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1DD1
CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
提交 1999-11-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 B
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 C
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 9
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;PEG 4000, LISO4, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.62 Å
R-free 0.175
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1DD1
CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
提交 1999-11-05
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 A
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 B
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 C
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 18
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;PEG 4000, LISO4, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.62 Å
R-free 0.175
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1G88
S4AFL3ARG515 MUTANT
提交 2000-11-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 B
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
链 C
285–552(268 aa)
片段:SMAD4 ACTIVE FRAGMENT
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突变:R515S
突变:R515S
突变:R515S
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 3.00 Å
R-free 0.263
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1U7F
Crystal Structure of the phosphorylated Smad3/Smad4 heterotrimeric complex
提交 2004-08-03
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
314–552(239 aa)
片段:MH2 and Linker domains
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;50 mM Tris-HCl, 0-15 mM magnesium chloride, 5-15% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.247
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1U7V
Crystal Structure of the phosphorylated Smad2/Smad4 heterotrimeric complex
提交 2004-08-04
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
314–549(236 aa)
片段:MH2 and Linker domains
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;50 mM Tris-HCl, 0-15 mM magnesium chloride, 5-15% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.70 Å
R-free 0.279
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1YGS
CRYSTAL STRUCTURE OF THE SMAD4 TUMOR SUPPRESSOR C-TERMINAL DOMAIN
提交 1997-10-03
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
319–552(234 aa)
片段:C-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 319 - 552
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;100 MM NAMES, PH6.5, 25% PEG MONOMETHYLETHER 5000, 5 MM DTT, 200 MM (NH4)2SO4
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分辨率 2.10 Å
R-free 0.279
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5C4V
Ski-like protein
提交 2015-06-18
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
314–549(236 aa)
片段:residues 314-549
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未记录
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GOL GLYCEROL × 1
ZN ZINC ION × 1
NI NICKEL (II) ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;2.8-3.3 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.242
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5C4V
Ski-like protein
提交 2015-06-18
|
构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 C
314–549(236 aa)
片段:residues 314-549
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;2.8-3.3 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.242
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5C4V
Ski-like protein
提交 2015-06-18
|
构建体不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 E
314–549(236 aa)
片段:residues 314-549
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;2.8-3.3 M sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5
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分辨率 2.60 Å
R-free 0.242
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5MEY
Crystal structure of Smad4-MH1 bound to the GGCGC site.
提交 2016-11-16
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
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链 A
10–140(131 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 8
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
CA CALCIUM ION × 10
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;17% PEG 6000, 0.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate pH 5.0
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分辨率 2.05 Å
R-free 0.238
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5MEZ
Crystal structure of Smad4-MH1 bound to the GGCT site.
提交 2016-11-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白–DNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
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链 A
10–140(131 aa)
链 B
10–140(131 aa)
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未记录
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ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;24% PEG 3350, 0.2 M calcium chloride
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分辨率 2.98 Å
R-free 0.252
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5MF0
Crystal structure of Smad4-MH1 bound to the GGCCG site.
提交 2016-11-16
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白–DNA
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
10–140(131 aa)
链 B
10–140(131 aa)
|
未记录
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ZN ZINC ION × 2
CL CHLORIDE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;16% PEG MME 2000 and 0.1 M sodium acetate pH 5.0
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分辨率 3.03 Å
R-free 0.270
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