1p7n

Dimeric Rous Sarcoma virus Capsid protein structure with an upstream 25-amino acid residue extension of C-terminal of Gag p10 protein

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 76.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GAG POLYPROTEIN CAPSID PROTEIN P27

Rous sarcoma virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 215–386	片段：N-terminal domain	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；10 mM HEPES-sodium buffer and 0.8M potassium sodium tartrate tetrahydrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.298

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1P7N	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A6S M-DOMAIN FROM GAG POLYPROTEIN OF ROUS SARCOMA VIRUS, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–87（86 aa）片段：M-DOMAIN	突变：M1G	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM；压力 1 NMR样品组成 H20	分辨率未提供
1EM9 ROUS SARCOMA VIRUS CAPSID PROTEIN: N-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-03-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 240–393（154 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.1；277 K；Boric acid/Potassium Hydroxide, PEG 6000, Magnesium Nitrate, pH 9.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.05 Å R-free 0.271
1EM9 ROUS SARCOMA VIRUS CAPSID PROTEIN: N-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-03-16	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 240–393（154 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.1；277 K；Boric acid/Potassium Hydroxide, PEG 6000, Magnesium Nitrate, pH 9.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.05 Å R-free 0.271
1EOQ ROUS SARCOMA VIRUS CAPSID PROTEIN: C-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-03-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 394–488（95 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient NMR测量条件 pH 4.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient NMR测量条件 pH 4.9；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 U-15N RSV CA(155-249) (used for the 3D_15N-SEPARATED_NOESY, HNHA, HNHB expts) and U-15N/U-13C RSV CA(155-249) (used for the 3D_13C-SEPARATED_NOESY expt) both suspended in the same buffer (50 mM Sodium phosphate pH 4.9 50 mM NaCl 1 mM EDTA 1 mM DTT) \| 90% H20, 10%D20 NMR样品组成 U-15N RSV CA(155-249) 50 mM Sodium phosphate pH 4.9 50 mM NaCl 1 mM EDTA 1 mM DTT \| 90% H20, 10%D20 NMR样品组成 U-15N,13C RSV CA(155-249) 50 mM Sodium phosphate pH 4.9 50 mM NaCl 1 mM EDTA 1 mM DTT \| 90% H20, 10%D20	分辨率未提供
2IHX Solution Structure of the Rous Sarcoma Virus Nucleocapsid Protein:uPsi RNA Packaging Signal Complex 提交 2006-09-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric	链 A 503–563（61 aa）片段：Nucleocapsid domain (residues 503-563)	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）5 mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM unlabeled nucleocapsid protein, 1.0 mM A-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1.2 mM unlabeled nucleocapsid protein, 1.2 mM G-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.8 mM unlabeled nucleocapsid protein, 0.8 mM U-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 0.8 mM unlabeled nucleocapsid protein, 0.8 mM C-selectively-protonated uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1.2 mM unlabeled nucleocapsid protein, 1.2 mM unlabeled uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0, 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 1.2 mM 15N, 13C-labeled nucleocapsid protein, 1.2 mM unlabeled uPsi RNA, 5 mM Tris-d11-HCl buffer, pH 7.0; 5mM NaCl, 0.1 mM ZnCl2, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2RSP STRUCTURE OF THE ASPARTIC PROTEASE FROM ROUS SARCOMA RETROVIRUS REFINED AT 2 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1989-10-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 578–701（124 aa）链 B 578–701（124 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-MERIC	链 A 240–465（226 aa）片段：RESIDUES 240-465	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 240–465（226 aa）片段：RESIDUES 240-465	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 240–465（226 aa）片段：RESIDUES 240-465	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 240–465（226 aa）片段：RESIDUES 240-465	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 18.30 Å
2X8Q Cryo-EM 3D model of the icosahedral particle composed of Rous sarcoma virus capsid protein pentamers 提交 2010-03-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 240–465（226 aa）片段：RESIDUES 240-465	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL；pH 5；0.1M CITRIC ACID, 5MM MOPS/KOH, 725MM NACL, 0.25MM NA AZIDE, 0.125MM TCEP-HCL cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 90, TEMPERATURE- 85, INSTRUMENT- VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 5 SECONDS BEFORE PLUNGING,	分辨率 18.30 Å
3G0V Crystal structure of the C-terminal domain from the Rous Sarcoma Virus capsid protein: mutant D179A 提交 2009-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465	突变：D179A	NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.3；291 K；0.2M Succinic acid/KOH, pH4.3, 24% PEG8000, 1M Sodium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
3G1G Crystal structure of the C-terminal domain from the Rous Sarcoma Virus capsid protein: High pH 提交 2009-01-29	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 390–476（87 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476 链 B 390–476（87 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.3；291 K；0.2M Beta-Alanine/KOH, pH10.3, 10-25% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.01 Å R-free 0.257
3G1G Crystal structure of the C-terminal domain from the Rous Sarcoma Virus capsid protein: High pH 提交 2009-01-29	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 390–476（87 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476 链 B 390–476（87 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 390-476	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.3；291 K；0.2M Beta-Alanine/KOH, pH10.3, 10-25% PEG8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.01 Å R-free 0.257
3G1I Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: Intermediate pH 提交 2009-01-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465 链 B 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2M Bis-tris propane/HCl, pH8.5, 0.75-1.85M Ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
3G21 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: Low pH 提交 2009-01-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465	未记录	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.3；291 K；0.20M Succinic acid/KOH, pH4.3, 13-18% PEG8000, 0.75M Magnesium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 0.90 Å R-free 0.142
3G26 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: Mutant A184C 提交 2009-01-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465	突变：A184C	MLA MALONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.7；291 K；0.1M Malic acid/KOH, pH3.7, 1.4 M Malonic acid/KOH, pH3.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.55 Å R-free 0.214
3G28 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: mutant D179N, low pH 提交 2009-01-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465	突变：D179N	NO3 NITRATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.7；291 K；0.2M Formic acid/KOH, pH3.7, 12% PEG8000, 0.25M Ammonium Nitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.64 Å R-free 0.200
3G29 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: D179N mutant, neutral pH 提交 2009-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465	突变：D179N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；0.20M Tris/HCl, pH7.9, 1.5M Ammonium Citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.322
3G29 Crystal structure of the C-terminal domain of the Rous Sarcoma Virus capsid protein: D179N mutant, neutral pH 提交 2009-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 389–465（77 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 389-465	突变：D179N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；0.20M Tris/HCl, pH7.9, 1.5M Ammonium Citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.50 Å R-free 0.322
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 84–577（494 aa）链 B 84–577（494 aa）链 C 84–577（494 aa）链 D 84–577（494 aa）链 E 84–577（494 aa）链 F 84–577（494 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.	分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 84–577（494 aa）链 C 84–577（494 aa）链 D 84–577（494 aa）链 E 84–577（494 aa）链 K 84–577（494 aa）链 R 84–577（494 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.	分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 84–577（494 aa）链 C 84–577（494 aa）链 D 84–577（494 aa）链 E 84–577（494 aa）链 L 84–577（494 aa）链 M 84–577（494 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.	分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 84–577（494 aa）链 C 84–577（494 aa）链 D 84–577（494 aa）链 E 84–577（494 aa）链 G 84–577（494 aa）链 N 84–577（494 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.	分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 84–577（494 aa）链 C 84–577（494 aa）链 D 84–577（494 aa）链 E 84–577（494 aa）链 H 84–577（494 aa）链 O 84–577（494 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.	分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 84–577（494 aa）链 C 84–577（494 aa）链 D 84–577（494 aa）链 E 84–577（494 aa）链 I 84–577（494 aa）链 P 84–577（494 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.	分辨率 7.70 Å
5A9E Cryo-electron tomography and subtomogram averaging of Rous-Sarcoma- Virus deltaMBD virus-like particles 提交 2015-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 84–577（494 aa）链 C 84–577（494 aa）链 D 84–577（494 aa）链 E 84–577（494 aa）链 J 84–577（494 aa）链 Q 84–577（494 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP；pH 6.5；MES PH6.5, 100MM NACL, 2UM ZNCL2, 2MM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；DEGASSED C-FLAT 2 2-3C GRIDS WERE GLOW DISCHARGED FOR 30 SECONDS AT 20 MA. VIRUS SOLUTION WAS DILUTED IN OBS CONTAINING 10NM COLLOIDAL GOLD. 2.5UL OF THIS MIXTURE WAS APPLIED TO A GRID. BLOTTING TIME 2.5 SECONDS.	分辨率 7.70 Å
7NO0 Structure of the mature RSV CA lattice: T=1 CA icosahedron 提交 2021-02-25	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot time= 2.5 s blot force= 0	分辨率 3.10 Å
7NO1 Structure of the mature RSV CA lattice: T=3 CA icosahedron 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot time = 2.5s blot force = 0	分辨率 7.60 Å
7NO2 Structure of the mature RSV CA lattice: hexamer derived from tubes (C2-symmetric) 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 4.30 Å
7NO3 Structure of the mature RSV CA lattice: pentamer derived from polyhedral VLPs 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 5.80 Å
7NO4 Structure of the mature RSV CA lattice: hexamer with 3 adjacent pentamers (C3 symmetric) 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.50 Å
7NO5 Structure of the mature RSV CA lattice: hexamer with 2 adjacent pentamers (C2 symmetric) 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.40 Å
7NO6 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-hexamer interface, class 1 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 6.00 Å
7NO7 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-hexamer interface, class 1"2 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.50 Å
7NO8 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-hexamer interface, class 1"6 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.90 Å
7NO9 Structure of the mature RSV CA lattice: Group I, pentamer-pentamer interface, class 1'1 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.60 Å
7NOA Structure of the mature RSV CA lattice: Group II, hexamer-hexamer interface, class 6 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 6.40 Å
7NOB Structure of the mature RSV CA lattice: Group II, hexamer-hexamer interface, class 2'6 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 6.70 Å
7NOC Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 3'3 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.80 Å
7NOD Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 3'4 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.80 Å
7NOE Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 3'5 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.50 Å
7NOF Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 4'4 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.60 Å
7NOG Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 4'5 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.80 Å
7NOH Structure of the mature RSV CA lattice: Group III, hexamer-hexamer interface, class 5'5 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.10 Å
7NOI Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 3'Alpha 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.20 Å
7NOJ Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 3'Beta 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 6.70 Å
7NOK Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 3'Gamma 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 9.10 Å
7NOL Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 4'Alpha 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 8.20 Å
7NOM Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 4'Beta 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 6.70 Å
7NON Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 4'Gamma 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 6.80 Å
7NOO Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 5'Alpha 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.90 Å
7NOP Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 5'Beta 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 7.80 Å
7NOQ Structure of the mature RSV CA lattice: Group IV, hexamer-hexamer interface, class 5'Gamma 提交 2021-02-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 240–468（229 aa）链 B 240–468（229 aa）链 C 240–468（229 aa）链 D 240–468（229 aa）链 E 240–468（229 aa）链 F 240–468（229 aa）链 G 240–468（229 aa）链 H 240–468（229 aa）链 I 240–468（229 aa）链 J 240–468（229 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 seconds blotting time	分辨率 6.50 Å

共 41 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GAG_RSVP
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–176； UniProt 215–386

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1p7n
沉积日期 deposition_date	2003-05-02
结构标题 title	Dimeric Rous Sarcoma virus Capsid protein structure with an upstream 25-amino acid residue extension of C-terminal of Gag p10 protein
关键词 keywords	Retrovirus, capsid protein, Gag Polyprotein, immature gag, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	20.58 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.29 Å
零角强度 I(0) i0	6492360.00
分子量 molecular_weight	18720.0 kDa
排除体积 excluded_volume	23552 Å³
包络体积 envelope_volume	29398 Å³
水化壳体积 shell_volume	13824 Å³
包络直径 envelope_diameter	76.6 Å
壳层 Rg shell_rg	23.99 Å
包络 Rg envelope_rg	20.84 Å
形状 Rg shape_rg	20.26 Å
总 Rg total_rg	20.96 Å
总原子数 total_atoms	1315
残基数 n_residues	176
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	76.1 Å
Rg (实空间) rg_real	20.81 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.78 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.4920e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.3180e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	20.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6492000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7997
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	18.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.613
峰度 Kurtosis kurtosis	0.014
角度范围 angular_range	— – 0.3850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	904000.0000
实空间数据点数 n_real_points	70
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.623; Stabil: 0.994; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.572; Smooth: 0.967

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d1p7na1
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.73 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain
超家族 Superfamily superfamily	a.73.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain
家族 Family family	a.73.1.1 — Retrovirus capsid protein, N-terminal core domain

结构域编号 domain_id	d1p7na2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	1p7nA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	375 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Human Immunodeficiency Virus Type 1 Capsid Protein

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	47.870 Å
晶胞边长 b length_b	47.870 Å
晶胞边长 c length_c	170.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	26.500 Å
R 因子 r_factor	0.2600
R_work r_work	0.2600
R_free r_free	0.2980

描述 description	GAG POLYPROTEIN CAPSID PROTEIN P27
分子量 formula_weight	18736.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1315

Dimeric Rous Sarcoma virus Capsid protein structure with an upstream 25-amino acid residue extension of C-terminal of Gag p10 protein

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

GAG POLYPROTEIN CAPSID PROTEIN P27

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Rous sarcoma virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11886
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

fit	/app/data/saxs_computation/p7/1p7n/1p7n.fit
pddf	/app/data/pr_computation/p7/1p7n/1p7n.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/p7/1p7n/1p7n.dat