SAXSdb — 1ouz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integration Host Factor Alpha-subunit

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 3	;Phage lambda H' site ; × 1 5'-D(GPGPCPCPAPAPAPAPAPAPGPCPAPTPT)-3' × 1 5'-D(GPCPTPTPAPTPCPAPAPTPTPTPGPTPAPGPCPAPCP*C)-3' × 1 Integration Host Factor Beta-subunit × 1 （P0A6Y1） water × 5	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IHFA_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–99； UniProt 1–99

Integration Host Factor Beta-subunit

Escherichia coli

UniProt P0A6Y1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 2 DNA 3	;Phage lambda H' site ; × 1 5'-D(GPGPCPCPAPAPAPAPAPAPGPCPAPTPT)-3' × 1 5'-D(GPCPTPTPAPTPCPAPAPTPTPTPGPTPAPGPCPAPCP*C)-3' × 1 Integration Host Factor Alpha-subunit × 1 （P0A6X7） water × 5	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IHFB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ouz
沉积日期 deposition_date	2003-03-25
结构标题 title	Crystal structure of a mutant IHF (BetaE44A) complexed with a variant H' Site (T44A)
关键词 keywords	protein-DNA recognition, indirect readout, IHF, DNA bending, TRANSCRIPTION-DNA COMPLEX; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ouz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ouz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ouz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.71 Å
Rg（电子密度）	22.25 Å
总 Rg	23.03 Å
原子数	2939
残基数	260
排除体积	47718 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ouz__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Phage lambda H' site ;
分子量 formula_weight	10793.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	3101

CGGTGCTACAAATTGATAAGCAATGCTTTTTTGGC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	5'-D(GPGPCPCPAPAPAPAPAPAPGPCPAPTP*T)-3'
分子量 formula_weight	4611.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D

GGCCAAAAAAGCATT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	5'-D(GPCPTPTPAPTPCPAPAPTPTPTPGPTPAPGPCPAPCPC)-3'
分子量 formula_weight	6084.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	E

GCTTATCAATTTGTAGCACC

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Integration Host Factor Alpha-subunit
分子量 formula_weight	11374.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MALTKAEMSEYLFDKLGLSKRDAKELVELFFEEIRRALENGEQVKLSGFGNFDLRDKNQRPGRNPKTGEDIPITARRVVTFRPGQKLKSRVENASPKDE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Integration Host Factor Beta-subunit
分子量 formula_weight	10613.1 kDa
突变 mutation	E44A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MTKSELIERLATQQSHIPAKTVEDAVKEMLEHMASTLAQGERIAIRGFGSFSLHYRAPRTGRNPKTGDKVELEGKYVPHFKPGKELRDRANIYG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	162

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1ouza_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.55 — IHF-like DNA-binding proteins
超家族 Superfamily superfamily	a.55.1 — IHF-like DNA-binding proteins
家族 Family family	a.55.1.1 — Prokaryotic DNA-bending protein

结构域编号 domain_id	d1ouzb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.55 — IHF-like DNA-binding proteins
超家族 Superfamily superfamily	a.55.1 — IHF-like DNA-binding proteins
家族 Family family	a.55.1.1 — Prokaryotic DNA-bending protein

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	1ouzA00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	520 — HU Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — IHF-like DNA-binding proteins

结构域编号 domain_id	1ouzB00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	520 — HU Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — IHF-like DNA-binding proteins

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晶胞边长 a length_a	46.799 Å
晶胞边长 b length_b	60.107 Å
晶胞边长 c length_c	181.179 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.410 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.2426
R_work r_work	0.2412
R_free r_free	0.2710

Crystal structure of a mutant IHF (BetaE44A) complexed with a variant H' Site (T44A)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integration Host Factor Alpha-subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Integration Host Factor Beta-subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ouz__assembly_1__model_1

1ouz__assembly_1__model_1 | I(q)

1ouz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a mutant IHF (BetaE44A) complexed with a variant H' Site (T44A)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integration Host Factor Alpha-subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Integration Host Factor Beta-subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ouz__assembly_1__model_1

1ouz__assembly_1__model_1 | I(q)

1ouz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)