ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 isoform Rac1b
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–201 | 片段:residues 1-201 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
| 2 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 B; UniProt 1–201 | 片段:residues 1-201 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.223 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 1RYF | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1FOE CRYSTAL STRUCTURE OF RAC1 IN COMPLEX WITH THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE REGION OF TIAM1 提交 2000-08-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;277 K;PEG 3350, Li2SO4, MES, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 1FOE CRYSTAL STRUCTURE OF RAC1 IN COMPLEX WITH THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE REGION OF TIAM1 提交 2000-08-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;277 K;PEG 3350, Li2SO4, MES, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 1FOE CRYSTAL STRUCTURE OF RAC1 IN COMPLEX WITH THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE REGION OF TIAM1 提交 2000-08-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;277 K;PEG 3350, Li2SO4, MES, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 1FOE CRYSTAL STRUCTURE OF RAC1 IN COMPLEX WITH THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE REGION OF TIAM1 提交 2000-08-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;277 K;PEG 3350, Li2SO4, MES, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 1FOE CRYSTAL STRUCTURE OF RAC1 IN COMPLEX WITH THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE REGION OF TIAM1 提交 2000-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
链 D
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
链 F
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
链 H
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;277 K;PEG 3350, Li2SO4, MES, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 1FOE CRYSTAL STRUCTURE OF RAC1 IN COMPLEX WITH THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE REGION OF TIAM1 提交 2000-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
链 H
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;277 K;PEG 3350, Li2SO4, MES, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 1FOE CRYSTAL STRUCTURE OF RAC1 IN COMPLEX WITH THE GUANINE NUCLEOTIDE EXCHANGE REGION OF TIAM1 提交 2000-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 D
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
链 F
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1 TO 177 FROM HUMAN RAC1
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;277 K;PEG 3350, Li2SO4, MES, glycerol, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.293 |
| 1G4U CRYSTAL STRUCTURE OF THE SALMONELLA TYROSINE PHOSPHATASE AND GTPASE ACTIVATING PROTEIN SPTP BOUND TO RAC1 提交 2000-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 R
1–184(184 aa)
片段:RAC1 RESIDUES 1-184
|
突变:F78S | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.7;18 %PEG 400, 0.1M MES, 15mM sodium flouride, 0.1mM aluminum chloride, 2mM DTT, 2mM magnesium chloride, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.258 |
| 1I4D CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF RAC1-GDP COMPLEXED WITH ARFAPTIN (P21) 提交 2001-02-20 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–192(192 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;291 K;Tris, Peg20K, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.298 |
| 1I4L CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF RAC1-GDP IN COMPLEX WITH ARFAPTIN (P41) 提交 2001-02-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–192(192 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;291 K;Tris, PEG20K, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.301 |
| 1I4L CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF RAC1-GDP IN COMPLEX WITH ARFAPTIN (P41) 提交 2001-02-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–192(192 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;291 K;Tris, PEG20K, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.301 |
| 1I4T CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF RAC1-GMPPNP IN COMPLEX WITH ARFAPTIN 提交 2001-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–192(192 aa)
|
突变:Q61L | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;291 K;Tris, PEG20K, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1I4T CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF RAC1-GMPPNP IN COMPLEX WITH ARFAPTIN 提交 2001-02-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 D
1–192(192 aa)
|
突变:Q61L | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;291 K;Tris, PEG20K, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.304 |
| 1MH1 SMALL G-PROTEIN 提交 1997-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–184(183 aa)
片段:RESIDUES 1 - 184
|
突变:M1P, F78S | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.8;pH 6.8
|
分辨率 1.38 Å R-free 0.205 |
| 1RYH Alternative Splicing of Rac1 Generates Rac1b, a Self-activating GTPase 提交 2003-12-22 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–201(201 aa)
片段:residues 1-201
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 1RYH Alternative Splicing of Rac1 Generates Rac1b, a Self-activating GTPase 提交 2003-12-22 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–201(201 aa)
片段:residues 1-201
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.75 Å R-free 0.219 |
| 2FJU Activated Rac1 bound to its effector phospholipase C beta 2 提交 2006-01-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
片段:residues 1-189
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;291 K;8% PEG 3350, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.226 |
| 2H7V Co-crystal structure of YpkA-Rac1 提交 2006-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
|
突变:F78S | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;100mM HEPES pH 6.5-7.5, 5%-8% PEGMME2000 micro seeding, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.257 |
| 2H7V Co-crystal structure of YpkA-Rac1 提交 2006-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–184(184 aa)
|
突变:F78S | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;100mM HEPES pH 6.5-7.5, 5%-8% PEGMME2000 micro seeding, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.257 |
| 2NZ8 N-terminal DHPH cassette of Trio in complex with nucleotide-free Rac1 提交 2006-11-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
片段:soluble part (residues 1-177)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6;291 K;100 mM sodium cacodylate pH 5.5 to 6.5, 14 to 18% (w/v) PEG 8000, and 300-500 mM calcium acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.249 |
| 2P2L Rac1-GDP-Zinc Complex 提交 2007-03-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
链 C
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;100mM MES pH6.0, 15mM ZnSO4, 10% PEGMME 550., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.208 |
| 2P2L Rac1-GDP-Zinc Complex 提交 2007-03-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
链 C
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;100mM MES pH6.0, 15mM ZnSO4, 10% PEGMME 550., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.208 |
| 2RMK Rac1/PRK1 Complex 提交 2007-10-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–192(192 aa)
|
突变:Q61L | MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.225;压力 ambient
NMR样品组成
0.6mM [U-13C; U-15N; U-2H] Rac1; 0.6mM PRK1 HR1b; 0.7mM PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Rac1; 0.6mM PRK1 HR1b; 0.7mM PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6mM [U-100% 15N] Rac1; 0.6mM PRK1 HR1b; 0.7mM PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Rac1; 0.6mM PRK1 Rac1; 0.7mM PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6mM [U-100% 15N] HR1b; 0.6mM PRK1 Rac1; 0.7mM PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2VRW Critical structural role for the PH and C1 domains of the Vav1 exchange factor 提交 2008-04-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
片段:RESIDUES 1-184
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 9;100MM BICINE PH9.0 10% PEG 6000
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.251 |
| 2WKP Structure of a photoactivatable Rac1 containing Lov2 Wildtype 提交 2009-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
4–180(177 aa)
片段:NPH1-1, RESIDUES 404-546 AND P21-RAC1, RESIDUES 4-180
|
突变:YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
100 MM CA ACETATE, 100 MM SODIUM CACODYLATE PH 5.5, 12 % (W/V) PEG 8000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.195 |
| 2WKQ Structure of a photoactivatable Rac1 containing the Lov2 C450A Mutant 提交 2009-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
4–180(177 aa)
片段:NPH1-1 RESIDUES 404-546 AND P21-RAC1, RESIDUES 4-180
|
突变:YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
100 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5% (W/V) PEG 4000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.186 |
| 2WKR Structure of a photoactivatable Rac1 containing the Lov2 C450M Mutant 提交 2009-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
4–180(177 aa)
片段:NPH1-1, RESIDUES 404-546 AND P21-RAC1, RESIDUES 4-180
|
突变:YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
18 % (V/V) PEG 600
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.226 |
| 2YIN STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN Dock2 AND Rac1. 提交 2011-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1-177
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;293 K;0.1 M MES PH 6.5, 12% (W/V) PEG 3350, 10% (V/V) GLYCEROL AND 150 MM NACL. AT 20 C
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.255 |
| 2YIN STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN Dock2 AND Rac1. 提交 2011-05-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–177(177 aa)
片段:RESIDUES 1-177
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;293 K;0.1 M MES PH 6.5, 12% (W/V) PEG 3350, 10% (V/V) GLYCEROL AND 150 MM NACL. AT 20 C
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.255 |
| 3B13 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK2 in complex with Rac1 (T17N mutant) 提交 2011-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–177(177 aa)
片段:GTPase domain (UNP RESIDUES 1-177)
链 D
1–177(177 aa)
片段:GTPase domain (UNP RESIDUES 1-177)
|
突变:T17N 突变:T17N | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;293 K;100mM sodium citrate, 15% PEG 6000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.234 |
| 3BJI Structural Basis of Promiscuous Guanine Nucleotide Exchange by the T-Cell Essential Vav1 提交 2007-12-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–177(177 aa)
片段:Rac1
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;17% PEG-3350, 100 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM ammonium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.293 |
| 3BJI Structural Basis of Promiscuous Guanine Nucleotide Exchange by the T-Cell Essential Vav1 提交 2007-12-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–177(177 aa)
片段:Rac1
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;17% PEG-3350, 100 mM HEPES, pH 7.5, 200 mM ammonium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.293 |
| 3RYT The Plexin A1 intracellular region in complex with Rac1 提交 2011-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
|
突变:Q61L | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;15% PEG1500, 100 mM SPG buffer, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.58 Å R-free 0.340 |
| 3SBD Crystal structure of RAC1 P29S mutant 提交 2011-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–177(176 aa)
|
突变:P29S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;20% PEG4000, 7% isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.285 |
| 3SBD Crystal structure of RAC1 P29S mutant 提交 2011-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–177(176 aa)
|
突变:P29S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;20% PEG4000, 7% isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.285 |
| 3SBE Crystal structure of RAC1 P29S mutant 提交 2011-06-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–177(176 aa)
|
突变:P29S | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;20% PEG4000, 7% isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.296 |
| 3SU8 Crystal structure of a truncated intracellular domain of Plexin-B1 in complex with Rac1 提交 2011-07-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.238 |
| 3SUA Crystal structure of the intracellular domain of Plexin-B1 in complex with Rac1 提交 2011-07-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.39 Å R-free 0.264 |
| 3SUA Crystal structure of the intracellular domain of Plexin-B1 in complex with Rac1 提交 2011-07-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.39 Å R-free 0.264 |
| 3SUA Crystal structure of the intracellular domain of Plexin-B1 in complex with Rac1 提交 2011-07-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.39 Å R-free 0.264 |
| 3SUA Crystal structure of the intracellular domain of Plexin-B1 in complex with Rac1 提交 2011-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 A
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
链 B
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
链 C
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.39 Å R-free 0.264 |
| 3TH5 Crystal structure of wild-type RAC1 提交 2011-08-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–177(176 aa)
片段:UNP residues 2-177
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;22% PEG4000, 7% isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.264 |
| 3TH5 Crystal structure of wild-type RAC1 提交 2011-08-18 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–177(176 aa)
片段:UNP residues 2-177
|
未记录 | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;294 K;22% PEG4000, 7% isopropanol, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.264 |
| 4GZL Crystal structure of RAC1 Q61L mutant 提交 2012-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–177(176 aa)
片段:UNP residues 2-177
|
突变:Q61L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;16-18% PEG4000, 6% isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 4GZL Crystal structure of RAC1 Q61L mutant 提交 2012-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–177(176 aa)
片段:UNP residues 2-177
|
突变:Q61L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;16-18% PEG4000, 6% isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 4GZM Crystal structure of RAC1 F28L mutant 提交 2012-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–177(176 aa)
片段:UNP residues 2-177
|
突变:F28L | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;16-18% PEG4000, 8% isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.288 |
| 4GZM Crystal structure of RAC1 F28L mutant 提交 2012-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–177(176 aa)
片段:UNP residues 2-177
|
突变:F28L | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;16-18% PEG4000, 8% isopropanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.288 |
| 4YON P-Rex1:Rac1 complex 提交 2015-03-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
片段:UNP residues 1-177
|
突变:G12V | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 sodium MES, pH 6.5, 0.2M sodium acetate, 15% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.183 |
| 5FI0 Crystal Structure of the P-Rex1 DH/PH tandem in complex with Rac1 提交 2015-12-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–192(192 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;294 K;Sodium dihydrogen phosphate, PEG 8000
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.235 |
| 5FI0 Crystal Structure of the P-Rex1 DH/PH tandem in complex with Rac1 提交 2015-12-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–192(192 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;294 K;Sodium dihydrogen phosphate, PEG 8000
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.235 |
| 5FI0 Crystal Structure of the P-Rex1 DH/PH tandem in complex with Rac1 提交 2015-12-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
1–192(192 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;294 K;Sodium dihydrogen phosphate, PEG 8000
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.235 |
| 5FI0 Crystal Structure of the P-Rex1 DH/PH tandem in complex with Rac1 提交 2015-12-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
1–192(192 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;294 K;Sodium dihydrogen phosphate, PEG 8000
|
分辨率 3.28 Å R-free 0.235 |
| 5HZH Crystal structure of photoinhibitable Rac1 containing C450A mutant LOV2 domain 提交 2016-02-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–47(47 aa)
链 A
48–180(133 aa)
|
突变:Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L 突变:Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;0.2 M calcium acetate, 26% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 5N6O Wild type human Rac1-GDP 提交 2017-02-15 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–177(176 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;0,1 mM MES ph 6.5
PEG 3350 20%
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.252 |
| 5N6O Wild type human Rac1-GDP 提交 2017-02-15 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–177(176 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.15 K;0,1 mM MES ph 6.5
PEG 3350 20%
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.252 |
| 5O33 A structure of the GEF Kalirin DH1 domain in complex with the small GTPase Rac1 提交 2017-05-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.2;293 K;0.1M citrate pH4.2, 0.2M sodium chloride, 18% (W/V) PEG 8000
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.240 |
| 5QQD PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with Z56880342 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 JGA N-ethyl-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.259 |
| 5QQE PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-009-531-494 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N5S N-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)-N'-[(3S)-4,4,4-trifluoro-3-hydroxy-3-(5-methylfuran-2-yl)butyl]urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.284 |
| 5QQF PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-004-412-710 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N5V N-ethyl-N'-1,3-thiazol-2-ylurea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.270 |
| 5QQG PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-009-541-216 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N64 N-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)-N'-[3-(4-phenylpiperazin-1-yl)propyl]urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.274 |
| 5QQH PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-020-096-465 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N67 N-methyl-5-({[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbamoyl]amino}methyl)thiophene-2-sulfonamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.263 |
| 5QQI PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-009-178-994 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N6D N-[3-(methoxymethyl)phenyl]-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.277 |
| 5QQJ PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-009-587-558 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N6J N-{1-[(imidazo[1,2-a]pyridin-2-yl)methyl]-1H-pyrazol-4-yl}-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.269 |
| 5QQK PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-009-359-835 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N6V N-{1-[2-(diethylamino)ethyl]-1H-indol-5-yl}-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.266 |
| 5QQL PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-009-565-301 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N71 N-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)-N'-[2-(phenylsulfonyl)ethyl]urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.270 |
| 5QQM PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-009-565-325 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N74 N-(1-benzyl-1H-pyrazol-4-yl)-N'-(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)urea × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.273 |
| 5QQN PanDDA analysis group deposition -- Crystal Structure of Kalirin/Rac1 in complex with MolPort-010-382-606 提交 2019-05-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 N5D N-cyclopropyl-2-(4-{[(5-methyl-1,2-oxazol-3-yl)carbamoyl]amino}-1H-pyrazol-1-yl)acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.279 |
| 5QU9 PanDDA analysis group deposition of ground-state model of Kalirin/Rac1 screened against a customized urea fragment library by X-ray Crystallography at the XChem facility of Diamond Light Source beamline I04-1 提交 2019-12-13 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293.15 K;0.1M bis-tris pH 5.5 24% PEG 3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.231 |
| 6AGP Structure of Rac1 in the low-affinity state for Mg2+ 提交 2018-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–181(181 aa)
|
突变:E31C, D63C, Q74C, L160C | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;313 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 1
NMR样品组成
20 mM HEPES, 5 mM MgCl2, 0.5 mM GDP, 0.1 mM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6BC1 A Complex between PH Domain of p190RhoGEF and Activated Rac1 Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–177(176 aa)
|
未记录 | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;22% PEG 3350, 100mM NaHEPES
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.323 |
| 6BC1 A Complex between PH Domain of p190RhoGEF and Activated Rac1 Bound to a GTP Analog 提交 2017-10-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2–177(176 aa)
|
未记录 | GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;22% PEG 3350, 100mM NaHEPES
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.323 |
| 6TGC CryoEM structure of the ternary DOCK2-ELMO1-RAC1 complex. 提交 2019-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–192(192 aa)
链 F
1–192(192 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6X1G Crystal structure of a GEF domain from the Orientia tsutsugamushi protein OtDUB in complex with Rac1 提交 2020-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 9.5;293 K;25 mM CHES pH 9.5, 25% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.218 |
| 6X1G Crystal structure of a GEF domain from the Orientia tsutsugamushi protein OtDUB in complex with Rac1 提交 2020-05-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–177(177 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 9.5;293 K;25 mM CHES pH 9.5, 25% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.218 |
| 7AJK Crystal structure of CRYI-B Rac1 complex 提交 2020-09-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 BBB
2–177(176 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;279 K;8% v/v PEG4,000
0.1M Tris pH 8.5
0.2M Sodium acetate
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.282 |
| 7DPA Cryo-EM structure of the human ELMO1-DOCK5-Rac1 complex 提交 2020-12-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 B
1–177(177 aa)
链 E
1–177(177 aa)
|
突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7SJ4 Human Trio residues 1284-1959 in complex with Rac1 提交 2021-10-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–192(192 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Blot force 10
|
分辨率 2.86 Å |
| 7USD Cryo-EM structure of D-site Rac1-bound WAVE Regulatory Complex 提交 2022-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 F
1–188(188 aa)
|
突变:P29S, Q61L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7USE Cryo-EM structure of WAVE regulatory complex with Rac1 bound on both A and D site 提交 2022-04-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 F
1–188(188 aa)
链 G
1–188(188 aa)
|
突变:P29S 突变:P29S, Q61L | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8I5V DOCK10 mutant L1903Y complexed with Rac1 提交 2023-01-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;ammonium sulfate, sodium cacodylate, PEG 8000, glycerol
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.208 |
| 8I5W Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK10 in complex with Rac1 提交 2023-01-26 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;ammonium sulfate, sodium cacodylate, PEG 8000, glycerol
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.280 |
| 8Q0N HACE1 in complex with RAC1 Q61L 提交 2023-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–192(192 aa)
|
突变:Q61L | 04E iodoacetic acid × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8S1N Crystal structure of human Rac1-GDP 提交 2024-02-15 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291.5 K;100 mM HEPES 7.0, 200 mM Calcium chloride, 20% PEG 6000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.258 |
| 8S1O Crystal structure of human Rac1-GDP-Pi 提交 2024-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;292.15 K;100 mM SPG buffer pH 5 and 25% PEG 1500
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.266 |
| 8ZJ2 Cryo-EM structure of the RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 complex 提交 2024-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 C
1–177(177 aa)
链 G
1–177(177 aa)
|
突变:G15A 突变:G15A | MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.66 Å |
| 8ZJI Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 1) 提交 2024-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–177(177 aa)
链 F
1–177(177 aa)
|
突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 8ZJJ Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 2) 提交 2024-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–177(177 aa)
链 F
1–177(177 aa)
|
突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 8ZJK Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 3) 提交 2024-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–177(177 aa)
链 F
1–177(177 aa)
|
突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.23 Å |
| 8ZJL Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 4) 提交 2024-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–177(177 aa)
链 F
1–177(177 aa)
|
突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.31 Å |
| 8ZJM Structure of DOCK5/ELMO1/Rac1 core (RhoG/DOCK5/ELMO1/Rac1 dataset, class 5) 提交 2024-05-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 C
1–177(177 aa)
链 F
1–177(177 aa)
|
突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.52 Å |
| 9HU8 Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with MC-278. 提交 2024-12-20 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | A1IXV 2-chloranyl-~{N}-(2-oxidanylidene-5,6,7,8-tetrahydro-1~{H}-1,8-naphthyridin-4-yl)ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M citrate pH 4.2, 0.2 M NaCl and 18 % PEG 8K
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.231 |
| 9I1L Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with RS-009 提交 2025-01-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | A1IZQ 2-chloranyl-~{N}-(6-oxidanylidene-1,7-dihydropyrrolo[2,3-b]pyridin-4-yl)ethanamide × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M bis-tris pH 5.5, 0.1 M NaCl,
27% PEG 3350
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.269 |
| 9IFK Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with DK-2 提交 2025-02-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | A1I32 2-chloranyl-~{N}-(2-oxidanylidene-1~{H}-quinolin-4-yl)ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M citrate pH 4.7, 0.8 M LiCl and
25% PEG 6K.
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.235 |
| 9IG1 Crystal structure of Kalirin/Rac1 in complex with DK-652 提交 2025-02-18 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
未记录 | A1I33 2-chloranyl-~{N}-(1-oxidanylidene-2~{H}-isoquinolin-7-yl)ethanamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;0.1 M bis-tris pH 5.5, 0.2 M NaCl and
25% PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.293 |
| 9LX0 DOCK5/ELMO1 complex with RhoG and Rac1 on lipid membrane 提交 2025-02-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 D
1–188(188 aa)
链 H
1–188(188 aa)
|
突变:G15A, C189S 突变:G15A, C189S | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.98 Å |
| 9RFB Crystal Structure of Human Rac1 in Complex with the Scaffold Protein POSH (residues 321-348) 提交 2025-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;0.05 M phosphate, 20% (w/v) PEG 8000. RAC1 6 mg/mL , GMPPNP 1mM, POSH 3 mM
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.226 |
| 9RFB Crystal Structure of Human Rac1 in Complex with the Scaffold Protein POSH (residues 321-348) 提交 2025-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;0.05 M phosphate, 20% (w/v) PEG 8000. RAC1 6 mg/mL , GMPPNP 1mM, POSH 3 mM
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.226 |
| 9RFF Crystal Structure of Human Rac1 Fused with the Scaffold Protein POSH (residues 319-371) 提交 2025-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–177(177 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;0.12 M ethylene glycol, 0.1 M imidazole-MES pH 6.5, 37% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD)-PEG 1000-PEG 3500
2 mg/mL Rac1-POSH
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.164 |
| 9VM4 Structure of DOCK6-Rac1 complex protomer 提交 2025-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–177(177 aa)
|
突变:G15A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 4.20 Å |
| 9VM5 Structure of DOCK6-Rac1 complex 提交 2025-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–177(177 aa)
链 D
1–177(177 aa)
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突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 5.32 Å |
| 9VM7 Structure of DOCK6 tetramer complexed with Rac1 提交 2025-06-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 B
1–177(177 aa)
链 D
1–177(177 aa)
链 F
1–177(177 aa)
链 H
1–177(177 aa)
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突变:G15A 突变:G15A 突变:G15A 突变:G15A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 6.85 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | RAC1_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 3–203; UniProt 1–201 作者链 B; PDB构建体 3–203; UniProt 1–201 |