1vsq

Solution NMR structure of the productive complex between IIAMannose and IIBMannose of the mannose transporter of the E. coli phosphotransferase system

Method: SOLUTION NMR
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mannose-specific phosphotransferase enzyme IIA component

Escherichia coli

UniProt P69797

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PTNAB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–133; UniProt 2–134 作者链 B; PDB构建体 1–133; UniProt 2–134 作者链 C; PDB构建体 1–165; UniProt 159–323

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1vsq
沉积日期 deposition_date2008-01-10
结构标题 titleSolution NMR structure of the productive complex between IIAMannose and IIBMannose of the mannose transporter of the E. coli phosphotransferase system
关键词 keywords;phosphotransferase, sugar transport, transferase, transferase-phosphocarrier complex, Membrane, Phosphoprotein, Phosphotransferase system ;; TRANSFERASE
实验方法 methodSOLUTION NMR
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1vsq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1vsq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1vsq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.20 Å
Rg(电子密度)23.14 Å
总 Rg24.04 Å
原子数6713
残基数429
排除体积59659 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1vsq__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1vsq__assembly_1__model_2 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd1vsqa_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.54 — PTS system fructose IIA component-like
超家族 Superfamily superfamilyc.54.1 — PTS system fructose IIA component-like
家族 Family familyc.54.1.1 — EIIA-man component-like
结构域编号 domain_idd1vsqb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.54 — PTS system fructose IIA component-like
超家族 Superfamily superfamilyc.54.1 — PTS system fructose IIA component-like
家族 Family familyc.54.1.1 — EIIA-man component-like
结构域编号 domain_idd1vsqc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.38 — PTS IIb component
超家族 Superfamily superfamilyc.38.1 — PTS IIb component
家族 Family familyc.38.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id1vsqA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily510 — Phosphotransferase system, mannose-type IIA component
结构域编号 domain_id1vsqB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily510 — Phosphotransferase system, mannose-type IIA component
结构域编号 domain_id1vsqC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology35 — Fructose Permease
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Phosphotransferase system, sorbose subfamily IIB component
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7. 引用文献 (1)