1ku8

Crystal structure of Jacalin

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

JACALIN ALPHA CHAIN

物种未注明

UniProt P18670

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 JACALIN BETA CHAIN × 4 (P18671) water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LECA_ARTIN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–133; UniProt 1–133 作者链 C; PDB构建体 1–133; UniProt 1–133 作者链 E; PDB构建体 1–133; UniProt 1–133 作者链 G; PDB构建体 1–133; UniProt 1–133

JACALIN BETA CHAIN

物种未注明

UniProt P18671

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 JACALIN ALPHA CHAIN × 4 (P18670) water × 8 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LEC1_ARTIN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–18; UniProt 61–78 作者链 D; PDB构建体 1–18; UniProt 61–78 作者链 F; PDB构建体 1–18; UniProt 61–78 作者链 H; PDB构建体 1–18; UniProt 61–78

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1ku8
沉积日期 deposition_date2002-01-21
结构标题 titleCrystal structure of Jacalin
关键词 keywordsLECTIN, BETA-PRISM FOLD, CARBOHYDRATE BINDING, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ku8__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ku8__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ku8__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)27.56 Å
Rg(电子密度)26.67 Å
总 Rg27.39 Å
原子数4618
残基数596
排除体积82710 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1ku8__assembly_1__model_1 octameric (8) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1ku8.1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamilyb.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family familyb.77.3.1 — Mannose-binding lectins
结构域编号 domain_idd1ku8.2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamilyb.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family familyb.77.3.1 — Mannose-binding lectins
结构域编号 domain_idd1ku8.3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamilyb.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family familyb.77.3.1 — Mannose-binding lectins
结构域编号 domain_idd1ku8.4
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamilyb.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family familyb.77.3.1 — Mannose-binding lectins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1ku8A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Jacalin-like lectin domain
结构域编号 domain_id1ku8C00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Jacalin-like lectin domain
结构域编号 domain_id1ku8E00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Jacalin-like lectin domain
结构域编号 domain_id1ku8G00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Jacalin-like lectin domain
▶

7. 引用文献 (1)