PAPAIN
Carica papaya
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | STEFIN B (CYSTATIN B) × 1 （P04080） water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | PAPA1_CARPA |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 E； PDB构建体 1–212； UniProt 134–345 |
1stf
THE REFINED 2.4 ANGSTROMS X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT HUMAN STEFIN B IN COMPLEX WITH THE CYSTEINE PROTEINASE PAPAIN: A NOVEL TYPE OF PROTEINASE INHIBITOR INTERACTION
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
STEFIN B (CYSTATIN B)
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | PAPAIN × 1 （P00784） water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CYTB_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 I； PDB构建体 1–98； UniProt 1–98 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 1stf |
| 沉积日期 deposition_date | 1993-04-21 |
| 结构标题 title | THE REFINED 2.4 ANGSTROMS X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF RECOMBINANT HUMAN STEFIN B IN COMPLEX WITH THE CYSTEINE PROTEINASE PAPAIN: A NOVEL TYPE OF PROTEINASE INHIBITOR INTERACTION |
| 关键词 keywords | HYDROLASE(SULFHYDRYL PROTEINASE); HYDROLASE(SULFHYDRYL PROTEINASE) |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
1stf__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
1stf__assembly_1__model_1 | I(q)
1stf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 21.42 Å |
| Rg（电子密度） | 20.72 Å |
| 总 Rg | 21.50 Å |
| 原子数 | 2448 |
| 残基数 | 309 |
| 排除体积 | 43243 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d1stfe_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.3 — Cysteine proteinases |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.3.1 — Cysteine proteinases |
| 家族 Family family | d.3.1.1 — Papain-like |
| 结构域编号 domain_id | d1stfi_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.17 — Cystatin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.17.1 — Cystatin/monellin |
| 家族 Family family | d.17.1.2 — Cystatins |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 1stfE00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 90 — Alpha-Beta Complex |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Cathepsin B; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Cysteine proteinases |
| 结构域编号 domain_id | 1stfI00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |