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1gmo

CRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 124.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HEPATOCYTE GROWTH FACTOR

HOMO SAPIENS

UniProt P14210

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 28–210 链 B； UniProt 28–210 片段：NK1 突变：YES ;2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid ; × 1 ;2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid ; × 1 ;2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid ; × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5 分辨率 3.00 Å R-free 0.295
2 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 28–210 链 D； UniProt 28–210 片段：NK1 突变：YES ;2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5 分辨率 3.00 Å R-free 0.295
3 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 28–210 链 F； UniProt 28–210 片段：NK1 突变：YES ;2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 SO4 SULFATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5 分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4 其他组合 同源多聚体 蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 28–210 链 H； UniProt 28–210 片段：NK1 突变：YES ;2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7.5；10% PEG4000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.10M SODIUM PARA-TOLUENE SULFONATE,0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5 分辨率 3.00 Å R-free 0.295

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1GMO Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1BHT NK1 FRAGMENT OF HUMAN HEPATOCYTE GROWTH FACTOR 提交 1998-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 35–210（176 aa） 片段：NK1 FRAGMENT, HEPARIN BINDING DOMAIN PLUS C-MET BINDING DOMAIN
链 B 35–210（176 aa） 片段：NK1 FRAGMENT, HEPARIN BINDING DOMAIN PLUS C-MET BINDING DOMAIN
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；40% PEG 3400, 0.1M HEPES PH 7.5, 0.3M AMMONIUM SULFATE. PROTEIN CONCENTRATION OF 3MG/ML
分辨率 2.00 Å R-free 0.247
1GMN CRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR 提交 2001-09-19 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：NK1
链 B 28–210（183 aa） 片段：NK1
突变：YES 突变：YES EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；10% PEG8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.55M SODIUM DIHYDROGEN PHOSPHATE 0.10M SODIUM HEPES, PH 7.5
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
1GP9 A New Crystal Form of the Nk1 Splice Variant of Hgf/Sf Demonstrates Extensive Hinge Movement and Suggests that the Nk1 Dimer Originates by Domain Swapping 提交 2001-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 40–210（171 aa） 片段：NK1, RESIDUES 40-210
链 B 40–210（171 aa） 片段：NK1, RESIDUES 40-210
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；18% PEG4000, 10% 2-PROPANOL, 0.1M SODIUM HEPES, PH 7.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.288
1GP9 A New Crystal Form of the Nk1 Splice Variant of Hgf/Sf Demonstrates Extensive Hinge Movement and Suggests that the Nk1 Dimer Originates by Domain Swapping 提交 2001-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 40–210（171 aa） 片段：NK1, RESIDUES 40-210
链 D 40–210（171 aa） 片段：NK1, RESIDUES 40-210
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；18% PEG4000, 10% 2-PROPANOL, 0.1M SODIUM HEPES, PH 7.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.288
1NK1 NK1 FRAGMENT OF HUMAN HEPATOCYTE GROWTH FACTOR/SCATTER FACTOR (HGF/SF) AT 2.5 ANGSTROM RESOLUTION 提交 1998-08-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：NK1
链 B 28–210（183 aa） 片段：NK1
突变：A29V 突变：A29V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.7；18% PEG4000, 0.20M SODIUM ACETATE, 0.15M TRIS, PH 8.5 , pH 8.7
分辨率 2.50 Å R-free 0.319
1SHY The Crystal Structure of HGF beta-chain in Complex with the Sema Domain of the Met Receptor. 提交 2004-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 495–728（234 aa） 片段：HGF beta chain
突变：C604S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；PEG, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 3.22 Å R-free 0.270
1SI5 Protease-like domain from 2-chain hepatocyte growth factor 提交 2004-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 495–728（234 aa） 片段：protease-like domain
突变：Cys604Ser 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；292 K；NaCl, CaCl2, PEG 1500, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
分辨率 2.53 Å R-free 0.301
2HGF HAIRPIN LOOP CONTAINING DOMAIN OF HEPATOCYTE GROWTH FACTOR, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1997-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 31–127（97 aa） 片段：AMINO TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；303 K
分辨率未提供
2QJ2 A Mechanistic Basis for Converting a Receptor Tyrosine Kinase Agonist to an Antagonist 提交 2007-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–209（182 aa） 片段：residues 28-209
链 B 28–209（182 aa） 片段：residues 28-209
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM ammonium sulfate, 26-29% PEG 4000 (w/w), 100 mM Tris-HCl pH 8.0, 0.5 mM beta-octyl glucoside, and 5% ethylene glycol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.81 Å R-free 0.248
3HMS Crystal Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, orthorhombic crystal form 提交 2009-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–126（99 aa） 片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM Ammonium sulfate, 28-32% PEG 1000 or 2000, 50 mM Tris-HCl pH 8.0, 5% Isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.70 Å R-free 0.255
3HMT Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, trigonal crystal form 提交 2009-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–126（99 aa） 片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
链 B 28–126（99 aa） 片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
3HMT Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, trigonal crystal form 提交 2009-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–126（99 aa） 片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
3HMT Crystal structure of the N-terminal fragment (28-126) of the human hepatocyte growth factor/scatter factor, trigonal crystal form 提交 2009-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 28–126（99 aa） 片段：N-terminal domain: UNP residues 28-126
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.4 M sodium malonate pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
3HN4 Crystal structure of the NK2 fragment (28-289) of human hepatocyte growth factor/scatter factor 提交 2009-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–289（262 aa） 片段：UNP residues 28-289
突变：K132E, R134E, C214A EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；50 mM Ammonium sulfate, 17-23% PEG 2000 or 4000, 100 mM HEPES pH 8.0, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, 0.5 mM Beta-octyl glucoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.60 Å R-free 0.333
3MKP Crystal structure of 1K1 mutant of Hepatocyte Growth Factor/Scatter Factor fragment NK1 in complex with heparin 提交 2010-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：K132E, R134E 突变：K132E, R134E SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 SGN 2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.243M Ammonium Sulfate, 22.295% PEG 3350, 0.1M Na-Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.81 Å R-free 0.261
3MKP Crystal structure of 1K1 mutant of Hepatocyte Growth Factor/Scatter Factor fragment NK1 in complex with heparin 提交 2010-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 D 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：K132E, R134E 突变：K132E, R134E SO4 SULFATE ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.243M Ammonium Sulfate, 22.295% PEG 3350, 0.1M Na-Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.81 Å R-free 0.261
3SP8 Crystal structure of NK2 in complex with fractionated Heparin DP10 提交 2011-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–288（261 aa） 片段：NK2
链 B 28–288（261 aa） 片段：NK2
突变：G146D, C214S 突变：G146D, C214S MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50mM MES pH=6.0, 30% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K, temperature 294K
分辨率 1.86 Å R-free 0.217
3SP8 Crystal structure of NK2 in complex with fractionated Heparin DP10 提交 2011-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 28–288（261 aa） 片段：NK2
突变：G146D, C214S MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50mM MES pH=6.0, 30% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K, temperature 294K
分辨率 1.86 Å R-free 0.217
3SP8 Crystal structure of NK2 in complex with fractionated Heparin DP10 提交 2011-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 28–288（261 aa） 片段：NK2
突变：G146D, C214S MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50mM MES pH=6.0, 30% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K, temperature 294K
分辨率 1.86 Å R-free 0.217
4D3C Crystal structure of the NK1 domain of HGF in complex with anti-HGF monoclonal antibody SFN68. 提交 2014-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 32–210（179 aa） 片段：RESIDUES 23-210
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.62 Å R-free 0.298
4K3J Crystal structure of Onartuzumab Fab in complex with MET and HGF-beta 提交 2013-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 495–721（227 aa） 片段：unp residues 495-721
突变：C604S NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；298 K；0.1 M sodium cacodylate pH 6.2, 20% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4O3T Zymogen HGF-beta/MET with Zymogen Activator Peptide ZAP.14 提交 2013-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 495–728（234 aa） 片段：HGF-beta (UNP Residues 25-567)
突变：V495G/C604S 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；PEG6000, 800 mM NaCl, 400 mM trimethylammonium oxide, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.99 Å R-free 0.276
4O3U Zymogen HGF-beta/MET with Zymogen Activator Peptide ZAP2.3 提交 2013-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 495–728（234 aa） 片段：HGF-beta (UNP Residues 25-567)
突变：V495G/C604S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；8% PEG8000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.04 Å R-free 0.251
5COE The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with HEPES 提交 2015-07-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 2.18 Å R-free 0.264
5CP9 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with MB605 提交 2015-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V 6O5 3-(furan-2-yl)propanoic acid × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 1.90 Å R-free 0.227
5CS1 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 nM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 2.00 Å R-free 0.255
5CS3 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with (H)EPPS 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V EP1 3-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]PROPANE-1-SULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 2.50 Å R-free 0.318
5CS5 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with PIPES 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V PIN PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 1.90 Å R-free 0.240
5CS9 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with MES 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000. 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
5CSQ The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with MOPS 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V MPO 3[N-MORPHOLINO]PROPANE SULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM NA Acetate, 150 mM Tris
分辨率 1.95 Å R-free 0.274
5CT1 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with CHES 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V NHE 2-[N-CYCLOHEXYLAMINO]ETHANE SULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 2.00 Å R-free 0.269
5CT2 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with CAPS 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V CXS 3-CYCLOHEXYL-1-PROPYLSULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 2.00 Å R-free 0.295
5CT3 The structure of the NK1 fragment of HGF/SF complexed with 2FA 提交 2015-07-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
链 B 28–210（183 aa） 片段：UNP residues 28-210
突变：A29V 突变：A29V 54O 3-hydroxypropane-1-sulfonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 4000, 200 mM Na Acetate, 150 mM Tris
分辨率 2.00 Å R-free 0.251
6LZ9 t8E4 antibody Fab complexed with the active form of HGF 提交 2020-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 388–494（107 aa） 片段：K4 domain
链 B 495–728（234 aa） 片段：SP domain
突变：N402Q, T476G, K491I, Q492E, L493G 突变：C561S, N566Q, N653Q 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；10 % (w/v) PEG 10000, 0.1M Magnesium acetate, 0.1M MES pH 6.5
分辨率 2.80 Å R-free 0.297
7MO7 Cryo-EM structure of 2:2 c-MET/HGF holo-complex 提交 2021-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–728（728 aa）
链 D 1–728（728 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7MO8 Cryo-EM structure of 1:1 c-MET I/HGF I complex after focused 3D refinement of holo-complex 提交 2021-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–728（728 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7MO9 Cryo-EM map of the c-MET II/HGF I/HGF II (K4 and SPH) sub-complex 提交 2021-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–728（728 aa）
链 D 1–728（728 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7MOA Cryo-EM structure of the c-MET II/HGF I complex bound with HGF II in a rigid conformation 提交 2021-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–728（728 aa）
链 D 1–728（728 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
7MOB Cryo-EM structure of 2:2 c-MET/NK1 complex 提交 2021-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–210（210 aa）
链 B 1–210（210 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
7OCL K1K1, a potent recombinant minimal hepatocyte growth factor/scatter factor mimic 提交 2021-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 125–211（87 aa）
链 A 129–210（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290.15 K；100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM Sodium nitrate, 30 mM Sodium phosphate dibasic, 30 mM Ammonium sulfate, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
7OCL K1K1, a potent recombinant minimal hepatocyte growth factor/scatter factor mimic 提交 2021-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 125–211（87 aa）
链 B 129–210（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；290.15 K；100 mM Tris/Bicine pH 8.5, 30 mM Sodium nitrate, 30 mM Sodium phosphate dibasic, 30 mM Ammonium sulfate, 12.5% w/v PEG 1000, 12.5% w/v PEG 3350, 12.5% v/v MPD
分辨率 1.80 Å R-free 0.227
7OCM K1K1H6, a potent recombinant minimal hepatocyte growth factor/scatter factor mimic 提交 2021-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 125–211（87 aa）
链 A 129–210（82 aa）
未记录 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290.15 K；100 mM MOPS/HEPES pH 7.5, 30 mM sodium nitrate, 30 mM sodium phosphate dibasic, 30 mM ammonium sulphate, 20% v/v glycerol, 10% w/v PEG4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.195

共 35 个其他 PDB 条目、42 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HGF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210 作者链 B； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210 作者链 C； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210 作者链 D； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210 作者链 E； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210 作者链 F； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210 作者链 G； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210 作者链 H； PDB构建体 1–183； UniProt 28–210

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1gmo

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1gmo
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1gmo
沉积日期 deposition_date2001-09-20
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURES OF NK1-HEPARIN COMPLEXES REVEAL THE BASIS FOR NK1 ACTIVITY AND ENABLE ENGINEERING OF POTENT AGONISTS OF THE MET RECEPTOR
关键词 keywordsHORMONE, GROWTH FACTOR; HORMONE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.92 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron41.04 Å
零角强度 I(0) i0486351000.00
分子量 molecular_weight164130.0 kDa
排除体积 excluded_volume198070 ų
包络体积 envelope_volume295880 ų
水化壳体积 shell_volume58777 ų
包络直径 envelope_diameter127.6 Å
壳层 Rg shell_rg48.66 Å
包络 Rg envelope_rg39.14 Å
形状 Rg shape_rg40.99 Å
总 Rg total_rg41.56 Å
总原子数 total_atoms11372
残基数 n_residues1377
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax124.2 Å
Rg (实空间) rg_real41.63 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.69 Å
I(0) (实空间) i0_real4.8640e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.6980e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.92 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal486500000.0000
解质量估计 total_estimate0.8927
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary65.4 Å
偏度 Skewness skewness-0.128
峰度 Kurtosis kurtosis-0.688
角度范围 angular_range— – 0.1900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha40770000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.897; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.985; Smooth: 0.927
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

SCOP 2.08 (16 domains)

结构域编号 domain_idd1gmoa1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmoa2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd1gmob1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmob2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd1gmoc1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmoc2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd1gmod1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmod2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd1gmoe1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmoe2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd1gmof1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmof2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd1gmog1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmog2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules
结构域编号 domain_idd1gmoh1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.10 — Hairpin loop containing domain-like
超家族 Superfamily superfamilyg.10.1 — Hairpin loop containing domain-like
家族 Family familyg.10.1.1 — Hairpin loop containing domain
结构域编号 domain_idd1gmoh2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.14 — Kringle-like
超家族 Superfamily superfamilyg.14.1 — Kringle-like
家族 Family familyg.14.1.1 — Kringle modules

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id1gmoA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id1gmoB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id1gmoC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id1gmoD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id1gmoE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id1gmoF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoF02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id1gmoG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoG02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
结构域编号 domain_id1gmoH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Hepatocyte Growth Factor
结构域编号 domain_id1gmoH02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — Plasminogen Kringle 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Plasminogen Kringle 4
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)