1h9o

PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, CRYSTAL STRUCTURE AT 1.79 A

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 46.6 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 617–724	片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN, P85-ALPHA REGULATORY SUBUNIT RESIDUES 617 - 724	BETA-PLATELET-DERIVED GROWTH FACTOR RECEPTOR × 1 （P09619）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7；40MG/ML PROTEIN IN 20 MM PHOSPHATE PH6.2 + PEG8000, RESERVOIR WITH SAME PHOSPHATE + PEG8000 + 250MM NACL, pH 7.00	分辨率 1.79 Å R-free 0.219

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1H9O	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A0N NMR STUDY OF THE SH3 DOMAIN FROM FYN PROTO-ONCOGENE TYROSINE KINASE COMPLEXED WITH THE SYNTHETIC PEPTIDE P2L CORRESPONDING TO RESIDUES 91-104 OF THE P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, FAMILY OF 25 STRUCTURES 提交 1997-12-05	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 91–104（14 aa）片段：P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, RESIDUES 91 - 104	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1AZG NMR STUDY OF THE SH3 DOMAIN FROM FYN PROTO-ONCOGENE TYROSINE KINASE KINASE COMPLEXED WITH THE SYNTHETIC PEPTIDE P2L CORRESPONDING TO RESIDUES 91-104 OF THE P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, MINIMIZED AVERAGE (PROBMAP) STRUCTURE 提交 1997-11-18	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 91–104（14 aa）片段：P85 SUBUNIT OF PI3-KINASE, RESIDUES 91 - 104	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1PBW STRUCTURE OF BCR-HOMOLOGY (BH) DOMAIN 提交 1996-10-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 105–319（215 aa）片段：P85 ALPHA SUBUNIT BCR-HOMOLOGY DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.235
1PBW STRUCTURE OF BCR-HOMOLOGY (BH) DOMAIN 提交 1996-10-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 105–319（215 aa）片段：P85 ALPHA SUBUNIT BCR-HOMOLOGY DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.235
1PHT PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN, RESIDUES 1-85 提交 1995-08-17	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–85（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.258
1PIC PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, NMR, MINIMIZED MEAN STRUCTURE 提交 1997-06-23	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 617–724（108 aa）片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 617 - 724 OF P85-ALPHA REGULATORY SUBUNIT	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；296 K	分辨率未提供
1PKS STRUCTURE OF THE PI3K SH3 DOMAIN AND ANALYSIS OF THE SH3 FAMILY 提交 1994-03-07	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–79（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1PKT STRUCTURE OF THE PI3K SH3 DOMAIN AND ANALYSIS OF THE SH3 FAMILY 提交 1994-03-07	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–79（79 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2IUG Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain 提交 2006-06-03	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 321–440（120 aa）片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 20% PEG4000, 50MM MGCL2, 50MM TRIS PH7.5	分辨率 1.89 Å R-free 0.289
2IUH Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with c-Kit phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–440（120 aa）片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M NA CITRATE PH5.6, 0.2M NA/K TARTRATE, 2M AMMONIUM SULFATE	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–440（120 aa）片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–440（120 aa）片段：N-TERMINAL SH2 DOMAIN, RESIDUES 321-440	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2RD0 Structure of a human p110alpha/p85alpha complex 提交 2007-09-20	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：UNP residues 322-600	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；Sodium Formate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 3.05 Å R-free 0.323
2V1Y Structure of a phosphoinositide 3-kinase alpha adaptor-binding domain (ABD) in a complex with the iSH2 domain from p85 alpha 提交 2007-05-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 431–600（170 aa）片段：INTER-SH2 DOMAIN (ISH2), RESIDUES 431-600	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；0.2M MG(NO3)2, 20% PEG3350 (HAMPTON), 5MM TRIS-HCL PH 7.0 (25C), 5% GLYCEROL AND 5MM FRESH DTT	分辨率 2.40 Å R-free 0.292
3HHM Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha and the drug wortmannin 提交 2009-05-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–694（373 aa）片段：UNP residues 322-694	突变：D330N	KWT (1S,6BR,9AS,11R,11BR)-9A,11B-DIMETHYL-1-[(METHYLOXY)METHYL]-3,6,9-TRIOXO-1,6,6B,7,8,9,9A,10,11,11B-DECAHYDRO-3H-FURO[4, 3,2-DE]INDENO[4,5-H][2]BENZOPYRAN-11-YL ACETATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.307
3HIZ Crystal structure of p110alpha H1047R mutant in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2009-05-20	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–694（373 aa）片段：UNP residues 322-694	突变：D330N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；Na formate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.333
3I5R PI3K SH3 domain in complex with a peptide ligand 提交 2009-07-06	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–83（83 aa）片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；293 K；100mM CAPS, 2M ammonium sulfate, 0.2M lithium sulfate, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 1.70 Å R-free 0.223
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–83（83 aa）片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–83（83 aa）片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–83（83 aa）片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.299
3I5S Crystal structure of PI3K SH3 提交 2009-07-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–83（83 aa）片段：SH3 domain (UNP residues 1-83)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；100mM Na-citrate, 0.5M ammonium sulfate, 1M lithium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 3.00 Å R-free 0.299
4A55 Crystal structure of p110alpha in complex with iSH2 of p85alpha and the inhibitor PIK-108 提交 2011-10-24	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：NISH2, RESIDUES 322-600	未记录	P08 PIK-108 × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.4；0.1 M NAK PHOSPHATE PH 6.4, 0.14 M NH4H2SO4, 0.1 M NA FORMATE, 0.42 M NA2SO4, 15% ETHYLENE GLYCOL	分辨率 3.50 Å R-free 0.228
4JPS Co-crystal Structures of the Lipid Kinase PI3K alpha with Pan and Isoform Selective Inhibitors 提交 2013-03-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 307–593（287 aa）	未记录	SCN THIOCYANATE ION × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6uL protein to 4uL well with streak seeding at 18C , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 303K	分辨率 2.20 Å R-free 0.228
4L1B Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha 提交 2013-06-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.59 Å R-free 0.274
4L23 Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and PI-103 提交 2013-06-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615	未记录	X6K 3-(4-MORPHOLIN-4-YLPYRIDO[3',2':4,5]FURO[3,2-D]PYRIMIDIN-2-YL)PHENOL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.273
4L2Y Crystal Structure of p110alpha complexed with niSH2 of p85alpha and compound 9d 提交 2013-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：niSH2 of p85alpha, UNP residues 318-615	未记录	XXK 3-amino-5-[4-(morpholin-4-yl)pyrido[3',2':4,5]furo[3,2-d]pyrimidin-2-yl]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；0.15 M Lithium sulfate, 0.1 M Tris PH 8.5, 30%(W/V) PEG 1000MME, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
4OVU Crystal Structure of p110alpha in complex with niSH2 of p85alpha 提交 2014-01-14	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：UNP residues 322-600	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate	分辨率 2.96 Å R-free 0.272
4OVV Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with diC4-PIP2 提交 2014-01-14	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：UNP residues 322-600	未记录	PBU (2R)-3-{[(R)-HYDROXY{[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-TRIHYDROXY-4,5-BIS(PHOSPHONOOXY)CYCLOHEXYL]OXY}PHOSPHORYL]OXY}PROPANE-1 ,2-DIYL DIBUTANOATE × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；298 K；NaFormate	分辨率 3.50 Å R-free 0.339
4WAF Crystal Structure of a novel tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazine in an engineered PI3K alpha 提交 2014-08-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–317（316 aa）片段：UNP residues 2-317	突变：T12Y	3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12% PEG 3350, 120mM potassium thiocyanate	分辨率 2.39 Å R-free 0.247
4YKN Pi3K alpha lipid kinase with Active Site Inhibitor 提交 2015-03-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 318–615（298 aa）片段：UNP P27986 residues 318-615, LINKER (GSPGISGGGGG), P42336 residues 2-1068	未记录	4EL 3-(6-methoxypyridin-3-yl)-5-[({4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)sulfamoyl]phenyl}amino)methyl]benzoic acid × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；ethylenene glycol, PIP2	分辨率 2.90 Å R-free 0.247
4ZOP Co-crystal Structure of Lipid Kinase PI3K alpha with a selective phosphatidylinositol-3 kinase alpha inhibitor 提交 2015-05-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–290（290 aa）	未记录	4Q2 (2S,3R)-N~1~-(8-tert-butyl-4,5-dihydro[1,3]thiazolo[4,5-h]quinazolin-2-yl)-3-methylpyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；303 K；12% PEG 3350, 120MM KSCN, 6UL PROTEIN TO 4UL WELL WITH STREAK SEEDING AT 18C , PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.62 Å R-free 0.258
5AUL PI3K p85 C-terminal SH2 domain/CD28-derived peptide complex 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 622–728（107 aa）片段：UNP residues 614-720	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Sodium Acetate trihydrate, 200 mM Ammonium Acetate, 30% PEG4000	分辨率 1.10 Å R-free 0.160
5FI4 Discovery of imidazo[1,2-a]-pyridine inhibitors of pan-PI3 kinases that are efficacious in a mouse xenograft model 提交 2015-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–317（316 aa）片段：UNP residues 2-317	未记录	GOL GLYCEROL × 1 5XV ~{N}-[6-[5-azanyl-6-[(2~{S})-1,1,1-tris(fluoranyl)propan-2-yl]oxy-pyrazin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl]ethanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；12.5% PEG 3350, 125 mM KSCN Drops were 5uL protein: 3uL well solutions and streak seeded.	分辨率 2.50 Å R-free 0.245
5GJI PI3K p85 N-terminal SH2 domain/CD28-derived peptide complex 提交 2016-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 325–430（106 aa）片段：UNP residues 325-430	突变：D330N	SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；100mM Sodium acetate trihydrate, 30% PEG MME 2000, 200mM Ammonium sulfate	分辨率 0.90 Å R-free 0.145
5ITD Crystal structure of PI3K alpha with PI3K delta inhibitor 提交 2016-03-16	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–317（316 aa）片段：UNP residues 2-317	未记录	6CY 5-{4-[3-(4-acetylpiperazine-1-carbonyl)phenyl]quinazolin-6-yl}-2-methoxypyridine-3-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 uL of protein was mixed with 5 uL of well solution containing 12% PEG 3350 and 120 mM potassium thiocyanate	分辨率 3.02 Å R-free 0.241
5M6U HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH LASW1579 提交 2016-10-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–724（724 aa）片段：UNP residues 431-599	未记录	7KA 4-azanyl-6-[[(1~{S})-1-(4-oxidanylidene-3-phenyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-2-yl)ethyl]amino]pyrimidine-5-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；NULL	分辨率 2.85 Å R-free 0.309
5SW8 Crystal structure of PI3Kalpha in complex with fragments 7 and 11 提交 2016-08-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 70S 2H-indazol-5-amine × 1 FB1 2-CHLOROBENZENESULFONAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.30 Å R-free 0.298
5SWG Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 5 and 21 提交 2016-08-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	AX7 1H-benzimidazol-2-amine × 1 CAQ CATECHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.11 Å R-free 0.262
5SWO Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 4 and 19 提交 2016-08-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 70T 2-methyl-5-nitro-1H-indole × 1 2ZV 4-methyl-3-nitropyridin-2-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.50 Å R-free 0.274
5SWP Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 6 and 24 提交 2016-08-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	70W tert-butyl 4-aminopiperidine-1-carboxylate × 2 70V 2-methylcyclohexane-1,3-dione × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.41 Å R-free 0.296
5SWR Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 20 and 26 提交 2016-08-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	718 6-hydroxy-3,4-dihydronaphthalen-1(2H)-one × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SAL 2-HYDROXYBENZOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.31 Å R-free 0.273
5SWT Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 17 and 27 提交 2016-08-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	71A pyridin-3-ol × 1 71B 3-fluoro-4-methoxyaniline × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.49 Å R-free 0.285
5SX8 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 12 and 15 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	71M 6-methylpyridin-2-amine × 2 LUZ pteridine-2,4(1H,3H)-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.47 Å R-free 0.276
5SX9 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 14 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	71L 4,6-dimethylpyridin-2-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.52 Å R-free 0.277
5SXA Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 10 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	71N 2-(trifluoromethyl)-1H-benzimidazol-5-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.35 Å R-free 0.275
5SXB Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 23 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	SOA ISATOIC ANHYDRIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.30 Å R-free 0.278
5SXC Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 8 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	URF 5-FLUOROURACIL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.55 Å R-free 0.268
5SXD Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 22 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	71F 2-methoxybenzoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.50 Å R-free 0.276
5SXE Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragments 19 and 28 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	71G 3-aminobenzonitrile × 1 ES3 4-bromo-1H-imidazole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.51 Å R-free 0.271
5SXF Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 9 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	HPP HYDROXYPHENYL PROPIONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.46 Å R-free 0.267
5SXI Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 13 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	71J trans-cyclohexane-1,4-diol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.40 Å R-free 0.279
5SXJ Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 29 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	BHO BENZHYDROXAMIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.42 Å R-free 0.279
5SXK Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with fragment 18 提交 2016-08-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）片段：residues 322-600	未记录	71K 2-methylbenzene-1,3-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；NaFormate	分辨率 3.55 Å R-free 0.278
5UBT CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A 7-(3-(PIPERAZIN-1-YL)PHENYL)PYRROLO[2,1-F][1,2,4] TRIAZIN-4-AMINE DERIVIATINE 提交 2016-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 432–599（168 aa）	未记录	85S 1-[4-(3-{4-amino-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL	分辨率 2.83 Å R-free 0.268
5UK8 The co-structure of (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–293（293 aa）	突变：T6Y	8DV (R)-4-(6-(1-(cyclopropylsulfonyl)cyclopropyl)-2-(1H-indol-4-yl)pyrimidin-4-yl)-3-methylmorpholine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 303.15K	分辨率 2.50 Å R-free 0.240
5UKJ The co-structure of N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3- b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5- a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–293（293 aa）	未记录	3K6 N,N-dimethyl-4-[(6R)-6-methyl-5-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)-4,5,6,7-tetrahydropyrazolo[1,5-a]pyrazin-3-yl]benzenesulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,	分辨率 2.80 Å R-free 0.252
5UL1 The co-structure of 3-amino-6-(4-((1-(dimethylamino)propan-2-yl)sulfonyl)phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide and a rationally designed PI3K-alpha mutant that mimics ATR 提交 2017-01-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–293（293 aa）	未记录	8DY 3-amino-6-(4-{[(2S)-1-(dimethylamino)propan-2-yl]sulfonyl}phenyl)-N-phenylpyrazine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303.15 K；3 UL OF PROTEIN WAS MIXED WITH 5 UL OF WELL SOLUTION CONTAINING 12% PEG 3350 AND 120 MM POTASSIUM THIOCYANATE, PH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.00 Å R-free 0.260
5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 431–600（170 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.279
5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 431–600（170 aa）	未记录	9EM 4-acetyl-1-(3-{4-amino-5-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)-3,3-dimethylpiperazin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.279
5XGH Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–598（277 aa）片段：UNP residues 322-598	未记录	84U 3-[(4-fluorophenyl)methylamino]-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME	分辨率 2.97 Å R-free 0.280
5XGI Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–598（277 aa）片段：UNP residues 322-598	未记录	84R 3-azanyl-5-(4-morpholin-4-ylthieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)phenol × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME	分辨率 2.56 Å R-free 0.290
5XGJ Crystal structure of PI3K complex with an inhibitor 提交 2017-04-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–599（278 aa）片段：UNP residues 322-598	未记录	84X 3-(4-morpholin-4-ylfuro[3,2-d]pyrimidin-2-yl)-5-[(phenylmethyl)amino]phenol × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15M Lithium sulfate, 0.1M Tris-HCl pH 8.5, 28%(W/V) PEG2000MME	分辨率 2.97 Å R-free 0.279
6NCT Structure of p110alpha/niSH2 - vector data collection 提交 2018-12-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes, 1.4-1.6 M sodium formate	分辨率 3.35 Å R-free 0.271
6PYR Human PI3Kdelta in complex with Compound 2-10 ((3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one) 提交 2019-07-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 131–299（169 aa）片段：UNP residues 131-299	未记录	P5J (3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 mM MES/NaOH, pH 5.75, 5 mM DTT	分辨率 2.21 Å R-free 0.259
6PYU Human PI3Kdelta in complex with Compound 4-2 ((3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one) 提交 2019-07-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 131–299（169 aa）片段：UNP residues 131-299	未记录	P5V (3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；not available	分辨率 2.54 Å R-free 0.292
7CIO Molecular interactions of cytoplasmic region of CTLA-4 with SH2 domains of PI3-kinase 提交 2020-07-08	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 614–720（107 aa）	突变：C656S, C659V, C670L	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate trihydrate pH 4.6, 30% PEG 4000	分辨率 1.10 Å R-free 0.179
7LM2 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 3C 提交 2021-02-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 131–299（169 aa）	未记录	Y5Y cyclopropyl[(3S)-3-{[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]amino}pyrrolidin-1-yl]methanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 MM MES/NAOH, PH 5.75, 5 MM DTT	分辨率 2.79 Å R-free 0.289
7LQ1 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 28 提交 2021-02-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 131–299（169 aa）	未记录	YA7 N-(5-(6-(2-((2S,6R)-2,6-dimethylmorpholino)pyridin-4-yl)-1-oxoisoindolin-4-yl)-2-methoxypyridin-3-yl)methanesulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES PH 6.0	分辨率 2.96 Å R-free 0.281
7MYN Cryo-EM Structure of p110alpha in complex with p85alpha 提交 2021-05-21	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.79 Å
7MYO Cryo-EM structure of p110alpha in complex with p85alpha inhibited by BYL-719 提交 2021-05-21	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.92 Å
7PG5 Crystal Structure of PI3Kalpha 提交 2021-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 307–593（287 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；10% PEG 5K MME (w/v), 160 nM KSCN, 100 mM sodium cacodylate pH 6.5.	分辨率 2.20 Å R-free 0.246
7PG6 Crystal Structure of PI3Kalpha in complex with the inhibitor NVP-BYL719 提交 2021-08-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 307–593（287 aa）	未记录	1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；10% PEG 5000, 160 mM KSCN and 100 mM sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.240
7RNS nSH2 domain of p85-alpha subunit of phosphatidylinositol 3-kinase in complex with an actin peptide with phosphorylated tyrosine 53 提交 2021-07-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 51–164（114 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.05 M cadmium sulfate hydrate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 1.0 M sodium acetate trihydrate	分辨率 1.14 Å R-free 0.147
7TZ7 PI3K alpha in complex with an inhibitor 提交 2022-02-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–291（291 aa）	未记录	KVJ (4S,5R)-3-[2'-amino-2-(morpholin-4-yl)-4'-(trifluoromethyl)[4,5'-bipyrimidin]-6-yl]-4-(hydroxymethyl)-5-methyl-1,3-oxazolidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；303.15 K；0.15M Potassium Thiocyanate, 20% PEG 3350	分辨率 2.41 Å R-free 0.277
8DCP PI 3-kinase alpha with nanobody 3-126 提交 2022-06-17	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.41 Å
8DCX PI 3-kinase alpha with nanobody 3-159 提交 2022-06-17	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8DD4 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142 提交 2022-06-17	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8DD8 PI 3-kinase alpha with nanobody 3-142, crosslinked with DSG 提交 2022-06-17	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8GUB Cryo-EM structure of cancer-specific PI3Kalpha mutant H1047R in complex with BYL-719 提交 2022-09-11	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.73 Å
8H36 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a dimeric complex 提交 2022-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 G 1–724（724 aa）链 H 1–724（724 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
8H37 Cryo-EM Structure of the KBTBD2-CUL3-Rbx1-p85a tetrameric complex 提交 2022-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 G 1–724（724 aa）链 H 1–724（724 aa）链 I 1–724（724 aa）链 J 1–724（724 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 12	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.52 Å
8ILR Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 16 提交 2023-03-04	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	7TZ N-[(2S)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å
8ILS Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 17 提交 2023-03-04	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	7U5 N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[4-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8ILV Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound 18 提交 2023-03-04	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	L2V N-[(2R)-1-(ethylamino)-1-oxidanylidene-3-[3-(2-quinoxalin-6-ylethynyl)phenyl]propan-2-yl]-2,3-dimethyl-quinoxaline-6-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
8SBC Co-structure of Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform and brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–293（293 aa）	未记录	ZTV (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(pyridin-2-yl)-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN PROTEIN SOLUTION : 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML FORMATION METHOD : SOAKING PROTOCOL : SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, REMARK 280 XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS METHOD : VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP TEMPERATURE : 303.0 CRYO PROTOCOL : 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
8SBJ Co-structure Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform complexed with brain penetrant inhibitors 提交 2023-04-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–293（293 aa）	未记录	ZUO (2M)-7-[(3R)-3-methylmorpholin-4-yl]-5-[(3S)-3-methylmorpholin-4-yl]-2-(1H-pyrazol-3-yl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；303 K；RESERVOIR SOLUTION : 12%-20% PEG 3350, 0.125M-0.20M KSCN; PROTEIN SOLUTION: 20MM TRIS PH 7.2, 200MM NACL, 1% BETAINE, 1% ETHYLENE GLYCOL, 0.02% CHAPS, 5MM DTT, PROTEIN IS 7.4 MG/ML, FORMATION METHOD : SOAKING, PROTOCOL: SET UP APO XTALS DROPS IN 1:1 RATIO IN 30C, XTALS GROW OVERNIGHT, THEN ADD 2MM OF STOCK CPD AND INCUBATE FOR A FEW HOURS; CRYO PROTOCOL: 20% ETHYLENE GLYCOL PLUS WELL SOLUTION	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 8–293（286 aa）	未记录	X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350	分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TDU STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to PI3Kalpha 提交 2023-07-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 8–293（286 aa）	未记录	X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；0.1 M MES pH 6.8, 500mM NaCl, 8% w/v PEG 3350	分辨率 3.11 Å R-free 0.267
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 8–293（286 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350	分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TGD STX-478, a Mutant-Selective, Allosteric Inhibitor bound to H1047R PI3Kalpha 提交 2023-07-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 8–293（286 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X3N N~2~-{(4S,11aP)-2-[(4S)-4-(difluoromethyl)-2-oxo-1,3-oxazolidin-3-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-L-alaninamide × 1 ZWE N-(2-aminopyrimidin-5-yl)-N'-[(1R)-1-(5,7-difluoro-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2,2,2-trifluoroethyl]urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH pH 6.8, 5% w/v PEG 3350	分辨率 2.93 Å R-free 0.252
8TS7 Human PI3K p85alpha/p110alpha 提交 2023-08-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：residues 318-615	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350	分辨率 2.71 Å R-free 0.288
8TS8 p85alpha/p110alpha heterodimer H1047R mutant 提交 2023-08-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：residues 318-615	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350	分辨率 2.72 Å R-free 0.265
8TS9 Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 1 提交 2023-08-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：residues 318-615	未记录	UE9 5-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350	分辨率 2.83 Å R-free 0.252
8TSA Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 2 提交 2023-08-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：residues 318-615	未记录	UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350	分辨率 2.51 Å R-free 0.276
8TSB Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to compound 2 提交 2023-08-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：residues 318-615	未记录	UIW 5-(3-bromo-5-fluorobenzamido)-N-methyl-6-(2-methylanilino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350	分辨率 3.53 Å R-free 0.256
8TSC Human PI3K p85alpha/p110alpha H1047R bound to compound 3 提交 2023-08-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：residues 318-615	未记录	UJC (1S)-7-[3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamido]-N-methyl-1-(2-methylphenyl)-3-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350	分辨率 3.62 Å R-free 0.255
8TSD Human PI3K p85alpha/p110alpha bound to RLY-2608 提交 2023-08-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 318–615（298 aa）片段：residues 318-615	未记录	XUZ N-{(3R,6M)-3-(2-chloro-5-fluorophenyl)-6-[(4S)-5-cyano[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-6-yl]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-3-fluoro-5-(trifluoromethyl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 9% PEG-3350	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
8TU6 CryoEM structure of PI3Kalpha 提交 2023-08-15	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–724（724 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.12 Å
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.	分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8H PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 4). 提交 2023-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 322–600（279 aa）	未记录	YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5, 4% w/v PEG 4000.	分辨率 3.58 Å R-free 0.272
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8I PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket (compound 5). 提交 2023-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 322–600（279 aa）	未记录	YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.1 M Sodium Malonate pH 5.0, 10% w/v PEG 3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.310
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2	分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8J PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitors in two cryptic pockets (compounds 4 and 5). 提交 2023-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 322–600（279 aa）	未记录	YO4 2-({(1R)-1-[2-(4,4-dimethylpiperidin-1-yl)-3,6-dimethyl-4-oxo-4H-1-benzopyran-8-yl]ethyl}amino)benzoic acid × 1 YOR N-{(3S)-3-(2-methylphenyl)-6-[(oxetan-3-yl)amino]-1-oxo-2,3-dihydro-1H-isoindol-4-yl}-1-benzothiophene-3-carboxamide × 1 YNZ (2S)-N~1~-[(4P)-2-tert-butyl-4'-methyl[4,5'-bi-1,3-thiazol]-2'-yl]pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；0.4M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Citrate, pH 5.2	分辨率 3.35 Å R-free 0.251
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0	分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8U PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 12). 提交 2023-12-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 322–600（279 aa）	未记录	1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1 YQB (3S)-9-[(1R)-1-(2-carboxyanilino)ethyl]-3-cyano-7-methyl-4-oxo-2-(piperidin-1-yl)-3,4-dihydropyrido[1,2-a]pyrimidin-5-ium × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.3-0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0	分辨率 2.93 Å R-free 0.255
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0	分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8V8V PI3Ka H1047R co-crystal structure with inhibitor in cryptic pocket near H1047R (compound 7). 提交 2023-12-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 322–600（279 aa）	未记录	YQ2 2-[[(1~{R})-1-(7-methyl-4-oxidanylidene-2-piperidin-1-yl-3~{H}-pyrido[1,2-a]pyrimidin-9-yl)ethyl]amino]benzoic acid × 1 1LT (2S)-N~1~-{4-methyl-5-[2-(1,1,1-trifluoro-2-methylpropan-2-yl)pyridin-4-yl]-1,3-thiazol-2-yl}pyrrolidine-1,2-dicarboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.6 M Sodium Formate, 0.1 M Citrate pH 5.0	分辨率 2.61 Å R-free 0.288
8W9A CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-7909 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–724（724 aa）	未记录	UEX 6-chloranyl-3-[[(1R)-1-[2-(1,3-dihydropyrrolo[3,4-c]pyridin-2-yl)-3,6-dimethyl-4-oxidanylidene-quinazolin-8-yl]ethyl]amino]pyridine-2-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8W9B CryoEM structure of human PI3K-alpha (P85/P110-H1047R) with QR-8557 binding at an allosteric site 提交 2023-09-05	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 322–600（279 aa）	未记录	UJ3 1-[(1S)-1-(5-fluoranyl-3-methyl-1-benzofuran-2-yl)-2-methyl-propyl]-3-(1-oxidanylidene-2,3-dihydroisoindol-5-yl)urea × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9LWQ Cryo-EM structure of PI3Kalpha in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	QIH 1-[7-[[2-[[4-(4-ethylpiperazin-1-yl)phenyl]amino]pyridin-4-yl]amino]-2,3-dihydroindol-1-yl]ethanone × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
9LWR Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9LWS Cryo-EM structure of PI3Kalpha H1047R in complex with compound UCL-TRO-1938 提交 2025-02-16	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 3–724（722 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9NI6 Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–724（724 aa）	未记录	A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
9NI8 Cryo-EM structure of the Class 2 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs 提交 2025-02-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–724（724 aa）	未记录	A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
9NLC Cryo-EM structure of the Class 1 PI3K alpha/KRas complex on POPC/POPS nanodiscs low-pass filtered to 10 angstroms 提交 2025-03-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–724（724 aa）	未记录	A1AZD tert-butyl [2-(2-{[(2P)-2-{4-[4-(2-amino-2-oxoethyl)-2-fluoroanilino]thieno[2,3-d]pyridazin-7-yl}phenyl]oxy}ethoxy)ethyl]carbamate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM Tris-HCL, 150 mM NaCl, 1mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å

共 103 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	P85A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–112； UniProt 617–724

BETA-PLATELET-DERIVED GROWTH FACTOR RECEPTOR

物种未注明

UniProt P09619

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 751–755	片段：RESIDUES 751 - 755 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE × 1 （P27986）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 7；40MG/ML PROTEIN IN 20 MM PHOSPHATE PH6.2 + PEG8000, RESERVOIR WITH SAME PHOSPHATE + PEG8000 + 250MM NACL, pH 7.00	分辨率 1.79 Å R-free 0.219

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1H9O	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
11UE Structure of PDGFRb Kinase Domain Bound to JNJ-PDGFRBi-1 提交 2026-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 557–981（425 aa）	未记录	A1DA1 N-[2-(2,2-dimethylpyrrolidin-1-yl)ethyl]-6-methyl-5-({1-methyl-6-[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino]-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M MES PH 6.5, 11% PEG 550 MME	分辨率 2.32 Å R-free 0.236
1GQ5 Structural Determinants of the NHERF Interaction with beta2-AR and PDGFR 提交 2001-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1102–1106（5 aa）片段：PDZ1 DOMAIN, RESIDUES 11-94	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；SODIUM ACETATE, SODIUM CHLORIDE, pH 4.60	分辨率 2.20 Å R-free 0.263
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 748–758（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2IUI Crystal structure of the PI3-kinase p85 N-terminal SH2 domain in complex with PDGFR phosphotyrosyl peptide 提交 2006-06-03	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 748–758（11 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6, 0.2M AMMONIUM ACETATE, 30% PEG4000	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
2L6W PDGFR beta-TM 提交 2010-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 526–563（38 aa）片段：UNP residues 526-563 链 B 526–563（38 aa）片段：UNP residues 526-563	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；323 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] PDGFR-TM, 200 mM [U-2H] DPC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PDGFR-TM, 200 mM [U-2H] DPC, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] and natural abundance PDGFR-TM, 200 mM DPC, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] PDGFR-TM, 200 mM [U-2H] DPC, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2PLD NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE STRUCTURE OF AN SH2 DOMAIN OF PHOSPHOLIPASE C-GAMMA1 COMPLEXED WITH A HIGH AFFINITY BINDING PEPTIDE 提交 1994-08-19	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1018–1029（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2PLE NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE STRUCTURE OF AN SH2 DOMAIN OF PHOSPHOLIPASE C-GAMMA1 COMPLEXED WITH A HIGH AFFINITY BINDING PEPTIDE 提交 1994-08-19	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1018–1029（12 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
3MJG The structure of a platelet derived growth factor receptor complex 提交 2010-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 X 33–314（282 aa）片段：UNP residues 33-314 链 Y 33–314（282 aa）片段：UNP residues 33-314	未记录	NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.84 M (NH4)2HPO4, 0.1 M imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
3MJG The structure of a platelet derived growth factor receptor complex 提交 2010-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 X 33–314（282 aa）片段：UNP residues 33-314 链 Y 33–314（282 aa）片段：UNP residues 33-314	未记录	NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.84 M (NH4)2HPO4, 0.1 M imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277

共 7 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PGDR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–5； UniProt 751–755

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1h9o
沉积日期 deposition_date	2001-03-14
结构标题 title	PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, CRYSTAL STRUCTURE AT 1.79 A
关键词 keywords	;TRANSFERASE/RECEPTOR, COMPLEX (PHOSPHOTRANSFERASE-RECEPTOR), PHOSPHOTRANSFERASE, SH2 DOMAIN, SIGNAL TRANSDUCTION, PHOSPHOINOSITIDE 3-KINASE, TRANSFERASE-RECEPTOR complex ;; TRANSFERASE/RECEPTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	14.37 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	12.93 Å
零角强度 I(0) i0	3508600.00
分子量 molecular_weight	12725.0 kDa
排除体积 excluded_volume	15762 Å³
包络体积 envelope_volume	17447 Å³
水化壳体积 shell_volume	11398 Å³
包络直径 envelope_diameter	44.4 Å
壳层 Rg shell_rg	18.78 Å
包络 Rg envelope_rg	13.28 Å
形状 Rg shape_rg	12.91 Å
总 Rg total_rg	14.24 Å
总原子数 total_atoms	895
残基数 n_residues	113
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	46.6 Å
Rg (实空间) rg_real	14.26 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.30 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.5090e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.0850e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	14.27 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	3509000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8766
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.052
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.381
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	784900.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.801; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.994

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE
分子量 formula_weight	12612.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1034

GSPIPHHDEKTWNVGSSNRNKAENLLRGKRDGTFLVRESSKQGCYACSVVVDGEVKHCVINKTATGYGFAEPYNLYSSLKELVLHYQHTSLVQHNDSLNVTLAYPVYAQQRR

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	BETA-PLATELET-DERIVED GROWTH FACTOR RECEPTOR
分子量 formula_weight	701.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

YVPML

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	110

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1h9oa_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.93 — SH2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.93.1 — SH2 domain
家族 Family family	d.93.1.1 — SH2 domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1h9oA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — SH2 domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	59.000 Å
晶胞边长 b length_b	32.800 Å
晶胞边长 c length_c	54.900 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	96.20 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.790 Å
最低分辨率 resolution_low	54.000 Å
R 因子 r_factor	0.1680
R_work r_work	0.1630
R_free r_free	0.2190

fit	/app/data/saxs_computation/h9/1h9o/1h9o.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h9/1h9o/1h9o.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h9/1h9o/1h9o.dat

PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE, P85-ALPHA SUBUNIT: C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A TYR751 PHOSPHOPEPTIDE FROM THE PDGF RECEPTOR, CRYSTAL STRUCTURE AT 1.79 A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

BETA-PLATELET-DERIVED GROWTH FACTOR RECEPTOR

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)