1iwg

Crystal structure of Bacterial Multidrug Efflux transporter AcrB

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AcrB

Escherichia coli

UniProt P31224

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACRB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1049; UniProt 1–1049

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1iwg
沉积日期 deposition_date2002-05-15
结构标题 titleCrystal structure of Bacterial Multidrug Efflux transporter AcrB
关键词 keywordsDrug resistance, multidrug efflux, transporter, antiporter, membrane protein; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1iwg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1iwg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1iwg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)45.51 Å
Rg(电子密度)44.92 Å
总 Rg45.23 Å
原子数22917
残基数3018
排除体积414290 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1iwg__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd1iwga1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.44 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
家族 Family familyd.58.44.1 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
结构域编号 domain_idd1iwga2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.44 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
家族 Family familyd.58.44.1 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
结构域编号 domain_idd1iwga3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.44 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
家族 Family familyd.58.44.1 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
结构域编号 domain_idd1iwga4
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.58.44 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
家族 Family familyd.58.44.1 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain; PN1, PN2, PC1 and PC2 subdomains
结构域编号 domain_idd1iwga5
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.225 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
超家族 Superfamily superfamilyd.225.1 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
家族 Family familyd.225.1.1 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
结构域编号 domain_idd1iwga6
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.225 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
超家族 Superfamily superfamilyd.225.1 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
家族 Family familyd.225.1.1 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
结构域编号 domain_idd1iwga7
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.35 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain
超家族 Superfamily superfamilyf.35.1 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain
家族 Family familyf.35.1.1 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain
结构域编号 domain_idd1iwga8
类 Class classf — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold foldf.35 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain
超家族 Superfamily superfamilyf.35.1 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain
家族 Family familyf.35.1.1 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id1iwgA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1640 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain
结构域编号 domain_id1iwgA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1430 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain
结构域编号 domain_id1iwgA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1320 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain like
结构域编号 domain_id1iwgA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2090 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
结构域编号 domain_id1iwgA05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1640 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Multidrug efflux transporter AcrB transmembrane domain
结构域编号 domain_id1iwgA06
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1430 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain
结构域编号 domain_id1iwgA07
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1440 — Multidrug efflux transporter AcrB pore domain
结构域编号 domain_id1iwgA08
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology2090 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Multidrug efflux transporter AcrB TolC docking domain; DN and DC subdomains
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7. 引用文献 (1)