1hh4

Rac1-RhoGDI complex involved in NADPH oxidase activation

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 117.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–192	未记录	RHO GDP-DISSOCIATION INHIBITOR 1 × 1 （P52565） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；HANGING DROP AT 20C WITH RESERVOIR: 30% PEG 4000, 100 MM NA CITRATE PH=5.6, 5 MM MGCL2, 200 MM AMMONIUM ACETATE, pH 5.60	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–192	未记录	RHO GDP-DISSOCIATION INHIBITOR 1 × 1 （P52565） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；HANGING DROP AT 20C WITH RESERVOIR: 30% PEG 4000, 100 MM NA CITRATE PH=5.6, 5 MM MGCL2, 200 MM AMMONIUM ACETATE, pH 5.60	分辨率 2.70 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1HH4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1E96 Structure of the Rac/p67phox complex 提交 2000-10-10	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：YES	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 10.5；0.1 M CAPS PH 10.5, 0.2 M LI ACETATE, 0.8 M NAH2PO4, 1.2 M K2HPO4	分辨率 2.40 Å R-free 0.284
1HE1 Crystal structure of the complex between the GAP domain of the Pseudomonas aeruginosa ExoS toxin and human Rac 提交 2000-11-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–176（176 aa）片段：2-184	未记录	NI NICKEL (II) ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；8% PEG 6000, 3MM NICL2, 100 MM TRIS/HCL PH8.5, pH 8.50	分辨率 2.00 Å R-free 0.224
1HE1 Crystal structure of the complex between the GAP domain of the Pseudomonas aeruginosa ExoS toxin and human Rac 提交 2000-11-18	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–176（176 aa）片段：2-184	未记录	NI NICKEL (II) ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；8% PEG 6000, 3MM NICL2, 100 MM TRIS/HCL PH8.5, pH 8.50	分辨率 2.00 Å R-free 0.224

共 2 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–192； UniProt 1–192 作者链 B； PDB构建体 1–192； UniProt 1–192

RHO GDP-DISSOCIATION INHIBITOR 1

HOMO SAPIENS

UniProt P52565

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–204	未记录	RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1 × 1 （P15154） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；HANGING DROP AT 20C WITH RESERVOIR: 30% PEG 4000, 100 MM NA CITRATE PH=5.6, 5 MM MGCL2, 200 MM AMMONIUM ACETATE, pH 5.60	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–204	未记录	RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1 × 1 （P15154） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；HANGING DROP AT 20C WITH RESERVOIR: 30% PEG 4000, 100 MM NA CITRATE PH=5.6, 5 MM MGCL2, 200 MM AMMONIUM ACETATE, pH 5.60	分辨率 2.70 Å R-free 0.280

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1HH4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CC0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE RHOA.GDP-RHOGDI COMPLEX 提交 1999-03-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–204（204 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION IN A SITTING DROP USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR. CRYSTALLIZATION OCCURED OVER A PERIOD OF SEVERAL DAYS AT 20 DEGREE CELSIUS. PROTEIN (15 MG/ML) WAS IN 25MM TRIS-HCL, PH=8.0, 100MM NACL, 5MM MGCL2. RESERVOIR CONTAINED: 51% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE, PH=5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 5.00 Å
1CC0 CRYSTAL STRUCTURE OF THE RHOA.GDP-RHOGDI COMPLEX 提交 1999-03-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–204（204 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.3；293 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION IN A SITTING DROP USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AND RESERVOIR. CRYSTALLIZATION OCCURED OVER A PERIOD OF SEVERAL DAYS AT 20 DEGREE CELSIUS. PROTEIN (15 MG/ML) WAS IN 25MM TRIS-HCL, PH=8.0, 100MM NACL, 5MM MGCL2. RESERVOIR CONTAINED: 51% SATURATED AMMONIUM SULFATE, 100 MM SODIUM ACETATE, PH=5.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 5.00 Å
1FSO CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI QUADRUPLE MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K135A, K138A, K141A, L196F	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；ammonium sulfate and MES buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.232
1FST CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI TRIPLE MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–204（181 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K135A, K138A, K141A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 3400, isopropanol, HEPES buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.261
1FST CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI TRIPLE MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 24–204（181 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K135A, K138A, K141A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 3400, isopropanol, HEPES buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.70 Å R-free 0.261
1FT0 CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI K113A MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K113A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；ammonium sulfate, Na/K tartrate, and sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
1FT0 CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI K113A MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K113A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；ammonium sulfate, Na/K tartrate, and sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
1FT0 CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED HUMAN RHOGDI K113A MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN 链 B 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K113A 突变：K113A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；ammonium sulfate, Na/K tartrate, and sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
1FT3 CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED RHOGDI K141A MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K141A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；ammonium sulfate, Na/K tartrate, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
1FT3 CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED RHOGDI K141A MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K141A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；ammonium sulfate, Na/K tartrate, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
1FT3 CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED RHOGDI K141A MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN 链 B 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K141A 突变：K141A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；ammonium sulfate, Na/K tartrate, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
1FT3 CRYSTAL STRUCTURE OF TRUNCATED RHOGDI K141A MUTANT 提交 2000-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 67–204（138 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	突变：K141A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；ammonium sulfate, Na/K tartrate, sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
1KMT Crystal structure of RhoGDI Glu(154,155)Ala mutant 提交 2001-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 64–204（141 aa）	突变：E154A, E155A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；294 K；PEG 4000, Tris-HCl, Lithium sulfate, methylpentane diol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 1.30 Å R-free 0.195
1KMT Crystal structure of RhoGDI Glu(154,155)Ala mutant 提交 2001-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 64–204（141 aa）	突变：E154A, E155A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；294 K；PEG 4000, Tris-HCl, Lithium sulfate, methylpentane diol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 1.30 Å R-free 0.195
1QVY Crystal structure of RhoGDI K(199,200)R double mutant 提交 2003-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 67–204（138 aa）片段：C-terminal domain	突变：K(199,200)R	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 M lithium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.0K	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
1QVY Crystal structure of RhoGDI K(199,200)R double mutant 提交 2003-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 67–204（138 aa）片段：C-terminal domain	突变：K(199,200)R	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 M lithium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.0K	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
1QVY Crystal structure of RhoGDI K(199,200)R double mutant 提交 2003-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 67–204（138 aa）片段：C-terminal domain	突变：K(199,200)R	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 M lithium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.0K	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
1QVY Crystal structure of RhoGDI K(199,200)R double mutant 提交 2003-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 67–204（138 aa）片段：C-terminal domain	突变：K(199,200)R	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；30% PEG 400, 0.1 M Tris, 0.2 M lithium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294.0K	分辨率 1.60 Å R-free 0.210
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 59–203（145 aa）链 C 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 59–203（145 aa）链 C 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
1RHO STRUCTURE OF RHO GUANINE NUCLEOTIDE DISSOCIATION INHIBITOR 提交 1996-10-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 59–203（145 aa）链 C 59–203（145 aa）	突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：TRYPSIN PROTEOLYSIS AT R58 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；2 M NH4 SO4 0.1 M TRIS PH 8.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.298
2BXW CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI Lys(135,138,141)Tyr MUTANT 提交 2005-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 67–204（138 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 67-204	突变：YES	FMT FORMIC ACID × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.88；4M NA FORMATE, pH 7.88	分辨率 2.40 Å R-free 0.222
2BXW CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI Lys(135,138,141)Tyr MUTANT 提交 2005-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 67–204（138 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 67-204	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.88；4M NA FORMATE, pH 7.88	分辨率 2.40 Å R-free 0.222
2JHS CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K135H,K138H,K141H MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.4 M SODIUM CITRATE, 100 MM HEPES PH 7.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.209
2JHT CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K135T,K138T,K141T MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 1 LI LITHIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；35% PEG 4000 0.2 M LITHIUM SULFATE 0.1M TRIS PH 8.5	分辨率 1.88 Å R-free 0.259
2JHT CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K135T,K138T,K141T MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；35% PEG 4000 0.2 M LITHIUM SULFATE 0.1M TRIS PH 8.5	分辨率 1.88 Å R-free 0.259
2JHT CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K135T,K138T,K141T MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；35% PEG 4000 0.2 M LITHIUM SULFATE 0.1M TRIS PH 8.5	分辨率 1.88 Å R-free 0.259
2JHT CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K135T,K138T,K141T MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；35% PEG 4000 0.2 M LITHIUM SULFATE 0.1M TRIS PH 8.5	分辨率 1.88 Å R-free 0.259
2JHU CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.233
2JHU CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.233
2JHV CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 2.07 Å R-free 0.257
2JHV CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 2.07 Å R-free 0.257
2JHV CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 2.07 Å R-free 0.257
2JHV CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 2.07 Å R-free 0.257
2JHV CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 2.07 Å R-free 0.257
2JHV CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E154A,E155A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；2.0 M AMMONIUM SULFATE 0.2 M SODIUM CHLORIDE 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 6.5	分辨率 2.07 Å R-free 0.257
2JHW CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155A, E157A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；2M AMMONIUM SULFATE, pH 8.00	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
2JHW CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155A, E157A MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；2M AMMONIUM SULFATE, pH 8.00	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
2JHX CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155H, E157H MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.4 M SODIUM CITRATE 0.1 M HEPES PH 7.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.219
2JHX CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155H, E157H MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.4 M SODIUM CITRATE 0.1 M HEPES PH 7.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.219
2JHY CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155H, E157H MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.4 M SODIUM CITRATE 0.1 M HEPES PH 7.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.250
2JHZ CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155S, E157S MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.4 M SODIUM CITRATE 0.1 M HEPES PH 7.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.228
2JHZ CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI E155S, E157S MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；1.4 M SODIUM CITRATE 0.1 M HEPES PH 7.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.228
2JI0 CRYSTAL STRUCTURE OF RHOGDI K138Y, K141Y MUTANT 提交 2007-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 66–201（136 aa）片段：ISOPRENYL-BINDING DOMAIN, RESIDUES 66-201	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；32% PEG 8000, 0.22M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH6.5, pH 7.50	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
2N80 p75NTR DD:RhoGDI 提交 2015-09-30	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 31–204（174 aa）片段：UNP residues 31-204	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；301 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] p75NTR DD-1, 1 mM [U-98% 2H] DTT-2, 10 mM [U-98% 2H] HEPES-3, 1 mM EDTA-4, 1 mM sodium azide-5, 2 mM RhoGDI-6, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] RhoGDI-7, 2 mM p75NTR DD-8, 1 mM [U-98% 2H] DTT-9, 10 mM [U-98% 2H] HEPES-10, 1 mM EDTA-11, 1 mM sodium azide-12, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
8X8T NMR structure of p75NTR juxtamembrane domain in complex with RhoGDI N-terminal domain containing a phosphorylation-mimicking S34D mutation 提交 2023-11-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–60（59 aa）	突变：S34D	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1 NMR样品组成 0.8 mM [U-13C; U-15N] RhoGDI-NTD, 2.4 mM NA p75NTR-JMD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM [U-13C; U-15N] p75NTR-JMD, 2.4 mM NA RhoGDI-NTD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	GDIR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204 作者链 E； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1hh4
沉积日期 deposition_date	2000-12-20
结构标题 title	Rac1-RhoGDI complex involved in NADPH oxidase activation
关键词 keywords	;SIGNALING PROTEIN/INHIBITOR, SINGAL PROTEIN INHIBITOR COMPLEX, SMALL G PROTEIN, GTPASE ACTIVATION, GTP-BINDING, PRENYLATION, LIPOPROTEIN, SIGNALING PROTEIN-INHIBITOR complex ;; SIGNALING PROTEIN/INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	36.01 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	35.62 Å
零角强度 I(0) i0	105710000.00
分子量 molecular_weight	83588.0 kDa
排除体积 excluded_volume	105140 Å³
包络体积 envelope_volume	148490 Å³
水化壳体积 shell_volume	35134 Å³
包络直径 envelope_diameter	120.0 Å
壳层 Rg shell_rg	41.92 Å
包络 Rg envelope_rg	34.48 Å
形状 Rg shape_rg	35.59 Å
总 Rg total_rg	36.17 Å
总原子数 total_atoms	5878
残基数 n_residues	744
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	117.9 Å
Rg (实空间) rg_real	36.04 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.16 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0570e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.7320e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	36.03 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	105700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8826
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	50.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.208
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.709
角度范围 angular_range	— – 0.2200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	20480000.0000
实空间数据点数 n_real_points	45
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.896; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.893; Smooth: 0.887

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1
分子量 formula_weight	21383.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5908

PQAIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNAFPGEYIPTVFDNYSANVMVDGKPVNLGLWDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVSLICFSLVSPASFENVRAKWYPEVRHHCPNTPIILVGTKLDLRDDKDTIEKLKEKKLTPITYPQGLAMAKEIGAVKYLECSALTQRGLKTVFDEAIRAVLCPPPVKKRKRKCLLL

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RHO GDP-DISSOCIATION INHIBITOR 1
分子量 formula_weight	23238.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E

MAEQEPTAEQLAQIAAENEEDEHSVNYKPPAQKSIQEIQELDKDDESLRKYKEALLGRVAVSADPNVPNVVVTGLTLVCSSAPGPLELDLTGDLESFKKQSFVLKEGVEYRIKISFRVNREIVSGMKYIQHTYRKGVKIDKTDYMVGSYGPRAEEYEFLTPVEEAPKGMLARGSYSIKSRFTDDDKTDHLSWEWNLTIKKDWKD

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	SPODOPTERA FRUGIPERDA

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GERAN-8-YL GERAN
分子量 formula_weight	274.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	30

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1hh4a1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1hh4a2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1hh4b1
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

结构域编号 domain_id	d1hh4b2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d1hh4d_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.18 — E set domains
家族 Family family	b.1.18.8 — RhoGDI-like

结构域编号 domain_id	d1hh4e_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.18 — E set domains
家族 Family family	b.1.18.8 — RhoGDI-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1hh4A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1hh4B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	1hh4D00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Coagulation Factor XIII; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Coagulation Factor XIII, subunit A, domain 1

结构域编号 domain_id	1hh4E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Coagulation Factor XIII; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Coagulation Factor XIII, subunit A, domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	154.700 Å
晶胞边长 b length_b	88.700 Å
晶胞边长 c length_c	62.600 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	19.800 Å
R 因子 r_factor	0.2560
R_work r_work	0.2560
R_free r_free	0.2800

fit	/app/data/saxs_computation/hh/1hh4/1hh4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/hh/1hh4/1hh4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/hh/1hh4/1hh4.dat

Rac1-RhoGDI complex involved in NADPH oxidase activation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RAS-RELATED C3 BOTULINUM TOXIN SUBSTRATE 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

RHO GDP-DISSOCIATION INHIBITOR 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)