SAXSdb — 1kdx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CBP

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 586–666	片段：KIX, RESIDUES 586-666	CREB × 1 （P15337）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 5.5；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 1 NMR样品组成：H2O OR D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1KDX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F81 SOLUTION STRUCTURE OF THE TAZ2 DOMAIN OF THE TRANSCRIPTIONAL ADAPTOR PROTEIN CBP 提交 2000-06-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1764–1850（87 aa）片段：TAZ2 DOMAIN (1764-1850)	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25 mM；压力 1 NMR样品组成 1.5 mM Taz2 \| 25 mM deuterated acetate 0.1 mM ZnCl2 0.1 mM DTT pH 5.9	分辨率未提供
1JJS NMR Structure of IBiD, A Domain of CBP/p300 提交 2001-07-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2067–2112（46 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K	分辨率未提供
1KBH Mutual Synergistic Folding in the Interaction Between Nuclear Receptor Coactivators CBP and ACTR 提交 2001-11-06	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2059–2117（59 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.6；31 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM；压力 ambient NMR样品组成 3mM U-15N,13C-CBP:2059-2117 6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 3mM U-15N,12C-CBP:2059-2117 6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 3mM U-15N,13C-CBP:2059-2117 6mM 14N,12C-ACTR:1018-1088 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 100%D2O NMR样品组成 2mM U-15N,13C-ACTR:1018-1088 4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 2mM U-15N,12C-ACTR:1018-1088 4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 95%H2O,5%D2O NMR样品组成 2mM U-15N,13C-ACTR:1018-1088 4mM 14N,12C-CBP:2059-2117 \| 10 mM Tris, 50 mM NaCl 100%D2O	分辨率未提供
1L8C STRUCTURAL BASIS FOR HIF-1ALPHA/CBP RECOGNITION IN THE CELLULAR HYPOXIC RESPONSE 提交 2002-03-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 345–439（95 aa）片段：TAZ1 (Transcription activation zinc finger) domain, Residues 345-439	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）2.0 Millimolar；压力 Ambient NMR样品组成 1MM 13C, 15N-TAZ1, 2MM HIF-1a NMR样品组成 1MM 13C, 15N-HIF-1a, 2MM TAZ1 NMR样品组成 10MM D-TRIS, 10MM D-DTT, 0.02% NAN3, 0.5MM ZnSO4	分辨率未提供
1SB0 Solution structure of the KIX domain of CBP bound to the transactivation domain of c-Myb 提交 2004-02-09	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 580–666（87 aa）片段：KIX domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；27 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM；压力 ambient NMR样品组成 20 mM Tris d11 acetate d4; 50 mM NaCl; 2 mM NaN3; pH 5.5 \| 90% H20; 10% D2O	分辨率未提供
1TOT ZZ Domain of CBP- a Novel Fold for a Protein Interaction Module 提交 2004-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1700–1751（52 aa）片段：ZZ domain of murine CBP (residues 1700-1751)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 ambient NMR样品组成 2.3 mM solutions in degassed 10 mM Tris-d11 pH 6.8, 200 M ZnCl2, 10 mM DTT-d10, 0.05% w/v sodium azide, 94 % H2O, 6 % D2O \| 94 % H2O, 6 % D2O	分辨率未提供
1U2N Structure CBP TAZ1 Domain 提交 2004-07-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 340–439（100 aa）片段：CBP TAZ1 Domain	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 ambient NMR样品组成 1mM N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT \| 90% H2O, 10% 2H2O NMR样品组成 1mM C13,N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT \| 100% 2H2O NMR样品组成 1mM C13,N15 TAZ1; 10mM Tris-d11 pH 6.9; 50mM NaCl; 2mM DTT \| 90% H2O, 10% 2H2O	分辨率未提供
2AGH Structural basis for cooperative transcription factor binding to the CBP coactivator 提交 2005-07-26	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 586–672（87 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；压力 1 NMR样品组成 0.5-0.8 mM 15N,13C-labeled protein (e.g. CBP) + 3 fold excess of unlabeled binding partners (MYB + MLL), 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MYB + UNLABELED CBP & MYB, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O NMR样品组成 13C,15N-MLL + UNLABELED CBP & MLL, 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O \| 20 mM Tris-d3-acetate, 50 mM NaCl, 0.2% sodium azide, 10% D2O	分辨率未提供
2C52 Structural diversity in CBP p160 complexes 提交 2005-10-25	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2059–2117（59 aa）片段：SID, RESIDUES 2059-2117	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 NMR样品组成 90% WATER/10% D2O NMR样品组成 90% WATER/10% D2O NMR样品组成 100% D2O NMR样品组成 100% D2O	分辨率未提供
2KA6 NMR structure of the CBP-TAZ2/STAT1-TAD complex 提交 2008-10-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1764–1855（92 aa）片段：UNP residues 1764 to 1855	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；290 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] TAZ2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KKJ Solution structure of the Nuclear coactivator binding domain of CBP 提交 2009-06-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2059–2117（59 aa）片段：Nuclear coactivator binding domain, UNP residues 2059-2441	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；31 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 10 % D2O-1, 20 mM sodium chloride-2, 20 mM sodium phosphate-3, 2 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-4, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2L14 Structure of CBP nuclear coactivator binding domain in complex with p53 TAD 提交 2010-07-22	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2059–2117（59 aa）片段：CBP nuclear coactivator binding domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 15N] p53 TAD, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] CBP nuclear coactivator binding domain, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] p53 TAD, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LQH NMR structure of FOXO3a transactivation domains (CR2C-CR3) in complex with CBP KIX domain (2b3l conformation) 提交 2012-03-06	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 586–672（87 aa）片段：KIX domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LQI NMR structure of FOXO3a transactivation domains (CR2C-CR3) in complex with CBP KIX domain (2l3b conformation) 提交 2012-03-06	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 586–672（87 aa）片段：KIX DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] KIX, 0.6 mM CR2C-CR3, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CR2C-CR3, 0.6 mM KIX, 20 mM MES, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LWW NMR structure of RelA-TAD/CBP-TAZ1 complex 提交 2012-08-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 340–439（100 aa）片段：TAZ-type 1 zinc finger residues 340-439	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）40；压力 ambient NMR样品组成 0.8-1.1 mM [U-13C; U-15N] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.8-1.1 mM [U-13C] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM [U-2H] DTT, 20 mM [U-2H] TRIS, 40 mM sodium chloride, 99.8 % [U-2H] D2O, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-13C] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM [U-2H] DTT, 20 mM [U-2H] TRIS, 40 mM sodium chloride, 99.8 % [U-2H] D2O, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-13C; U-15N] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.8-1.1 mM [U-15N] TAZ1, 1.2-1.5 mM RelA-TA2, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.7-0.9 mM [U-15N] RelA-TA2, 1.5-1.8 mM TAZ1, 2 mM DTT, 20 mM TRIS, 40 mM sodium chloride, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
4I9O Crystal Structure of GACKIX L664C Tethered to 1-10 提交 2012-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 586–672（87 aa）片段：UNP residues 562-672, GACKIX domain	突变：L664C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	KI1 1-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-hydroxypiperidin-1-yl}-3-sulfanylpropan-1-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.233
4I9O Crystal Structure of GACKIX L664C Tethered to 1-10 提交 2012-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 586–672（87 aa）片段：UNP residues 562-672, GACKIX domain	突变：L664C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	KI1 1-{4-[4-chloro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-4-hydroxypiperidin-1-yl}-3-sulfanylpropan-1-one × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1.8 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.233
5HOU Solution Structure of p53TAD-TAZ1 提交 2016-01-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 340–439（100 aa）片段：p53TAD, TAZ1 domain of CBP	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR测量条件 pH 6.4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1.0 mM [U-15N] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O, 5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.0 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1.0 mM [U-15N][U-13C] p53TAD - [NA] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [NA] p53TAD - [U-15N][U-13C] TAZ1 p53TAD-TAZ1 fusion protein, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
5HP0 Solution Structure of TAZ2-p53AD2 提交 2016-01-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1764–1855（92 aa）片段：p53AD2, TAZ2 domain of CBP	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR测量条件 pH 6.4；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53AD2, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 5 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53AD2(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 5 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] p53AD2, 1 mM TAZ2, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O	分辨率未提供
5HPD Solution Structure of TAZ2-p53TAD 提交 2016-01-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1764–1855（92 aa）片段：p53TAD, TAZ2 domain of CBP	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR测量条件 pH 6.4；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.75 mM [U-13C; U-15N] TAZ2-p53TAD, 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 1 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-37, 1 mM p53(38-61), 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 20 mM [U-2H] TRIS, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-37), 1 mM [U-13C] p53(38-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-15N] p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-15N] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM DTT, 10 % [U-2H] D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM TAZ2, 1 mM [U-13C] p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O NMR样品组成 1 mM [U-13C] TAZ2, 1 mM p53(13-61), 20 mM [U-2H] TRIS, 50 mM sodium chloride, 2 mM [U-2H] DTT, 99 % [U-2H] D2O, 99% D2O, 1% H2O \| 99% D2O, 1% H2O	分辨率未提供
5W0I CREBBP Bromodomain in complex with Cpd8 (1-(3-(7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-1-(tetrahydrofuran-3-yl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl)ethan-1-one) 提交 2017-05-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1083–1198（116 aa）片段：Bromodomain, UNP residues 1083-1198	未记录	9UA 1-{3-[7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-1-[(3S)-oxolan-3-yl]-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl}ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；0.2 M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 23% PEG33500	分辨率 1.43 Å R-free 0.192
6DMX HBZ56 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 586–672（87 aa）片段：residues 284-315 链 D 586–672（87 aa）片段：residues 284-315	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301
6DMX HBZ56 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 586–672（87 aa）片段：residues 284-315 链 I 586–672（87 aa）片段：residues 284-315	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, ammonium iodide	分辨率 2.80 Å R-free 0.301
6DNQ HBZ77 in complex with KIX and c-Myb 提交 2018-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 586–672（87 aa）片段：residues 586-672 链 D 586–672（87 aa）片段：residues 586-672	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, calcium chloride	分辨率 2.35 Å R-free 0.229
7LVS The CBP TAZ1 Domain in Complex with a CITED2-HIF-1-Alpha Fusion Peptide 提交 2021-02-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 340–439（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 6.87, 28% PEG 4000	分辨率 2.02 Å R-free 0.241

共 23 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CBP_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–81； UniProt 586–666

CREB

Rattus norvegicus

UniProt P15337

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 119–146	片段：KID, RESIDUES 101-160 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CBP × 1 （P45481）	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 5.5；315 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 1 NMR样品组成：H2O OR D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CREB1_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–28； UniProt 119–146

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1kdx
沉积日期 deposition_date	1997-09-16
结构标题 title	KIX DOMAIN OF MOUSE CBP (CREB BINDING PROTEIN) IN COMPLEX WITH PHOSPHORYLATED KINASE INDUCIBLE DOMAIN (PKID) OF RAT CREB (CYCLIC AMP RESPONSE ELEMENT BINDING PROTEIN), NMR 17 STRUCTURES
关键词 keywords	;COMPLEX (TRANSCRIPTION ACTIVATOR-CO-ACTIVATOR), PROTEIN-PROTEIN INTERACTION, PHOSPHOSERINE RECOGNITION, TRANSCRIPTION REGULATION COMPLEX ;; TRANSCRIPTION REGULATION COMPLEX
实验方法 method	SOLUTION NMR

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	14.75 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	14.34 Å
零角强度 I(0) i0	710796000.00
分子量 molecular_weight	219070.0 kDa
排除体积 excluded_volume	271930 Å³
包络体积 envelope_volume	27973 Å³
水化壳体积 shell_volume	14792 Å³
包络直径 envelope_diameter	52.9 Å
壳层 Rg shell_rg	21.78 Å
包络 Rg envelope_rg	16.43 Å
形状 Rg shape_rg	14.31 Å
总 Rg total_rg	14.57 Å
总原子数 total_atoms	30753
残基数 n_residues	1836
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	46.1 Å
Rg (实空间) rg_real	14.68 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.1080e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.2420e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	14.69 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	710800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8236
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	16.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.125
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.467
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	186900.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.904; Stabil: 0.997; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CBP
分子量 formula_weight	9552.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	30753

GVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEE

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CREB
分子量 formula_weight	3389.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

TDSQKRREILSRRPSYRKILNDLSSDAP

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1kdxa_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.12 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
超家族 Superfamily superfamily	a.12.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)
家族 Family family	a.12.1.1 — Kix domain of CBP (creb binding protein)

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1kdxA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Coactivator CBP, KIX domain

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

fit	/app/data/saxs_computation/kd/1kdx/1kdx.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kd/1kdx/1kdx.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kd/1kdx/1kdx.dat

KIX DOMAIN OF MOUSE CBP (CREB BINDING PROTEIN) IN COMPLEX WITH PHOSPHORYLATED KINASE INDUCIBLE DOMAIN (PKID) OF RAT CREB (CYCLIC AMP RESPONSE ELEMENT BINDING PROTEIN), NMR 17 STRUCTURES

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CBP

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CREB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)