1uea

MMP-3/TIMP-1 COMPLEX

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 127.7 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MATRIX METALLOPROTEINASE-3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 100–272	片段：CATALYTIC DOMAIN 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE-1 × 1 （P01033） ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.80 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 100–272	片段：CATALYTIC DOMAIN 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE-1 × 1 （P01033） ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1UEA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B3D STROMELYSIN-1 提交 1998-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 S27 N-[[2-METHYL-4-HYDROXYCARBAMOYL]BUT-4-YL-N]-BENZYL-P-[PHENYL]-P-[METHYL]PHOSPHINAMID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.4；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-PROPANOL, 10 MM CACL2 0.1 M TRIS-HCL BUFFER, PH 7.5-8.5, pH 7.4	分辨率 2.30 Å R-free 0.263
1B8Y X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATIONS FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–266（167 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 IN7 [4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-ACETIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.214
1B8Y X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATIONS FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–266（167 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 IN7 [4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-ACETIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.214
1BIW DESIGN AND SYNTHESIS OF CONFORMATIONALLY-CONSTRAINED MMP INHIBITORS 提交 1998-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 S80 N1-HYDROXY-2-(3-HYDROXY-PROPYL)-3-ISOBUTYL-N4-[1-(2-METHOXY-ETHYL)-2-OXO-AZEPAN-3-YL]-SUCCINAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；10 MG/ML PROTEIN IN 20-24% PEG 8000, 2.5% 2-PROPANOL, 10MM CACL2 AND 0.1M TRIS HCL BUFFER, PH 7.5-8.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.275
1BM6 SOLUTION STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN STROMELYSIN-1 COMPLEXED TO A POTENT NON-PEPTIDIC INHIBITOR, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1998-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 HAV HYDROXYAMINOVALINE × 1 3MP 3-METHYLPYRIDINE × 1 MSB 1-METHYLOXY-4-SULFONE-BENZENE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310 K	分辨率未提供
1BQO DISCOVERY OF POTENT, ACHIRAL MATRIX METALLOPROTEINASE INHIBITORS 提交 1998-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 N25 1,3-BIS-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-5,5-DIMETHYL-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-2-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1BQO DISCOVERY OF POTENT, ACHIRAL MATRIX METALLOPROTEINASE INHIBITORS 提交 1998-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 N25 1,3-BIS-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-5,5-DIMETHYL-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-2-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1BQO DISCOVERY OF POTENT, ACHIRAL MATRIX METALLOPROTEINASE INHIBITORS 提交 1998-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 100–272（173 aa）链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 9 N25 1,3-BIS-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-5,5-DIMETHYL-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-2-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.294
1C3I HUMAN STROMELYSIN-1 CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH RO-26-2812 提交 1999-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN 链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 TR1 2-(2-{2-[(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-AMINO]-3-MERCAPTO-PENTANOYLAMINO}-ACETYLAMINO)-3-METHYL-BUTYRIC ACID METHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG, POTASSIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, CACODYLATE, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.83 Å
1C3I HUMAN STROMELYSIN-1 CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH RO-26-2812 提交 1999-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN 链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 TR1 2-(2-{2-[(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-AMINO]-3-MERCAPTO-PENTANOYLAMINO}-ACETYLAMINO)-3-METHYL-BUTYRIC ACID METHYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG, POTASSIUM CHLORIDE, CALCIUM CHLORIDE, CACODYLATE, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.83 Å
1C8T HUMAN STROMELYSIN-1 (E202Q) CATALYTIC DOMAIN COMPLEXED WITH RO-26-2812 提交 1999-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 103–269（167 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN 链 B 103–269（167 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	突变：E202Q, S252P 突变：E202Q, S252P	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 TR1 2-(2-{2-[(BIPHENYL-4-YLMETHYL)-AMINO]-3-MERCAPTO-PENTANOYLAMINO}-ACETYLAMINO)-3-METHYL-BUTYRIC ACID METHYL ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG, potassium chloride, calcium chloride, cacodylate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å
1CAQ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–267（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1CAQ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–267（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
1CIZ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-04-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–267（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.64 Å R-free 0.245
1CIZ X-RAY STRUCTURE OF HUMAN STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN COMPLEXES WITH NON-PEPTIDE INHIBITORS: IMPLICATION FOR INHIBITOR SELECTIVITY 提交 1999-04-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–267（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SO4 SULFATE ION × 2 DPS 3-(1H-INDOL-3-YL)-2-[4-(4-PHENYL-PIPERIDIN-1-YL)-BENZENESULFONYLAMINO]-PROPIONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 1.64 Å R-free 0.245
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1CQR CRYSTAL STRUCTURE OF THE STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN AT 2.0 A RESOLUTION 提交 1999-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）链 B 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20-24% PEG 8000, 2.5% 2-propanol, 10mM CaCl2, 0.1 M Tris-HCL buffer, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.K	分辨率 2.00 Å R-free 0.266
1D5J CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A THIAZEPINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MM3 N-HYDROXY-4-[(4-METHOXYLPHENYL)SULFONYL]-2,2-DIMETHYL-HEXAHYDRO-1,4-THIAZEPINE-3(S)-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NACL, MGCL2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
1D5J CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A THIAZEPINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MM3 N-HYDROXY-4-[(4-METHOXYLPHENYL)SULFONYL]-2,2-DIMETHYL-HEXAHYDRO-1,4-THIAZEPINE-3(S)-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NACL, MGCL2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
1D7X CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A MODIFIED PROLINE SCAFFOLD BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN 链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 SPC N-HYDROXY 1N(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL-4-(Z,E-N-METHOXYIMINO)PYRROLIDINE-2R-CARBOXAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, SODIUM CHLORIDE, MAGNESIUM CHLORIDE, TRIS, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
1D8F CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A PIPERAZINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-22	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.252
1D8F CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A PIPERAZINE BASED INHIBITOR. 提交 1999-10-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 SPI N-HYDROXY-1-(4-METHOXYPHENYL)SULFONYL-4-BENZYLOXYCARBONYL-PIPERAZINE-2-CARBOXAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.252
1D8M CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A HETEROCYCLE-BASED INHIBITOR 提交 1999-10-25	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.44 Å R-free 0.315
1D8M CRYSTAL STRUCTURE OF MMP3 COMPLEXED WITH A HETEROCYCLE-BASED INHIBITOR 提交 1999-10-25	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 BBH 1-BENZYL-3-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-6-OXO-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-4-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.44 Å R-free 0.315
1G05 HETEROCYCLE-BASED MMP INHIBITOR WITH P2'SUBSTITUENTS 提交 2000-10-05	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.45 Å R-free 0.293
1G05 HETEROCYCLE-BASED MMP INHIBITOR WITH P2'SUBSTITUENTS 提交 2000-10-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 BBH 1-BENZYL-3-(4-METHOXY-BENZENESULFONYL)-6-OXO-HEXAHYDRO-PYRIMIDINE-4-CARBOXYLIC ACID HYDROXYAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.45 Å R-free 0.293
1G49 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2000-10-26	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NaCl, MgCl2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.253
1G49 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2000-10-26	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 111 (1N)-4-N-BUTOXYPHENYLSULFONYL-(2R)-N-HYDROXYCARBOXAMIDO-(4S)-METHANESULFONYLAMINO-PYRROLIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 6000, NaCl, MgCl2, Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.253
1G4K X-ray Structure of a Novel Matrix Metalloproteinase Inhibitor Complexed to Stromelysin 提交 2000-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 83–250（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HQQ 5-METHYL-5-(4-PHENOXY-PHENYL)-PYRIMIDINE-2,4,6-TRIONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG-MME 5000, ammonium sulfate, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.284
1G4K X-ray Structure of a Novel Matrix Metalloproteinase Inhibitor Complexed to Stromelysin 提交 2000-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 83–250（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HQQ 5-METHYL-5-(4-PHENOXY-PHENYL)-PYRIMIDINE-2,4,6-TRIONE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG-MME 5000, ammonium sulfate, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.284
1G4K X-ray Structure of a Novel Matrix Metalloproteinase Inhibitor Complexed to Stromelysin 提交 2000-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 83–250（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 HQQ 5-METHYL-5-(4-PHENOXY-PHENYL)-PYRIMIDINE-2,4,6-TRIONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG-MME 5000, ammonium sulfate, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.284
1HFS CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THE N-CARBOXY-ALKYL INHIBITOR L-764,004 提交 1997-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 105–264（160 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 L04 6-(4'-FLUORO-BIPHENYL-4-YL)-4-(3-METHYL-1-PHENYLCARBAMOYL-BUTYLCARBAMOYL)-2-[4-(1-OXO-1,3-DIHYDRO-ISOINDOL-2-YL)-BUTYL]-HEXANOIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.70 Å R-free 0.217
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 MBS R-2-{[4'-METHOXY-(1,1'-BIPHENYL)-4-YL]-SULFONYL}-AMINO-6-METHOXY-HEX-4-YNOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272 链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MBS R-2-{[4'-METHOXY-(1,1'-BIPHENYL)-4-YL]-SULFONYL}-AMINO-6-METHOXY-HEX-4-YNOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1HY7 A CARBOXYLIC ACID BASED INHIBITOR IN COMPLEX WITH MMP3 提交 2001-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272 链 B 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 100-272	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MBS R-2-{[4'-METHOXY-(1,1'-BIPHENYL)-4-YL]-SULFONYL}-AMINO-6-METHOXY-HEX-4-YNOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG6000, sodium chloride, magnesium chloride, Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.50 Å R-free 0.220
1OO9 Orientation in Solution of MMP-3 Catalytic Domain and N-TIMP-1 from Residual Dipolar Couplings 提交 2003-03-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–267（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.7；307 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2;1mM Sodium Azide；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM MMP-3 U-15N, 13C; 0.8mM N-TIMP-1; 20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O, 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.5mM MMP-3 U-2H, 15N; 0.5mM N-TIMP-1; 20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O, 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.66mM N-TIMP-1 U-15N, 13C; 0.66mM MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM MMP-3 (E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM (15N-IV, 15N, 13C-L)MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM (15N-IV, 15N, 13C-L)MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O 5% PEG(C12E6)/1-hexanol \| 93% H2O; 7% D2O 5% PEG(C12E6)/1-hexanol	分辨率未提供
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250 链 C 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIA CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250 链 D 106–267（162 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 89-250	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 106–266（161 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 106–266（161 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 106–266（161 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1QIC CRYSTAL STRUCTURE OF STROMELYSIN CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 106–266（161 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 89-249	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.270
1SLM CRYSTAL STRUCTURE OF FIBROBLAST STROMELYSIN-1: THE C-TRUNCATED HUMAN PROENZYME 提交 1995-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–272（255 aa）片段：PROPEPTIDE, CATALYTIC	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. 2.0 MICROLITER DROPS OF PROENZYME SOLUTION (10 MG/ML PROTEIN, 5.0 MILLIMOLAR CALCIUM CHLORIDE, 50 MICROMOLAR ZINC ACETATE, 0.02% SODIUM AZIDE, 20 MILLIMOLAR MES, PH 6.5, 0.02 MOLE INHIBITOR PER MOLE PROENZYME) WERE MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR BUFFER (14% PEG-6000, 5% SATURATED SODIUM CITRATE, 0.02% SODIUM AZIDE, 0.1 M CACODYLATE, PH 5.8) AND INCUBATED AT 4 DEGREES CENTIGRADE., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.256
1SLN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THE N-CARBOXY-ALKYL INHIBITOR L-702,842 提交 1995-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 255	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 8MI N-(R-CARBOXY-ETHYL)-ALPHA-(S)-(2-PHENYLETHYL)GLYCYL-L-ARGININE-N-PHENYLAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.54；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION. 1.5 MICROLITER DROPS OF ENZYME:INHIBITOR SOLUTION (9 MG/ML ENZYME, 1.5 MILLIMOLAR INHIBITOR, 5.0 MILLIMOLAR CALCIUM CHLORIDE, 0.02% SODIUM AZIDE, 20 MILLIMOLAR TRIS HYDROCHLORIDE, PH 7.5) WERE MIXED WITH AN EQUAL VOLUME OF RESERVOIR BUFFER (10% PEG-6000, 15% SATURATED AMMONIUM ACETATE 0.02% SODIUM AZIDE, 0.1 M CACODYLATE, PH 5.54) AND INCUBATED AT ROOM TEMPERATURE., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.27 Å R-free 0.299
1UMS STROMELYSIN-1 CATALYTIC DOMAIN WITH HYDROPHOBIC INHIBITOR BOUND, PH 7.0, 32OC, 20 MM CACL2, 15% ACETONITRILE; NMR ENSEMBLE OF 20 STRUCTURES 提交 1995-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–273（174 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 256	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 0DS N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-L-leucyl-L-phenylalaninamide × 1	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1UMT Stromelysin-1 catalytic domain with hydrophobic inhibitor bound, ph 7.0, 32oc, 20 mm cacl2, 15% acetonitrile; nmr average of 20 structures minimized with restraints 提交 1995-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–273（174 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 256	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 1 0DS N-{(2R)-2-[2-(hydroxyamino)-2-oxoethyl]-4-methylpentanoyl}-L-leucyl-L-phenylalaninamide × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；305 K；压力 ambient NMR样品组成 1.0-1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] double labeled SCD, 10 mM Tris-d11.HCl, 20 mM CaCl2, 15% acetonitrile-d3, 92% H2O/8% D2O \| 92% H2O/8% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] double labeled SCD, 10 mM Tris-d11.HCl, 20 mM CaCl2, 15% acetonitrile-d3, 92% H2O/8% D2O \| 92% H2O/8% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-99% 15N] N15 labeled SCD, 10 mM Tris-d11.HCl, 20 mM CaCl2, 15% acetonitrile-d3, 92% H2O/8% D2O \| 92% H2O/8% D2O	分辨率未提供
1USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-142372 提交 1998-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–264（165 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247	未记录	ZN ZINC ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 IN9 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PENTAFLUOROPHENYL-PROPIONAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop	分辨率 1.80 Å
1USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-142372 提交 1998-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 100–264（165 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247	未记录	ZN ZINC ION × 9 CA CALCIUM ION × 9 IN9 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PENTAFLUOROPHENYL-PROPIONAMIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop	分辨率 1.80 Å
1USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-142372 提交 1998-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–264（165 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247	未记录	ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 6 IN9 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PENTAFLUOROPHENYL-PROPIONAMIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop	分辨率 1.80 Å
2D1O Stromelysin-1 (MMP-3) complexed to a hydroxamic acid inhibitor 提交 2005-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–270（171 aa）片段：C-Terminal catalytic domain	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 FA4 SM-25453 × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG400, MPD, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.02 Å R-free 0.206
2D1O Stromelysin-1 (MMP-3) complexed to a hydroxamic acid inhibitor 提交 2005-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–270（171 aa）片段：C-Terminal catalytic domain	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 FA4 SM-25453 × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG400, MPD, hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.02 Å R-free 0.206
2JNP Solution structure of matrix metalloproteinase 3 (MMP-3) in the presence of N-isobutyl-N-[4-methoxyphenylsulfonyl]glycyl hydroxamic acid (NNGH) 提交 2007-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 105–265（161 aa）片段：residues 88-248	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）Tris 0.02, NaCl 3；压力 ambient NMR样品组成 1 mM MMP3, 20 mM TRIS, 300 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] MMP3, 20 mM TRIS, 300 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-99% 15N] MMP3, 20 mM TRIS, 300 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2JT5 solution structure of matrix metalloproteinase 3 (MMP-3) in the presence of n-hydroxy-2-[n-(2-hydroxyethyl)biphenyl-4-sulfonamide] hydroxamic acid (MLC88) 提交 2007-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 105–265（161 aa）片段：sequence database residues 105-265	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 JT5 N~2~-(biphenyl-4-ylsulfonyl)-N-hydroxy-N~2~-(2-hydroxyethyl)glycinamide × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2JT6 Solution structure of matrix metalloproteinase 3 (MMP-3) in the presence of 3-4'-cyanobyphenyl-4-yloxy)-n-hdydroxypropionamide (MMP-3 inhibitor VII) 提交 2007-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 105–265（161 aa）片段：sequence database residues 105-265	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 JT6 3-[(4'-cyanobiphenyl-4-yl)oxy]-N-hydroxypropanamide × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] entity_1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2SRT CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN STROMELYSIN-1 AT PH 5.5 AND 40OC COMPLEXED WITH INHIBITOR 提交 1995-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 8MI N-(R-CARBOXY-ETHYL)-ALPHA-(S)-(2-PHENYLETHYL)GLYCYL-L-ARGININE-N-PHENYLAMIDE × 1	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2USN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THIADIAZOLE INHIBITOR PNU-141803 提交 1998-06-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–264（165 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN RESIDUES 83 - 247	未记录	ZN ZINC ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 IN8 [2-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2-YLCARBAMOYL)-1-PHENYL-ETHYL]-CARBAMIC ACID BENZYL ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROP VAPOR DIFFUSION., pH 7.0, vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.20 Å
3OHL catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methoxy-N-(pyridine-3-ylmethyl)phenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–266（167 aa）片段：UNP residues 100-266	未记录	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 OHL N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-N~2~-(pyridin-4-ylmethyl)glycinamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 29% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.36 Å R-free 0.283
3OHL catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methoxy-N-(pyridine-3-ylmethyl)phenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–266（167 aa）片段：UNP residues 100-266	未记录	CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 OHL N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]-N~2~-(pyridin-4-ylmethyl)glycinamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 29% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.36 Å R-free 0.283
3OHO catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methylphenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–268（169 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP Residues 100-268)	未记录	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 Z79 N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]glycinamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 26% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
3OHO catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methylphenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–268（169 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP Residues 100-268)	未记录	CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 Z79 N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]glycinamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 26% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
3OHO catalytic domain of stromelysin-1 in complex with N-Hydroxy-2-(4-methylphenylsulfonamido)acetamide 提交 2010-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–268（169 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN (UNP Residues 100-268)	未记录	CA CALCIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 4 Z79 N-hydroxy-N~2~-[(4-methoxyphenyl)sulfonyl]glycinamide × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M (NH4)2SO4, 0.1 M Na-cacodylate, pH 6.5, 26% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.264
3USN STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN FIBROBLAST STROMELYSIN-1 INHIBITED WITH THE THIADIAZOLE INHIBITOR IPNU-107859, NMR, 1 STRUCTURE 提交 1998-06-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–267（168 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 83(1) - 250(168)	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 ATT 2-[3-(5-MERCAPTO-[1,3,4]THIADIAZOL-2-YL)-UREIDO]-N-METHYL-3-PHENYL-PROPIONAMIDE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；300 K	分辨率未提供
4DPE Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor. 提交 2012-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：unp residues 100-272	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.96 Å R-free 0.231
4DPE Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor. 提交 2012-02-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：unp residues 100-272	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 5 CL CHLORIDE ION × 2 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.96 Å R-free 0.231
4G9L Structure of MMP3 complexed with NNGH inhibitor. 提交 2012-07-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：catalytic domain (unp residues 100-272)	未记录	ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 1.88 Å R-free 0.270
4G9L Structure of MMP3 complexed with NNGH inhibitor. 提交 2012-07-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：catalytic domain (unp residues 100-272)	未记录	ZN ZINC ION × 3 CA CALCIUM ION × 3 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；293 K；25-30% PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 1.88 Å R-free 0.270
4JA1 Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor 提交 2013-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 100–272（173 aa）片段：catalytic domain	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Protein 7-15mg/ml, 25-30% (w/v) PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.96 Å R-free 0.244
4JA1 Structure of MMP3 complexed with a platinum-based inhibitor 提交 2013-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 100–272（173 aa）片段：catalytic domain	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 PT PLATINUM (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 NGH N-ISOBUTYL-N-[4-METHOXYPHENYLSULFONYL]GLYCYL HYDROXAMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Protein 7-15mg/ml, 25-30% (w/v) PEG 8000, 10 mM CaCl2, 100 mM TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.96 Å R-free 0.244
6MAV Complex of tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) mutant L34G with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2018-08-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–267（168 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Ammonium Acetate 0.1 M Bis-Tris: HCl, pH 5.5, 17 % (w/v) PEG 10,000	分辨率 2.37 Å R-free 0.298
6N9D Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/L133P/L151C/G154A) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2018-12-03	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–264（165 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Sodium Acetate, 0.1 M Sodium Cacodylate: HCl, pH 6.5 18 % (w/v) PEG 8000	分辨率 2.67 Å R-free 0.258
7S7L Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/M66S/E67Y/L133N/S155L) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2021-09-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 100-272)	未记录	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；310 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v PEG 3350 Anatrace-Microlytic Top96 #65	分辨率 2.34 Å R-free 0.239
7S7M Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/M66D/T98G/P131S/Q153N) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2021-09-16	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 100–272（173 aa）片段：Catalytic domain (UNP residues 100-272)	未记录	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；310 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5, 17% w/v PEG10000	分辨率 3.00 Å R-free 0.248

共 43 个其他 PDB 条目、79 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MMP3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–173； UniProt 100–272 作者链 C； PDB构建体 1–173； UniProt 100–272

TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE-1

Homo sapiens

UniProt P01033

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 24–207	未记录	MATRIX METALLOPROTEINASE-3 × 1 （P08254） ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.80 Å
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 24–207	未记录	MATRIX METALLOPROTEINASE-3 × 1 （P08254） ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1UEA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1D2B THE MMP-INHIBITORY, N-TERMINAL DOMAIN OF HUMAN TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASES-1 (N-TIMP-1), SOLUTION NMR, 29 STRUCTURES 提交 1999-09-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–149（126 aa）片段：NTR domain, residues 24-149	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0.171；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.5 MM N-TIMP-1 U-15N NMR样品组成 0.9 MM N-TIMP-1 U-15N,13C NMR样品组成 0.7 MM N-TIMP-1 U-15N,13C NMR样品组成 0.4 MM N-TIMP-1 16% 13C NMR样品组成 0.4 MM N-TIMP-1 U-15N,13C	分辨率未提供
1OO9 Orientation in Solution of MMP-3 Catalytic Domain and N-TIMP-1 from Residual Dipolar Couplings 提交 2003-03-03	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–149（126 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；310 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide；压力 ambient NMR测量条件 pH 6.7；307 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2;1mM Sodium Azide；压力 ambient NMR样品组成 0.8mM MMP-3 U-15N, 13C; 0.8mM N-TIMP-1; 20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O, 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.5mM MMP-3 U-2H, 15N; 0.5mM N-TIMP-1; 20mM Tris-d11; 100 mM NaCl; 15 mM CaCl2; 3uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O, 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.66mM N-TIMP-1 U-15N, 13C; 0.66mM MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM MMP-3 (E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM (15N-IV, 15N, 13C-L)MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O \| 93% H2O/7% D2O NMR样品组成 0.3mM 98% 2H/15N N-TIMP-1; 0.3mM (15N-IV, 15N, 13C-L)MMP-3(E202Q); 20mM Tris-d11; 125mM NaCl; 15 mM CaCl2; 50uM ZnCl2; 1mM Sodium Azide; 93% H2O; 7% D2O 5% PEG(C12E6)/1-hexanol \| 93% H2O; 7% D2O 5% PEG(C12E6)/1-hexanol	分辨率未提供
2J0T Crystal Structure of the Catalytic Domain of MMP-1 in Complex with the Inhibitory Domain of TIMP-1 提交 2006-08-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 24–149（126 aa）片段：N-TERMINAL INHIBITORY DOMAIN, RESIDUES 24-149	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；10% PEG 8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.1M HEPES (PH 7.5).	分辨率 2.54 Å R-free 0.275
2J0T Crystal Structure of the Catalytic Domain of MMP-1 in Complex with the Inhibitory Domain of TIMP-1 提交 2006-08-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–149（126 aa）片段：N-TERMINAL INHIBITORY DOMAIN, RESIDUES 24-149	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；10% PEG 8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.1M HEPES (PH 7.5).	分辨率 2.54 Å R-free 0.275
2J0T Crystal Structure of the Catalytic Domain of MMP-1 in Complex with the Inhibitory Domain of TIMP-1 提交 2006-08-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 24–149（126 aa）片段：N-TERMINAL INHIBITORY DOMAIN, RESIDUES 24-149	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；10% PEG 8000, 8% ETHYLENE GLYCOL, 0.1M HEPES (PH 7.5).	分辨率 2.54 Å R-free 0.275
3MA2 Complex membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) with tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) 提交 2010-03-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 24–148（125 aa）片段：Residues 24-148	突变：V27A,P29V,T121L	CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.247
3MA2 Complex membrane type-1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP) with tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) 提交 2010-03-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–148（125 aa）片段：Residues 24-148	突变：V27A,P29V,T121L	CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；292 K；100 mM Bis-Tris pH 5.5, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.05 Å R-free 0.247
3V96 Complex of matrix metalloproteinase-10 catalytic domain (MMP-10cd) with tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) 提交 2011-12-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–207（184 aa）片段：unp residues 24-207	突变：N30A	PO4 PHOSPHATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；298 K；0.1 M sodium dihydrogen phosphate solution, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
6MAV Complex of tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) mutant L34G with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2018-08-28	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–207（184 aa）	突变：L34G	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；0.1 M Ammonium Acetate 0.1 M Bis-Tris: HCl, pH 5.5, 17 % (w/v) PEG 10,000	分辨率 2.37 Å R-free 0.298
6N9D Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/L133P/L151C/G154A) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2018-12-03	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–207（184 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M Sodium Acetate, 0.1 M Sodium Cacodylate: HCl, pH 6.5 18 % (w/v) PEG 8000	分辨率 2.67 Å R-free 0.258
7S7L Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/M66S/E67Y/L133N/S155L) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2021-09-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–207（184 aa）	突变：L34G, M66S, E67Y, L133N, S155L	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；310 K；0.2M ammonium sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v PEG 3350 Anatrace-Microlytic Top96 #65	分辨率 2.34 Å R-free 0.239
7S7M Complex of tissue inhibitor of metalloproteinases-1 (TIMP-1) mutant (L34G/M66D/T98G/P131S/Q153N) with matrix metalloproteinase-3 catalytic domain (MMP-3cd) 提交 2021-09-16	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–207（184 aa）	突变：L34G, M66D, T98G, P131S, Q153N	CA CALCIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；310 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5, 17% w/v PEG10000	分辨率 3.00 Å R-free 0.248
9SOP Tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) 提交 2025-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–203（180 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 FLC CITRATE ANION × 1 P3G 3,6,9,12,15-PENTAOXAHEPTADECANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293.15 K；0.2 M Lithium Citrate tribasic tetrahydrate, 20% PEG 3350, 15% Glycerol	分辨率 1.95 Å R-free 0.239
9SOP Tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1) 提交 2025-09-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 24–203（180 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293.15 K；0.2 M Lithium Citrate tribasic tetrahydrate, 20% PEG 3350, 15% Glycerol	分辨率 1.95 Å R-free 0.239
9SOQ Tissue inhibitor of Metalloproteinase 1 (TIMP-1) 提交 2025-09-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–207（184 aa）	未记录	FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；0.2 Ammonium Sulphate, 0.1 M tri-sodium citrate, 25% PEG4000	分辨率 2.30 Å R-free 0.262
9SOQ Tissue inhibitor of Metalloproteinase 1 (TIMP-1) 提交 2025-09-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 24–207（184 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293.15 K；0.2 Ammonium Sulphate, 0.1 M tri-sodium citrate, 25% PEG4000	分辨率 2.30 Å R-free 0.262
9SOS Tissue Inhibitor of Matrix Metalloproteinase-1 (TIMP-1) 提交 2025-09-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–207（184 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.4；293.15 K；0.2 M Lithium Citrate tribasic tetrahydrate, 20% PEG3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.255

共 12 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIMP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–184； UniProt 24–207 作者链 D； PDB构建体 1–184； UniProt 24–207

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1uea
沉积日期 deposition_date	1997-06-06
结构标题 title	MMP-3/TIMP-1 COMPLEX
关键词 keywords	;PROTEINASE, ZINC-ENDOPEPTIDASE, PROTEINASE INHIBITOR, COMPLEX, MMPS (MATRIX METALLO PROTEINASES) TIMPS (TISSUE INHIBITOR OF METALLO PROTEINASES), METZINCINS, COMPLEX (METALLOPROTEASE-INHIBITOR), COMPLEX (METALLOPROTEASE-INHIBITOR) complex ;; COMPLEX (METALLOPROTEASE/INHIBITOR)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	36.59 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.99 Å
零角强度 I(0) i0	97510700.00
分子量 molecular_weight	78967.0 kDa
排除体积 excluded_volume	98339 Å³
包络体积 envelope_volume	128030 Å³
水化壳体积 shell_volume	31457 Å³
包络直径 envelope_diameter	125.4 Å
壳层 Rg shell_rg	38.74 Å
包络 Rg envelope_rg	37.15 Å
形状 Rg shape_rg	36.97 Å
总 Rg total_rg	37.15 Å
总原子数 total_atoms	5528
残基数 n_residues	694
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	127.7 Å
Rg (实空间) rg_real	37.17 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.50 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.7510e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.7380e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	36.82 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	97480000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7136
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	26.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.559
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.592
角度范围 angular_range	— – 0.2150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	16180000.0000
实空间数据点数 n_real_points	44
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.395; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.241; Smooth: 0.846

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MATRIX METALLOPROTEINASE-3
分子量 formula_weight	19510.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.24.17
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	6039

FRTFPGIPKWRKTHLTYRIVNYTPDLPKDAVDSAVEKALKVWEEVTPLTFSRLYEGEADIMISFAVREHGDFYPFDGPGNVLAHAYAPGPGINGDAHFDDDEQWTKDTTGTNLFLVAAHEIGHSLGLFHSANTEALMYPLYHSLTDLTRFRLSQDDINGIQSLYGPPPDSPET

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE-1
分子量 formula_weight	20646.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

CTCVPPHPQTAFCNSDLVIRAKFVGTPEVAQTTLYQRYEIKMTKMYKGFQALGDAADIRFVYTPAMESVCGYFHRSHARSEEFLIAGKLQDGLLHITTCSFVAPWNSLSLAQRRGFTKTYTVGCEECTVFPCLSIPCKLQSGTHCLWTDQLLQGSEKGFQSRHLACLPREPGLCTWQSLRSQIA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	511

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1ueaa_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family family	d.92.1.11 — Matrix metalloproteases, catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1ueab_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.3 — TIMP-like
家族 Family family	b.40.3.1 — Tissue inhibitor of metalloproteinases, TIMP

结构域编号 domain_id	d1ueac_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.92 — Zincin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.92.1 — Metalloproteases ('zincins'), catalytic domain
家族 Family family	d.92.1.11 — Matrix metalloproteases, catalytic domain

结构域编号 domain_id	d1uead_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.3 — TIMP-like
家族 Family family	b.40.3.1 — Tissue inhibitor of metalloproteinases, TIMP

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1ueaA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Collagenase (Catalytic Domain)

结构域编号 domain_id	1ueaB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	370 — Tissue inhibitor of metalloproteinase-1. Chain B, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tissue inhibitor of metalloproteinase-1. Chain B, domain 1

结构域编号 domain_id	1ueaB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

结构域编号 domain_id	1ueaC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	390 — Collagenase (Catalytic Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Collagenase (Catalytic Domain)

结构域编号 domain_id	1ueaD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	370 — Tissue inhibitor of metalloproteinase-1. Chain B, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tissue inhibitor of metalloproteinase-1. Chain B, domain 1

结构域编号 domain_id	1ueaD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 —

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8. 引用文献 (3)

▶

晶胞边长 a length_a	80.620 Å
晶胞边长 b length_b	80.620 Å
晶胞边长 c length_c	157.620 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43
空间群编号 int_tables_number	78
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	100.000 Å
R 因子 r_factor	0.1970
R_work r_work	0.1970
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/ue/1uea/1uea.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ue/1uea/1uea.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ue/1uea/1uea.dat

MMP-3/TIMP-1 COMPLEX

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MATRIX METALLOPROTEINASE-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TISSUE INHIBITOR OF METALLOPROTEINASE-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (3)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)