SAXSdb — 1j2f

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interferon regulatory factor 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 175–427	片段：residues 170-427	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；magnesium formate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.242
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 175–427	片段：residues 170-427	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；magnesium formate, pH 4.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.242

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1J2F	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1QWT Auto-inhibitory interferon regulation factor-3 (IRF3) transactivation domain 提交 2003-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 173–427（255 aa）链 B 173–427（255 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.214
1T2K Structure Of The DNA Binding Domains Of IRF3, ATF-2 and Jun Bound To DNA 提交 2004-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–112（112 aa）片段：N-terminal DNA binding domain 链 B 1–112（112 aa）片段：N-terminal DNA binding domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；100 mM NaCacodylate, pH 6.5, 12.5% (w/v) PEG 6000, 400 mM NH4OAc, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.00 Å R-free 0.296
1ZOQ IRF3-CBP complex 提交 2005-05-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 196–386（191 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.15 M Mg acetate, 5% (v/v) PEG 4000, 50 mM Na HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.37 Å R-free 0.226
1ZOQ IRF3-CBP complex 提交 2005-05-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 196–386（191 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.15 M Mg acetate, 5% (v/v) PEG 4000, 50 mM Na HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.37 Å R-free 0.226
2O61 Crystal Structure of NFkB, IRF7, IRF3 bound to the interferon-b enhancer 提交 2006-12-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 9–111（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；100 mM HEPES, pH 7.0, 15% (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.80 Å R-free 0.278
2O6G Crystal structure of IRF-3 bound to the interferon-b enhancer 提交 2006-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 E 1–123（123 aa）片段：DNA binding domain, residues 3-112 链 F 1–123（123 aa）片段：DNA binding domain, residues 3-112 链 G 1–123（123 aa）片段：DNA binding domain, residues 3-112 链 H 1–123（123 aa）片段：DNA binding domain, residues 3-112	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；100 mM Tris, 20% (w/v) PEG 6000, 500 mM NH4OAc, 100 mM NaCl, 5 mM MgCl2, 5% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 3.10 Å R-free 0.265
2PI0 Crystal Structure of IRF-3 bound to the PRDIII-I regulatory element of the human interferon-B enhancer 提交 2007-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric	链 A 1–113（113 aa）片段：IRF-3 DNA Binding Domain 链 B 1–113（113 aa）片段：IRF-3 DNA Binding Domain 链 C 1–113（113 aa）片段：IRF-3 DNA Binding Domain 链 D 1–113（113 aa）片段：IRF-3 DNA Binding Domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；12%PEG 400,200mM NaCl, pH 7., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.31 Å R-free 0.264
3A77 The crystal structure of phosphorylated IRF-3 提交 2009-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACY ACETIC ACID × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；10% MPD, 50mM sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.221
3A77 The crystal structure of phosphorylated IRF-3 提交 2009-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；10% MPD, 50mM sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.221
3A77 The crystal structure of phosphorylated IRF-3 提交 2009-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACY ACETIC ACID × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；10% MPD, 50mM sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.221
3A77 The crystal structure of phosphorylated IRF-3 提交 2009-09-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；10% MPD, 50mM sodium acetate pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.221
5JEJ Phosphorylated STING in complex with IRF-3 CTD 提交 2016-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427 链 B 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 200 mM MgCl2, 20% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
5JEK Phosphorylated MAVS in complex with IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 80 mM MgCl2, 20% PEG 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.251
5JEK Phosphorylated MAVS in complex with IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 80 mM MgCl2, 20% PEG 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.251
5JEL Phosphorylated TRIF in complex with IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M NaAc pH 4.6, 2.0M NaCl	分辨率 1.60 Å R-free 0.187
5JEL Phosphorylated TRIF in complex with IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1M NaAc pH 4.6, 2.0M NaCl	分辨率 1.60 Å R-free 0.187
5JEM Complex of IRF-3 with CBP 提交 2016-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 189–398（210 aa）片段：UNP residues 189-398 链 B 189–398（210 aa）片段：UNP residues 189-398	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.242
5JEM Complex of IRF-3 with CBP 提交 2016-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 189–398（210 aa）片段：UNP residues 189-398 链 G 189–398（210 aa）片段：UNP residues 189-398	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.242
5JEO Phosphorylated Rotavirus NSP1 in complex with IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES sodium pH7.5, 0.8 M NaH2PO4, 0.8 M KH2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.183
5JEO Phosphorylated Rotavirus NSP1 in complex with IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES sodium pH7.5, 0.8 M NaH2PO4, 0.8 M KH2PO4	分辨率 1.72 Å R-free 0.183
5JER Structure of Rotavirus NSP1 bound to IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 200 mM MgCl2, 23% PEG 3350	分辨率 2.91 Å R-free 0.250
5JER Structure of Rotavirus NSP1 bound to IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 200 mM MgCl2, 23% PEG 3350	分辨率 2.91 Å R-free 0.250
5JER Structure of Rotavirus NSP1 bound to IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 200 mM MgCl2, 23% PEG 3350	分辨率 2.91 Å R-free 0.250
5JER Structure of Rotavirus NSP1 bound to IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 200 mM MgCl2, 23% PEG 3350	分辨率 2.91 Å R-free 0.250
5JER Structure of Rotavirus NSP1 bound to IRF-3 提交 2016-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427 链 C 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427 链 E 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427 链 G 189–427（239 aa）片段：UNP residues 189-427	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 200 mM MgCl2, 23% PEG 3350	分辨率 2.91 Å R-free 0.250
6SIV Structure of HPV16 E6 oncoprotein in complex with mutant IRF3 LxxLL motif 提交 2019-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 137–148（12 aa）	突变：;K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,N2146E,M2147E,V2148R,K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,N2146E,M2147E,V2148R,K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,N2146E,M2147E,V2148R,K84A,K240A,E360A,K363A,D364A,N2146E,M2147E,V2148R ;	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；PEG 1500 30%	分辨率 1.75 Å R-free 0.220
6SJA Structure of HPV16 E6 oncoprotein in complex with IRF3 LxxLL motif 提交 2019-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 137–148（12 aa）	突变：E360A,K363A,D364A,K84A,K240A	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；298 K；PEG 1500 30%	分辨率 1.50 Å R-free 0.191
7JFL Crystal structure of human phosphorylated IRF-3 bound to CBP 提交 2020-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 189–398（210 aa）链 B 189–398（210 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；0.1 M sodium acetate pH 5.0, 0.2 M MgCl2, 5% PEG 3350	分辨率 1.68 Å R-free 0.223

共 16 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IRF3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–258； UniProt 175–427 作者链 B； PDB构建体 6–258； UniProt 175–427

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1j2f
沉积日期 deposition_date	2003-01-04
结构标题 title	X-ray crystal structure of IRF-3 and its functional implications
关键词 keywords	TRANSCRIPTION FACTOR, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.67 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.59 Å
零角强度 I(0) i0	42077300.00
分子量 molecular_weight	50556.0 kDa
排除体积 excluded_volume	63313 Å³
包络体积 envelope_volume	79480 Å³
水化壳体积 shell_volume	26187 Å³
包络直径 envelope_diameter	89.9 Å
壳层 Rg shell_rg	32.57 Å
包络 Rg envelope_rg	25.32 Å
形状 Rg shape_rg	25.60 Å
总 Rg total_rg	26.38 Å
总原子数 total_atoms	3568
残基数 n_residues	457
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	85.2 Å
Rg (实空间) rg_real	26.66 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.2080e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.8140e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.67 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	42080000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9018
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.314
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.454
角度范围 angular_range	— – 0.2950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	11380000.0000
实空间数据点数 n_real_points	60
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.974; Smooth: 0.968

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1j2fa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamily	b.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family family	b.26.1.3 — Interferon regulatory factor 3 (IRF3), transactivation domain

结构域编号 domain_id	d1j2fb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamily	b.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family family	b.26.1.3 — Interferon regulatory factor 3 (IRF3), transactivation domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1j2fA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1j2fB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	134.808 Å
晶胞边长 b length_b	134.808 Å
晶胞边长 c length_c	69.340 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 4 21 2
空间群编号 int_tables_number	90
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.300 Å
最低分辨率 resolution_low	62.017 Å
R 因子 r_factor	0.2194
R_work r_work	0.2170
R_free r_free	0.2419

描述 description	Interferon regulatory factor 3
分子量 formula_weight	28379.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3728

X-ray crystal structure of IRF-3 and its functional implications

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interferon regulatory factor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	160

fit	/app/data/saxs_computation/j2/1j2f/1j2f.fit
pddf	/app/data/pr_computation/j2/1j2f/1j2f.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/j2/1j2f/1j2f.dat