1y76

Solution Structure of Patj/Pals1 L27 Domain Complex

Method: SOLUTION NMR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

protein associated to tight junctions

Rattus norvegicus

UniProt O55164

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 MAGUK p55 subfamily member 5 × 2 (Q8N3R9) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MPDZ_RAT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–62; UniProt 4–65 作者链 C; PDB构建体 1–62; UniProt 4–65

MAGUK p55 subfamily member 5

Homo sapiens

UniProt Q8N3R9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 protein associated to tight junctions × 2 (O55164) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MPP5_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–60; UniProt 118–177 作者链 D; PDB构建体 1–60; UniProt 118–177

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id1y76
沉积日期 deposition_date2004-12-08
结构标题 titleSolution Structure of Patj/Pals1 L27 Domain Complex
关键词 keywordsL27 domain, scaffold protein, protein assembly, cell polarity, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodSOLUTION NMR

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1y76__assembly_1__model_4

Assembly 1 · Model 4 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1y76__assembly_1__model_4 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

1y76__assembly_1__model_4 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)22.28 Å
Rg(电子密度)21.05 Å
总 Rg21.86 Å
原子数3984
残基数244
排除体积35110 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 1y76__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 2 1y76__assembly_1__model_2 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 3 1y76__assembly_1__model_3 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 4 1y76__assembly_1__model_4 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 5 1y76__assembly_1__model_5 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 6 1y76__assembly_1__model_6 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 7 1y76__assembly_1__model_7 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 8 1y76__assembly_1__model_8 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 9 1y76__assembly_1__model_9 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 10 1y76__assembly_1__model_10 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 11 1y76__assembly_1__model_11 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 12 1y76__assembly_1__model_12 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 13 1y76__assembly_1__model_13 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 14 1y76__assembly_1__model_14 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 15 1y76__assembly_1__model_15 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 16 1y76__assembly_1__model_16 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 17 1y76__assembly_1__model_17 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 18 1y76__assembly_1__model_18 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 19 1y76__assembly_1__model_19 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
1 20 1y76__assembly_1__model_20 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd1y76a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.194 — L27 domain
超家族 Superfamily superfamilya.194.1 — L27 domain
家族 Family familya.194.1.1 — L27 domain
结构域编号 domain_idd1y76b1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.194 — L27 domain
超家族 Superfamily superfamilya.194.1 — L27 domain
家族 Family familya.194.1.1 — L27 domain
结构域编号 domain_idd1y76c_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.194 — L27 domain
超家族 Superfamily superfamilya.194.1 — L27 domain
家族 Family familya.194.1.1 — L27 domain
结构域编号 domain_idd1y76d_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.194 — L27 domain
超家族 Superfamily superfamilya.194.1 — L27 domain
家族 Family familya.194.1.1 — L27 domain

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id1y76A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily650 — L27 domain
结构域编号 domain_id1y76B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily650 — L27 domain
结构域编号 domain_id1y76C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily650 — L27 domain
结构域编号 domain_id1y76D00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily650 — L27 domain

7. 引用文献 (1)