SAXSdb — 1mj9

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ESA1 PROTEIN

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 160–435	片段：HISTONE ACETYLTRANSFERASE DOMAIN (Residues 160-445) 突变：C304S	NA SODIUM ION × 1 COA COENZYME A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.255
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 160–435	片段：HISTONE ACETYLTRANSFERASE DOMAIN (Residues 160-445) 突变：C304S	NA SODIUM ION × 3 COA COENZYME A × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.255
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 160–435	片段：HISTONE ACETYLTRANSFERASE DOMAIN (Residues 160-445) 突变：C304S	NA SODIUM ION × 6 COA COENZYME A × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.255

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1MJ9	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FY7 CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST ESA1 HISTONE ACETYLTRANSFERASE DOMAIN COMPLEXED WITH COENZYME A 提交 2000-09-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 160–435（276 aa）片段：ACETYLTRANSFERASE DOMAIN	未记录	NA SODIUM ION × 1 COA COENZYME A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；amonium phosphate, cacodylate,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.236
1FY7 CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST ESA1 HISTONE ACETYLTRANSFERASE DOMAIN COMPLEXED WITH COENZYME A 提交 2000-09-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 160–435（276 aa）片段：ACETYLTRANSFERASE DOMAIN	未记录	NA SODIUM ION × 3 COA COENZYME A × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；amonium phosphate, cacodylate,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.236
1FY7 CRYSTAL STRUCTURE OF YEAST ESA1 HISTONE ACETYLTRANSFERASE DOMAIN COMPLEXED WITH COENZYME A 提交 2000-09-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 160–435（276 aa）片段：ACETYLTRANSFERASE DOMAIN	未记录	NA SODIUM ION × 6 COA COENZYME A × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；amonium phosphate, cacodylate,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.236
1MJA Crystal structure of yeast Esa1 histone acetyltransferase domain complexed with acetyl coenzyme A 提交 2002-08-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 160–435（276 aa）片段：Histone acetyltransferase domain (Residues 160-445)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	COA COENZYME A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.26 Å R-free 0.224
1MJA Crystal structure of yeast Esa1 histone acetyltransferase domain complexed with acetyl coenzyme A 提交 2002-08-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 160–435（276 aa）片段：Histone acetyltransferase domain (Residues 160-445)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	COA COENZYME A × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.26 Å R-free 0.224
1MJA Crystal structure of yeast Esa1 histone acetyltransferase domain complexed with acetyl coenzyme A 提交 2002-08-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 160–435（276 aa）片段：Histone acetyltransferase domain (Residues 160-445)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	COA COENZYME A × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.26 Å R-free 0.224
1MJB Crystal structure of yeast Esa1 histone acetyltransferase E338Q mutant complexed with acetyl coenzyme A 提交 2002-08-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 160–435（276 aa）片段：Histone acetyltransferase domain (Residues 160-445)	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACO ACETYL COENZYME *A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
1MJB Crystal structure of yeast Esa1 histone acetyltransferase E338Q mutant complexed with acetyl coenzyme A 提交 2002-08-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 160–435（276 aa）片段：Histone acetyltransferase domain (Residues 160-445)	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACO ACETYL COENZYME *A × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
1MJB Crystal structure of yeast Esa1 histone acetyltransferase E338Q mutant complexed with acetyl coenzyme A 提交 2002-08-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 160–435（276 aa）片段：Histone acetyltransferase domain (Residues 160-445)	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACO ACETYL COENZYME *A × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；sodium cacodylate, ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
2RNZ Solution structure of the presumed chromodomain of the yeast histone acetyltransferase, Esa1 提交 2008-03-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–89（73 aa）片段：Residues 17-89	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；295 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.1mM CHROMODOMAIN [U-99% 13C; U-99% 15N], 200mM potassium phosphate, 5mM D-DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1mM CHROMODOMAIN [U-99% 13C; U-99% 15N], 200mM potassium phosphate, 5mM D-DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2RO0 Solution structure of the knotted tudor domain of the yeast histone acetyltransferase, Esa1 提交 2008-03-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–89（89 aa）片段：Residues 1-89	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；295 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.35mM CHROMODOMAIN [U-99% 13C; U-99% 15N], 200mM potassium phosphate, 5mM D-DTT, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 0.35mM CHROMODOMAIN [U-99% 13C; U-99% 15N], 200mM potassium phosphate, 5mM D-DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3TO6 Crystal structure of yeast Esa1 HAT domain complexed with H4K16CoA bisubstrate inhibitor 提交 2011-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 160–435（276 aa）片段：UNP residues 160-435	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 1.6 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.10 Å R-free 0.232
3TO7 Crystal structure of yeast Esa1 HAT domain bound to coenzyme A with active site lysine acetylated 提交 2011-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 160–435（276 aa）片段：UNP residues 160-435	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	COA COENZYME A × 1 CAD CACODYLIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 1.6 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3TO7 Crystal structure of yeast Esa1 HAT domain bound to coenzyme A with active site lysine acetylated 提交 2011-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 160–435（276 aa）片段：UNP residues 160-435	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	COA COENZYME A × 3 CAD CACODYLIC ACID × 3 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 1.6 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.226
3TO9 Crystal structure of yeast Esa1 E338Q HAT domain bound to coenzyme A with active site lysine acetylated 提交 2011-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 160–435（276 aa）片段：UNP residues 160-435	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	COA COENZYME A × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 2 CAD CACODYLIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 1.6 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
3TO9 Crystal structure of yeast Esa1 E338Q HAT domain bound to coenzyme A with active site lysine acetylated 提交 2011-09-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 160–435（276 aa）片段：UNP residues 160-435	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	COA COENZYME A × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 SO4 SULFATE ION × 6 CAD CACODYLIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 1.6 M ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.234
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACO ACETYL COENZYME *A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 141–445（305 aa）片段：UNP residues 141-445	突变：E338Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACO ACETYL COENZYME *A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 P 1–445（445 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å

共 13 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ESA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–278； UniProt 160–435

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1mj9
沉积日期 deposition_date	2002-08-27
结构标题 title	Crystal structure of yeast Esa1(C304S) mutant complexed with Coenzyme A
关键词 keywords	Esa1, HAT, Histone acetyltransferase, MYST, Transferase; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.49 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.70 Å
零角强度 I(0) i0	18957400.00
分子量 molecular_weight	33498.0 kDa
排除体积 excluded_volume	42177 Å³
包络体积 envelope_volume	50027 Å³
水化壳体积 shell_volume	20847 Å³
包络直径 envelope_diameter	80.6 Å
壳层 Rg shell_rg	26.98 Å
包络 Rg envelope_rg	21.16 Å
形状 Rg shape_rg	20.69 Å
总 Rg total_rg	21.59 Å
总原子数 total_atoms	2360
残基数 n_residues	273
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	75.7 Å
Rg (实空间) rg_real	21.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.57 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.8960e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2670e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.54 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	18960000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7627
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	66.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.524
峰度 Kurtosis kurtosis	0.098
角度范围 angular_range	— – 0.3700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4815000.0000
实空间数据点数 n_real_points	69
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.658; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.940; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ESA1 PROTEIN
分子量 formula_weight	33356.4 kDa
突变 mutation	C304S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2433

MKEVARVRNLNRIIMGKYEIEPWYFSPYPIELTDEDFIYIDDFTLQYFGSKKQYERYRKKCTLRHPPGNEIYRDDYVSFFEIDGRKQRTWCRNLCLLSKLFLDHKTLYYDVDPFLFYCMTRRDELGHHLVGYFSKEKESADGYNVASILTLPQYQRMGYGKLLIEFSYELSKKENKVGSPEKPLSDLGLLSYRAYWSDTLITLLVEHQKEITIDEISSMTSMTTTDILHTAKTLNILRYYKGQHIIFLNEDILDRYNRLKAKKRRTIDPNRLIWKPPV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	COENZYME A
分子量 formula_weight	767.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	73

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d1mj9a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.108 — Acyl-CoA N-acyltransferases (Nat)
超家族 Superfamily superfamily	d.108.1 — Acyl-CoA N-acyltransferases (Nat)
家族 Family family	d.108.1.1 — N-acetyl transferase, NAT

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	1mj9A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — N-acetyl transferase-like

结构域编号 domain_id	1mj9A02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	630 — Aminopeptidase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Gcn5-related N-acetyltransferase (GNAT)

结构域编号 domain_id	1mj9A03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	181.301 Å
晶胞边长 b length_b	181.301 Å
晶胞边长 c length_c	181.301 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	I 41 3 2
空间群编号 int_tables_number	214
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2320
R_free r_free	0.2550

fit	/app/data/saxs_computation/mj/1mj9/1mj9.fit
pddf	/app/data/pr_computation/mj/1mj9/1mj9.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/mj/1mj9/1mj9.dat

Crystal structure of yeast Esa1(C304S) mutant complexed with Coenzyme A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ESA1 PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction