1tbr

CRYSTAL STRUCTURE OF INSECT DERIVED DOUBLE DOMAIN KAZAL INHIBITOR RHODNIIN IN COMPLEX WITH THROMBIN

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

THROMBIN

物种未注明

UniProt P00735

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 RHODNIIN × 2 (Q06684) water × 6 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 RHODNIIN × 1 (Q06684) water × 3 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 RHODNIIN × 1 (Q06684) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THRB_BOVIN
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 22–49; UniProt 318–366 作者链 L; PDB构建体 22–49; UniProt 318–366 作者链 H; PDB构建体 1–259; UniProt 367–625 作者链 K; PDB构建体 1–259; UniProt 367–625

RHODNIIN

Rhodnius prolixus

UniProt Q06684

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 THROMBIN × 2 (P00735) THROMBIN × 2 (P00735) water × 6 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 THROMBIN × 1 (P00735) THROMBIN × 1 (P00735) water × 3 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 THROMBIN × 1 (P00735) THROMBIN × 1 (P00735) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THBI_RHOPR
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103 作者链 S; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1tbr
沉积日期 deposition_date1995-03-03
结构标题 titleCRYSTAL STRUCTURE OF INSECT DERIVED DOUBLE DOMAIN KAZAL INHIBITOR RHODNIIN IN COMPLEX WITH THROMBIN
关键词 keywordsCOMPLEX (SERINE PROTEASE-INHIBITOR), KAZAL-TYPE INHIBITOR, THROMBIN, COMPLEX (SERINE PROTEASE-INHIBITOR) complex; COMPLEX (SERINE PROTEASE/INHIBITOR)
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1tbr__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1tbr__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1tbr__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.49 Å
Rg(电子密度)21.30 Å
总 Rg22.24 Å
原子数3419
残基数411
排除体积57569 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1tbr__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 1tbr__assembly_2__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 1tbr__assembly_3__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd1tbr.1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.2 — Eukaryotic proteases
结构域编号 domain_idd1tbr.2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.2 — Eukaryotic proteases
结构域编号 domain_idd1tbrr1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like
结构域编号 domain_idd1tbrr2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like
结构域编号 domain_idd1tbrs1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like
结构域编号 domain_idd1tbrs2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.68 — Kazal-type serine protease inhibitors
超家族 Superfamily superfamilyg.68.1 — Kazal-type serine protease inhibitors
家族 Family familyg.68.1.1 — Ovomucoid domain III-like

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id1tbrH01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id1tbrH02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id1tbrJ00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology140 — Epsilon-Thrombin; Chain L
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thrombin light chain domain
结构域编号 domain_id1tbrK01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id1tbrK02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id1tbrL00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology140 — Epsilon-Thrombin; Chain L
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Thrombin light chain domain
结构域编号 domain_id1tbrR01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1tbrR02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1tbrS01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id1tbrS02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology60 — Wheat Germ Agglutinin (Isolectin 2); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
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7. 引用文献 (7)