1kvp

STRUCTURAL ANALYSIS OF THE SPIROPLASMA VIRUS, SPV4, IMPLICATIONS FOR EVOLUTIONARY VARIATION TO OBTAIN HOST DIVERSITY AMONG THE MICROVIRIDAE, ELECTRON MICROSCOPY, ALPHA CARBONS ONLY

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SPV4 CAPSID PROTEIN VP1

Enterobacteria phage phiX174

UniProt P03641

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 60 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 5 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
5 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VGF_BPPHX
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–497; UniProt 1–426

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1kvp
沉积日期 deposition_date1997-12-12
结构标题 titleSTRUCTURAL ANALYSIS OF THE SPIROPLASMA VIRUS, SPV4, IMPLICATIONS FOR EVOLUTIONARY VARIATION TO OBTAIN HOST DIVERSITY AMONG THE MICROVIRIDAE, ELECTRON MICROSCOPY, ALPHA CARBONS ONLY
关键词 keywordsBACTERIOPHAGE SPV4 COAT PROTEIN, CHIMERA, Icosahedral virus, Virus; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1kvp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1kvp__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1kvp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)124.50 Å
总 Rg124.50 Å
原子数0
残基数0
排除体积4081600 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1kvp__assembly_1__model_1 60-MERIC (60) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1kvp__assembly_2__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 1kvp__assembly_3__model_1 pentameric (5) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 1kvp__assembly_4__model_1 hexameric (6) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 1kvp__assembly_5__model_1 monomeric (1) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1kvpa_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.121 — Nucleoplasmin-like/VP (viral coat and capsid proteins)
超家族 Superfamily superfamilyb.121.5 — ssDNA viruses
家族 Family familyb.121.5.1 — Microviridae-like VP
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7. 引用文献 (3)