SAXSdb — 1xb0

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 8

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–95 链 B； UniProt 1–95 链 C； UniProt 1–95 链 D； UniProt 1–95 链 E； UniProt 1–95 链 F； UniProt 1–95	未记录	Diablo homolog, mitochondrial × 6 （Q9NR28） ZN ZINC ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM sodium acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.244

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1XB0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1XB1 The Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2 提交 2004-08-27	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–95（95 aa）链 B 1–95（95 aa）链 C 1–95（95 aa）链 D 1–95（95 aa）链 E 1–95（95 aa）链 F 1–95（95 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 23	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM Na acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
1XB1 The Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2 提交 2004-08-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–95（95 aa）链 B 1–95（95 aa）链 C 1–95（95 aa）链 D 1–95（95 aa）链 E 1–95（95 aa）链 F 1–95（95 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 46	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM Na acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.277

共 1 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BIRC8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 14–108； UniProt 1–95 作者链 B； PDB构建体 14–108； UniProt 1–95 作者链 C； PDB构建体 14–108； UniProt 1–95 作者链 D； PDB构建体 14–108； UniProt 1–95 作者链 E； PDB构建体 14–108； UniProt 1–95 作者链 F； PDB构建体 14–108； UniProt 1–95

Diablo homolog, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q9NR28

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 56–62 链 H； UniProt 56–62 链 I； UniProt 56–62 链 J； UniProt 56–62 链 K； UniProt 56–62 链 L； UniProt 56–62	未记录	Baculoviral IAP repeat-containing protein 8 × 6 （Q96P09） ZN ZINC ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM sodium acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.20 Å R-free 0.244

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1XB0	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1FEW CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC/DIABLO 提交 2000-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 56–239（184 aa）片段：SMAC/DIABLO	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；276 K；Dioxane, Ammonium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 276.0K	分辨率 2.20 Å R-free 0.259
1FEW CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC/DIABLO 提交 2000-07-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 56–239（184 aa）片段：SMAC/DIABLO	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；276 K；Dioxane, Ammonium Sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 276.0K	分辨率 2.20 Å R-free 0.259
1G3F NMR STRUCTURE OF A 9 RESIDUE PEPTIDE FROM SMAC/DIABLO COMPLEXED TO THE BIR3 DOMAIN OF XIAP 提交 2000-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 56–64（9 aa）片段：9 RESIDUE PEPTIDE	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；300 K；压力 1 NMR样品组成 1 mM protein/peptide complex, 120 mM NaCl, 1mM DTT, 10mM phosphate \| 90% h20, 10% d20	分辨率未提供
1G73 CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC BOUND TO XIAP-BIR3 DOMAIN 提交 2000-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 56–217（162 aa）片段：RESIDUES 1-162	突变：F33D	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；297 K；100 mM Citrate, pH5.5 5% PEG4000 10% Isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.00 Å R-free 0.268
1G73 CRYSTAL STRUCTURE OF SMAC BOUND TO XIAP-BIR3 DOMAIN 提交 2000-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 56–217（162 aa）片段：RESIDUES 1-162	突变：F33D	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；297 K；100 mM Citrate, pH5.5 5% PEG4000 10% Isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.00 Å R-free 0.268
1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 56–64（9 aa）片段：Smac residues 1-9	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.71 Å R-free 0.171
1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 56–64（9 aa）片段：Smac residues 1-9	未记录	ZN ZINC ION × 1 LI LITHIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.71 Å R-free 0.171
1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 56–64（9 aa）片段：Smac residues 1-9 链 D 56–64（9 aa）片段：Smac residues 1-9	未记录	ZN ZINC ION × 4 LI LITHIUM ION × 2 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.71 Å R-free 0.171
1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 56–64（9 aa）片段：Smac residues 1-9 链 D 56–64（9 aa）片段：Smac residues 1-9	未记录	ZN ZINC ION × 2 LI LITHIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.71 Å R-free 0.171
1TW6 Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a 9mer peptide derived from Smac 提交 2004-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 56–64（9 aa）片段：Smac residues 1-9	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；lithium sulfate, Bis-tris, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.71 Å R-free 0.171
1XB1 The Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2 提交 2004-08-27	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 56–62（7 aa）链 H 56–62（7 aa）链 I 56–62（7 aa）链 J 56–62（7 aa）链 K 56–62（7 aa）链 L 56–62（7 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 23	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM Na acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
1XB1 The Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2 提交 2004-08-27	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 G 56–62（7 aa）链 H 56–62（7 aa）链 I 56–62（7 aa）链 J 56–62（7 aa）链 K 56–62（7 aa）链 L 56–62（7 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 46	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；295 K；5% PEG3000, 100mM Na acetate, 100mM Zinc acetate, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
3UIH crystal structure of human Survivin in complex with Smac/DIABLO(1-15) peptide 提交 2011-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 56–70（15 aa）片段：unp residues 1-15 链 Q 56–70（15 aa）片段：unp residues 1-15	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.2 M potassium thiocyanate, 10% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.245
3UIJ Crystal structure of human Survivin K62Y/H80W mutant in complex with Smac/DIABLO(1-15) peptide 提交 2011-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 56–70（15 aa）片段：unp residues 1-15 链 Q 56–70（15 aa）片段：unp residues 1-15	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.2 M sodium bromide, 12% PEG 3350, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.71 Å R-free 0.242
4TX5 Crystal structure of Smac-DIABLO (in space group P65) 提交 2014-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 56–239（184 aa）片段：UNP Residues 56-239 链 B 56–239（184 aa）片段：UNP Residues 56-239	未记录	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6 ACT ACETATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；30% MPD, 0.1 M Sodium Acetate, 0.02 M Calcium Chloride.	分辨率 1.80 Å R-free 0.202
6JX6 Tetrameric form of Smac 提交 2019-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 56–239（184 aa）链 B 56–239（184 aa）链 C 56–239（184 aa）链 D 56–239（184 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；296 K；200mM Potassium Phosphate Monobasic, 20% PEG 3350	分辨率 2.81 Å R-free 0.264
8ATO Structure of the giant inhibitor of apoptosis, BIRC6 bound to the regulator SMAC 提交 2022-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 56–239（184 aa）链 D 56–239（184 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8AUW Cryo-EM structure of human BIRC6 in complex with SMAC. 提交 2022-08-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 56–239（184 aa）链 D 56–239（184 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.20 Å
8E2I Cryo-EM structure of BIRC6/Smac 提交 2022-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 56–239（184 aa）链 F 56–239（184 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.04 Å
8E2J Cryo-EM structure of BIRC6/Smac (from local refinement 1) 提交 2022-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 56–239（184 aa）链 B 56–239（184 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å

共 13 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DBLOH_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–7； UniProt 56–62 作者链 H； PDB构建体 1–7； UniProt 56–62 作者链 I； PDB构建体 1–7； UniProt 56–62 作者链 J； PDB构建体 1–7； UniProt 56–62 作者链 K； PDB构建体 1–7； UniProt 56–62 作者链 L； PDB构建体 1–7； UniProt 56–62

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1xb0
沉积日期 deposition_date	2004-08-27
结构标题 title	Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2
关键词 keywords	SMAC, DIABLO, APOPTOSIS, CASPASE INHIBITION, XIAP; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	30.57 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	29.94 Å
零角强度 I(0) i0	83131800.00
分子量 molecular_weight	69783.0 kDa
排除体积 excluded_volume	86082 Å³
包络体积 envelope_volume	115700 Å³
水化壳体积 shell_volume	31271 Å³
包络直径 envelope_diameter	96.0 Å
壳层 Rg shell_rg	38.27 Å
包络 Rg envelope_rg	28.92 Å
形状 Rg shape_rg	30.00 Å
总 Rg total_rg	30.59 Å
总原子数 total_atoms	4842
残基数 n_residues	596
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	88.5 Å
Rg (实空间) rg_real	30.40 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.58 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.3130e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3110e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	30.48 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	83140000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9120
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	49.3 Å
偏度 Skewness skewness	-0.041
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.855
角度范围 angular_range	— – 0.2600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	8793000.0000
实空间数据点数 n_real_points	53
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.964; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.964

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Baculoviral IAP repeat-containing protein 8
分子量 formula_weight	12349.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	5158

GSHMSTNLPRNPSMTGYEARLITFGTWMYSVNKEQLARAGFYAIGQEDKVQCFHCGGGLANWKPKEDPWEQHAKWYPGCKYLLEEKGHEYINNIHLTRSLEGALVQTT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Diablo homolog, mitochondrial
分子量 formula_weight	726.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I,J,K,L

AVPIAQK

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	24

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	316

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d1xb0a_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1xb0b_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1xb0c_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1xb0d_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1xb0e_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d1xb0f_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	1xb0A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1xb0B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1xb0C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1xb0D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1xb0E00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	1xb0F00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	86.400 Å
晶胞边长 b length_b	86.400 Å
晶胞边长 c length_c	226.770 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2225
R_free r_free	0.2443

fit	/app/data/saxs_computation/xb/1xb0/1xb0.fit
pddf	/app/data/pr_computation/xb/1xb0/1xb0.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/xb/1xb0/1xb0.dat

Structure of the BIR domain of IAP-like protein 2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Diablo homolog, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)