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1plo

TRANSFORMING GROWTH FACTOR-BETA TYPE II RECEPTOR EXTRACELLULAR DOMAIN

Method: SOLUTION NMR Dmax: 55.0 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TGF-beta receptor type II

Homo sapiens

UniProt P37173

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 38–159 突变：N19A 无其他共同聚合物 SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 5.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl, pH 5.5；压力 ambient NMR测量条件：pH 5.1；300 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl；压力 ambient NMR测量条件：pH 5.5；313 K；离子强度（mmCIF原始值）25mM sodium acetate, 25mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成：1mM ecTbR2 U-15N, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 99.99% D2O | 99.99% D2O NMR样品组成：1mM ecTbR2 U-15N, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 4% (w/v) 1,2-di-O-hexyl-sn-glycero-3-phosphocholine (6-O-PC) and 1,2-di-O-tetradecyl-sn-glycero-3-phosphocholine (14-O-PC) mixed in a molar ratio of 1:3, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O NMR样品组成：1mM ecTbR2 U-15N, 13C, 25mM sodium acetate, 25mM NaCl, 4% (w/v) 1,2-di-O-hexyl-sn-glycero-3-phosphocholine (6-O-PC) and 1,2-di-O-tetradecyl-sn-glycero-3-phosphocholine (14-O-PC) mixed in a molar ratio of 1:3, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O 分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 1PLO Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1KTZ Crystal Structure of the Human TGF-beta Type II Receptor Extracellular Domain in Complex with TGF-beta3 提交 2002-01-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 38–159（122 aa） 片段：Extracellular Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 HANGING DROP VAPOR DIFFUSION USING A WELL SOLUTION CONTAINING 20% (V/V) 2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL AND 0.1 M CITRATE PH 4.0
分辨率 2.15 Å R-free 0.215
1M9Z CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN TGF-BETA TYPE II RECEPTOR LIGAND BINDING DOMAIN 提交 2002-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 49–159（111 aa） 片段：Extracellular
突变：Q26A,K97T GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；PEG 2000, sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 1.05 Å R-free 0.166
2PJY Structural basis for cooperative assembly of the TGF-beta signaling complex 提交 2007-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 42–149（108 aa） 片段：extracellular domain
突变：N42A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10-20% PEG 3350, 0.4-0.65 M calcium acetate, 0.1-0.25M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.297
3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
链 F 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
链 H 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.268
3KFD Ternary complex of TGF-b1 reveals isoform-specific ligand recognition and receptor recruitment in the superfamily 提交 2009-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
链 F 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
链 G 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
链 H 38–153（116 aa） 片段：extracellular domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；298 K；8-15% Peg 4000-8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.268
4P7U Extracellular domain of type II Transforming Growth Factor Beta receptor in complex with NDSB-201 提交 2014-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 75–184（110 aa） 片段：extracellular domain, UNP residues 74-175
突变：Q26A K97T 1PS 3-PYRIDINIUM-1-YLPROPANE-1-SULFONATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；100 mM sodium citrate, 30% PEG 2000
分辨率 1.50 Å R-free 0.206
4XJJ Extracellular domain of type II Transforming Growth Factor Beta receptor in complex with 2-(2-Hydroxyethyl)NDSB-201 提交 2015-01-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 50–159（110 aa） 片段：ligand binding domain (UNP reisudes 50-159)
突变：K97T 41D 3-[2-(2-hydroxyethyl)pyridinium-1-yl]propane-1-sulfonate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；100 mM sodium citrate, 30% PEG 2000
分辨率 1.40 Å R-free 0.185
5E8V TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) 提交 2015-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–549（313 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
分辨率 1.69 Å R-free 0.219
5E8Y TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH STAUROSPORINE 提交 2015-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–549（313 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A STU STAUROSPORINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
分辨率 2.05 Å R-free 0.227
5E91 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH 3-AMINO-6-[4-(2- HYDROXYETHYL)PHENYL]-N-[4-(MORPHOLIN-4-YL)PYRIDIN-3-YL] PYRAZINE-2-CARBOXAMIDE 提交 2015-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–549（313 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A 5L4 3-amino-6-[4-(2-hydroxyethyl)phenyl]-N-[4-(morpholin-4-yl)pyridin-3-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
分辨率 2.42 Å R-free 0.242
5E92 TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN (E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A) IN COMPLEX WITH AMPPNP 提交 2015-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–549（313 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mm TRIS-HCl, PH 8.5, 150 mm MgCl2, 24%(w/v) PEG4000, 20%(v/v) glcyerol
分辨率 2.08 Å R-free 0.231
5QIN TGF-BETA RECEPTOR TYPE 2 KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH N- {4-[3-(6-METHOXYPYRIDIN-3-YL)-1H-PYRROLO[3,2-B]PYRIDIN-2- YL]PYRIDIN-2-YL}ACETAMIDE 提交 2018-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–549（313 aa） 片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 237-549
未记录 J2V N-{4-[3-(6-methoxypyridin-3-yl)-1H-pyrrolo[3,2-b]pyridin-2-yl]pyridin-2-yl}acetamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；23%(w/v) PEG3350, 3%(v/v) glcyerol
分辨率 1.57 Å R-free 0.203
5TX4 Derivative of mouse TGF-beta2, with a deletion of residues 52-71 and K25R, R26K, L51R, A74K, C77S, L89V, I92V, K94R T95K, I98V single amino acid substitutions, bound to human TGF-beta type II receptor ectodomain residues 15-130 提交 2016-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 38–153（116 aa） 片段：UNP residues 38-153
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Hepes, pH 7.5, 60 % v/v (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 1.88 Å R-free 0.222
5TY4 MicroED structure of a complex between monomeric TGF-b and its receptor, TbRII, at 2.9 A resolution 提交 2016-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 72–174（103 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.5 ul 20 mg/mL protein + 0.25 ul mother liquor + 0.2 ul seed stock in 100 mM HEPES/NaOH pH 7.5, 45% MPD
分辨率 2.90 Å R-free 0.328
7DV6 Discovery of Functionally Selective Transforming Growth Factor beta Type II Receptor (TGF-beta RII) Inhibitors as Anti-Fibrosis Agents 提交 2021-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–549（313 aa）
突变：E431A,R433A,E485A,K488A,R493A,R495A HJF 5-[(3S)-5,5-dimethyloxolan-3-yl]-6-methoxy-3-(2-methoxypyridin-4-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；12-22% PEG4000,3% Ethylene Glycol,16% glycerol, 160 mM MgCl2, 80 mM TrisHCl at pH 7.5-9.3,The 9.2 mg/mL of TGFbetaRII protein was incubated with 1mM compound at 277K for 1-2 hr
分辨率 2.39 Å R-free 0.224
8G4K Complex of TbRII mini protein binder bound to the TbRII ECD 提交 2023-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 46–155（110 aa） 片段：ECD (UNP residues 46-155)
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；300 K；20% PEG5000 MME, 0.2-0.4 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.4, 16-32% glycerol
分辨率 1.24 Å R-free 0.196
8YGZ The Crystal Structure of TGF beta R2 kinase domain from Biortus. 提交 2024-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 237–549（313 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Tris-HCl pH8.5, 30% PEG4,000
分辨率 2.10 Å R-free 0.254
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 42–153（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9B9F Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 I 42–153（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M tris pH 8.5, 30 %(w/v) polyethylene glycol 4000
分辨率 3.00 Å R-free 0.278
9E9G Heligmosomoides polygyrus TGF-beta Mimic 6 Domain 3 (TGM6-D3) Bound to Human TGF-beta Type II Receptor Extracellular Domain 提交 2024-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 38–154（117 aa） 片段：UNP residues 38-154
未记录 GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 5 CAC CACODYLATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M sodium cacodylate, 25% w/v PEG4000, pH 6.5
分辨率 1.40 Å R-free 0.182
9FDY Betaglycan Orphan Domain (ratBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 42–153（112 aa）
链 E 42–153（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9FK5 Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-B3 and extracellular domains of TGFBRI and TGFBRII 提交 2024-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 42–153（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9FKP Zebrafish Betaglycan Orphan Domain (zfBGo) in complex with TGF-b1 and extracellular domain of TGFBRII 提交 2024-06-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 42–153（112 aa）
链 E 42–153（112 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.72 Å

共 21 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TGFR2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–122； UniProt 38–159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 1plo

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 1plo
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1plo
沉积日期 deposition_date2003-06-08
结构标题 titleTRANSFORMING GROWTH FACTOR-BETA TYPE II RECEPTOR EXTRACELLULAR DOMAIN
关键词 keywordsThree-Finger Toxin Fold, Cytokine receptor; Cytokine receptor
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier14.94 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron15.00 Å
零角强度 I(0) i0307797000.00
分子量 molecular_weight137890.0 kDa
排除体积 excluded_volume168530 ų
包络体积 envelope_volume35022 ų
水化壳体积 shell_volume16788 ų
包络直径 envelope_diameter63.1 Å
壳层 Rg shell_rg23.86 Å
包络 Rg envelope_rg18.41 Å
形状 Rg shape_rg15.05 Å
总 Rg total_rg15.13 Å
总原子数 total_atoms18530
残基数 n_residues1220
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax55.0 Å
Rg (实空间) rg_real14.94 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.49 Å
I(0) (实空间) i0_real3.0780e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.6960e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal14.94 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal307800000.0000
解质量估计 total_estimate0.7538
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary17.4 Å
偏度 Skewness skewness0.386
峰度 Kurtosis kurtosis-0.036
角度范围 angular_range— – 0.5000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha540800.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.643; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.871; Smooth: 0.000
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd1ploa_
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.7 — Snake toxin-like
超家族 Superfamily superfamilyg.7.1 — Snake toxin-like
家族 Family familyg.7.1.3 — Extracellular domain of cell surface receptors

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id1ploA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)