1ry1

Structure of the signal recognition particle interacting with the elongation-arrested ribosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SRP14

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 6 RNA 8	SRP Alu domain × 1 SRP S domain × 1 SRP RNA × 1 SRP RNA × 1 SRP RNA × 1 SRP RNA × 1 SRP RNA × 1 SRP RNA × 1 SRP9 × 1 SRP19 × 1 SRP54NG × 1 SRP54M × 1 signal sequence peptide × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SRP14_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–106； UniProt 2–107

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ry1
沉积日期 deposition_date	2003-12-19
结构标题 title	Structure of the signal recognition particle interacting with the elongation-arrested ribosome
关键词 keywords	signal recognition particle, RNA binding, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ry1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ry1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ry1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	84.48 Å
Rg（电子密度）	86.97 Å
总 Rg	86.89 Å
原子数	11794
残基数	976
排除体积	187200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ry1__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	SRP Alu domain
分子量 formula_weight	16277.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	E
原子数 atom_count	11794

GGGCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	SRP S domain
分子量 formula_weight	41566.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A

GACACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGUC

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	SRP RNA
分子量 formula_weight	8784.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	M

AGGCUGGAGGAUCGCUUGAGUCCAGGA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	SRP RNA
分子量 formula_weight	9807.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	N

CCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCUUU

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	SRP RNA
分子量 formula_weight	7695.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	O

GUUCUGGGCUGUAGUGCGCUAUGC

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	SRP RNA
分子量 formula_weight	6325.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	P

CAAUAGCCACUGCACUCCAG

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	SRP RNA
分子量 formula_weight	3844.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Q

CGAUCGGGUGUC

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	SRP RNA
分子量 formula_weight	3804.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	R

AUCGCGCCUGUG

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	SRP9
分子量 formula_weight	9996.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

PQYQTWEEFSRAAEKLYLADPMKARVVLKYRHSDGNLCVKVTDDLVCLVYKTDQAQDVKKIEKFHSQLMRLMVAKEARNVTMETE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	SRP14
分子量 formula_weight	12114.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

VLLESEQFLTELTRLFQKCRTSGSVYITLKKYDGRTKPIPKKGTVEGFEPADNKCLLRATDGKKKISTVVSSKEVNKFQMAYSNLLRANMDGLKKRDKKNKTKKTK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	SRP19
分子量 formula_weight	12561.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MRFICIYPAYLNNKKTIAEGRRIPISKAVENPTATEIQDVCSAVGLNVFLEKNKMYSREWNRDVQYRGRVRVQLKQEDGSLCLVQFPSRKSVMLYAAEMIPKLKTRTQ

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	SRP54NG
分子量 formula_weight	32472.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MFQQLSARLQEAIGRLRGRGRITEEDLKATLREIRRALMDADVNLEVARDFVERVREEALGKQVLESLTPAEVILATVYEALKEALGGEARLPVLKDRNLWFLVGLQGSGKTTTAAKLALYYKGKGRRPLLVAADTQRPAAREQLRLLGEKVGVPVLEVMDGESPESIRRRVEEKARLEARDLILVDTAGRLQIDEPLMGELARLKEVLGPDEVLLVLDAMTGQEALSVARAFDEKVGVTGLVLTKLDGDARGGAALSARHVTGKPIYFAGVSEKPEGLEPFYPERLAGRILGMGD

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	SRP54M
分子量 formula_weight	12473.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

QFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDFMSKGNEQESMARLKKLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKKM

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	signal sequence peptide
分子量 formula_weight	2121.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

LGFPINFLTLYVTVQHKK

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1ry1b_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.22 — Signal recognition particle (SRP) complex
超家族 Superfamily superfamily	i.22.1 — Signal recognition particle (SRP) complex
家族 Family family	i.22.1.1 — Signal recognition particle (SRP) complex

结构域编号 domain_id	d1ry1c_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.22 — Signal recognition particle (SRP) complex
超家族 Superfamily superfamily	i.22.1 — Signal recognition particle (SRP) complex
家族 Family family	i.22.1.1 — Signal recognition particle (SRP) complex

结构域编号 domain_id	d1ry1d_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.22 — Signal recognition particle (SRP) complex
超家族 Superfamily superfamily	i.22.1 — Signal recognition particle (SRP) complex
家族 Family family	i.22.1.1 — Signal recognition particle (SRP) complex

结构域编号 domain_id	d1ry1s_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.22 — Signal recognition particle (SRP) complex
超家族 Superfamily superfamily	i.22.1 — Signal recognition particle (SRP) complex
家族 Family family	i.22.1.1 — Signal recognition particle (SRP) complex

结构域编号 domain_id	d1ry1u_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.22 — Signal recognition particle (SRP) complex
超家族 Superfamily superfamily	i.22.1 — Signal recognition particle (SRP) complex
家族 Family family	i.22.1.1 — Signal recognition particle (SRP) complex

结构域编号 domain_id	d1ry1w_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.22 — Signal recognition particle (SRP) complex
超家族 Superfamily superfamily	i.22.1 — Signal recognition particle (SRP) complex
家族 Family family	i.22.1.1 — Signal recognition particle (SRP) complex

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分辨率 resolution	12.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	12.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	—

Structure of the signal recognition particle interacting with the elongation-arrested ribosome

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SRP14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1ry1__assembly_1__model_1

1ry1__assembly_1__model_1 | I(q)

1ry1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer

聚合物 Polymer

实体 11 Entity 11 polymer

聚合物 Polymer

实体 12 Entity 12 polymer

聚合物 Polymer

实体 13 Entity 13 polymer

聚合物 Polymer

实体 14 Entity 14 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

7. 引用文献 (1)