1mr1

Crystal Structure of a Smad4-Ski Complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mothers against decapentaplegic homolog 4

Homo sapiens

UniProt Q13485

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ski oncogene × 1 (P12755) ZINC ION × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Ski oncogene × 1 (P12755) ZINC ION × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SMAD4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–235; UniProt 319–552 作者链 B; PDB构建体 2–235; UniProt 319–552

Ski oncogene

Homo sapiens

UniProt P12755

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Mothers against decapentaplegic homolog 4 × 1 (Q13485) ZINC ION × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Mothers against decapentaplegic homolog 4 × 1 (Q13485) ZINC ION × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SKI_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 5–99; UniProt 219–313 作者链 D; PDB构建体 5–99; UniProt 219–313

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1mr1
沉积日期 deposition_date2002-09-17
结构标题 titleCrystal Structure of a Smad4-Ski Complex
关键词 keywordsSmad, Ski, cancer, TGF-b signaling, protein interaction, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1mr1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1mr1__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1mr1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.29 Å
Rg(电子密度)21.38 Å
总 Rg22.32 Å
原子数2333
残基数291
排除体积41258 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1mr1__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1mr1__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1mr1a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamilyb.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family familyb.26.1.1 — SMAD domain
结构域编号 domain_idd1mr1b_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamilyb.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family familyb.26.1.1 — SMAD domain
结构域编号 domain_idd1mr1c1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.217 — SAND domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.217.1 — SAND domain-like
家族 Family familyd.217.1.2 — SMAD4-binding domain of oncoprotein Ski
结构域编号 domain_idd1mr1c2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd1mr1d1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.217 — SAND domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.217.1 — SAND domain-like
家族 Family familyd.217.1.2 — SMAD4-binding domain of oncoprotein Ski
结构域编号 domain_idd1mr1d2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1mr1A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1mr1B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id1mr1C00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SAND domain-like
结构域编号 domain_id1mr1D00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SAND domain-like
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7. 引用文献 (1)