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1nau

NMR Solution Structure of the Glucagon Antagonist [desHis1, desPhe6, Glu9]Glucagon Amide in the Presence of Perdeuterated Dodecylphosphocholine Micelles

Method: SOLUTION NMR Dmax: 41.3 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucagon

物种未注明

UniProt P01275

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 53–81 突变：DEL(H53), DEL(F58), D7E 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM sodium phosphate; 1mM sodium azide；压力 ambient NMR样品组成：7mM [desHis1, desPhe6, Glu9]Glucagon Amide; 50 mM sodium phosphate buffer; 283 mM dodecylphosphocholine-d38 micelles; 1 mM sodium azide; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 1NAU Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1BH0 STRUCTURE OF A GLUCAGON ANALOG 提交 1998-06-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 53–81（29 aa）
突变：R17K, R18K, D21E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 slow cooling of saturated soln；SLOW COOLING OF HEATED SUPERSATURATED SOLUTION, slow cooling of saturated soln
分辨率 3.00 Å
1D0R SOLUTION STRUCTURE OF GLUCAGON-LIKE PEPTIDE-1-(7-36)-AMIDE IN TRIFLUOROETHANOL/WATER 提交 1999-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 98–127（30 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 2.5；300 K；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1.4MM GLUCAGON-LIKE PEPTIDE 1-(7-36)-AMIDE
NMR样品组成 1.4MM GLUCAGON-LIKE PEPTIDE 1-(7-36)-AMIDE
分辨率未提供
2L63 NMR solution structure of GLP-2 in 2,2,2 trifluroethanol 提交 2010-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 146–178（33 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3.9；310 K；压力 ambient
NMR样品组成 33 % TFE-1, trifluoroethanol/water | trifluoroethanol/water
分辨率未提供
2L64 NMR Solution structure of GLP-2 in DHPC micelles 提交 2010-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 146–178（33 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 3.9；310 K；压力 ambient
NMR样品组成 350 mM DHPC-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2M5P Solution structure of lipidated glucagon analog in water 提交 2013-03-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 53–81（29 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GGL GAMMA-L-GLUTAMIC ACID × 2 PLM PALMITIC ACID × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM peptide, 20 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2M5Q Solution structure of lipidated glucagon analog in d-TFE 提交 2013-03-04 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 X 53–81（29 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GGL GAMMA-L-GLUTAMIC ACID × 2 PLM PALMITIC ACID × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM protein, 95% [U-100% 2H] TFE/5% H2O | 95% [U-100% 2H] TFE/5% H2O
分辨率未提供
3IOL Crystal structure of Glucagon-Like Peptide-1 in complex with the extracellular domain of the Glucagon-Like Peptide-1 Receptor 提交 2009-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 98–128（31 aa） 片段：UNP residues 98-128
未记录 10M decyl 4-O-alpha-D-glucopyranosyl-1-thio-beta-D-glucopyranoside × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；291 K；0.1M N-(2-Acetamido) Iminodiacetic Acid (ADA), pH 6.9, 14 vol-% (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol (MPD), 9mM n-decyl-beta-D-thiomaltoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.226
4APD Liraglutide 提交 2012-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 98–128（31 aa）
未记录 D6M N-hexadecanoyl-L-glutamic acid × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.9；300 K；压力 1.0
NMR样品组成 10% D2O / 90% H2O
分辨率未提供
5OTU Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Hcs 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 98–128（31 aa）
突变：A8HCS, T11HCS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution G1: 0.1 M Carboxylic acids, 0.1 Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) PEG500mme, 10% (w/v) PEG20000
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
5OTU Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Hcs 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 98–128（31 aa）
突变：A8HCS, T11HCS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution G1: 0.1 M Carboxylic acids, 0.1 Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) PEG500mme, 10% (w/v) PEG20000
分辨率 1.80 Å R-free 0.211
5OTV Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cyc/Thr11Hcs 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 98–128（31 aa）
突变：A8C, T11HCS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E5: 0.12 M Ethylene Glycols, 0.1 M Buffer System 2 pH 7.5, 205 (v/v) PEg500mme, 10% (w/v) PEG20000
分辨率 2.00 Å R-free 0.246
5OTV Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cyc/Thr11Hcs 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 98–128（31 aa）
突变：A8C, T11HCS 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E5: 0.12 M Ethylene Glycols, 0.1 M Buffer System 2 pH 7.5, 205 (v/v) PEg500mme, 10% (w/v) PEG20000
分辨率 2.00 Å R-free 0.246
5OTW Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Cys 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 98–128（31 aa）
突变：A8HCS, T11C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E12: 0.12 M ethylene Glycols, 0.1 M Buffer system 3 pH 8.5, 12.5% (v/v) MPD, 12.5% (w/v) PEG1000, 12.5% (w/v) PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.239
5OTW Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Hcs/Thr11Cys 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 98–128（31 aa）
突变：A8HCS, T11C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions, solution E12: 0.12 M ethylene Glycols, 0.1 M Buffer system 3 pH 8.5, 12.5% (v/v) MPD, 12.5% (w/v) PEG1000, 12.5% (w/v) PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.239
5OTX Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cys/Thr11Cys 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 98–128（31 aa）
突变：A8C, T11C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions solution F2: 0.12 M Monosaccharides, 0.1 M Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) Ethylene Glycol, 10% (w/v) PEG8000
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
5OTX Extracellular domain of GLP-1 receptor in complex with GLP-1 variant Ala8Cys/Thr11Cys 提交 2017-08-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 98–128（31 aa）
突变：A8C, T11C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Morpheus from Molecular Dimensions solution F2: 0.12 M Monosaccharides, 0.1 M Buffer system 1 pH 6.5, 20% (v/v) Ethylene Glycol, 10% (w/v) PEG8000
分辨率 2.00 Å R-free 0.240
5VAI Cryo-EM structure of the activated Glucagon-like peptide-1 receptor in complex with G protein 提交 2017-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 98–128（31 aa） 片段：UNP residues 98-128
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6EDS Structure of Cysteine-free Human Insulin-Degrading Enzyme in complex with Glucagon and Substrate-selective Macrocyclic Inhibitor 63 提交 2018-08-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 53–81（29 aa）
未记录 J22 {(8R,9S,10S)-9-(2',3'-dimethyl[1,1'-biphenyl]-4-yl)-6-[(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)sulfonyl]-1,6-diazabicyclo[6.2.0]decan-10-yl}methanol × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.0, 12% Tacsimate pH 7.0, 13% PEGMME, 10% Dioxane
分辨率 3.18 Å R-free 0.222
6EDS Structure of Cysteine-free Human Insulin-Degrading Enzyme in complex with Glucagon and Substrate-selective Macrocyclic Inhibitor 63 提交 2018-08-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 53–81（29 aa）
未记录 J22 {(8R,9S,10S)-9-(2',3'-dimethyl[1,1'-biphenyl]-4-yl)-6-[(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)sulfonyl]-1,6-diazabicyclo[6.2.0]decan-10-yl}methanol × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES pH 7.0, 12% Tacsimate pH 7.0, 13% PEGMME, 10% Dioxane
分辨率 3.18 Å R-free 0.222
6LMK Cryo-EM structure of the human glucagon receptor in complex with Gs 提交 2019-12-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 53–81（29 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6LML Cryo-EM structure of the human glucagon receptor in complex with Gi1 提交 2019-12-26 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 53–81（29 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6NZN Dimer-of-dimer amyloid fibril structure of glucagon 提交 2019-02-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 A 53–81（29 aa）
链 B 53–81（29 aa）
链 C 53–81（29 aa）
链 D 53–81（29 aa）
链 E 53–81（29 aa）
链 F 53–81（29 aa）
链 G 53–81（29 aa）
链 H 53–81（29 aa）
链 I 53–81（29 aa）
链 J 53–81（29 aa）
链 K 53–81（29 aa）
链 L 53–81（29 aa）
链 M 53–81（29 aa）
链 N 53–81（29 aa）
链 O 53–81（29 aa）
链 P 53–81（29 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLID-STATE NMR
NMR测量条件 pH 2；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.01；压力 1
NMR样品组成 0.1 mg/uL {U-13C; U-15N]-G4,S8,L14,A19,V23 Glucagon, water | water
NMR样品组成 0.1 mg/uL {U-13C; U-15N]-S2,Q3,G4,T5,Q24,W25,L26,M27,N28 Glucagon, water | water
NMR样品组成 0.1 mg/uL {U-13C; U-15N]-T5,F6,T7,S8,D9,Y10,S11,A19,Q20,D21,F22,V23,Q24 Glucagon, water | water
NMR样品组成 0.1 mg/uL {U-13C; U-15N]-S11,K12,Y13,L14,D15,S16,R17,R18,A19 Glucagon, water | water
分辨率未提供
6PHI Crystal structure of native glucagon in space group I41 at 1.1 A resolution 提交 2019-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 53–81（29 aa） 片段：UNP residues 53-81
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；2.5 M sodium chloride, 0.1 M imidazole, pH 8
分辨率 1.10 Å R-free 0.139
6PHJ Crystal structure of native glucagon in space group P213 at 1.99 A resolution 提交 2019-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 53–81（29 aa） 片段：UNP residues 53-81
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1 M sodium/potassium tartrate, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7
分辨率 1.99 Å R-free 0.307
6PHK Crystal structure of glucagon analog with mono-stereoinversion at position 21 (D-Asp21) in space group I41 at 1.18 A resolution 提交 2019-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 53–81（29 aa） 片段：UNP residues 53-81
突变：D21D-Asp 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；0.2 M lithium sulfate, 20% butanediol, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 1.18 Å R-free 0.162
6PHL Crystal structure of glucagon analog with mono-stereoinversion at position 23 (D-Val23) in space group I41 at 1.44 A resolution 提交 2019-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 53–81（29 aa） 片段：UNP residues 53-81
突变：V23D-Val 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；tri-sodium citrate, pH 5.5, 20% PEG3000
分辨率 1.44 Å R-free 0.169
6PHO Crystal structure of glucagon analog with selenomethionine substitutions at position 1 and 27 in space group I41 at 1.42 A resolution 提交 2019-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 53–81（29 aa） 片段：UNP residues 53-81
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M tri-potassium citrate, 20% PEG3350
分辨率 1.42 Å R-free 0.189
6PHP Crystal structure of glucagon analog with 4-bromo-phenylalanine substitutions at position 6 and 22 in space group I41 at 1.65 A resolution 提交 2019-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 53–81（29 aa） 片段：UNP residues 53-81
突变：F6BrF, F22BrF 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tacsimate, pH 4, 16% PEG3350, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6
分辨率 1.65 Å R-free 0.246
6VCB Cryo-EM structure of the Glucagon-like peptide-1 receptor in complex with G protein, GLP-1 peptide and a positive allosteric modulator 提交 2019-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 98–128（31 aa）
未记录 QW7 1-[(1R)-1-(2,6-dichloro-3-methoxyphenyl)ethyl]-6-{2-[(2R)-piperidin-2-yl]phenyl}-1H-benzimidazole × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6X18 GLP-1 peptide hormone bound to Glucagon-Like peptide-1 (GLP-1) Receptor 提交 2020-05-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 98–127（30 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
7D68 Cryo-EM structure of the human glucagon-like peptide-2 receptor-Gs protein complex 提交 2020-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 146–178（33 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7DUQ Cryo-EM structure of the compound 2 and GLP-1-bound human GLP-1 receptor-Gs complex 提交 2021-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 98–127（30 aa）
未记录 HNO N-tert-butyl-6,7-bis(chloranyl)quinoxalin-2-amine × 1 CLR CHOLESTEROL × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7XM8 Glucagon amyloid fibril 提交 2022-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 A 53–81（29 aa）
链 B 53–81（29 aa）
链 C 53–81（29 aa）
链 D 53–81（29 aa）
链 E 53–81（29 aa）
链 F 53–81（29 aa）
链 G 53–81（29 aa）
链 H 53–81（29 aa）
链 I 53–81（29 aa）
链 J 53–81（29 aa）
链 K 53–81（29 aa）
链 L 53–81（29 aa）
链 M 53–81（29 aa）
链 N 53–81（29 aa）
链 O 53–81（29 aa）
链 P 53–81（29 aa）
链 Q 53–81（29 aa）
链 R 53–81（29 aa）
链 S 53–81（29 aa）
链 T 53–81（29 aa）
链 U 53–81（29 aa）
链 V 53–81（29 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 2.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8JRV Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to glucagon and beta-arrestin 1 提交 2023-06-17 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 53–81（29 aa）
未记录 PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9E2A Glucagon Like Peptide Receptor-1 (GLP1R) A316T mutant with GLP-1 peptide. Dominant negative Gs complex. 提交 2024-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 98–127（30 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9N0E Cryo-EM structure of GCGR-Gs complex with oxyntomodulin 提交 2025-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 53–89（37 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
9X20 Cryo-EM structure of the GLP-1-bound human GLP-1R-Gi complex 提交 2025-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 P 98–127（30 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
9X22 Cryo-EM structure of the GLP-1-bound human GLP-1R-Gq complex 提交 2025-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 98–127（30 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.92 Å

共 33 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GLUC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–27； UniProt 53–81

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1nau

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1nau
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1nau
沉积日期 deposition_date2002-11-28
结构标题 titleNMR Solution Structure of the Glucagon Antagonist [desHis1, desPhe6, Glu9]Glucagon Amide in the Presence of Perdeuterated Dodecylphosphocholine Micelles
关键词 keywordsHELIX, TURN, HORMONE-GROWTH FACTOR COMPLEX; HORMONE/GROWTH FACTOR
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier10.39 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron10.05 Å
零角强度 I(0) i044483800.00
分子量 molecular_weight51384.0 kDa
排除体积 excluded_volume62705 ų
包络体积 envelope_volume10797 ų
水化壳体积 shell_volume7997 ų
包络直径 envelope_diameter40.6 Å
壳层 Rg shell_rg17.05 Å
包络 Rg envelope_rg12.65 Å
形状 Rg shape_rg9.97 Å
总 Rg total_rg10.65 Å
总原子数 total_atoms7024
残基数 n_residues432
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax41.3 Å
Rg (实空间) rg_real10.47 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.57 Å
I(0) (实空间) i0_real4.4480e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.6140e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal10.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal44480000.0000
解质量估计 total_estimate0.7335
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary7.8 Å
偏度 Skewness skewness0.318
峰度 Kurtosis kurtosis-0.491
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha6775.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.446; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.206; Smooth: 0.988
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1naua_
类 Class classj — Peptides
折叠类型 Fold foldj.6 — Peptide hormones
超家族 Superfamily superfamilyj.6.1 — Peptide hormones
家族 Family familyj.6.1.1 — Peptide hormones
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)