SAXSdb — 1uh1

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Agglutinin alpha chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 2	Agglutinin beta-3 chain × 4 （P18673） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 2 methyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranoside × 2 water × 8	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 4	Agglutinin beta-3 chain × 4 （P18673） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 4 water × 8	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 12 其他聚合物 4	Agglutinin beta-3 chain × 6 （P18673） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 4 methyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranoside × 2 water × 12	与蛋白数一致
4	其他组合	异源复合物	蛋白 12 其他聚合物 4	Agglutinin beta-3 chain × 6 （P18673） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 4 methyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranoside × 2 water × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LECA_ARTIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–133； UniProt 1–133 作者链 C； PDB构建体 1–133； UniProt 1–133 作者链 E； PDB构建体 1–133； UniProt 1–133 作者链 G； PDB构建体 1–133； UniProt 1–133

Agglutinin beta-3 chain

物种未注明

UniProt P18673

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 2	Agglutinin alpha chain × 4 （P18670） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 2 methyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranoside × 2 water × 8	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 4	Agglutinin alpha chain × 4 （P18670） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 4 water × 8	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 12 其他聚合物 4	Agglutinin alpha chain × 6 （P18670） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 4 methyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranoside × 2 water × 12	与蛋白数一致
4	其他组合	异源复合物	蛋白 12 其他聚合物 4	Agglutinin alpha chain × 6 （P18670） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside × 4 methyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranoside × 2 water × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LEC3_ARTIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–20； UniProt 1–20 作者链 D； PDB构建体 1–20； UniProt 1–20 作者链 F； PDB构建体 1–20； UniProt 1–20 作者链 H； PDB构建体 1–20； UniProt 1–20

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1uh1
沉积日期 deposition_date	2003-06-23
结构标题 title	Crystal structure of jacalin- GalNAc-beta(1-3)-Gal-alpha-O-Me complex
关键词 keywords	All beta sheet protein, Beta-prism I fold, Gal specific, SUGAR BINDING PROTEIN; SUGAR BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1uh1__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1uh1__assembly_3__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1uh1__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.80 Å
Rg（电子密度）	30.95 Å
总 Rg	31.67 Å
原子数	7016
残基数	888
排除体积	125850 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1uh1__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`1uh1__assembly_2__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`1uh1__assembly_3__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`1uh1__assembly_4__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Agglutinin alpha chain
分子量 formula_weight	14673.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	4801

GKAFDDGAFTGIREINLSYNKETAIGDFQVVYDLNGSPYVGQNHKSFITGFTPVKISLDFPSEYIMEVSGYTGNVSGYVVVRSLTFKTNKKTYGPYGVTSGTPFNLPIENGLIVGFKGSIGYWLDYFSMYLSL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Agglutinin beta-3 chain
分子量 formula_weight	2075.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

DEQSGKSQTVIVGPWGAKVS

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose-(1-3)-methyl alpha-D-galactopyranoside
分子量 formula_weight	397.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	methyl 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranoside
分子量 formula_weight	235.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	120

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d1uh1.1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamily	b.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family family	b.77.3.1 — Mannose-binding lectins

结构域编号 domain_id	d1uh1.2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamily	b.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family family	b.77.3.1 — Mannose-binding lectins

结构域编号 domain_id	d1uh1.3
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamily	b.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family family	b.77.3.1 — Mannose-binding lectins

结构域编号 domain_id	d1uh1.4
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.77 — beta-Prism I
超家族 Superfamily superfamily	b.77.3 — Mannose-binding lectins
家族 Family family	b.77.3.1 — Mannose-binding lectins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1uh1A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology	10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Jacalin-like lectin domain

结构域编号 domain_id	1uh1C00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology	10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Jacalin-like lectin domain

结构域编号 domain_id	1uh1E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology	10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Jacalin-like lectin domain

结构域编号 domain_id	1uh1G00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	100 — Aligned Prism
拓扑 Topology topology	10 — Vitelline Membrane Outer Layer Protein I, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Jacalin-like lectin domain

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晶胞边长 a length_a	129.446 Å
晶胞边长 b length_b	129.446 Å
晶胞边长 c length_c	158.346 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 65 2 2
空间群编号 int_tables_number	179
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	19.970 Å
R 因子 r_factor	0.1920
R_work r_work	0.1920
R_free r_free	0.2320

Crystal structure of jacalin- GalNAc-beta(1-3)-Gal-alpha-O-Me complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Agglutinin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Agglutinin beta-3 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1uh1__assembly_3__model_1

1uh1__assembly_3__model_1 | I(q)

1uh1__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (3)

Crystal structure of jacalin- GalNAc-beta(1-3)-Gal-alpha-O-Me complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Agglutinin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Agglutinin beta-3 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1uh1__assembly_3__model_1

1uh1__assembly_3__model_1 | I(q)

1uh1__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (3)