SAXSdb — 1n1l

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HCV NS3 SERINE PROTEASE

Hepatitis C virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	NS4A COFACTOR × 1 ZINC ION × 1 {1-[2-(1-FORMYL-PROPYL)-3-METHANESULFONYLAMINO-PYRROLIDINE-1-CARBONYL]-2-METHYL-PROPYL}-CARBAMIC ACID TERT-BUTYL ESTER × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	NS4A COFACTOR × 1 ZINC ION × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	NS4A COFACTOR × 2 ZINC ION × 2 {1-[2-(1-FORMYL-PROPYL)-3-METHANESULFONYLAMINO-PYRROLIDINE-1-CARBONYL]-2-METHYL-PROPYL}-CARBAMIC ACID TERT-BUTYL ESTER × 1 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	POLG_HCVH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 11–190； UniProt 1026–1205 作者链 B； PDB构建体 11–190； UniProt 1026–1205

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1n1l
沉积日期 deposition_date	2002-10-18
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (GW472467X)
关键词 keywords	VIRAL PROTEIN, SERINE PROTEASE, NONSTRUCTURAL PROTEINS, COFACTOR PEPTIDE, HELICASE, INHIBITOR; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1n1l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1n1l__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1n1l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	17.29 Å
Rg（电子密度）	16.38 Å
总 Rg	17.59 Å
原子数	1516
残基数	201
排除体积	27241 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1n1l__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1n1l__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1n1l__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HCV NS3 SERINE PROTEASE
分子量 formula_weight	21045.0 kDa
突变 mutation	A164T
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2870

ASMTGGQQMGAPITAYAQQTRGLLGCIITSLTGRDKNQVEGEVQIVSTATQTFLATCINGVCWTVYHGAGTRTIASPKGPVIQMYTNVDQDLVGWPAPQGSRSLTPCTCGSSDLYLVTRHADVIPVRRRGDSRGSLLSPRPISYLKGSSGGPLLCPAGHAVGLFRAAVCTRGVTKAVDFIPVENLETTMRGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Hepatitis C virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11103
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	NS4A COFACTOR
分子量 formula_weight	2394.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

KKGSVVIVGRIVLSGKPAIIPKK

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	{1-[2-(1-FORMYL-PROPYL)-3-METHANESULFONYLAMINO-PYRROLIDINE-1-CARBONYL]-2-METHYL-PROPYL}-CARBAMIC ACID TERT-BUTYL ESTER
分子量 formula_weight	433.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	107

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1n1l.1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family family	b.47.1.3 — Viral proteases

结构域编号 domain_id	d1n1l.2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamily	b.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family family	b.47.1.3 — Viral proteases

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1n1lA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	1n1lA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

结构域编号 domain_id	1n1lB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	1n1lB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Trypsin-like serine proteases

▶

晶胞边长 a length_a	225.450 Å
晶胞边长 b length_b	225.450 Å
晶胞边长 c length_c	75.890 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	H 3 2
空间群编号 int_tables_number	155
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1851
R_work r_work	0.1832
R_free r_free	0.2195

CRYSTAL STRUCTURE OF HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (GW472467X)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HCV NS3 SERINE PROTEASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1n1l__assembly_1__model_1

1n1l__assembly_1__model_1 | I(q)

1n1l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF HCV NS3 PROTEASE DOMAIN:NS4A PEPTIDE COMPLEX WITH COVALENTLY BOUND INHIBITOR (GW472467X)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HCV NS3 SERINE PROTEASE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1n1l__assembly_1__model_1

1n1l__assembly_1__model_1 | I(q)

1n1l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)