMBIENT
NMR样品组成 15N-Bcl-2(2); 15N,13C-BCL-2(2) | H2O
NMR样品组成 15N, 13C-Bcl-2(2) | D2O
分辨率未提供
1LXL NMR STRUCTURE OF BCL-XL, AN INHIBITOR OF PROGRAMMED CELL DEATH, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-04-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：RESIDUES 1-209, LACKING THE C-TERMINAL HYDROPHOBIC REGION
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.3；303 K
分辨率未提供
1MAZ X-RAY STRUCTURE OF BCL-XL, AN INHIBITOR OF PROGRAMMED CELL DEATH 提交 1996-04-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：RESIDUES 1-209
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å R-free 0.259
1R2D Structure of Human Bcl-XL at 1.95 Angstroms 提交 2003-09-26 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–211（211 aa） 片段：Bcl-XL
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.9M Ammonium Sulfate, 50mM Sodium Citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.217
1R2E Human Bcl-XL containing a Glu to Leu mutation at position 92 提交 2003-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–211（211 aa） 片段：Bcl-XL
突变：E92L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.9M Ammonium Sulfate, 50mM Sodium Citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.239
1R2G Human Bcl-XL containing a Phe to Trp mutation at position 97 提交 2003-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–211（211 aa） 片段：Bcl-XL
突变：F97W 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.9M Ammonium Sulfate, 50mM Sodium Citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.230
1R2H Human Bcl-XL containing an Ala to Leu mutation at position 142 提交 2003-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–211（211 aa） 片段：Bcl-XL
突变：A142L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.9M Ammonium Sulfate, 50mM Sodium Citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
1R2I Human Bcl-XL containing a Phe to Leu mutation at position 146 提交 2003-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–211（211 aa） 片段：Bcl-XL
突变：F146L 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；1.9M Ammonium Sulfate, 50mM Sodium Citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
1YSG Solution Structure of the Anti-apoptotic Protein Bcl-xL in Complex with "SAR by NMR" Ligands 提交 2005-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa）
链 A 85–209（125 aa）
未记录 4FC 4'-FLUORO-1,1'-BIPHENYL-4-CARBOXYLIC ACID × 1 TN1 5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-1-OL × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM Bcl-xL U-15N,13C; 50 mM sodium phosphate, 5 mM deuterated dithiothreitol, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
1YSI Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-xL in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2005-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa）
链 A 85–209（125 aa）
未记录 N3B N-[(4'-FLUORO-1,1'-BIPHENYL-4-YL)CARBONYL]-3-NITRO-4-{[2-(PHENYLSULFANYL)ETHYL]AMINO}BENZENESULFONAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR样品组成 1mM Bcl-xL U-15N,13C 50mM sodium phosphate, 5 mM deuterated Dithiothreitol, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
1YSN Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-xL complexed with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2005-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa）
链 A 85–209（125 aa）
未记录 43B 3-NITRO-N-{4-[2-(2-PHENYLETHYL)-1,3-BENZOTHIAZOL-5-YL]BENZOYL}-4-{[2-(PHENYLSULFANYL)ETHYL]AMINO}BENZENESULFONAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM Bcl-xL U-15N,13C, 50 mM sodium phosphate, 5 mM deuterated dithiothreitol, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2B48 Bcl-XL 3D Domain Swapped Dimer 提交 2005-09-22 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–211（211 aa） 片段：residues 1-211
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；277 K；100mM Na/K Phosphate, 42% 2-Methyl-2,4 Pentanediol, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.45 Å R-free 0.305
2LP8 SOLUTION STRUCTURE OF AN APOPTOSIS ACTIVATING PHOTOSWITCHABLE BAK PEPTIDE BOUND to BCL-XL 提交 2012-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–44（44 aa）
链 A 85–209（125 aa）
未记录 33B 3,3'-(E)-diazene-1,2-diylbis{6-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL- XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 5 MM 2- MERCAPTOETHANOL, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL- XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 MM [U-98% 13C U-98% 15N] BCL-XL, 1.1 MM PHOTOSWITCHABLE BAK, 5 MM SODIUM PHOSPHATE, 100% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LPC NMR STRUCTURE of Bcl-XL 提交 2012-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa）
链 A 85–209（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）5；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1.5 - 1.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] BCL-XL, 5 mM sodium phosphate, 5 mM 2-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2M03 Solution structure of BCL-xL determined with selective isotope labelling of I,L,V sidechains 提交 2012-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa）
突变：delta(45-84) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298.1 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-95% 2H; Ile,Leu,Val C1H3] BCL-xL, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
分辨率未提供
2M04 Solution structure of BCL-xL in complex with PUMA BH3 peptide 提交 2012-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa）
突变：delta(45-84) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298.1 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-95% 2H; Ile,Leu,Val C1H3] BCL-xL, 0.9 mM PUMA BH3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
NMR样品组成 0.9 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] BCL-xL, 0.9 mM PUMA BH3, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
分辨率未提供
2ME8 Solution Structure of BCL-xL in its p53-bound conformation determined with selective isotope labelling of I,L,V sidechains 提交 2013-09-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：UNP residues 1-209
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 0.6 mM [U- 98% 13C; U- 98% 15N; U- 98% 2H; U- I,LV CH3 1H] BCL-xL, 0.65 mM p53, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
2ME9 Solution structure of BCL-xL containing the alpha1-alpha2 disordered loop determined with selective isotope labelling of I,L,V sidechains 提交 2013-09-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：UNP residues 1-209
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 0.6 mM [U- 98% 13C; U- 98% 15N; U- 98% 2H; U- I,LV CH3 1H] BCL-xL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
2MEJ Solution Structure of the Complex Between BCL-xL and the p53 Core Domain determined with PRE restraints 提交 2013-09-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：UNP residues 1-209
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 13C; U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] BCL-xL, 0.1 mM p53, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 13C; U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.65 mM BCL-xL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S122C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S122C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S2C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] p53, 0.1 mM BCL-xL_C151S_S2C MTSL, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 0.1 mM [U-98% 15N; U-98% 2H] BCL-xL, 0.1 mM Co_p53, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
2O1Y Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-xL in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa）
链 A 85–209（125 aa）
未记录 43B 3-NITRO-N-{4-[2-(2-PHENYLETHYL)-1,3-BENZOTHIAZOL-5-YL]BENZOYL}-4-{[2-(PHENYLSULFANYL)ETHYL]AMINO}BENZENESULFONAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM sodium phosphate；压力 1
NMR样品组成 50mM sodium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2O21 Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-2 in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-29 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 43B 3-NITRO-N-{4-[2-(2-PHENYLETHYL)-1,3-BENZOTHIAZOL-5-YL]BENZOYL}-4-{[2-(PHENYLSULFANYL)ETHYL]AMINO}BENZENESULFONAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM TRIS; 150 mM sodium chloride；压力 1
NMR样品组成 25mM TRIS buffer; 150 mM sodium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2O22 Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-2 in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-29 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 LIU N-[(4-{[1,1-dimethyl-2-(phenylthio)ethyl]amino}-3-nitrophenyl)sulfonyl]-4-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)benzamide × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM TRIS; 150 mM sodium chloride；压力 1
NMR样品组成 25 mM TRIS buffer; 150 mM sodium chloride; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2O2M Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-xL in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–23（22 aa）
链 A 83–196（114 aa）
未记录 LI0 4-(4-BENZYL-4-METHOXYPIPERIDIN-1-YL)-N-[(4-{[1,1-DIMETHYL-2-(PHENYLTHIO)ETHYL]AMINO}-3-NITROPHENYL)SULFONYL]BENZAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM sodium phosphate；压力 1
NMR样品组成 50mM sodium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2O2N Solution structure of the anti-apoptotic protein Bcl-xL in complex with an acyl-sulfonamide-based ligand 提交 2006-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–23（22 aa）
链 A 83–196（114 aa）
未记录 LIW 4-[4-(BIPHENYL-2-YLMETHYL)PIPERAZIN-1-YL]-N-[(4-{[1,1-DIMETHYL-2-(PHENYLTHIO)ETHYL]AMINO}-3-NITROPHENYL)SULFONYL]BENZAMIDE × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM sodium phosphate；压力 1
NMR样品组成 50mM sodium phosphate buffer; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 A 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 C 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 E 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 G 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 A 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 C 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 C 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 E 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 E 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 G 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 G 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 E 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 G 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 G 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2P1L Structure of the Bcl-XL:Beclin 1 complex 提交 2007-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 A 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 C 1–26（26 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
链 C 83–209（127 aa） 片段：Bcl-XL Delta-loop
突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 突变：Loop 27-82 deletion mutant 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；24% (w/v) PEG-400, 0.1M HEPES pH7.5, 0.2M sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.50 Å R-free 0.262
2PON Solution structure of the Bcl-xL/Beclin-1 complex 提交 2007-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–44（44 aa） 片段：deletion of 45-84
链 B 85–196（112 aa） 片段：deletion of 45-84
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM potassium phosphate；压力 1
NMR样品组成 1.5mM unlabelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 99.9% D2O; 50mM potassium phosphate | 99.9% D2O
NMR样品组成 1.5mM uniformly 15N labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 90% H2O/10% D2O; 50mM potassium phosphate | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.5mM uniformly 15N/13C labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 99.9% D2O; 50mM potassium phosphate | 99.9% D2O
NMR样品组成 1.5mM 80% deuterated, uniformly 15N/13C labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 90% H2O/10% D2O; 50mM potassium phosphate | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.5mM 100% deuterated, uniformly 15N labelled Bcl-xL/Beclin-1 complex in 90% H2O/10% D2O; 50mM potassium phosphate | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2YJ1 Puma BH3 foldamer in complex with Bcl-xL 提交 2011-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 C 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 C 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；0.05 M CADMIUM SULPHATE 1.0 M SODIUM ACETATE 0.1 M HEPES PH 7.5.
分辨率 2.24 Å R-free 0.253
2YQ6 Structure of Bcl-xL bound to BimSAHB 提交 2012-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 GOL GLYCEROL × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 15 % (W/V) PEG 400, 5 % PEG 3000, 10 % GLYCEROL AND 0.1 M MES PH 6.5.
分辨率 1.80 Å R-free 0.201
2YQ7 Structure of Bcl-xL bound to BimLOCK 提交 2012-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 15 % (W/V) PEG 400, 5 % PEG 3000, 10 % GLYCEROL AND 0.1 M MES PH 6.5.
分辨率 1.90 Å R-free 0.208
2YXJ Crystal structure of Bcl-xL in complex with ABT-737 提交 2007-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa） 片段：Bcl-xL
链 A 85–209（125 aa） 片段：Bcl-xL
未记录 CL CHLORIDE ION × 1 N3C 4-{4-[(4'-CHLOROBIPHENYL-2-YL)METHYL]PIPERAZIN-1-YL}-N-{[4-({(1R)-3-(DIMETHYLAMINO)-1-[(PHENYLTHIO)METHYL]PROPYL}AMINO)-3-NITROPHENYL]SULFONYL}BENZAMIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.85M Sodium Citrate, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
2YXJ Crystal structure of Bcl-xL in complex with ABT-737 提交 2007-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–44（44 aa） 片段：Bcl-xL
链 B 85–209（125 aa） 片段：Bcl-xL
未记录 N3C 4-{4-[(4'-CHLOROBIPHENYL-2-YL)METHYL]PIPERAZIN-1-YL}-N-{[4-({(1R)-3-(DIMETHYLAMINO)-1-[(PHENYLTHIO)METHYL]PROPYL}AMINO)-3-NITROPHENYL]SULFONYL}BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.85M Sodium Citrate, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.249
3CVA Human Bcl-xL containing a Trp to Ala mutation at position 137 提交 2008-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 1–211（211 aa） 片段：residues in database 1-211
突变：W137A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；1.9M ammonium sulfate, 50mM MES, pH 5.8, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.307
3FDL Bim BH3 peptide in complex with Bcl-xL 提交 2008-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
链 A 83–209（127 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1M Sodium citrate, 0.1M Sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.208
3FDL Bim BH3 peptide in complex with Bcl-xL 提交 2008-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
链 A 83–209（127 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；1M Sodium citrate, 0.1M Sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.78 Å R-free 0.208
3FDM alpha/beta foldamer in complex with Bcl-xL 提交 2008-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
链 A 83–209（127 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
链 B 1–26（26 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
链 B 83–209（127 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M Lithium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.26 Å R-free 0.235
3FDM alpha/beta foldamer in complex with Bcl-xL 提交 2008-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–26（26 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
链 C 83–209（127 aa） 片段：residue 1-209, Deletion of amino acids 27 to 82
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% (w/v) PEG 3350, 0.2M Lithium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.26 Å R-free 0.235
3INQ Crystal structure of BCL-XL in complex with W1191542 提交 2009-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：residues 1-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：residues 1-209
链 B 1–26（26 aa） 片段：residues 1-209
链 B 83–209（127 aa） 片段：residues 1-209
突变：DELETION OF AMINO ACIDS 27 TO 82 突变：DELETION OF AMINO ACIDS 27 TO 82 突变：DELETION OF AMINO ACIDS 27 TO 82 突变：DELETION OF AMINO ACIDS 27 TO 82 X0J 4-[4-(biphenyl-3-ylmethyl)piperazin-1-yl]-N-{[4-({(1R)-3-(dimethylamino)-1-[(phenylsulfanyl)methyl]propyl}amino)-3-nitrophenyl]sulfonyl}benzamide × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.2M Calcium Acetate, 10%(w/v) PEG8000, 0.1M Imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
3IO8 BimL12F in complex with Bcl-xL 提交 2009-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：residues 1-26, and residues 83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：residues 1-26, and residues 83-209
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.02M Zinc Acetate 2.5M Sodium Chloride 0.1M Imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.231
3IO8 BimL12F in complex with Bcl-xL 提交 2009-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa） 片段：residues 1-26, and residues 83-209
链 C 83–209（127 aa） 片段：residues 1-26, and residues 83-209
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.02M Zinc Acetate 2.5M Sodium Chloride 0.1M Imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.231
3PL7 Crystal structure of Bcl-xL in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：Bcl-xL, UNP residues 1-209
突变：deletion of residues 45-84 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；13% Peg 6000, 0.2M CaCl2, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.61 Å R-free 0.249
3PL7 Crystal structure of Bcl-xL in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–209（209 aa） 片段：Bcl-xL, UNP residues 1-209
突变：deletion of residues 45-84 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；13% Peg 6000, 0.2M CaCl2, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.61 Å R-free 0.249
3QKD Crystal structure of Bcl-xL in complex with a Quinazoline sulfonamide inhibitor 提交 2011-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa）
未记录 HI0 (R)-N-(7-(4-((4'-chlorobiphenyl-2-yl)methyl)piperazin-1-yl)quinazolin-4-yl)-4-(4-(dimethylamino)-1-(phenylthio)butan-2-ylamino)-3-nitrobenzenesulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1.1M Sodium Citrate, 0.1M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.02 Å R-free 0.231
3QKD Crystal structure of Bcl-xL in complex with a Quinazoline sulfonamide inhibitor 提交 2011-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–209（209 aa）
未记录 HI0 (R)-N-(7-(4-((4'-chlorobiphenyl-2-yl)methyl)piperazin-1-yl)quinazolin-4-yl)-4-(4-(dimethylamino)-1-(phenylthio)butan-2-ylamino)-3-nitrobenzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1.1M Sodium Citrate, 0.1M Tris pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.02 Å R-free 0.231
3R85 Crystal structure of human SOUL BH3 domain in complex with Bcl-xL 提交 2011-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
链 A 83–197（115 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M sodium sulphate, 15% PEG 6000, 0.3M 1-butyl-3-methylimidazolium 2-(2-methoxyethoxy)ethyl sulphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.263
3R85 Crystal structure of human SOUL BH3 domain in complex with Bcl-xL 提交 2011-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–26（26 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
链 B 83–197（115 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M sodium sulphate, 15% PEG 6000, 0.3M 1-butyl-3-methylimidazolium 2-(2-methoxyethoxy)ethyl sulphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.263
3R85 Crystal structure of human SOUL BH3 domain in complex with Bcl-xL 提交 2011-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
链 C 83–197（115 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M sodium sulphate, 15% PEG 6000, 0.3M 1-butyl-3-methylimidazolium 2-(2-methoxyethoxy)ethyl sulphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.263
3R85 Crystal structure of human SOUL BH3 domain in complex with Bcl-xL 提交 2011-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–26（26 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
链 D 83–197（115 aa） 片段：residues 1-209 with the deletion of residues 27-82
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M sodium sulphate, 15% PEG 6000, 0.3M 1-butyl-3-methylimidazolium 2-(2-methoxyethoxy)ethyl sulphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.263
3SP7 Crystal Structure of Bcl-xL bound to BM903 提交 2011-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 A 85–209（125 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 03B 5-(4-chlorophenyl)-4-{3-[4-(4-{[(4-{[(2R)-4-(dimethylamino)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-nitrophenyl)sulfonyl]amino}phenyl)piperazin-1-yl]phenyl}-1,2-dimethyl-1H-pyrrole-3-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 4 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.5；293 K；4% PEG3000, 0.6 M zinc acetate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.40 Å R-free 0.185
3SPF Crystal Structure of Bcl-xL bound to BM501 提交 2011-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 A 85–209（125 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 B50 4-(4-chlorophenyl)-1-[(3S)-3,4-dihydroxybutyl]-N-[3-(4-methylpiperazin-1-yl)propyl]-3-phenyl-1H-pyrrole-2-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9；293 K；1.2 M sodium citrate, 25 mM CHES, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.204
3WIZ Crystal structure of Bcl-xL in complex with compound 10 提交 2013-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–44（44 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-44, 85-209
链 A 85–209（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-44, 85-209
链 B 1–44（44 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-44, 85-209
链 B 85–209（125 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-44, 85-209
未记录 LC6 7-(4-{[(4-{[(2R)-4-(dimethylamino)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-nitrophenyl)sulfonyl]carbamoyl}-2-methylphenyl)-3-[3-(naphthalen-1-yloxy)propyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-2-carboxylic acid × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Na-K phosphate pH 6.5, 0.72M sodium malonate, 0.84% MEGA-8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.45 Å R-free 0.238
3ZK6 Crystal structure of Bcl-xL in complex with inhibitor (Compound 2). 提交 2013-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–40（40 aa） 片段：RESIDUES 1-40 AND 81-209
链 A 81–209（129 aa） 片段：RESIDUES 1-40 AND 81-209
未记录 H1I N-(3-(5-(1-(2-(benzo[d]thiazol-2-yl)hydrazono)ethyl)furan-2-yl)phenylsulfonyl)-6-phenylhexanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 2.2 M (NH4)2 SO4, 0.1 M BIS TRIS, PH 5.5
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3ZK6 Crystal structure of Bcl-xL in complex with inhibitor (Compound 2). 提交 2013-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–40（40 aa） 片段：RESIDUES 1-40 AND 81-209
链 B 81–209（129 aa） 片段：RESIDUES 1-40 AND 81-209
未记录 H1I N-(3-(5-(1-(2-(benzo[d]thiazol-2-yl)hydrazono)ethyl)furan-2-yl)phenylsulfonyl)-6-phenylhexanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 2.2 M (NH4)2 SO4, 0.1 M BIS TRIS, PH 5.5
分辨率 2.48 Å R-free 0.261
3ZLN Crystal structure of BCL-XL in complex with inhibitor (Compound 3) 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa） 片段：RESIDUES 1-44 AND 85-209
链 A 85–209（125 aa） 片段：RESIDUES 1-44 AND 85-209
未记录 H0Y 6-[(8E)-8-(1,3-benzothiazol-2-ylhydrazinylidene)-6,7-dihydro-5H-naphthalen-2-yl]pyridine-2-carboxylic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；1.8 M (NH4)2 SO4, 40 MM MG2 SO4, 10 MM TRIS PH 8.0
分辨率 2.29 Å R-free 0.246
3ZLO Crystal structure of BCL-XL in complex with inhibitor (Compound 6) 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–44（44 aa） 片段：RESIDUES 1-44 AND 85-209
链 A 85–209（125 aa） 片段：RESIDUES 1-44 AND 85-209
未记录 X8U 2-[(8E)-8-(1,3-benzothiazol-2-ylhydrazinylidene)-6,7-dihydro-5H-naphthalen-2-yl]-5-(4-phenylbutyl)-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；2 M (NH4)2SO4, 0.5 M GUANADINE HCL, 0.1 M MES PH 6.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.282
3ZLR Crystal structure of BCL-XL in complex with inhibitor (WEHI-539) 提交 2013-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 X0B 5-[3-[4-(aminomethyl)phenoxy]propyl]-2-[(8E)-8-(1,3-benzothiazol-2-ylhydrazinylidene)-6,7-dihydro-5H-naphthalen-2-yl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；1.6 M (NH4)2 SO4, 100 MM MES PH 5.5
分辨率 2.03 Å R-free 0.208
4A1U Crystal structure of alpha-beta-foldamer 2c in complex with Bcl-xL 提交 2011-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；1.5 M AMMONIUM SULPHATE, 0.1 M TRIS PH 8.5, 12% (V/V) GLYCEROL
分辨率 1.54 Å R-free 0.198
4A1W Crystal structure of alpha-beta foldamer 4c in complex with Bcl-xL 提交 2011-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 D 1–26（26 aa）
链 D 83–209（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；25% (W/V) PEG 3350, 0.2 M LITHIUM SULFATE, 0.1 M HEPES PH 7.5.
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4A1W Crystal structure of alpha-beta foldamer 4c in complex with Bcl-xL 提交 2011-09-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
链 C 1–26（26 aa）
链 C 83–209（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；25% (W/V) PEG 3350, 0.2 M LITHIUM SULFATE, 0.1 M HEPES PH 7.5.
分辨率 2.50 Å R-free 0.264
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4AQ3 HUMAN BCL-2 WITH PHENYLACYLSULFONAMIDE INHIBITOR 提交 2012-04-12 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-33 AND 92-207 OF P10415 AND RESIDUES 29-44 OF Q07817
未记录 398 N,N-dibutyl-4-chloranyl-1-[2-(3,4-dihydro-1H-isoquinolin-2-ylcarbonyl)-4-[(7-iodanylnaphthalen-2-yl)sulfonylcarbamoyl]phenyl]-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å R-free 0.245
4BPK Bcl-xL bound to alpha beta Puma BH3 peptide 5 提交 2013-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 CD CADMIUM ION × 15 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1M HEPES, PH7.5 1M SODIUM ACETATE 50MM CADMIUM SULPHATE
分辨率 1.76 Å R-free 0.252
4C52 Crystal structure of Bcl-xL in complex with benzoylurea compound (39b) 提交 2013-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 X0D (R)-2-(3-(3-((2,4-DIFLUOROPENYL)ETHYNYL)BENZOYL)-3-PROPYLUREIDO)-3-(ISOBUTYLTHIO) PROPANOIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；1.4 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES PH 6.5, 25% (V/V) ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.05 Å R-free 0.216
4C5D Crystal structure of Bcl-xL in complex with benzoylurea compound (42) 提交 2013-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
未记录 X0R (R)-3-(4-BROMOBENZYLTHIO)-2-(3-(3-((2,4-DIFLUOROPHENYL)ETHYNYL)BENZOYL)-3-PROPYLUREIDO)PROPANOIC ACID × 4 SO4 SULFATE ION × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；1.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M MES PH 6.5, 25% (V/V) ETHYLENE GLYCOL
分辨率 2.30 Å R-free 0.242
4CIN Complex of Bcl-xL with its BH3 domain 提交 2013-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 C 79–102（24 aa） 片段：BH3 DOMAIN, RESIDUES 79-102
未记录 CA CALCIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；40% (V/V) PEG400, 0.2M CALCIUM ACETATE, 0.1M HEPES, PH7.5
分辨率 2.69 Å R-free 0.271
4CIN Complex of Bcl-xL with its BH3 domain 提交 2013-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–26（26 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 B 83–209（127 aa） 片段：RESIDUES 1-26,83-209
链 D 79–102（24 aa） 片段：BH3 DOMAIN, RESIDUES 79-102
未记录 CA CALCIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；40% (V/V) PEG400, 0.2M CALCIUM ACETATE, 0.1M HEPES, PH7.5
分辨率 2.69 Å R-free 0.271
4EHR Crystal structure of Bcl-Xl complex with 4-(5-butyl-3-(hydroxymethyl)-1-phenyl-1h-pyrazol-4-yl)-3-(3,4-dihydro-2(1h)-isoquinolinylcarbonyl)-n-((2-(trimethylsilyl)ethyl)sulfonyl)benzamide 提交 2012-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-209
未记录 0Q5 4-[5-butyl-3-(hydroxymethyl)-1-phenyl-1H-pyrazol-4-yl]-3-(3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-ylcarbonyl)-N-{[2-(trimethylsilyl)ethyl]sulfonyl}benzamide × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.09 Å R-free 0.283
4HNJ Crystallographic structure of BCL-xL domain-swapped dimer in complex with PUMA BH3 peptide at 2.9A resolution 提交 2012-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–209（209 aa）
链 B 1–209（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；0.2 M CaCl2, 0.1 M NaOAc, 20% V/V isopropanol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.90 Å R-free 0.254
4IEH Crystal Structure of human Bcl-2 in complex with a small molecule inhibitor targeting Bcl-2 BH3 domain interactions 提交 2012-12-13 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 1E9 N-(6-{4-[(4'-chlorobiphenyl-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-1,1-dioxido-1,2-benzothiazol-3-yl)-4-{[(2R)-4-(dimethylamino)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-nitrobenzenesulfonamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.6；277 K；0.05 M succinic acid, 0.25 M sodium malonate, 12% PEG3350, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
分辨率 2.10 Å R-free 0.218
4PPI Crystal structure of Bcl-xL hexamer 提交 2014-02-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–209（209 aa） 片段：Bcl-xl, UNP residues 1-209, with deletion of residues 45-84
未记录 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；291 K；1.0M sodium citrate, 0.1M CHES pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.85 Å R-free 0.269
4QVE Crystal structure of Bcl-xL in complex with BID BH3 domain 提交 2014-07-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：UNP residues 1-209
未记录 IMD IMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.5；291 K；2.0M Ammonium Sulphate, 0.2M Lithium Sulphate, 0.1M CAPS pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.05 Å R-free 0.224
4QVF Crystal structure of Bcl-xL in complex with BIM BH3 domain 提交 2014-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa） 片段：UNP residues 1-209
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；291 K；17.5% PEG 8000, 0.2M NaCl, 0.1M phosphate citrate pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.53 Å R-free 0.230
4QVX Discovery of a Potent and Selective BCL-XL Inhibitor That Demonstrates Thrombocytopenia and Inhibits Tumor Growth in Vivo 提交 2014-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–23（23 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 A 83–209（127 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 B 1–23（23 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 B 83–209（127 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 3CQ 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-5-(3-{4-[3-(dimethylamino)prop-1-yn-1-yl]-2-fluorophenoxy}propyl)-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；10.73 uM compound in DMSO + 2.14 uM protein in 25 mM Tris, 0.1 M sodium chloride, 10% v/v glycerol, 1 mM DTT, pH 8.0 incubated overnight at 277K then concentrated to 12 mg/mL, 1:1 protein solution:reservoir solution (3 M sodium chloride, 0.1 M citric acid, pH 3.5) used in drop, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
4QVX Discovery of a Potent and Selective BCL-XL Inhibitor That Demonstrates Thrombocytopenia and Inhibits Tumor Growth in Vivo 提交 2014-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–23（23 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 A 83–209（127 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 3CQ 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-5-(3-{4-[3-(dimethylamino)prop-1-yn-1-yl]-2-fluorophenoxy}propyl)-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；10.73 uM compound in DMSO + 2.14 uM protein in 25 mM Tris, 0.1 M sodium chloride, 10% v/v glycerol, 1 mM DTT, pH 8.0 incubated overnight at 277K then concentrated to 12 mg/mL, 1:1 protein solution:reservoir solution (3 M sodium chloride, 0.1 M citric acid, pH 3.5) used in drop, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
4QVX Discovery of a Potent and Selective BCL-XL Inhibitor That Demonstrates Thrombocytopenia and Inhibits Tumor Growth in Vivo 提交 2014-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–23（23 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 B 83–209（127 aa） 片段：SEE REMARK 999
未记录 3CQ 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-5-(3-{4-[3-(dimethylamino)prop-1-yn-1-yl]-2-fluorophenoxy}propyl)-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290 K；10.73 uM compound in DMSO + 2.14 uM protein in 25 mM Tris, 0.1 M sodium chloride, 10% v/v glycerol, 1 mM DTT, pH 8.0 incubated overnight at 277K then concentrated to 12 mg/mL, 1:1 protein solution:reservoir solution (3 M sodium chloride, 0.1 M citric acid, pH 3.5) used in drop, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.257
4TUH Bcl-xL in complex with inhibitor (Compound 10) 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 B 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 B 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
未记录 38H 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-5-{3-[4-(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)phenoxy]propyl}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Mg Acetate, 4% DMSO, 20% PEG3350, 0.1 M Hepes, pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.209
4TUH Bcl-xL in complex with inhibitor (Compound 10) 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 C 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 D 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 D 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
未记录 38H 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-5-{3-[4-(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)phenoxy]propyl}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Mg Acetate, 4% DMSO, 20% PEG3350, 0.1 M Hepes, pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.209
4TUH Bcl-xL in complex with inhibitor (Compound 10) 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 E 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 F 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 F 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
未记录 38H 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-5-{3-[4-(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)phenoxy]propyl}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Mg Acetate, 4% DMSO, 20% PEG3350, 0.1 M Hepes, pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.209
4TUH Bcl-xL in complex with inhibitor (Compound 10) 提交 2014-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 G 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 H 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
链 H 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26, 83-209
未记录 38H 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-5-{3-[4-(1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl)phenoxy]propyl}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M Mg Acetate, 4% DMSO, 20% PEG3350, 0.1 M Hepes, pH 6.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.209
4Z9V TCTP contains a BH3-like domain, which instead of inhibiting, activates Bcl-xL 提交 2015-04-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–208（126 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–208（126 aa）
突变：FRAGMENT: BCL-XL DELTA-LOOP, residues 1-28 and residues 83-208 突变：FRAGMENT: BCL-XL DELTA-LOOP, residues 1-28 and residues 83-208 突变：FRAGMENT: BCL-XL DELTA-LOOP, residues 1-28 and residues 83-208 突变：FRAGMENT: BCL-XL DELTA-LOOP, residues 1-28 and residues 83-208 BCT BICARBONATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1.5M Tris-sodium citrate, 100mM Pipes pH
分辨率 2.10 Å R-free 0.222
5AGW Bcl-2 alpha beta-1 complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；0.02M CACL2, 0.1M MOPS PH7.0, 10% 2-PROPANOL
分辨率 2.69 Å R-free 0.272
5AGW Bcl-2 alpha beta-1 complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；0.02M CACL2, 0.1M MOPS PH7.0, 10% 2-PROPANOL
分辨率 2.69 Å R-free 0.272
5AGX Bcl-2 alpha beta-1 LINEAR complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；PH 7.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.245
5AGX Bcl-2 alpha beta-1 LINEAR complex 提交 2015-02-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 29–44（16 aa） 片段：RESIDUES 1-34,29-44,92-207
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；PH 7.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.245
5B1Z Crystal structure of Bcl-xL in complex with HBx-BH3 motif 提交 2015-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–209（209 aa） 片段：UNP residues 1-209, with deletion of residues 27-82
链 B 1–209（209 aa） 片段：UNP residues 1-209, with deletion of residues 27-82
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；1.05M Sodium Citrate, 0.1M CHES pH 9.5
分辨率 2.15 Å R-free 0.274
5C3G Crystal structure of Bcl-xl bound to BIM-MM 提交 2015-06-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26,UNP residues 83-209
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；12% Peg 1500, 0.1M Sodium Acetate pH 5.5, 2.5M NaCl, 1.5% MPD
分辨率 2.45 Å R-free 0.274
5FMJ Bcl-xL with mouse Bak BH3 Q75L complex 提交 2015-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-26,83-209
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.2 M SODIUM THIOCYANATE, 20% PEG 3350
分辨率 2.43 Å R-free 0.220
5FMK Bcl-xL with Bak BH3 complex 提交 2015-11-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-26,83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：UNP RESIDUES 1-26,83-209
未记录 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.16M CALCIUM ACETATE, 0.08M SODIUM CACODYLATE, PH6.5, 20% GLYCEROL, 14.4% PEG 8000
分辨率 1.73 Å R-free 0.186
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 29–44（16 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 29–44（16 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VAY Bcl-2 complex with Beclin 1 T108D BH3 domain 提交 2017-03-28 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 29–44（16 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Tris, pH 6.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.228
5VX3 Bcl-xL in complex with Bim-h3Pc-RT 提交 2017-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
链 A 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
链 E 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
链 E 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；273 K；200 mM magnesium chloride, 20 % PEG 6000, and 100 mM sodium MES pH 6
分辨率 1.95 Å R-free 0.243
5VX3 Bcl-xL in complex with Bim-h3Pc-RT 提交 2017-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
链 C 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
链 G 1–26（26 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
链 G 83–209（127 aa） 片段：UNP residues 1-26 and 83-209
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；273 K；200 mM magnesium chloride, 20 % PEG 6000, and 100 mM sodium MES pH 6
分辨率 1.95 Å R-free 0.243
6BF2 Solution structure of a Bcl-xL S62E mutant 提交 2017-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–209（209 aa）
突变：S62E 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成 2.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bcl-xL S62E, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
NMR样品组成 1.9 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bcl-xL S62E, 92% H2O/8% D2O | 92% H2O/8% D2O
分辨率未提供
6DCN Bcl-xL complex with Beclin 1 BH3 domain T108pThr 提交 2018-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–208（126 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–208（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M NaCl, 10% glycerol
分辨率 2.44 Å R-free 0.229
6DCN Bcl-xL complex with Beclin 1 BH3 domain T108pThr 提交 2018-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–208（126 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–208（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2M NaCl, 10% glycerol
分辨率 2.44 Å R-free 0.229
6DCO Bcl-xL complex with Beclin 1 BH3 domain T108D 提交 2018-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–208（126 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–208（126 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M Tris pH 7.0, 0.2M MgCl2, 2.5M NaCl
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
6F46 Structure of the transmembrane helix of BclxL in phospholipid nanodiscs 提交 2017-11-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 202–233（32 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 400 uM [U-98% 2H, U-98% 13C; U-98% 15N] BclxL, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6HJL Affimer:BclxL 提交 2018-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 83–197（115 aa）
链 B 83–195（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MPD
分辨率 2.20 Å R-free 0.267
6HJL Affimer:BclxL 提交 2018-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 83–195（113 aa）
链 F 83–195（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；MPD
分辨率 2.20 Å R-free 0.267
6IJQ Solution structure of BCL-XL bound to P73-TAD peptide 提交 2018-10-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–44（44 aa）
链 B 85–209（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15[U-13C; U-15N]N] Bcl-xL, 2 mM p73 peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.1 mM Bcl-XL, 1 mM p73 peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6LHD Crystal structure of p53/BCL-xL fusion complex 提交 2019-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–201（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.2M sodium malonate pH 7.0, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
6LHD Crystal structure of p53/BCL-xL fusion complex 提交 2019-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–201（200 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291.15 K；0.2M sodium malonate pH 7.0, 20%(w/v) polyethylene glycol 3,350
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
6O0K crystal structure of BCL-2 with venetoclax 提交 2019-02-16 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 2PE NONAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；5% PEG4K, 40%PEG400, 0.1M MES pH 6.0
分辨率 1.62 Å R-free 0.202
6O0L crystal structure of BCL-2 G101V mutation with venetoclax 提交 2019-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：G101V,G101V,G101V LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG4K, 35% PEG400, 0.08M MES pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6O0L crystal structure of BCL-2 G101V mutation with venetoclax 提交 2019-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 29–44（16 aa）
突变：G101V,G101V,G101V LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG4K, 35% PEG400, 0.08M MES pH 6.0
分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6O0M crystal structure of BCL-2 F104L mutation with venetoclax 提交 2019-02-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：F104L,F104L,F104L LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；5% PEG4K, 40% PEG400, 0.1M MES pH 6.0
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
6O0O crystal structure of BCL-2 G101V mutation with S55746 提交 2019-02-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：G101V,G101V,G101V F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；291 K；0.1M NaCl 0.1M Succinic acid-NaOH pH5.0 10% PEG200
分辨率 2.00 Å R-free 0.267
6O0O crystal structure of BCL-2 G101V mutation with S55746 提交 2019-02-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 29–44（16 aa）
突变：G101V,G101V,G101V F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5；291 K；0.1M NaCl 0.1M Succinic acid-NaOH pH5.0 10% PEG200
分辨率 2.00 Å R-free 0.267
6O0P crystal structure of BCL-2 G101A mutation with venetoclax 提交 2019-02-17 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：G101A,G101A,G101A LBM 4-{4-[(4'-chloro-5,5-dimethyl[3,4,5,6-tetrahydro[1,1'-biphenyl]]-2-yl)methyl]piperazin-1-yl}-N-[(3-nitro-4-{[(oxan-4-yl )methyl]amino}phenyl)sulfonyl]-2-[(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)oxy]benzamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；5% PEG4K, 40% PEG400, 0.1M MES pH 6.0
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
6QG8 Structure of human Bcl-2 in complex with PUMA BH3 peptide 提交 2019-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–44（16 aa）
链 A 197–210（14 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；284 K；from 0.2M MgCl2, 25% PegMME 2k, 0.1M Na Acetate buffer pH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.216
6QGG Structure of human Bcl-2 in complex with analogue of ABT-737 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
链 A 197–210（14 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D J1H [(3~{R})-3-[[4-[[4-[4-[[2-(4-chlorophenyl)phenyl]methyl]piperazin-1-yl]phenyl]carbonylsulfamoyl]-2-nitro-phenyl]amino]-4-phenylsulfanyl-butyl]-(2-hydroxy-2-oxoethyl)-dimethyl-azanium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；284 K；1.4M Na/K phosphate pH 5.6
分辨率 1.50 Å R-free 0.173
6QGH Structure of human Bcl-2 in complex with ABT-263 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
链 A 197–210（14 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 1XJ 4-(4-{[2-(4-chlorophenyl)-5,5-dimethylcyclohex-1-en-1-yl]methyl}piperazin-1-yl)-N-[(4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-[(trifluoromethyl)sulfonyl]phenyl)sulfonyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；284 K；0.2 M NaCl, 25% PEG3350 and 0.1 M Bis-Tris buffer pH 5.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.206
6QGJ Structure of human Bcl-2 in complex with fragment/ABT-263 hybrid 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
链 A 197–210（14 aa）
突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, L95Q, R106L, F124G, R127Y, G128A, R129S, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D J1T 4-[4-[(1~{R})-1-(6-methoxy-1,3-benzodioxol-5-yl)-2-pyrrolidin-1-yl-ethyl]phenyl]-~{N}-[4-[[(2~{R})-4-morpholin-4-yl-1-phenylsulfanyl-butan-2-yl]amino]-3-(trifluoromethylsulfonyl)phenyl]sulfonyl-benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；284 K；0.15M KSCN, 20% PEG1500 and 0.1M Na acetate buffer pH 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.225
6QGK Structure of human Bcl-2 in complex with THIQ-phenyl pyrazole compound 提交 2019-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
链 A 197–210（14 aa）
突变：H20S, E42A, E44A, L95Q, R106L, E114Q, F124G, R127Y, G128A, R129S, E135A, E165A, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D 突变：H20S, E42A, E44A, L95Q, R106L, E114Q, F124G, R127Y, G128A, R129S, E135A, E165A, P168V, L175A, T178A, E179T, R183D J1Q 1-[2-[[(3~{S})-3-(aminomethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]phenyl]-~{N},~{N}-dibutyl-5-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；0.2M Ca Acetate, 15% PEG4k, 0.1M Tris buffer pH 7.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.202
6RNU BCL-XL in a complex with a covalent small molecule inhibitor 提交 2019-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa）
链 B 1–209（209 aa）
未记录 KBH 4-(4-fluorophenyl)-3-fluorosulfonyl-benzoic acid × 2 BR BROMIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2M NaBr, 20% PEG 3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
6ST2 Selective Affimers Recognize BCL-2 Family Proteins Through Non-Canonical Structural Motifs 提交 2019-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–209（209 aa）
链 B 1–209（209 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 8000, 0.2M magnesium chloride and 0.1M Tris pH 7.0
分辨率 1.79 Å R-free 0.241
6UVC Crystal structure of BCL-XL bound to compound 8: (R)-3-(Benzylthio)-2-(3-(2-((4'-chloro-[1,1'-biphenyl]-2-yl)methyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-6-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
未记录 XOY (R)-3-(Benzylthio)-2-(3-(2-((4'-chloro-[1,1'-biphenyl]-2-yl)methyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-6-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.3 M ammonium sulphate, 0.1 M HEPES pH 6.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.207
6UVD Crystal structure of BCL-XL bound to compound 2: (2R)-3-(Benzylsulfanyl)-2-({[(4-methylphenyl)methyl] [(4 phenylphenyl)carbonyl] carbamoyl}amino) propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
未记录 XOU (2R)-3-(Benzylsulfanyl)-2-({[(4-methylphenyl)methyl] [(4 phenylphenyl)carbonyl] carbamoyl}amino) propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.4 M ammonium sulphate, 0.1 M HEPES pH 6.5
分辨率 2.15 Å R-free 0.212
6UVE Crystal structure of BCL-XL bound to compound 7: (R)-3-(Benzylthio)-2-(3-(4-chloro-[1,1':2',1'':3'',1'''-quaterphenyl]-4'''-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
未记录 QHV (R)-3-(Benzylthio)-2-(3-(4-chloro-[1,1':2',1'':3'',1'''-quaterphenyl]-4'''-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)propanoic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.9 M trisodium citrate, 0.1 M MES pH 6.0, 5% (v/v) PEG400
分辨率 2.87 Å R-free 0.254
6UVE Crystal structure of BCL-XL bound to compound 7: (R)-3-(Benzylthio)-2-(3-(4-chloro-[1,1':2',1'':3'',1'''-quaterphenyl]-4'''-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa）
链 C 83–209（127 aa）
未记录 QHV (R)-3-(Benzylthio)-2-(3-(4-chloro-[1,1':2',1'':3'',1'''-quaterphenyl]-4'''-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.9 M trisodium citrate, 0.1 M MES pH 6.0, 5% (v/v) PEG400
分辨率 2.87 Å R-free 0.254
6UVF Crystal structure of BCL-XL bound to compound 12: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 QHS (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.227
6UVF Crystal structure of BCL-XL bound to compound 12: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa）
链 C 83–209（127 aa）
链 D 1–26（26 aa）
链 D 83–209（127 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 QHS (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.227
6UVF Crystal structure of BCL-XL bound to compound 12: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–26（26 aa）
链 E 83–209（127 aa）
链 F 1–26（26 aa）
链 F 83–209（127 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 QHS (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.227
6UVF Crystal structure of BCL-XL bound to compound 12: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–26（26 aa）
链 G 83–209（127 aa）
链 H 1–26（26 aa）
链 H 83–209（127 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 QHS (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.227
6UVF Crystal structure of BCL-XL bound to compound 12: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 1–26（26 aa）
链 I 83–209（127 aa）
链 J 1–26（26 aa）
链 J 83–209（127 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 QHS (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.227
6UVF Crystal structure of BCL-XL bound to compound 12: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 1–26（26 aa）
链 K 83–209（127 aa）
链 L 1–26（26 aa）
链 L 83–209（127 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 QHS (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.24 Å R-free 0.227
6UVG Crystal structure of BCL-XL bound to compound 13: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
未记录 QHP (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
6UVG Crystal structure of BCL-XL bound to compound 13: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa）
链 C 83–209（127 aa）
链 D 1–26（26 aa）
链 D 83–209（127 aa）
未记录 QHP (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
6UVG Crystal structure of BCL-XL bound to compound 13: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–26（26 aa）
链 E 83–209（127 aa）
链 F 1–26（26 aa）
链 F 83–209（127 aa）
未记录 QHP (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
6UVG Crystal structure of BCL-XL bound to compound 13: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–26（26 aa）
链 G 83–209（127 aa）
链 H 1–26（26 aa）
链 H 83–209（127 aa）
未记录 QHP (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
6UVG Crystal structure of BCL-XL bound to compound 13: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 1–26（26 aa）
链 I 83–209（127 aa）
链 J 1–26（26 aa）
链 J 83–209（127 aa）
未记录 QHP (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
6UVG Crystal structure of BCL-XL bound to compound 13: (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 1–26（26 aa）
链 K 83–209（127 aa）
链 L 1–26（26 aa）
链 L 83–209（127 aa）
未记录 QHP (R)-2-(3-([1,1'-Biphenyl]-4-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-(((3R,5R,7R)-adamantan-1-ylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.7 M ammonium sulfate, 0.1 M MES pH 6.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
6UVH Crystal structure of BCL-XL bound to compound 15: (R)-2-(3-(2-((4'-Chloro-[1,1'-biphenyl]-2-yl)methyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-6-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 QHJ (R)-2-(3-(2-((4'-Chloro-[1,1'-biphenyl]-2-yl)methyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-6-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.0
分辨率 2.19 Å R-free 0.237
6UVH Crystal structure of BCL-XL bound to compound 15: (R)-2-(3-(2-((4'-Chloro-[1,1'-biphenyl]-2-yl)methyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-6-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid 提交 2019-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–26（26 aa）
链 C 83–209（127 aa）
链 D 1–26（26 aa）
链 D 83–209（127 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 QHJ (R)-2-(3-(2-((4'-Chloro-[1,1'-biphenyl]-2-yl)methyl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-6-carbonyl)-3-(4-methylbenzyl)ureido)-3-((cyclohexylmethyl)sulfonyl)propanoic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.3 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.0
分辨率 2.19 Å R-free 0.237
6VWC Crystal structure of Bcl-xL in complex with tetrahydroisoquinoline-pyridine based inhibitors 提交 2020-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–25（25 aa）
链 A 83–209（127 aa）
突变：W24A,E158K,D189A 突变：W24A,E158K,D189A RQ7 6-{8-[(1,3-benzothiazol-2-yl)carbamoyl]-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl}-3-{1-[(pyridin-4-yl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}pyridine-2-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；290 K；30%(w/v) PEG 10,000, 0.1M Tris Hcl pH 8.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.200
6VWC Crystal structure of Bcl-xL in complex with tetrahydroisoquinoline-pyridine based inhibitors 提交 2020-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–25（25 aa）
链 B 83–209（127 aa）
突变：W24A,E158K,D189A 突变：W24A,E158K,D189A RQ7 6-{8-[(1,3-benzothiazol-2-yl)carbamoyl]-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl}-3-{1-[(pyridin-4-yl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}pyridine-2-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；290 K；30%(w/v) PEG 10,000, 0.1M Tris Hcl pH 8.5
分辨率 1.60 Å R-free 0.200
6X7I Structure of the C-terminal domain of BCL-XL in membrane 提交 2020-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 206–233（28 aa） 片段：C-terminal domain, residues 206-233
未记录 未记录非水小分子 实验方法未声明
NMR测量条件 pH 6.5；318 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 15N] C-terminal domain of BCL-XL, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] C-terminal domain of BCL-XL, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 4 mg/mL selectively 15N Leu labeled C-terminal domain of BCL-XL, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 10 mg/mL selectively 15N Leu labeled C-terminal domain of BCL-XL, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6YLI Crystal structure of human bcl-xL bound to trichoplax adhaerens trBak BH3 提交 2020-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa）
突变：delta45-84 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 30 % w/v PEG 8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
6YLI Crystal structure of human bcl-xL bound to trichoplax adhaerens trBak BH3 提交 2020-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–209（209 aa）
突变：delta45-84 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2 M ammonium sulfate and 30 % w/v PEG 8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.236
6ZHC PROTAC6 mediated complex of VHL:EloB:EloC and Bcl-xL 提交 2020-06-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 DDD 1–209（209 aa）
未记录 QL8 2-[8-(1,3-benzothiazol-2-ylcarbamoyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]-5-[3-[4-[3-[2-[2-[2-[2-[2-[3-[[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[(2~{S},4~{R})-2-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methylcarbamoyl]-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]amino]-3-oxidanylidene-propoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]prop-1-ynyl]phenoxy]propyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 17 GOL GLYCEROL × 9 IOD IODIDE ION × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.2 M Potassium iodide, 0.1 M MES pH 6.5, 23% PEG 4000
分辨率 1.92 Å R-free 0.196
7CA4 The Crystal Structure of human Bcl-2-like protein 1 from Biortus 提交 2020-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–211（211 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；50mM MES, pH6.2, 1.8M ammonium sulfate
分辨率 2.70 Å R-free 0.228
7JGV CRYSTAL STRUCTURE OF BCL-XL IN COMPLEX WITH COMPOUND 1620116, CRYSTAL FORM 2 提交 2020-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
链 B 1–26（26 aa）
链 B 83–209（127 aa）
未记录 V9S 6-[(8E)-8-{2-[4-(benzylcarbamoyl)-1,3-thiazol-2-yl]hydrazinylidene}-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl]-3-(2-phenylethoxy)pyridine-2-carboxylic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0) 10% PEG MME 2000 10% ethanol
分辨率 2.05 Å R-free 0.246
7JGW Crystal structure of BCL-XL in complex with COMPOUND 1620116, CRYSTAL FORM 1 提交 2020-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 83–209（127 aa）
未记录 V9S 6-[(8E)-8-{2-[4-(benzylcarbamoyl)-1,3-thiazol-2-yl]hydrazinylidene}-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl]-3-(2-phenylethoxy)pyridine-2-carboxylic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0) 10% PEG 4000
分辨率 1.30 Å R-free 0.199
7LH7 Crystal structure of BCL-XL in complex with a benzothiazole-based inhibitor 提交 2021-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–25（25 aa）
链 A 83–209（127 aa）
突变：W24A,E158K,D189A 突变：W24A,E158K,D189A XZM N-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(4-{[(4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-[(trifluoromethyl)sulfonyl]phenyl)sulfonyl]carbamoyl}-1,3-thiazol-2-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-8-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 4.2；290 K；20% (w/v) PEG 8000, 0.1 M phosphate-citrate pH 4.2, 0.2 M sodium chloride. The method was liquid-liquid counter diffusion
分辨率 1.41 Å R-free 0.199
7LH7 Crystal structure of BCL-XL in complex with a benzothiazole-based inhibitor 提交 2021-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–25（25 aa）
链 B 83–209（127 aa）
突变：W24A,E158K,D189A 突变：W24A,E158K,D189A XZM N-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-(4-{[(4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-[(trifluoromethyl)sulfonyl]phenyl)sulfonyl]carbamoyl}-1,3-thiazol-2-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-8-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 4.2；290 K；20% (w/v) PEG 8000, 0.1 M phosphate-citrate pH 4.2, 0.2 M sodium chloride. The method was liquid-liquid counter diffusion
分辨率 1.41 Å R-free 0.199
7XGG Crystal structure of BCL-xL in complex with computationally designed inhibitor protein 提交 2022-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–44（44 aa）
链 B 85–209（125 aa）
链 C 1–44（44 aa）
链 C 85–209（125 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；4% PEG 3,000(w/v), 0.1M Sodium acetate(pH4.5)
分辨率 1.90 Å R-free 0.197
7XGG Crystal structure of BCL-xL in complex with computationally designed inhibitor protein 提交 2022-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 1–44（44 aa）
链 E 85–209（125 aa）
链 F 1–44（44 aa）
链 F 85–209（125 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；4% PEG 3,000(w/v), 0.1M Sodium acetate(pH4.5)
分辨率 1.90 Å R-free 0.197
7Y8D Crystal structure of cp1 bound BCLxl 提交 2022-06-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–27（27 aa）
链 A 83–196（114 aa）
未记录 JFF (2R)-3-[2-(aminomethyl)-3-azanyl-1-[4-[2-(2-chloranylethanoylamino)ethylcarbamoyl]phenyl]prop-1-enyl]sulfanyl-2-(carboxyamino)propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES pH7.5, 2.0M Ammonium formate
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
7YAA Crystal structure analysis of cp3 bound BCLxl 提交 2022-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–26（26 aa）
链 A 82–196（115 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 JJ9 N-(2-acetamidoethyl)-4-(4-methanoyl-1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；PEG 400, Tris, Magnesium chloride
分辨率 1.40 Å R-free 0.181
7YB7 anti-apoptotic protein BCL-2-M12 提交 2022-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 31–44（14 aa）
未记录 IQ8 N-(2-acetamidoethyl)-4-(4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.5 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1.0 M Lithium sulfate monohydrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.194
7YB7 anti-apoptotic protein BCL-2-M12 提交 2022-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 31–44（14 aa）
未记录 IQ8 N-(2-acetamidoethyl)-4-(4,5-dihydro-1,3-thiazol-2-yl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.5 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1.0 M Lithium sulfate monohydrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.194
8FY0 E3:PROTAC:target ternary complex structure (VCB/753b/BCL-xL) 提交 2023-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 1–212（212 aa）
未记录 CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 YF8 N-[8-(4-{[(1R,3R,4S)-4-(4-chlorophenyl)-1-methyl-3-{[4-(4-{[4-{[(2R)-4-(morpholin-4-yl)-1-(phenylsulfanyl)butan-2-yl]amino}-3-(trifluoromethanesulfonyl)benzene-1-sulfonyl]carbamoyl}phenyl)piperazin-1-yl]methyl}cyclohexyl]methyl}piperazin-1-yl)-8-oxooctanoyl]-3-methyl-L-valyl-(4R)-4-hydroxy-N-{(1S)-1-[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]ethyl}-L-prolinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.1 M Sodium Cacodylate pH 5.5, 0.2 M Sodium chloride, 6-8% PEG 8000 and 4% tert-Butanediol
分辨率 2.94 Å R-free 0.241
8U27 Bcl-2-xL complexed with compound 35 提交 2023-09-05 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 ULL propan-2-yl {4-[(5S)-1-(4-bromobenzoyl)-5-phenyl-4,5-dihydro-1H-pyrazol-3-yl]phenyl}carbamate × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.3；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0375；压力 1
NMR测量条件 pH 7.3；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0375；压力 1
NMR测量条件 pH 7.3；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.0375；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Bcl-2-xL, 300 uM Compound 35, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
NMR样品组成 300 uM [U-99% 15N] Bcl-2-xL, 300 uM Compound 35, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 300 uM [U-10% 13C] Bcl-2-xL, 300 uM Compound 35, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
8VWX Human Bcl-2 (G101V Mutant)/Bcl-xL Chimera Fused to Maltose-Binding Protein 提交 2024-02-02 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris (pH 8.5), 25% PEG 3350, and 200 mM sodium chloride
分辨率 1.77 Å R-free 0.225
8VWZ Human Bcl-2 (G101V Mutant)/Bcl-xL Chimera Fused to MBP in Complex with Inhibitor S55746 提交 2024-02-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：G101V F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；100 mM bis-tris (pH 5.5), 2 M ammonium sulfate
分辨率 2.33 Å R-free 0.256
8VXM Human Bcl-2/Bcl-xL Chimera Fused to MBP in Complex with Inhibitor S55746 提交 2024-02-05 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 F3Q ~{N}-(4-hydroxyphenyl)-3-[6-[[(3~{S})-3-(morpholin-4-ylmethyl)-3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl]carbonyl]-1,3-benzodioxol-5-yl]-~{N}-phenyl-5,6,7,8-tetrahydroindolizine-1-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris (pH 8.5), 25% PEG 3350, 200 mM lithium sulfate
分辨率 2.10 Å R-free 0.243
8VXN Human Bcl-2/Bcl-xL Chimera Fused to Maltose-Binding Protein 提交 2024-02-05 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris (pH 8.0), 29% PEG 3350, 200 mM sodium chloride
分辨率 2.09 Å R-free 0.264
8WLS Bcl-xL in complex with HBx BH3 delta C peptide 提交 2023-10-01 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–196（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR测量条件 pH 7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-15N] HBx-Bcl-xL fusion, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] HBx-Bcl-xL fusion, 1.2 mM Non Bcl-xL, 0.3 mM [U-13C; U-15N] HBx, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
8XP5 The Crystal Structure of p53/BCL-xL fusion complex from Biortus. 提交 2024-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–44（43 aa）
链 A 85–201（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05M MgCl2, 0.1M MES pH6.5, 5% PEG 4000, 10% 2-Propanol, 30% w/v D-Sorbito
分辨率 2.55 Å R-free 0.328
8XP5 The Crystal Structure of p53/BCL-xL fusion complex from Biortus. 提交 2024-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–44（43 aa）
链 B 85–201（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05M MgCl2, 0.1M MES pH6.5, 5% PEG 4000, 10% 2-Propanol, 30% w/v D-Sorbito
分辨率 2.55 Å R-free 0.328
8ZEB Crystal structure of BCL-XL bound by cp-B6X-4 提交 2024-05-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–196（196 aa）
链 B 1–196（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；289.15 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
8ZEB Crystal structure of BCL-XL bound by cp-B6X-4 提交 2024-05-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–196（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；289.15 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
8ZEB Crystal structure of BCL-XL bound by cp-B6X-4 提交 2024-05-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–196（196 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；289.15 K；15% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 10,000
分辨率 1.95 Å R-free 0.226
9AQZ Crystal structure of Bcl-xL in complex with a small molecule inhibitor 提交 2024-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–25（25 aa）
链 A 83–209（127 aa）
突变：W24A,E158K,D189A 突变：W24A,E158K,D189A A1AFG (3M)-3-(1-{[(1r,3R,5S,7r)-adamantan-1-yl]methyl}-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-6-{8-[(1,3-benzothiazol-2-yl)carbamoyl]-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl}pyridine-2-carboxylic acid × 1 CD CADMIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；290 K；1 M sodium acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M cadmium sulfate
分辨率 1.96 Å R-free 0.264
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–209（209 aa）
链 E 1–209（209 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–209（209 aa）
链 G 1–209（209 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–209（209 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–209（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–209（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 1–209（209 aa）
链 K 1–209（209 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 1–209（209 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LGU Crystal structure of Bcl-xL in complex with stapled HRK peptide 提交 2025-01-10 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 1–209（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3,350 (w/v)
分辨率 2.97 Å R-free 0.303
9LI8 Crystal structure of Bcl-xL in complex with HRK BH3 peptide 提交 2025-01-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–209（209 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris pH 8.5 and 25% w/v Polyethylene glycol 3350.
分辨率 2.32 Å R-free 0.264
9O14 Crystal Structure of BCL-2 in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–44（16 aa）
未记录 NI NICKEL (II) ION × 2 NTA NITRILOTRIACETIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；15.0% PEG-3350 and 150 mM CsCl
分辨率 1.73 Å R-free 0.222
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 29–44（16 aa）
突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 29–44（16 aa）
突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 29–44（16 aa）
突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 29–44（16 aa）
突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O15 Crystal Structure of BCL-2 (G101V) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 29–44（16 aa）
突变：G101V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30% Tacsimate, pH 7.0
分辨率 1.99 Å R-free 0.223
9O16 Crystal Structure of human BCL-2 (R129L) mutant in complex with a stapled BAD BH3 peptide BAD SAHB 4.2 提交 2025-04-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 29–44（16 aa）
突变：R129L IMD IMIDAZOLE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 NI NICKEL (II) ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG-3350, 200 mM Ammonium sulfate, 100 mM Tris, pH 8.5
分辨率 1.73 Å R-free 0.210

共 123 个其他 PDB 条目、195 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BCLX_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 35–50； UniProt 29–44

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1g5m

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1g5m
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1g5m
沉积日期 deposition_date2000-11-01
结构标题 titleHUMAN BCL-2, ISOFORM 1
关键词 keywordsAPOPTOSIS; APOPTOSIS
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier17.81 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron16.15 Å
零角强度 I(0) i07540440.00
分子量 molecular_weight18992.0 kDa
排除体积 excluded_volume23342 ų
包络体积 envelope_volume29916 ų
水化壳体积 shell_volume15508 ų
包络直径 envelope_diameter55.7 Å
壳层 Rg shell_rg22.12 Å
包络 Rg envelope_rg16.63 Å
形状 Rg shape_rg16.10 Å
总 Rg total_rg17.34 Å
总原子数 total_atoms2588
残基数 n_residues164
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax55.7 Å
Rg (实空间) rg_real17.68 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.21 Å
I(0) (实空间) i0_real7.5400e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.0390e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal17.69 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal7540000.0000
解质量估计 total_estimate0.8920
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.1 Å
偏度 Skewness skewness0.134
峰度 Kurtosis kurtosis-0.380
角度范围 angular_range— – 0.4450 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha2033000.0000
实空间数据点数 n_real_points75
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.873; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.982; Smooth: 0.990
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1g5ma_
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamilyf.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family familyf.1.4.1 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1g5mA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Blc2-like
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)